More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_0177 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_0177  MATE efflux family protein  100 
 
 		 442 aa  817    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37760  putative efflux protein, MATE family  59.22 
 
 		 446 aa  417  9.999999999999999e-116  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4176  MATE efflux family protein  59.58 
 
 		 460 aa  412  1e-114  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3689  MATE efflux family protein  57.89 
 
 		 470 aa  371  1e-101  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3091  multi anti extrusion protein MatE  48.39 
 
 		 451 aa  363  2e-99  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.170605  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4106  MATE efflux family protein  55.09 
 
 		 458 aa  355  7.999999999999999e-97  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4658  MATE efflux family protein  56.31 
 
 		 459 aa  354  2e-96  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.872929  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3554  MATE efflux family protein  49.19 
 
 		 466 aa  350  2e-95  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3351  MATE efflux family protein  57.27 
 
 		 441 aa  350  3e-95  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.442644  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3880  MATE efflux family protein  55.45 
 
 		 450 aa  344  2e-93  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000073056 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4334  MATE efflux family protein  56.58 
 
 		 437 aa  344  2e-93  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.210816  normal  0.91675 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4839  MATE efflux family protein  48.74 
 
 		 449 aa  343  2.9999999999999997e-93  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2521  MATE efflux family protein  50.12 
 
 		 455 aa  326  4.0000000000000003e-88  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.869508  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02790  putative efflux protein, MATE family  46.42 
 
 		 434 aa  322  8e-87  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9349  MATE efflux family protein  49.09 
 
 		 436 aa  320  1.9999999999999998e-86  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.51395 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21540  putative efflux protein, MATE family  51.77 
 
 		 470 aa  312  7.999999999999999e-84  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1451  MATE efflux family protein  48.41 
 
 		 465 aa  306  7e-82  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.815185 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4943  MATE efflux family protein  50.57 
 
 		 448 aa  305  1.0000000000000001e-81  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1233  Na+-driven multidrug efflux pump  43.78 
 
 		 481 aa  278  1e-73  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0659218  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0074  MATE efflux family protein  36.53 
 
 		 453 aa  257  4e-67  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000286401 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3426  MATE efflux family protein  44.2 
 
 		 434 aa  229  7e-59  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14620  putative efflux protein, MATE family  38.67 
 
 		 438 aa  224  3e-57  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.220591  normal  0.503837 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5830  MATE efflux family protein  35.87 
 
 		 434 aa  188  2e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0799038  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4036  MATE efflux family protein  37.21 
 
 		 439 aa  184  4.0000000000000006e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.192033  normal  0.230529 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2317  MATE efflux family protein  38.06 
 
 		 442 aa  176  6e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.816192  normal  0.0947968 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1452  MATE efflux family protein  38.22 
 
 		 442 aa  172  1e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.087859  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1719  MATE efflux family protein  35.32 
 
 		 441 aa  171  3e-41  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0706811  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2085  MATE efflux family protein  37.42 
 
 		 444 aa  170  5e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0451278  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2131  MATE efflux family protein  37.42 
 
 		 444 aa  170  5e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0258983 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2068  MATE efflux family protein  37.42 
 
 		 444 aa  170  5e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.163332  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2155  MATE efflux family protein  34.48 
 
 		 467 aa  168  2e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.430874  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1334  MATE efflux family protein  39.73 
 
 		 442 aa  162  1e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.433574  normal  0.014892 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1376  MATE efflux family protein  37.11 
 
 		 442 aa  158  2e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.136301 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12851  DNA-damage-inducible protein F dinF  37.76 
 
 		 436 aa  150  6e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000020718  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02855  hypothetical protein  29.17 
 
 		 445 aa  147  3e-34  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2162  MATE efflux family protein  33.42 
 
 		 453 aa  147  5e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3961  MATE efflux family protein  37.89 
 
 		 427 aa  139  1e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4595  MATE efflux family protein  31.49 
 
 		 445 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.122276 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0991  MATE efflux family protein  27.96 
 
 		 475 aa  130  4.0000000000000003e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000156724  normal  0.091152 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4459  DNA-damage-inducible SOS response protein  30.11 
 
 		 454 aa  124  3e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3527  MATE efflux family protein  28.08 
 
 		 436 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0614  MATE efflux family protein  31.59 
 
 		 445 aa  120  7e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0166177 
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_23253  multi antimicrobial extrusion family protein  30.18 
 
 		 492 aa  119  7.999999999999999e-26  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.332151  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0753  MATE efflux family protein  31.11 
 
 		 441 aa  119  9e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.10371 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3692  MATE efflux family protein  27.94 
 
 		 461 aa  119  9e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000025823  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4234  MATE efflux family protein  29.33 
 
 		 447 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0608  MATE efflux family protein  30.98 
 
 		 445 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0569  MATE efflux family protein  31.36 
 
 		 445 aa  117  5e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.163672  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0247  MATE efflux family protein  26.91 
 
 		 447 aa  117  5e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2891  multidrug efflux pump  26.21 
 
