More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_1452 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_1452  MATE efflux family protein  100 
 
 		 442 aa  827    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.087859  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1334  MATE efflux family protein  66.06 
 
 		 442 aa  470  1.0000000000000001e-131  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.433574  normal  0.014892 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1376  MATE efflux family protein  65.68 
 
 		 442 aa  457  1e-127  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.136301 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14620  putative efflux protein, MATE family  56.09 
 
 		 438 aa  429  1e-119  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.220591  normal  0.503837 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5830  MATE efflux family protein  57.65 
 
 		 434 aa  416  9.999999999999999e-116  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0799038  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1719  MATE efflux family protein  52.42 
 
 		 441 aa  375  1e-103  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0706811  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4036  MATE efflux family protein  52.07 
 
 		 439 aa  376  1e-103  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.192033  normal  0.230529 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2155  MATE efflux family protein  50.33 
 
 		 467 aa  368  1e-100  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.430874  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2085  MATE efflux family protein  52.87 
 
 		 444 aa  357  1.9999999999999998e-97  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0451278  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2131  MATE efflux family protein  52.87 
 
 		 444 aa  357  1.9999999999999998e-97  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0258983 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2068  MATE efflux family protein  52.87 
 
 		 444 aa  357  1.9999999999999998e-97  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.163332  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2317  MATE efflux family protein  52.06 
 
 		 442 aa  356  5e-97  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.816192  normal  0.0947968 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3961  MATE efflux family protein  54.7 
 
 		 427 aa  328  2.0000000000000001e-88  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12851  DNA-damage-inducible protein F dinF  52.68 
 
 		 436 aa  316  5e-85  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000020718  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3426  MATE efflux family protein  43.4 
 
 		 434 aa  244  3e-63  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3554  MATE efflux family protein  38.8 
 
 		 466 aa  226  9e-58  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4943  MATE efflux family protein  39.64 
 
 		 448 aa  221  3e-56  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4839  MATE efflux family protein  37.24 
 
 		 449 aa  218  1e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9349  MATE efflux family protein  38.62 
 
 		 436 aa  214  2.9999999999999995e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.51395 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1451  MATE efflux family protein  38.37 
 
 		 465 aa  214  3.9999999999999995e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.815185 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4658  MATE efflux family protein  40.37 
 
 		 459 aa  209  5e-53  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.872929  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3091  multi anti extrusion protein MatE  36.34 
 
 		 451 aa  200  3.9999999999999996e-50  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.170605  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3351  MATE efflux family protein  37.96 
 
 		 441 aa  196  6e-49  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.442644  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37760  putative efflux protein, MATE family  38.8 
 
 		 446 aa  196  9e-49  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0177  MATE efflux family protein  38.22 
 
 		 442 aa  192  1e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3689  MATE efflux family protein  39.32 
 
 		 470 aa  184  4.0000000000000006e-45  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4176  MATE efflux family protein  38.24 
 
 		 460 aa  181  2.9999999999999997e-44  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1233  Na+-driven multidrug efflux pump  37.35 
 
 		 481 aa  176  8e-43  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0659218  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0074  MATE efflux family protein  32.56 
 
 		 453 aa  174  3.9999999999999995e-42  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000286401 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4106  MATE efflux family protein  38.74 
 
 		 458 aa  169  1e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02790  putative efflux protein, MATE family  34.4 
 
 		 434 aa  167  4e-40  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4334  MATE efflux family protein  37.18 
 
 		 437 aa  162  1e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.210816  normal  0.91675 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3880  MATE efflux family protein  39.12 
 
 		 450 aa  161  2e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000073056 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21540  putative efflux protein, MATE family  37.12 
 
 		 470 aa  148  2.0000000000000003e-34  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2162  MATE efflux family protein  31.6 
 
 		 453 aa  144  3e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2891  multidrug efflux pump  29.3 
 
 		 443 aa  144  3e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.466203  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2521  MATE efflux family protein  35.68 
 
 		 455 aa  139  1e-31  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.869508  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002151  DNA-damage-inducible protein F  30.02 
 
 		 449 aa  138  2e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.539092  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0247  MATE efflux family protein  29.75 
 
 		 447 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3527  MATE efflux family protein  31.34 
 
 		 436 aa  134  5e-30  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02855  hypothetical protein  27.44 
 
 		 445 aa  129  1.0000000000000001e-28  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_23253  multi antimicrobial extrusion family protein  32.16 
 
 		 492 aa  125  2e-27  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.332151  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4459  DNA-damage-inducible SOS response protein  33.03 
 
 		 454 aa  125  2e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4595  MATE efflux family protein  31.6 
 
 		 445 aa  124  3e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.122276 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4617  DNA-damage-inducible protein F  29.78 
 
 		 455 aa  124  4e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00266  multidrug efflux pump  29.93 
 
 		 423 aa  124  4e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2965  MATE efflux family protein  30.37 
 
 		 446 aa  122  9e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0142288 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0110  MATE efflux family protein  25.05 
 
 		 469 aa  122  9e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.372068  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4009  MATE efflux family protein  29.07 
 
