More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_1334 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_1334  MATE efflux family protein  100 
 
 		 442 aa  808    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.433574  normal  0.014892 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1376  MATE efflux family protein  93.21 
 
 		 442 aa  673    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.136301 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1452  MATE efflux family protein  66.43 
 
 		 442 aa  478  1e-133  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.087859  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14620  putative efflux protein, MATE family  56.81 
 
 		 438 aa  422  1e-117  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.220591  normal  0.503837 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5830  MATE efflux family protein  59.76 
 
 		 434 aa  415  9.999999999999999e-116  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0799038  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4036  MATE efflux family protein  53.85 
 
 		 439 aa  395  1e-109  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.192033  normal  0.230529 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2085  MATE efflux family protein  55.3 
 
 		 444 aa  385  1e-106  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0451278  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2131  MATE efflux family protein  55.3 
 
 		 444 aa  385  1e-106  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0258983 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2317  MATE efflux family protein  55.41 
 
 		 442 aa  385  1e-106  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.816192  normal  0.0947968 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2068  MATE efflux family protein  55.3 
 
 		 444 aa  385  1e-106  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.163332  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1719  MATE efflux family protein  54.31 
 
 		 441 aa  367  1e-100  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0706811  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2155  MATE efflux family protein  50 
 
 		 467 aa  347  3e-94  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.430874  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12851  DNA-damage-inducible protein F dinF  55.58 
 
 		 436 aa  321  1.9999999999999998e-86  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000020718  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3961  MATE efflux family protein  58.02 
 
 		 427 aa  309  5.9999999999999995e-83  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3426  MATE efflux family protein  45.79 
 
 		 434 aa  256  7e-67  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4943  MATE efflux family protein  42.33 
 
 		 448 aa  224  2e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1451  MATE efflux family protein  39.47 
 
 		 465 aa  214  1.9999999999999998e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.815185 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3554  MATE efflux family protein  39.66 
 
 		 466 aa  209  7e-53  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4658  MATE efflux family protein  44.59 
 
 		 459 aa  206  6e-52  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.872929  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4839  MATE efflux family protein  37.53 
 
 		 449 aa  201  3e-50  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9349  MATE efflux family protein  38.39 
 
 		 436 aa  200  3.9999999999999996e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.51395 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3091  multi anti extrusion protein MatE  39.06 
 
 		 451 aa  197  2.0000000000000003e-49  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.170605  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0177  MATE efflux family protein  40.41 
 
 		 442 aa  198  2.0000000000000003e-49  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1233  Na+-driven multidrug efflux pump  37.34 
 
 		 481 aa  192  1e-47  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0659218  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4176  MATE efflux family protein  40.22 
 
 		 460 aa  189  7e-47  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3351  MATE efflux family protein  37.19 
 
 		 441 aa  187  3e-46  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.442644  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37760  putative efflux protein, MATE family  38.55 
 
 		 446 aa  186  1.0000000000000001e-45  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02790  putative efflux protein, MATE family  38.76 
 
 		 434 aa  183  6e-45  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4334  MATE efflux family protein  41.57 
 
 		 437 aa  182  1e-44  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.210816  normal  0.91675 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3689  MATE efflux family protein  39.86 
 
 		 470 aa  175  9.999999999999999e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0074  MATE efflux family protein  33.59 
 
 		 453 aa  166  5.9999999999999996e-40  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000286401 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2521  MATE efflux family protein  34.95 
 
 		 455 aa  155  9e-37  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.869508  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4106  MATE efflux family protein  37.89 
 
 		 458 aa  154  4e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3880  MATE efflux family protein  37.75 
 
 		 450 aa  145  1e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000073056 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2162  MATE efflux family protein  31.5 
 
 		 453 aa  142  9.999999999999999e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2891  multidrug efflux pump  29.53 
 
 		 443 aa  138  2e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.466203  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002151  DNA-damage-inducible protein F  29.95 
 
 		 449 aa  135  9.999999999999999e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.539092  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4617  DNA-damage-inducible protein F  30.02 
 
 		 455 aa  133  6e-30  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3527  MATE efflux family protein  30.34 
 
 		 436 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21540  putative efflux protein, MATE family  40.24 
 
 		 470 aa  132  1.0000000000000001e-29  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4009  MATE efflux family protein  31.54 
 
 		 443 aa  130  4.0000000000000003e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02855  hypothetical protein  27.98 
 
 		 445 aa  130  6e-29  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0247  MATE efflux family protein  28.54 
 
 		 447 aa  130  6e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0069  MATE efflux family protein  29.72 
 
 		 429 aa  129  1.0000000000000001e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.380329  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3802  MATE efflux family protein  30.32 
 
 		 455 aa  127  3e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0845  MATE efflux family protein  33.26 
 
 		 439 aa  127  4.0000000000000003e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.457545  normal  0.657757 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3501  DNA-damage-inducible protein F  30.68 
 
 		 437 aa  127  5e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00266  multidrug efflux pump  30.36 
 
 		 423 aa  126  7e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3875  MATE efflux family protein  29.87 
 
