More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_0418 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_0418  MATE efflux family protein  100 
 
 		 448 aa  850    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0686171 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2939  multidrug resistance protein  46.85 
 
 		 468 aa  335  7e-91  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000000251457  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1835  multidrug efflux pump NorM  46.62 
 
 		 468 aa  332  1e-89  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.143849  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2885  multidrug efflux pump NorM  46.62 
 
 		 468 aa  332  1e-89  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.132426  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0502  multidrug resistance protein NorM, putative  46.62 
 
 		 468 aa  332  1e-89  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00841305  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2770  multidrug efflux pump NorM  46.62 
 
 		 468 aa  332  1e-89  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00327808  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2511  multidrug efflux pump NorM  46.62 
 
 		 468 aa  332  1e-89  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0112614  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2943  MATE efflux family protein  45.27 
 
 		 470 aa  330  2e-89  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.223425  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1686  multidrug resistance protein NorM, putative  46.39 
 
 		 464 aa  330  3e-89  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.712622  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2824  Na+-driven multidrug efflux pump  46.39 
 
 		 468 aa  329  5.0000000000000004e-89  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.338684  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0967  MATE efflux family protein  45.88 
 
 		 462 aa  326  6e-88  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.932307  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1041  multi anti extrusion protein MatE  44.49 
 
 		 470 aa  325  9e-88  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0971  MATE efflux family protein  45.88 
 
 		 462 aa  325  9e-88  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.500099  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2212  MATE efflux family protein  45.41 
 
 		 462 aa  323  5e-87  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.520618  normal  0.988059 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0797  MATE efflux family protein  45.41 
 
 		 463 aa  322  9.999999999999999e-87  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.158372 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4204  multi anti extrusion protein MatE  44.94 
 
 		 462 aa  321  1.9999999999999998e-86  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0638116  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1050  MATE efflux family protein  44.52 
 
 		 462 aa  320  3.9999999999999996e-86  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.456746 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0612  MATE efflux family protein  44.52 
 
 		 462 aa  320  3.9999999999999996e-86  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1091  MATE efflux family protein  44.52 
 
 		 462 aa  320  3.9999999999999996e-86  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.427191  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0440  MATE efflux family protein  31.44 
 
 		 470 aa  187  4e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.589921  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0355  putative multidrug resistance protein NorM  31.21 
 
 		 471 aa  186  6e-46  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.277827  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0339  multidrug resistance protein NorM, putative  31.21 
 
 		 471 aa  185  1.0000000000000001e-45  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1935  MATE efflux family protein  34.98 
 
 		 460 aa  183  5.0000000000000004e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.18016  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0723  multidrug resistance protein  31.81 
 
 		 454 aa  183  6e-45  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3887  multi anti extrusion protein MatE  33.84 
 
 		 466 aa  181  2e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0845713 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1709  MATE efflux family protein  33.49 
 
 		 470 aa  175  9.999999999999999e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.578822 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0643  MATE efflux family protein  35.07 
 
 		 477 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.26876 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1263  MATE efflux family protein  34.68 
 
 		 467 aa  173  3.9999999999999995e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0813234  normal  0.914064 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6069  multidrug efflux protein NorA  34.17 
 
 		 462 aa  173  5e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1736  MATE efflux family protein  33.02 
 
 		 472 aa  173  6.999999999999999e-42  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.282832  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2346  MATE efflux family protein  30.14 
 
 		 460 aa  171  2e-41  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00458496 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1298  MATE efflux family protein  34.23 
 
 		 467 aa  165  2.0000000000000002e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69890  multidrug efflux protein NorA  33.19 
 
 		 488 aa  164  3e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0664  MATE efflux family protein  34.22 
 
 		 472 aa  164  4.0000000000000004e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.253686 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0255  multidrug efflux protein NorA  33.33 
 
 		 461 aa  163  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3141  MATE efflux family protein  33.72 
 
 		 472 aa  163  7e-39  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.565795  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0260  MATE efflux family protein  31.41 
 
 		 478 aa  163  8.000000000000001e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0454  MATE efflux family protein  33.41 
 
 		 477 aa  162  1e-38  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46680  putative transporter  33.04 
 
 		 477 aa  162  1e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.013844  hitchhiker  0.0000129498 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0697  multi anti extrusion protein MatE  35.01 
 
 		 468 aa  161  2e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.596572  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4023  putative transporter  33.04 
 
 		 477 aa  162  2e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.343891  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0755  MATE efflux family protein  34.07 
 
 		 456 aa  161  2e-38  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0124459  normal  0.621342 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0676  MATE efflux family protein  33.19 
 
 		 472 aa  160  6e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.441843  normal  0.0136882 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1146  multidrug efflux protein  29.16 
 
 		 461 aa  158  2e-37  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.292586  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1699  MATE efflux family protein  32.05 
 
 		 462 aa  157  3e-37  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.4571  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3112  multidrug efflux protein  31.69 
 
 		 465 aa  155  9e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1907  MATE efflux family protein  31.7 
 
 		 457 aa  154  4e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0742597  normal  0.100602 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1019  MATE efflux family protein  35.49 
 
 		 474 aa  154  4e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4308  MATE efflux family protein  35.35 
 