 		 443 aa  115  1.0000000000000001e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.466203  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0896  MATE efflux family protein  30.82 
 
 		 460 aa  114  3e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0613531 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0069  MATE efflux family protein  27.59 
 
 		 429 aa  111  2.0000000000000002e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.380329  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4123  MATE efflux family protein  28.77 
 
 		 455 aa  110  4.0000000000000004e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4322  MATE efflux family protein  28.77 
 
 		 455 aa  110  4.0000000000000004e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_31014  MOP(MATE) family transporter: multidrug efflux  30.66 
 
 		 560 aa  110  4.0000000000000004e-23  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00547148  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4191  MATE efflux family protein  28.77 
 
 		 456 aa  110  6e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0144  MATE efflux family protein  28.77 
 
 		 455 aa  110  6e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1069  MATE efflux family protein  28.77 
 
 		 461 aa  110  7.000000000000001e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.279345 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4844  DNA-damage-inducible protein F  29.4 
 
 		 446 aa  108  2e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.8205  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1840  MATE efflux family protein  29.25 
 
 		 458 aa  108  2e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.308247  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1418  MATE efflux family protein  28.95 
 
 		 462 aa  108  2e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4055  MATE efflux family protein  30.6 
 
 		 483 aa  105  1e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0254154 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002151  DNA-damage-inducible protein F  26.74 
 
 		 449 aa  105  2e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.539092  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4617  DNA-damage-inducible protein F  28.22 
 
 		 455 aa  105  2e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0630  multi anti extrusion protein MatE  29.27 
 
 		 449 aa  103  4e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2243  MATE efflux family protein  29.28 
 
 		 468 aa  104  4e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2937  MATE efflux family protein  31.46 
 
 		 451 aa  103  4e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3792  MATE efflux family protein  28.12 
 
 		 456 aa  103  5e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0729  MATE efflux family protein  29.73 
 
 		 449 aa  102  1e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.671906  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0762  MATE efflux family protein  24.94 
 
 		 458 aa  102  1e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0868  MATE efflux family protein  32.55 
 
 		 440 aa  102  1e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0983692  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1292  multi anti extrusion protein MatE  30.77 
 
 		 455 aa  101  3e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.110492 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3802  MATE efflux family protein  28.12 
 
 		 455 aa  101  3e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2237  MATE efflux family protein  29.9 
 
 		 469 aa  100  4e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000615121  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3875  MATE efflux family protein  28.54 
 
 		 456 aa  100  5e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4001  MATE efflux family protein  28.31 
 
 		 455 aa  99.8  9e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1551  MATE efflux family protein  28.99 
 
 		 440 aa  99  2e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.959023  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09280  MATE efflux family protein  23.84 
 
 		 453 aa  97.4  4e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000476954  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4384  multi anti extrusion protein MatE  28.54 
 
 		 446 aa  97.1  5e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4009  MATE efflux family protein  27.27 
 
 		 443 aa  97.4  5e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0794  cation efflux pump, DNA-damage-inducible protein  32.52 
 
 		 434 aa  97.1  5e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00344653 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0110  MATE efflux family protein  23.81 
 
 		 469 aa  97.4  5e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.372068  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1640  DNA-damage-inducible protein F  28.76 
 
 		 436 aa  97.1  6e-19  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1279  DNA-damage-inducible protein F  27.45 
 
 		 472 aa  96.3  9e-19  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.244391  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0575  MATE efflux family protein  27.07 
 
 		 459 aa  95.1  2e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000335028  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05890  putative efflux protein, MATE family  25.82 
 
 		 472 aa  95.5  2e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4619  MATE efflux family protein  29.27 
 
 		 452 aa  94.4  4e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1106  MATE efflux family protein  28.15 
 
 		 472 aa  94.4  4e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.373516  normal  0.414294 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0248  DNA-damage-inducible SOS response protein  28.65 
 
 		 439 aa  94.4  4e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.314498  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0160  MATE efflux family protein  26.77 
 
 		 444 aa  93.6  6e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00266  multidrug efflux pump  26.89 
 
 		 423 aa  93.2  8e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0180  MATE efflux family protein  26.76 
 
 		 445 aa  92.4  1e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4430  DNA-damage-inducible SOS response protein  30.42 
 
 		 441 aa  92  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000533043 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0791  MATE efflux family protein  30.56 
 
 		 451 aa  92  2e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.412838 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4849  MATE efflux family protein  32.72 
 
 		 450 aa  91.7  2e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4495  DNA-damage-inducible SOS response protein  30.42 
 
 		 441 aa  92  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3772  MATE efflux family protein  32.72 
 
 		 450 aa  91.7  2e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4580  DNA-damage-inducible SOS response protein  30.42 
 
 		 441 aa  92  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2306  MATE efflux family protein  22.82 
 
 		 469 aa  92  2e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.30452  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0035  DNA-damage-inducible protein F  25.29 
 
 		 516 aa  90.5  6e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>