More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_4839 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_4839  MATE efflux family protein  100 
 
 		 449 aa  857    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3091  multi anti extrusion protein MatE  68 
 
 		 451 aa  581  1e-164  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.170605  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3554  MATE efflux family protein  56.09 
 
 		 466 aa  423  1e-117  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4943  MATE efflux family protein  60.23 
 
 		 448 aa  424  1e-117  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9349  MATE efflux family protein  56.32 
 
 		 436 aa  406  1.0000000000000001e-112  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.51395 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0177  MATE efflux family protein  48.74 
 
 		 442 aa  343  2.9999999999999997e-93  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37760  putative efflux protein, MATE family  50.23 
 
 		 446 aa  338  1.9999999999999998e-91  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4176  MATE efflux family protein  49.54 
 
 		 460 aa  327  3e-88  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4658  MATE efflux family protein  50.45 
 
 		 459 aa  320  1.9999999999999998e-86  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.872929  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1451  MATE efflux family protein  46.98 
 
 		 465 aa  314  1.9999999999999998e-84  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.815185 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3689  MATE efflux family protein  49.07 
 
 		 470 aa  304  2.0000000000000002e-81  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4334  MATE efflux family protein  50.23 
 
 		 437 aa  302  9e-81  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.210816  normal  0.91675 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3351  MATE efflux family protein  50 
 
 		 441 aa  291  2e-77  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.442644  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4106  MATE efflux family protein  46.45 
 
 		 458 aa  280  3e-74  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3880  MATE efflux family protein  44.1 
 
 		 450 aa  268  1e-70  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000073056 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02790  putative efflux protein, MATE family  43.52 
 
 		 434 aa  268  2e-70  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2521  MATE efflux family protein  43.49 
 
 		 455 aa  257  2e-67  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.869508  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21540  putative efflux protein, MATE family  45.54 
 
 		 470 aa  255  1.0000000000000001e-66  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1233  Na+-driven multidrug efflux pump  39.42 
 
 		 481 aa  254  3e-66  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0659218  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3426  MATE efflux family protein  41.22 
 
 		 434 aa  230  4e-59  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0074  MATE efflux family protein  36.97 
 
 		 453 aa  230  4e-59  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000286401 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14620  putative efflux protein, MATE family  37.42 
 
 		 438 aa  228  2e-58  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.220591  normal  0.503837 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5830  MATE efflux family protein  37.83 
 
 		 434 aa  206  7e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0799038  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4036  MATE efflux family protein  36.71 
 
 		 439 aa  198  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.192033  normal  0.230529 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1719  MATE efflux family protein  34.55 
 
 		 441 aa  194  2e-48  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0706811  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1452  MATE efflux family protein  37.24 
 
 		 442 aa  192  7e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.087859  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2155  MATE efflux family protein  35.11 
 
 		 467 aa  181  2.9999999999999997e-44  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.430874  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2085  MATE efflux family protein  37.5 
 
 		 444 aa  172  7.999999999999999e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0451278  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2131  MATE efflux family protein  37.5 
 
 		 444 aa  172  7.999999999999999e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0258983 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2068  MATE efflux family protein  37.5 
 
 		 444 aa  172  7.999999999999999e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.163332  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1376  MATE efflux family protein  37.64 
 
 		 442 aa  170  4e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.136301 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1334  MATE efflux family protein  38.82 
 
 		 442 aa  165  1.0000000000000001e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.433574  normal  0.014892 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3961  MATE efflux family protein  40.44 
 
 		 427 aa  165  1.0000000000000001e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2317  MATE efflux family protein  35.7 
 
 		 442 aa  164  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.816192  normal  0.0947968 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12851  DNA-damage-inducible protein F dinF  36.73 
 
 		 436 aa  162  1e-38  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000020718  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02855  hypothetical protein  27.75 
 
 		 445 aa  152  2e-35  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2162  MATE efflux family protein  31.69 
 
 		 453 aa  148  2.0000000000000003e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0247  MATE efflux family protein  26.26 
 
 		 447 aa  130  5.0000000000000004e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4595  MATE efflux family protein  31.21 
 
 		 445 aa  130  6e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.122276 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3527  MATE efflux family protein  27.4 
 
 		 436 aa  126  7e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0569  MATE efflux family protein  31.18 
 
 		 445 aa  125  2e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.163672  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0991  MATE efflux family protein  26.15 
 
 		 475 aa  125  2e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000156724  normal  0.091152 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09280  MATE efflux family protein  25.85 
 
 		 453 aa  124  3e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000476954  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0608  MATE efflux family protein  30.96 
 
 		 445 aa  124  5e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_31014  MOP(MATE) family transporter: multidrug efflux  30.69 
 
 		 560 aa  123  8e-27  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00547148  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1840  MATE efflux family protein  32.63 
 
 		 458 aa  122  9.999999999999999e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.308247  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0180  MATE efflux family protein  28.7 
 
 		 445 aa  121  3e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3792  MATE efflux family protein  28.95 
 
 		 456 aa  120  3.9999999999999996e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0614  MATE efflux family protein  30.82 
 
