More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_02855 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014230  CA2559_02855  hypothetical protein  100 
 
 		 445 aa  873    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3554  MATE efflux family protein  29.58 
 
 		 466 aa  171  3e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9349  MATE efflux family protein  25.84 
 
 		 436 aa  152  1e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.51395 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4839  MATE efflux family protein  27.75 
 
 		 449 aa  150  3e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0177  MATE efflux family protein  29.4 
 
 		 442 aa  150  5e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14620  putative efflux protein, MATE family  26.1 
 
 		 438 aa  147  3e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.220591  normal  0.503837 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3426  MATE efflux family protein  28.33 
 
 		 434 aa  142  9.999999999999999e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2891  multidrug efflux pump  27.75 
 
 		 443 aa  141  1.9999999999999998e-32  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.466203  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3091  multi anti extrusion protein MatE  26.47 
 
 		 451 aa  139  8.999999999999999e-32  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.170605  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002151  DNA-damage-inducible protein F  26.59 
 
 		 449 aa  133  5e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.539092  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1719  MATE efflux family protein  26.53 
 
 		 441 aa  131  2.0000000000000002e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0706811  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0025  MATE efflux family protein  25.4 
 
 		 433 aa  132  2.0000000000000002e-29  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00700816  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0160  MATE efflux family protein  28.11 
 
 		 444 aa  130  4.0000000000000003e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2162  MATE efflux family protein  27.68 
 
 		 453 aa  130  6e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0753  MATE efflux family protein  25.75 
 
 		 441 aa  129  9.000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.10371 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4943  MATE efflux family protein  27.38 
 
 		 448 aa  128  2.0000000000000002e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4036  MATE efflux family protein  27.27 
 
 		 439 aa  127  3e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.192033  normal  0.230529 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0180  MATE efflux family protein  27.19 
 
 		 445 aa  126  7e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0247  MATE efflux family protein  26.22 
 
 		 447 aa  126  8.000000000000001e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5830  MATE efflux family protein  26.18 
 
 		 434 aa  126  1e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0799038  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3527  MATE efflux family protein  27.77 
 
 		 436 aa  125  1e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0035  DNA-damage-inducible protein F  25.35 
 
 		 516 aa  125  2e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4322  MATE efflux family protein  27.08 
 
 		 455 aa  124  4e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4123  MATE efflux family protein  27.08 
 
 		 455 aa  124  4e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0144  MATE efflux family protein  27.08 
 
 		 455 aa  124  5e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0110  MATE efflux family protein  28.32 
 
 		 469 aa  122  9.999999999999999e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.372068  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1069  MATE efflux family protein  27.72 
 
 		 461 aa  122  9.999999999999999e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.279345 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3961  MATE efflux family protein  29.68 
 
 		 427 aa  122  1.9999999999999998e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4191  MATE efflux family protein  27.02 
 
 		 456 aa  120  3.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02790  putative efflux protein, MATE family  26.04 
 
 		 434 aa  120  6e-26  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0845  MATE efflux family protein  26.96 
 
 		 439 aa  120  7e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.457545  normal  0.657757 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00266  multidrug efflux pump  26 
 
 		 423 aa  120  7e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0107  MATE efflux family protein  28.38 
 
 		 448 aa  120  7e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1640  DNA-damage-inducible protein F  24.03 
 
 		 436 aa  118  1.9999999999999998e-25  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4617  DNA-damage-inducible protein F  26.47 
 
 		 455 aa  118  1.9999999999999998e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3501  DNA-damage-inducible protein F  25.12 
 
 		 437 aa  119  1.9999999999999998e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3875  MATE efflux family protein  26.26 
 
 		 456 aa  117  3e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2085  MATE efflux family protein  28.47 
 
 		 444 aa  117  5e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0451278  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2131  MATE efflux family protein  28.47 
 
 		 444 aa  117  5e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0258983 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2068  MATE efflux family protein  28.47 
 
 		 444 aa  117  5e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.163332  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3792  MATE efflux family protein  25.97 
 
 		 456 aa  117  5e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2425  DNA-damage-inducible protein F  26.48 
 
 		 454 aa  116  6.9999999999999995e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1452  MATE efflux family protein  26.9 
 
 		 442 aa  116  7.999999999999999e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.087859  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4009  MATE efflux family protein  26.21 
 
 		 443 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3613  MATE efflux family protein  29.87 
 
 		 477 aa  115  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.214192  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2494  MATE efflux family protein  29.87 
 
 		 477 aa  115  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3802  MATE efflux family protein  25.8 
 
 		 455 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4001  MATE efflux family protein  25.97 
 
 		 455 aa  114  3e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2317  MATE efflux family protein  27.9 
 
 		 442 aa  114  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.816192  normal  0.0947968 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1451  MATE efflux family protein  27.34 
 
 		 465 aa  113  7.000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.815185 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2155  MATE efflux family protein  25.61 
 
 		 467 aa  113  7.000000000000001e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.430874  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1551  MATE efflux family protein  27.7 
 