 		 456 aa  126  8.000000000000001e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4595  MATE efflux family protein  33.72 
 
 		 445 aa  126  1e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.122276 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0180  MATE efflux family protein  32.13 
 
 		 445 aa  126  1e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4001  MATE efflux family protein  29.86 
 
 		 455 aa  124  3e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3792  MATE efflux family protein  29.23 
 
 		 456 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4234  MATE efflux family protein  28.97 
 
 		 447 aa  122  1.9999999999999998e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4191  MATE efflux family protein  29.86 
 
 		 456 aa  121  3e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0144  MATE efflux family protein  29.53 
 
 		 455 aa  120  3e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0160  MATE efflux family protein  31.45 
 
 		 444 aa  120  3.9999999999999996e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4459  DNA-damage-inducible SOS response protein  31.98 
 
 		 454 aa  120  4.9999999999999996e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4322  MATE efflux family protein  29.86 
 
 		 455 aa  120  4.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4123  MATE efflux family protein  29.86 
 
 		 455 aa  120  4.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0107  MATE efflux family protein  29.75 
 
 		 448 aa  119  9e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0630  multi anti extrusion protein MatE  33.26 
 
 		 449 aa  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0753  MATE efflux family protein  31.6 
 
 		 441 aa  118  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.10371 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2863  MATE efflux family protein  33.25 
 
 		 445 aa  118  1.9999999999999998e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.277434  normal  0.247685 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0110  MATE efflux family protein  27.53 
 
 		 469 aa  118  1.9999999999999998e-25  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.372068  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4844  DNA-damage-inducible protein F  31.28 
 
 		 446 aa  116  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.8205  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1551  MATE efflux family protein  30.32 
 
 		 440 aa  115  1.0000000000000001e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.959023  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0614  MATE efflux family protein  33.92 
 
 		 445 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0166177 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2425  DNA-damage-inducible protein F  28.87 
 
 		 454 aa  114  3e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0248  DNA-damage-inducible SOS response protein  32.64 
 
 		 439 aa  114  5e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.314498  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0729  MATE efflux family protein  32.88 
 
 		 449 aa  114  5e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.671906  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0896  MATE efflux family protein  32.62 
 
 		 460 aa  113  7.000000000000001e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0613531 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4384  multi anti extrusion protein MatE  31.66 
 
 		 446 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07070  Multidrug efflux protein, MatE family  34.72 
 
 		 453 aa  112  1.0000000000000001e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.12454  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4632  DNA-damage-inducible SOS response protein  31.98 
 
 		 441 aa  110  4.0000000000000004e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.251658 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0035  DNA-damage-inducible protein F  28.8 
 
 		 516 aa  110  4.0000000000000004e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4581  DNA-damage-inducible SOS response protein  31.98 
 
 		 441 aa  110  4.0000000000000004e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.941537 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4495  DNA-damage-inducible SOS response protein  31.83 
 
 		 441 aa  109  8.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4580  DNA-damage-inducible SOS response protein  31.83 
 
 		 441 aa  109  8.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4430  DNA-damage-inducible SOS response protein  31.83 
 
 		 441 aa  109  8.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000533043 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0879  MATE efflux family protein  32.27 
 
 		 444 aa  108  1e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.696604 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2204  multidrug efflux pump, MATE family  32.41 
 
 		 444 aa  108  3e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.023203  n/a   
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_23253  multi antimicrobial extrusion family protein  29.13 
 
 		 492 aa  107  3e-22  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.332151  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1069  MATE efflux family protein  30.3 
 
 		 461 aa  107  3e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.279345 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63730  putative transporter  33.25 
 
 		 453 aa  107  4e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0352676  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04000  Na(+) driven multidrug efflux pump  28.61 
 
 		 424 aa  107  5e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0061  MATE efflux family protein  30.52 
 
 		 448 aa  107  5e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.871817  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0025  MATE efflux family protein  24.03 
 
 		 433 aa  107  5e-22  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00700816  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3692  MATE efflux family protein  31.06 
 
 		 461 aa  106  8e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000025823  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0569  MATE efflux family protein  32.18 
 
 		 445 aa  105  1e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.163672  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4597  DNA-damage-inducible SOS response protein  32.04 
 
 		 459 aa  105  1e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4284  DNA-damage-inducible SOS response protein  32.04 
 
 		 459 aa  105  2e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03916  DNA-damage-inducible SOS response protein  31.81 
 
 		 459 aa  104  3e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0608  MATE efflux family protein  31.94 
 
 		 445 aa  104  3e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03876  hypothetical protein  31.81 
 
 		 459 aa  104  3e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3984  DNA-damage-inducible SOS response protein  31.81 
 
 		 459 aa  104  3e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.270802 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4506  DNA-damage-inducible SOS response protein  31.79 
 
 		 441 aa  103  4e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2965  MATE efflux family protein  31.28 
 
 		 446 aa  103  5e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0142288 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5540  putative transporter  33.57 
 
 		 453 aa  103  5e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.360996  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4553  DNA-damage-inducible SOS response protein  31.58 
 
 		 459 aa  102  1e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>