 		 470 aa  152  1e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.462877 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1382  multidrug efflux protein  27.5 
 
 		 460 aa  152  2e-35  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.13512  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1761  MATE efflux family protein  28.19 
 
 		 453 aa  152  2e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.129666  normal  0.0637882 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2025  MATE efflux family protein  29.32 
 
 		 459 aa  150  4e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0331062  normal  0.321717 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2031  MATE efflux family protein  27.7 
 
 		 453 aa  150  5e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003524  multidrug efflux protein NorM  29.61 
 
 		 456 aa  150  5e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2039  MATE efflux family protein  29.32 
 
 		 459 aa  150  5e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.017072  normal  0.0193468 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2295  MATE efflux family protein  29.48 
 
 		 459 aa  149  9e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1951  MATE efflux family protein  29.09 
 
 		 459 aa  149  1.0000000000000001e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000663691  normal  0.290024 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02236  multidrug efflux protein  28.25 
 
 		 456 aa  147  5e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09173  MATE efflux family protein  28.7 
 
 		 457 aa  146  8.000000000000001e-34  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2021  MATE efflux family protein  28.64 
 
 		 459 aa  146  9e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.068877  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2189  multidrug efflux protein  29.72 
 
 		 458 aa  145  2e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00321419  hitchhiker  0.00000631963 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2521  multi anti extrusion protein MatE  33.63 
 
 		 490 aa  145  2e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.200402 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2226  MATE efflux family protein  28.64 
 
 		 459 aa  145  2e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00326481  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2334  MATE efflux family protein  28.41 
 
 		 459 aa  144  2e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0215455  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2268  MATE efflux family protein  27.84 
 
 		 452 aa  144  2e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.012169  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2117  MATE efflux family protein  27.62 
 
 		 458 aa  144  3e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0110658  normal  0.0465778 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2144  MATE efflux family protein  28.41 
 
 		 459 aa  144  3e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00844779  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1702  MATE efflux family protein  28.26 
 
 		 453 aa  144  4e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.125502  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1146  MATE efflux family protein  33.18 
 
 		 469 aa  143  7e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.890459  normal  0.943452 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2494  MATE efflux family protein  27.84 
 
 		 458 aa  142  9e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.121522  hitchhiker  0.0012501 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1783  multidrug efflux protein  28.98 
 
 		 457 aa  142  9.999999999999999e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00383484 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1930  MATE efflux family protein  31.08 
 
 		 460 aa  142  1.9999999999999998e-32  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.135248  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2708  MATE efflux family protein  31.08 
 
 		 467 aa  141  1.9999999999999998e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2180  MATE efflux family protein  28.18 
 
 		 459 aa  141  3e-32  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0347307  hitchhiker  0.00809884 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5262  multidrug efflux protein NorA  32.68 
 
 		 462 aa  140  3e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00407645  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2122  multi anti extrusion protein MatE  33.5 
 
 		 450 aa  140  3e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00000217461  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29880  Multidrug efflux protein  33.41 
 
 		 459 aa  140  4.999999999999999e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.613777  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1680  multidrug efflux protein  28.32 
 
 		 457 aa  140  4.999999999999999e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5933  MATE efflux family protein  32.46 
 
 		 456 aa  140  4.999999999999999e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.650247  normal  0.0243136 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1269  multidrug efflux protein  26.98 
 
 		 453 aa  139  7.999999999999999e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.801506  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4462  MATE efflux family protein  33.87 
 
 		 470 aa  139  7.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1558  multidrug efflux protein  29.85 
 
 		 457 aa  139  8.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.554893  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1918  multidrug efflux protein  29.85 
 
 		 457 aa  139  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.00462926  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1749  multidrug efflux protein  30.28 
 
 		 457 aa  139  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.000000000456858  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1521  multidrug efflux protein  30.28 
 
 		 457 aa  139  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0251273  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1501  multidrug efflux protein  26.85 
 
 		 454 aa  139  2e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1535  multidrug efflux protein  29.85 
 
 		 457 aa  138  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.153308  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2967  MATE efflux family protein  30.83 
 
 		 467 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0284207 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1295  multidrug efflux protein  26.74 
 
 		 453 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0578421  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2675  multidrug efflux protein  28.67 
 
 		 457 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1402  multidrug efflux protein  26.74 
 
 		 453 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1267  multidrug efflux protein  26.74 
 
 		 453 aa  137  4e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1472  multidrug efflux protein  26.74 
 
 		 453 aa  137  4e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3909  multidrug efflux protein  26.98 
 
 		 452 aa  137  5e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2037  MATE efflux family protein  28.05 
 
 		 461 aa  136  7.000000000000001e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.01185  hitchhiker  0.00138183 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0162  MATE efflux family protein  32.33 
 
 		 486 aa  136  9.999999999999999e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2391  multidrug efflux protein  29.13 
 
 		 457 aa  135  9.999999999999999e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.346064  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0811  multidrug efflux protein  27.16 
 
 		 425 aa  136  9.999999999999999e-31  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1225  multidrug efflux pump, NorM, MATE family  28.15 
 
 		 455 aa  134  1.9999999999999998e-30  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000329619  normal  0.0233556 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5517  multidrug efflux protein NorA  31.77 
 
 		 464 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>