 		 440 aa  111  2.0000000000000002e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.959023  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0729  MATE efflux family protein  25.87 
 
 		 449 aa  110  6e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.671906  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0074  MATE efflux family protein  27.34 
 
 		 453 aa  110  6e-23  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000286401 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1376  MATE efflux family protein  26.79 
 
 		 442 aa  110  6e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.136301 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3351  MATE efflux family protein  27 
 
 		 441 aa  107  5e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.442644  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1334  MATE efflux family protein  28.19 
 
 		 442 aa  106  7e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.433574  normal  0.014892 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37760  putative efflux protein, MATE family  26.64 
 
 		 446 aa  105  2e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4234  MATE efflux family protein  24.88 
 
 		 447 aa  105  2e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4658  MATE efflux family protein  29 
 
 		 459 aa  103  6e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.872929  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4459  DNA-damage-inducible SOS response protein  25.99 
 
 		 454 aa  103  7e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3880  MATE efflux family protein  28.12 
 
 		 450 aa  102  1e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000073056 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2863  MATE efflux family protein  25.47 
 
 		 445 aa  101  2e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.277434  normal  0.247685 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09280  MATE efflux family protein  25.78 
 
 		 453 aa  102  2e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000476954  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0061  MATE efflux family protein  24.94 
 
 		 448 aa  101  3e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.871817  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2237  MATE efflux family protein  24.44 
 
 		 469 aa  100  4e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000615121  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4595  MATE efflux family protein  24.29 
 
 		 445 aa  100  5e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.122276 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_31014  MOP(MATE) family transporter: multidrug efflux  28.48 
 
 		 560 aa  100  5e-20  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00547148  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4553  DNA-damage-inducible SOS response protein  24.83 
 
 		 459 aa  100  7e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3689  MATE efflux family protein  26.35 
 
 		 470 aa  100  7e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4581  DNA-damage-inducible SOS response protein  24.49 
 
 		 441 aa  100  7e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.941537 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4632  DNA-damage-inducible SOS response protein  24.49 
 
 		 441 aa  100  7e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.251658 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5525  DNA-damage-inducible SOS response protein  24.83 
 
 		 441 aa  99.8  9e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.580203  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03916  DNA-damage-inducible SOS response protein  24.83 
 
 		 459 aa  99.8  1e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3949  MATE efflux family protein  24.6 
 
 		 441 aa  99.4  1e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4176  MATE efflux family protein  28.03 
 
 		 460 aa  99.4  1e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4597  DNA-damage-inducible SOS response protein  24.83 
 
 		 459 aa  99.4  1e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03876  hypothetical protein  24.83 
 
 		 459 aa  99.8  1e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4284  DNA-damage-inducible SOS response protein  24.6 
 
 		 459 aa  99  1e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4506  DNA-damage-inducible SOS response protein  24.83 
 
 		 441 aa  99.4  1e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3984  DNA-damage-inducible SOS response protein  24.83 
 
 		 459 aa  99.8  1e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.270802 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4384  multi anti extrusion protein MatE  25.33 
 
 		 446 aa  98.6  2e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2937  MATE efflux family protein  25.46 
 
 		 451 aa  98.2  2e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0069  MATE efflux family protein  25.82 
 
 		 429 aa  98.2  2e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.380329  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04000  Na(+) driven multidrug efflux pump  24.77 
 
 		 424 aa  98.2  2e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4844  DNA-damage-inducible protein F  25 
 
 		 446 aa  97.8  3e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.8205  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4430  DNA-damage-inducible SOS response protein  24.03 
 
 		 441 aa  97.8  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000533043 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4495  DNA-damage-inducible SOS response protein  24.03 
 
 		 441 aa  97.8  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4580  DNA-damage-inducible SOS response protein  24.03 
 
 		 441 aa  97.8  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0997  MATE efflux family protein  26.96 
 
 		 437 aa  97.1  5e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.207525  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1106  MATE efflux family protein  26.91 
 
 		 472 aa  97.1  6e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.373516  normal  0.414294 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1133  MATE efflux family protein  26.96 
 
 		 437 aa  96.7  7e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0427  MATE efflux family protein  23.23 
 
 		 446 aa  96.3  9e-19  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.744275  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2965  MATE efflux family protein  24.64 
 
 		 446 aa  95.9  1e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0142288 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2306  MATE efflux family protein  25.29 
 
 		 469 aa  96.3  1e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.30452  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0575  MATE efflux family protein  24.94 
 
 		 459 aa  95.5  2e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000335028  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4106  MATE efflux family protein  26.77 
 
 		 458 aa  95.1  2e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0991  MATE efflux family protein  25.34 
 
 		 475 aa  95.1  2e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000156724  normal  0.091152 
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_23253  multi antimicrobial extrusion family protein  25.57 
 
 		 492 aa  94.7  3e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.332151  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4334  MATE efflux family protein  27.6 
 
 		 437 aa  94.7  3e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.210816  normal  0.91675 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>