 		 443 aa  122  1.9999999999999998e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0035  DNA-damage-inducible protein F  27.91 
 
 		 516 aa  118  1.9999999999999998e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0069  MATE efflux family protein  31.21 
 
 		 429 aa  118  1.9999999999999998e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.380329  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0845  MATE efflux family protein  29.35 
 
 		 439 aa  117  3.9999999999999997e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.457545  normal  0.657757 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4632  DNA-damage-inducible SOS response protein  31.89 
 
 		 441 aa  117  3.9999999999999997e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.251658 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4581  DNA-damage-inducible SOS response protein  31.89 
 
 		 441 aa  117  3.9999999999999997e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.941537 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1551  MATE efflux family protein  28.75 
 
 		 440 aa  116  8.999999999999998e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.959023  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0248  DNA-damage-inducible SOS response protein  34.13 
 
 		 439 aa  115  1.0000000000000001e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.314498  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4430  DNA-damage-inducible SOS response protein  31.89 
 
 		 441 aa  115  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000533043 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4580  DNA-damage-inducible SOS response protein  31.89 
 
 		 441 aa  115  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4495  DNA-damage-inducible SOS response protein  31.89 
 
 		 441 aa  115  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0614  MATE efflux family protein  31.66 
 
 		 445 aa  114  3e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0166177 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4597  DNA-damage-inducible SOS response protein  32.34 
 
 		 459 aa  114  3e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4234  MATE efflux family protein  29.14 
 
 		 447 aa  114  3e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3802  MATE efflux family protein  29.95 
 
 		 455 aa  114  3e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0879  MATE efflux family protein  30.25 
 
 		 444 aa  114  3e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.696604 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0144  MATE efflux family protein  29.13 
 
 		 455 aa  114  3e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0061  MATE efflux family protein  31.37 
 
 		 448 aa  114  4.0000000000000004e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.871817  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4322  MATE efflux family protein  29.13 
 
 		 455 aa  114  5e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4123  MATE efflux family protein  29.13 
 
 		 455 aa  114  5e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3792  MATE efflux family protein  28.17 
 
 		 456 aa  113  5e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03916  DNA-damage-inducible SOS response protein  32.11 
 
 		 459 aa  113  8.000000000000001e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03876  hypothetical protein  32.11 
 
 		 459 aa  113  8.000000000000001e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3984  DNA-damage-inducible SOS response protein  32.11 
 
 		 459 aa  113  8.000000000000001e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.270802 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3875  MATE efflux family protein  29.76 
 
 		 456 aa  113  8.000000000000001e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5525  DNA-damage-inducible SOS response protein  32.11 
 
 		 441 aa  113  9e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.580203  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4284  DNA-damage-inducible SOS response protein  32.11 
 
 		 459 aa  112  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3501  DNA-damage-inducible protein F  29.36 
 
 		 437 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2863  MATE efflux family protein  30.71 
 
 		 445 aa  111  2.0000000000000002e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.277434  normal  0.247685 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4553  DNA-damage-inducible SOS response protein  31.88 
 
 		 459 aa  111  3e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4506  DNA-damage-inducible SOS response protein  31.88 
 
 		 441 aa  111  3e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0107  MATE efflux family protein  28.25 
 
 		 448 aa  110  4.0000000000000004e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4191  MATE efflux family protein  28.9 
 
 		 456 aa  110  5e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3949  MATE efflux family protein  31.65 
 
 		 441 aa  110  6e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2204  multidrug efflux pump, MATE family  30.17 
 
 		 444 aa  109  1e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.023203  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4001  MATE efflux family protein  29.76 
 
 		 455 aa  108  2e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63730  putative transporter  32.19 
 
 		 453 aa  107  3e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0352676  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0160  MATE efflux family protein  29.43 
 
 		 444 aa  107  5e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1069  MATE efflux family protein  31.09 
 
 		 461 aa  107  5e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.279345 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07070  Multidrug efflux protein, MatE family  30.5 
 
 		 453 aa  105  1e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.12454  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_31014  MOP(MATE) family transporter: multidrug efflux  31.22 
 
 		 560 aa  103  5e-21  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00547148  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0180  MATE efflux family protein  29.59 
 
 		 445 aa  103  6e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0569  MATE efflux family protein  31.69 
 
 		 445 aa  103  8e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.163672  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2425  DNA-damage-inducible protein F  27.59 
 
 		 454 aa  102  1e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0608  MATE efflux family protein  31.46 
 
 		 445 aa  102  1e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0160  MATE efflux family protein  30.98 
 
 		 456 aa  102  2e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.538946 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0729  MATE efflux family protein  31.92 
 
 		 449 aa  100  4e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.671906  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3772  MATE efflux family protein  32.27 
 
 		 450 aa  100  5e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4849  MATE efflux family protein  32.27 
 
 		 450 aa  100  5e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1353  MATE efflux family protein  24.06 
 
 		 453 aa  99.4  1e-19  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5540  putative transporter  31.05 
 
 		 453 aa  98.6  2e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.360996  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2937  MATE efflux family protein  31.54 
 
 		 451 aa  99  2e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>