More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlut_21540 on replicon NC_012803
Organism: Micrococcus luteus NCTC 2665



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012803  Mlut_21540  putative efflux protein, MATE family  100 
 
 
470 aa  868    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3880  MATE efflux family protein  60.82 
 
 
450 aa  426  1e-118  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000073056 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4106  MATE efflux family protein  59.74 
 
 
458 aa  421  1e-116  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0177  MATE efflux family protein  51.77 
 
 
442 aa  372  1e-101  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37760  putative efflux protein, MATE family  52.1 
 
 
446 aa  339  8e-92  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3351  MATE efflux family protein  54.55 
 
 
441 aa  338  9.999999999999999e-92  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.442644  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4176  MATE efflux family protein  52.35 
 
 
460 aa  336  7e-91  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3554  MATE efflux family protein  46.81 
 
 
466 aa  325  1e-87  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4839  MATE efflux family protein  45.54 
 
 
449 aa  310  2e-83  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2521  MATE efflux family protein  47.78 
 
 
455 aa  310  2.9999999999999997e-83  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.869508  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3689  MATE efflux family protein  52 
 
 
470 aa  309  8e-83  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3091  multi anti extrusion protein MatE  44.83 
 
 
451 aa  306  7e-82  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.170605  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02790  putative efflux protein, MATE family  46.67 
 
 
434 aa  304  2.0000000000000002e-81  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9349  MATE efflux family protein  45.61 
 
 
436 aa  301  2e-80  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.51395 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4658  MATE efflux family protein  49.46 
 
 
459 aa  300  5e-80  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.872929  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4334  MATE efflux family protein  49.57 
 
 
437 aa  282  1e-74  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.210816  normal  0.91675 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1233  Na+-driven multidrug efflux pump  40.65 
 
 
481 aa  270  4e-71  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0659218  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4943  MATE efflux family protein  44.44 
 
 
448 aa  268  1e-70  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1451  MATE efflux family protein  43.97 
 
 
465 aa  259  5.0000000000000005e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.815185 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0074  MATE efflux family protein  38.27 
 
 
453 aa  247  3e-64  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000286401 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14620  putative efflux protein, MATE family  42.01 
 
 
438 aa  241  2e-62  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.220591  normal  0.503837 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3426  MATE efflux family protein  40.84 
 
 
434 aa  218  2e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5830  MATE efflux family protein  39.61 
 
 
434 aa  207  4e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0799038  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1719  MATE efflux family protein  39.39 
 
 
441 aa  206  8e-52  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0706811  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2085  MATE efflux family protein  39.69 
 
 
444 aa  203  4e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0451278  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2131  MATE efflux family protein  39.69 
 
 
444 aa  203  4e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0258983 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2068  MATE efflux family protein  39.69 
 
 
444 aa  203  4e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.163332  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4036  MATE efflux family protein  37.8 
 
 
439 aa  201  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.192033  normal  0.230529 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2317  MATE efflux family protein  38.04 
 
 
442 aa  192  9e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.816192  normal  0.0947968 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1452  MATE efflux family protein  39.8 
 
 
442 aa  187  4e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.087859  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3961  MATE efflux family protein  45.74 
 
 
427 aa  179  1e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12851  DNA-damage-inducible protein F dinF  37.97 
 
 
436 aa  171  2e-41  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000020718  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1376  MATE efflux family protein  41.44 
 
 
442 aa  168  2e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.136301 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2155  MATE efflux family protein  34.16 
 
 
467 aa  160  3e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.430874  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1334  MATE efflux family protein  40.24 
 
 
442 aa  155  1e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.433574  normal  0.014892 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2162  MATE efflux family protein  33.64 
 
 
453 aa  148  3e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4595  MATE efflux family protein  34.29 
 
 
445 aa  144  2e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.122276 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2863  MATE efflux family protein  34.31 
 
 
445 aa  144  5e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.277434  normal  0.247685 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0614  MATE efflux family protein  31.97 
 
 
445 aa  127  3e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0166177 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0608  MATE efflux family protein  32.25 
 
 
445 aa  127  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_23253  multi antimicrobial extrusion family protein  33.5 
 
 
492 aa  127  4.0000000000000003e-28  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.332151  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0569  MATE efflux family protein  32.18 
 
 
445 aa  127  5e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.163672  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4055  MATE efflux family protein  32.24 
 
 
483 aa  126  7e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0254154 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2243  MATE efflux family protein  32.47 
 
 
468 aa  124  5e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1551  MATE efflux family protein  30.26 
 
 
440 aa  122  1.9999999999999998e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.959023  normal 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_31014  MOP(MATE) family transporter: multidrug efflux  31.94 
 
 
560 aa  121  1.9999999999999998e-26  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00547148  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2891  multidrug efflux pump  25.81 
 
 
443 aa  120  7e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.466203  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0845  MATE efflux family protein  34.68 
 