 		 445 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0166177 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4123  MATE efflux family protein  28.7 
 
 		 455 aa  120  6e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4322  MATE efflux family protein  28.7 
 
 		 455 aa  120  6e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0144  MATE efflux family protein  28.7 
 
 		 455 aa  120  6e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0110  MATE efflux family protein  25 
 
 		 469 aa  119  9.999999999999999e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.372068  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4191  MATE efflux family protein  29.1 
 
 		 456 aa  117  5e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4009  MATE efflux family protein  28.18 
 
 		 443 aa  116  7.999999999999999e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4384  multi anti extrusion protein MatE  30.49 
 
 		 446 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_23253  multi antimicrobial extrusion family protein  28.61 
 
 		 492 aa  113  6e-24  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.332151  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4844  DNA-damage-inducible protein F  31.1 
 
 		 446 aa  113  9e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.8205  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0035  DNA-damage-inducible protein F  27.79 
 
 		 516 aa  112  2.0000000000000002e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1069  MATE efflux family protein  27.54 
 
 		 461 aa  112  2.0000000000000002e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.279345 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0160  MATE efflux family protein  27.52 
 
 		 444 aa  112  2.0000000000000002e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4617  DNA-damage-inducible protein F  28.12 
 
 		 455 aa  111  3e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1640  DNA-damage-inducible protein F  27.76 
 
 		 436 aa  109  9.000000000000001e-23  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4619  MATE efflux family protein  29.85 
 
 		 452 aa  109  1e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0896  MATE efflux family protein  28.31 
 
 		 460 aa  108  3e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0613531 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1551  MATE efflux family protein  28.07 
 
 		 440 aa  108  3e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.959023  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0107  MATE efflux family protein  29.36 
 
 		 448 aa  108  3e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2306  MATE efflux family protein  25.21 
 
 		 469 aa  107  5e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.30452  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0868  MATE efflux family protein  32 
 
 		 440 aa  105  2e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0983692  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2965  MATE efflux family protein  29.02 
 
 		 446 aa  104  3e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0142288 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1418  MATE efflux family protein  29.56 
 
 		 462 aa  104  3e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3692  MATE efflux family protein  26.22 
 
 		 461 aa  104  4e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000025823  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0729  MATE efflux family protein  30.92 
 
 		 449 aa  103  5e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.671906  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002151  DNA-damage-inducible protein F  25.92 
 
 		 449 aa  103  6e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.539092  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0931  MATE efflux family protein  26.46 
 
 		 448 aa  102  1e-20  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.102954  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0791  MATE efflux family protein  30.56 
 
 		 451 aa  102  1e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.412838 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0845  MATE efflux family protein  29.75 
 
 		 439 aa  102  1e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.457545  normal  0.657757 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2243  MATE efflux family protein  28.9 
 
 		 468 aa  102  2e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0630  multi anti extrusion protein MatE  29.96 
 
 		 449 aa  101  3e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2891  multidrug efflux pump  26.25 
 
 		 443 aa  100  4e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.466203  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0324  putative DNA-damage-inducible protein F  28.79 
 
 		 455 aa  100  5e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.315939  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4055  MATE efflux family protein  28.5 
 
 		 483 aa  99.8  9e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0254154 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2237  MATE efflux family protein  28.04 
 
 		 469 aa  99.4  1e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000615121  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4459  DNA-damage-inducible SOS response protein  30.49 
 
 		 454 aa  99.4  1e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1507  DNA-damage-inducible protein F  31.16 
 
 		 463 aa  98.2  2e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.208132  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2295  MATE efflux family protein  24.11 
 
 		 475 aa  98.2  2e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00026572  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3802  MATE efflux family protein  27.46 
 
 		 455 aa  98.2  3e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1536  DNA-damage-inducible protein  31.16 
 
 		 463 aa  97.8  3e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.65109  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0596  DNA-damage-inducible protein  31.16 
 
 		 463 aa  97.4  4e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0179694  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0061  MATE efflux family protein  27.83 
 
 		 448 aa  97.4  5e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.871817  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0743  MATE efflux family protein  24.6 
 
 		 454 aa  97.1  6e-19  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000193663  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0310  DNA-damage-inducible protein F, putative  28.57 
 
 		 455 aa  97.1  6e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07070  Multidrug efflux protein, MatE family  30.08 
 
 		 453 aa  96.7  8e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.12454  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1531  hypothetical protein  27.91 
 
 		 478 aa  95.9  1e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3875  MATE efflux family protein  27.23 
 
 		 456 aa  95.5  2e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0762  MATE efflux family protein  25.6 
 
 		 458 aa  95.1  2e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1851  MATE efflux family protein  23.1 
 
 		 475 aa  93.6  7e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00783953  normal  0.201536 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3276  MATE efflux family protein  26.95 
 
 		 457 aa  93.2  9e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000381455  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3815  MATE efflux family protein  27.49 
 
 		 467 aa  92.4  1e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.142559  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2542  MATE efflux family protein  28.22 
 
 		 459 aa  92.8  1e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>