More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_1451 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_1451  MATE efflux family protein  100 
 
 		 465 aa  886    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.815185 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4943  MATE efflux family protein  53.7 
 
 		 448 aa  363  4e-99  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4839  MATE efflux family protein  47.87 
 
 		 449 aa  348  1e-94  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4658  MATE efflux family protein  53.55 
 
 		 459 aa  342  1e-92  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.872929  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3554  MATE efflux family protein  48.11 
 
 		 466 aa  339  7e-92  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3091  multi anti extrusion protein MatE  45.07 
 
 		 451 aa  338  9.999999999999999e-92  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.170605  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9349  MATE efflux family protein  50.93 
 
 		 436 aa  337  1.9999999999999998e-91  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.51395 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0177  MATE efflux family protein  48.41 
 
 		 442 aa  337  3.9999999999999995e-91  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37760  putative efflux protein, MATE family  50.81 
 
 		 446 aa  329  6e-89  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4176  MATE efflux family protein  51.85 
 
 		 460 aa  320  3e-86  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3689  MATE efflux family protein  53.09 
 
 		 470 aa  316  5e-85  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4334  MATE efflux family protein  52.06 
 
 		 437 aa  300  4e-80  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.210816  normal  0.91675 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3351  MATE efflux family protein  50.35 
 
 		 441 aa  299  7e-80  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.442644  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4106  MATE efflux family protein  47.15 
 
 		 458 aa  288  2e-76  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3880  MATE efflux family protein  47.35 
 
 		 450 aa  277  2e-73  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000073056 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02790  putative efflux protein, MATE family  43.75 
 
 		 434 aa  269  7e-71  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2521  MATE efflux family protein  45.01 
 
 		 455 aa  269  8e-71  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.869508  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3426  MATE efflux family protein  43.26 
 
 		 434 aa  255  1.0000000000000001e-66  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0074  MATE efflux family protein  36.69 
 
 		 453 aa  252  9.000000000000001e-66  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000286401 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1233  Na+-driven multidrug efflux pump  37.3 
 
 		 481 aa  238  1e-61  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0659218  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14620  putative efflux protein, MATE family  37.79 
 
 		 438 aa  228  1e-58  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.220591  normal  0.503837 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21540  putative efflux protein, MATE family  44.52 
 
 		 470 aa  225  1e-57  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4036  MATE efflux family protein  37.1 
 
 		 439 aa  202  9.999999999999999e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.192033  normal  0.230529 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1452  MATE efflux family protein  39.17 
 
 		 442 aa  200  3.9999999999999996e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.087859  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5830  MATE efflux family protein  36.39 
 
 		 434 aa  198  2.0000000000000003e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0799038  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1334  MATE efflux family protein  40.13 
 
 		 442 aa  197  3e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.433574  normal  0.014892 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1719  MATE efflux family protein  36.19 
 
 		 441 aa  197  5.000000000000001e-49  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0706811  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1376  MATE efflux family protein  40.85 
 
 		 442 aa  193  7e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.136301 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2155  MATE efflux family protein  34.62 
 
 		 467 aa  184  2.0000000000000003e-45  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.430874  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2317  MATE efflux family protein  35.31 
 
 		 442 aa  179  1e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.816192  normal  0.0947968 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2085  MATE efflux family protein  35.7 
 
 		 444 aa  178  2e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0451278  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2131  MATE efflux family protein  35.7 
 
 		 444 aa  178  2e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0258983 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2068  MATE efflux family protein  35.7 
 
 		 444 aa  178  2e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.163332  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3961  MATE efflux family protein  39.85 
 
 		 427 aa  171  2e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2162  MATE efflux family protein  34.04 
 
 		 453 aa  171  4e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12851  DNA-damage-inducible protein F dinF  36.89 
 
 		 436 aa  163  5.0000000000000005e-39  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000020718  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02855  hypothetical protein  27.68 
 
 		 445 aa  133  6e-30  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1069  MATE efflux family protein  31.69 
 
 		 461 aa  132  1.0000000000000001e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.279345 
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_23253  multi antimicrobial extrusion family protein  29.77 
 
 		 492 aa  124  3e-27  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.332151  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2542  MATE efflux family protein  30 
 
 		 459 aa  114  3e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2243  MATE efflux family protein  29.45 
 
 		 468 aa  114  3e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0991  MATE efflux family protein  28.17 
 
 		 475 aa  111  3e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000156724  normal  0.091152 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2291  MATE efflux family protein  27.5 
 
 		 460 aa  110  4.0000000000000004e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_31014  MOP(MATE) family transporter: multidrug efflux  29.51 
 
 		 560 aa  107  6e-22  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00547148  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4055  MATE efflux family protein  29.21 
 
 		 483 aa  102  2e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0254154 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0069  MATE efflux family protein  26.74 
 
 		 429 aa  102  2e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.380329  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4459  DNA-damage-inducible SOS response protein  27.25 
 
 		 454 aa  101  3e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0247  MATE efflux family protein  25.29 
 
 		 447 aa  100  4e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3692  MATE efflux family protein  26.57 
 