 
439 aa  118  3e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.457545  normal  0.657757 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4844  DNA-damage-inducible protein F  31.39 
 
 
446 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.8205  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4384  multi anti extrusion protein MatE  32.9 
 
 
446 aa  116  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02855  hypothetical protein  26.95 
 
 
445 aa  113  8.000000000000001e-24  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3692  MATE efflux family protein  27.9 
 
 
461 aa  112  1.0000000000000001e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000025823  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2237  MATE efflux family protein  30.08 
 
 
469 aa  109  8.000000000000001e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000615121  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4619  MATE efflux family protein  30.6 
 
 
452 aa  107  3e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0247  MATE efflux family protein  27.02 
 
 
447 aa  108  3e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0753  MATE efflux family protein  31.33 
 
 
441 aa  107  7e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.10371 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2306  MATE efflux family protein  27.07 
 
 
469 aa  106  8e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.30452  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0035  DNA-damage-inducible protein F  29.07 
 
 
516 aa  106  1e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0762  MATE efflux family protein  27.17 
 
 
458 aa  105  1e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1640  DNA-damage-inducible protein F  30.24 
 
 
436 aa  105  2e-21  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2204  multidrug efflux pump, MATE family  32.84 
 
 
444 aa  105  2e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.023203  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4322  MATE efflux family protein  31.46 
 
 
455 aa  105  2e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0791  MATE efflux family protein  32.28 
 
 
451 aa  105  2e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.412838 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4123  MATE efflux family protein  31.46 
 
 
455 aa  105  2e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0729  MATE efflux family protein  29.87 
 
 
449 aa  105  2e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.671906  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0879  MATE efflux family protein  33.67 
 
 
444 aa  104  3e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.696604 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0144  MATE efflux family protein  31.46 
 
 
455 aa  104  3e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1069  MATE efflux family protein  31.08 
 
 
461 aa  103  5e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.279345 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4191  MATE efflux family protein  31.46 
 
 
456 aa  102  1e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002151  DNA-damage-inducible protein F  26.65 
 
 
449 aa  102  2e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.539092  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0111  MATE efflux family protein  23.95 
 
 
464 aa  102  2e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0113  MATE efflux family protein  23.95 
 
 
464 aa  101  3e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2965  MATE efflux family protein  29.93 
 
 
446 aa  101  3e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0142288 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0991  MATE efflux family protein  26.72 
 
 
475 aa  100  4e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000156724  normal  0.091152 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0160  MATE efflux family protein  30.61 
 
 
456 aa  100  5e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.538946 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3501  DNA-damage-inducible protein F  29.2 
 
 
437 aa  100  6e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3527  MATE efflux family protein  27.79 
 
 
436 aa  100  7e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2291  MATE efflux family protein  27.63 
 
 
460 aa  99.8  8e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0630  multi anti extrusion protein MatE  29.69 
 
 
449 aa  98.6  2e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0439  MATE efflux family protein  30.42 
 
 
438 aa  99  2e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3802  MATE efflux family protein  30.83 
 
 
455 aa  96.3  1e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3875  MATE efflux family protein  30.83 
 
 
456 aa  96.3  1e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0069  MATE efflux family protein  28.19 
 
 
429 aa  95.1  2e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.380329  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4617  DNA-damage-inducible protein F  30.69 
 
 
455 aa  95.1  2e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3792  MATE efflux family protein  30.77 
 
 
456 aa  95.1  2e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0896  MATE efflux family protein  29.95 
 
 
460 aa  95.5  2e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0613531 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0110  MATE efflux family protein  24.03 
 
 
469 aa  95.1  2e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.372068  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0160  MATE efflux family protein  29.47 
 
 
444 aa  94.7  3e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0868  MATE efflux family protein  30.24 
 
 
440 aa  94.4  5e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0983692  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6251  MATE efflux family protein  28.05 
 
 
461 aa  93.6  8e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0591  MATE efflux family protein  25.13 
 
 
438 aa  91.3  4e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4234  MATE efflux family protein  26.49 
 
 
447 aa  90.9  4e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4459  DNA-damage-inducible SOS response protein  27.83 
 
 
454 aa  89.7  1e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_35587  hypothetical protein  28.13 
 
 
561 aa  89.4  1e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.713211  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4009  MATE efflux family protein  28.87 
 
 
443 aa  89  2e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1851  MATE efflux family protein  23.7 
 
 
475 aa  87.4  4e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00783953  normal  0.201536 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1071  MATE efflux family protein  23.62 
 
 
475 aa  87.4  5e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0575  MATE efflux family protein  29.69 
 
 
459 aa  87.4  5e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000335028  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1418  MATE efflux family protein  27.83 
 
 
462 aa  87  6e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1277  MATE efflux family protein  24.82 
 
 
480 aa  86.7  7e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>