 		 461 aa  99.8  9e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000025823  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002151  DNA-damage-inducible protein F  26.02 
 
 		 449 aa  99  2e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.539092  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4234  MATE efflux family protein  26.8 
 
 		 447 aa  98.6  2e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04000  Na(+) driven multidrug efflux pump  26.1 
 
 		 424 aa  98.2  3e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0248  DNA-damage-inducible SOS response protein  28.31 
 
 		 439 aa  98.2  3e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.314498  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3527  MATE efflux family protein  25.17 
 
 		 436 aa  98.2  3e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0753  MATE efflux family protein  28.16 
 
 		 441 aa  97.4  5e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.10371 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0614  MATE efflux family protein  27.36 
 
 		 445 aa  95.5  2e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0166177 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1138  MATE efflux family protein  25.3 
 
 		 450 aa  93.6  6e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000318212  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1851  MATE efflux family protein  24.13 
 
 		 475 aa  93.2  8e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00783953  normal  0.201536 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4191  MATE efflux family protein  27.02 
 
 		 456 aa  92.4  1e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0144  MATE efflux family protein  26.96 
 
 		 455 aa  92.4  1e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1199  MATE efflux family protein  24.36 
 
 		 450 aa  92  2e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0538393  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4123  MATE efflux family protein  27.02 
 
 		 455 aa  92.4  2e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4322  MATE efflux family protein  27.02 
 
 		 455 aa  92.4  2e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3385  MATE efflux family protein  24.01 
 
 		 453 aa  92  2e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2863  MATE efflux family protein  28.37 
 
 		 445 aa  92  2e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.277434  normal  0.247685 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0896  MATE efflux family protein  27.76 
 
 		 460 aa  90.9  5e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0613531 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3792  MATE efflux family protein  25.06 
 
 		 456 aa  90.5  6e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3492  integral membrane protein  25.71 
 
 		 485 aa  90.1  7e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0396785  normal  0.244149 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0608  MATE efflux family protein  28.11 
 
 		 445 aa  90.1  7e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0569  MATE efflux family protein  27.88 
 
 		 445 aa  90.1  8e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.163672  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1551  MATE efflux family protein  25.18 
 
 		 440 aa  89.4  1e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.959023  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0180  MATE efflux family protein  26.62 
 
 		 445 aa  89.7  1e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2306  MATE efflux family protein  23.17 
 
 		 469 aa  89.4  1e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.30452  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2891  multidrug efflux pump  25.07 
 
 		 443 aa  89  2e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.466203  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4384  multi anti extrusion protein MatE  28.35 
 
 		 446 aa  89  2e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2358  MATE efflux family protein  24.31 
 
 		 467 aa  89  2e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2204  multidrug efflux pump, MATE family  30.23 
 
 		 444 aa  88.6  2e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.023203  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0762  MATE efflux family protein  28 
 
 		 458 aa  89  2e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4595  MATE efflux family protein  27.25 
 
 		 445 aa  89  2e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.122276 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0324  putative DNA-damage-inducible protein F  28.09 
 
 		 455 aa  89  2e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.315939  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0403  MATE efflux family protein  27.61 
 
 		 451 aa  88.2  3e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.360287  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3642  multi anti extrusion protein MatE  28.23 
 
 		 496 aa  87.4  5e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.104533  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0035  DNA-damage-inducible protein F  25.62 
 
 		 516 aa  87.4  5e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4580  DNA-damage-inducible SOS response protein  26.77 
 
 		 441 aa  86.7  8e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1840  MATE efflux family protein  27.14 
 
 		 458 aa  86.7  8e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.308247  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4495  DNA-damage-inducible SOS response protein  26.77 
 
 		 441 aa  86.7  8e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4430  DNA-damage-inducible SOS response protein  26.77 
 
 		 441 aa  86.7  8e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000533043 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0879  MATE efflux family protein  30.23 
 
 		 444 aa  86.7  8e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.696604 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4617  DNA-damage-inducible protein F  25.62 
 
 		 455 aa  86.3  0.000000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0110  MATE efflux family protein  23.09 
 
 		 469 aa  85.9  0.000000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.372068  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0061  MATE efflux family protein  28.24 
 
 		 448 aa  86.3  0.000000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.871817  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2504  hypothetical protein  25.61 
 
 		 474 aa  85.9  0.000000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0192343  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0310  DNA-damage-inducible protein F, putative  27.87 
 
 		 455 aa  85.9  0.000000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1694  hypothetical protein  25.61 
 
 		 474 aa  85.9  0.000000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.832751  normal  0.156755 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0404  MATE efflux family protein  25.47 
 
 		 457 aa  84.7  0.000000000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.294226 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0439  MATE efflux family protein  26.4 
 
 		 438 aa  85.1  0.000000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1071  MATE efflux family protein  23.11 
 
 		 475 aa  84.7  0.000000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0025  MATE efflux family protein  24.23 
 
 		 433 aa  85.1  0.000000000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00700816  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2888  MATE efflux family protein  24.87 
 
 		 462 aa  84.3  0.000000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0238453  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00266  multidrug efflux pump  24.88 
 
 		 423 aa  84.3  0.000000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>