More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_1719 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_1719  MATE efflux family protein  100 
 
 		 441 aa  832    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0706811  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4036  MATE efflux family protein  62.65 
 
 		 439 aa  478  1e-134  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.192033  normal  0.230529 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5830  MATE efflux family protein  60.05 
 
 		 434 aa  445  1.0000000000000001e-124  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0799038  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14620  putative efflux protein, MATE family  58.09 
 
 		 438 aa  447  1.0000000000000001e-124  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.220591  normal  0.503837 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2317  MATE efflux family protein  61.15 
 
 		 442 aa  443  1e-123  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.816192  normal  0.0947968 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2068  MATE efflux family protein  61.59 
 
 		 444 aa  438  9.999999999999999e-123  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.163332  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2085  MATE efflux family protein  61.59 
 
 		 444 aa  438  9.999999999999999e-123  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0451278  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2131  MATE efflux family protein  61.59 
 
 		 444 aa  438  9.999999999999999e-123  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0258983 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2155  MATE efflux family protein  56.95 
 
 		 467 aa  417  9.999999999999999e-116  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.430874  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12851  DNA-damage-inducible protein F dinF  59.45 
 
 		 436 aa  400  9.999999999999999e-111  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000020718  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1452  MATE efflux family protein  52.66 
 
 		 442 aa  370  1e-101  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.087859  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1334  MATE efflux family protein  53.35 
 
 		 442 aa  344  2e-93  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.433574  normal  0.014892 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1376  MATE efflux family protein  54.31 
 
 		 442 aa  343  4e-93  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.136301 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3961  MATE efflux family protein  56.14 
 
 		 427 aa  325  9e-88  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3426  MATE efflux family protein  43.38 
 
 		 434 aa  263  4.999999999999999e-69  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9349  MATE efflux family protein  36.55 
 
 		 436 aa  224  2e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.51395 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4943  MATE efflux family protein  39.58 
 
 		 448 aa  218  2e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3554  MATE efflux family protein  36.76 
 
 		 466 aa  218  2e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4839  MATE efflux family protein  34.84 
 
 		 449 aa  205  2e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3091  multi anti extrusion protein MatE  34.4 
 
 		 451 aa  201  1.9999999999999998e-50  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.170605  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4658  MATE efflux family protein  40 
 
 		 459 aa  193  6e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.872929  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02790  putative efflux protein, MATE family  37.73 
 
 		 434 aa  187  3e-46  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1451  MATE efflux family protein  36.19 
 
 		 465 aa  187  4e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.815185 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0177  MATE efflux family protein  35.32 
 
 		 442 aa  178  2e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4176  MATE efflux family protein  39.13 
 
 		 460 aa  177  3e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3351  MATE efflux family protein  36.78 
 
 		 441 aa  176  9.999999999999999e-43  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.442644  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4334  MATE efflux family protein  38.62 
 
 		 437 aa  173  5e-42  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.210816  normal  0.91675 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21540  putative efflux protein, MATE family  39.39 
 
 		 470 aa  169  7e-41  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3689  MATE efflux family protein  36.55 
 
 		 470 aa  167  2.9999999999999998e-40  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37760  putative efflux protein, MATE family  36.73 
 
 		 446 aa  167  2.9999999999999998e-40  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3880  MATE efflux family protein  38.44 
 
 		 450 aa  159  7e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000073056 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1233  Na+-driven multidrug efflux pump  35.01 
 
 		 481 aa  159  8e-38  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0659218  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0074  MATE efflux family protein  32.67 
 
 		 453 aa  157  3e-37  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000286401 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4106  MATE efflux family protein  36.49 
 
 		 458 aa  156  7e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02855  hypothetical protein  28.01 
 
 		 445 aa  140  6e-32  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2521  MATE efflux family protein  32.75 
 
 		 455 aa  138  2e-31  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.869508  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2162  MATE efflux family protein  29.74 
 
 		 453 aa  131  3e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2891  multidrug efflux pump  27.81 
 
 		 443 aa  129  1.0000000000000001e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.466203  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4595  MATE efflux family protein  31.74 
 
 		 445 aa  122  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.122276 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0753  MATE efflux family protein  29.93 
 
 		 441 aa  119  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.10371 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0110  MATE efflux family protein  26.26 
 
 		 469 aa  114  2.0000000000000002e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.372068  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0896  MATE efflux family protein  31.28 
 
 		 460 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0613531 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0439  MATE efflux family protein  27.97 
 
 		 438 aa  109  1e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2863  MATE efflux family protein  30.18 
 
 		 445 aa  109  1e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.277434  normal  0.247685 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0248  DNA-damage-inducible SOS response protein  31.28 
 
 		 439 aa  105  2e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.314498  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1551  MATE efflux family protein  29.8 
 
 		 440 aa  105  2e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.959023  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3692  MATE efflux family protein  25.68 
 
 		 461 aa  104  4e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000025823  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1292  multi anti extrusion protein MatE  31.03 
 
 		 455 aa  103  7e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.110492 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0614  MATE efflux family protein  31.26 
 
 		 445 aa  103  8e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0166177 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4619  MATE efflux family protein  29.82 
 
 		 452 aa  102  1e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_31014  MOP(MATE) family transporter: multidrug efflux  28.51 
 
 		 560 aa  102  2e-20  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00547148  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0879  MATE efflux family protein  28.77 
 
 		 444 aa  100  6e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.696604 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2844  MATE efflux family protein  31.72 
 
 		 455 aa  99.4  1e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.94035  normal  0.605375 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4459  DNA-damage-inducible SOS response protein  29.86 
 
 		 454 aa  99  1e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0791  MATE efflux family protein  29.63 
 
 		 451 aa  98.6  2e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.412838 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2425  DNA-damage-inducible protein F  28.57 
 
 		 454 aa  97.8  4e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_23253  multi antimicrobial extrusion family protein  28.57 
 
 		 492 aa  97.4  4e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.332151  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0729  MATE efflux family protein  30.54 
 
 		 449 aa  97.1  6e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.671906  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0794  cation efflux pump, DNA-damage-inducible protein  30.73 
 
 		 434 aa  97.1  6e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00344653 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4581  DNA-damage-inducible SOS response protein  29.93 
 
 		 441 aa  95.9  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.941537 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4632  DNA-damage-inducible SOS response protein  29.93 
 
 		 441 aa  95.9  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.251658 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3772  MATE efflux family protein  33.25 
 
 		 450 aa  95.5  2e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4849  MATE efflux family protein  33.25 
 
 		 450 aa  95.5  2e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002151  DNA-damage-inducible protein F  27.85 
 
 		 449 aa  95.1  2e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.539092  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0569  MATE efflux family protein  29.13 
 
 		 445 aa  94.7  3e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.163672  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0630  multi anti extrusion protein MatE  29.38 
 
 		 449 aa  94.4  3e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0991  MATE efflux family protein  25.59 
 
 		 475 aa  94.4  3e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000156724  normal  0.091152 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4495  DNA-damage-inducible SOS response protein  29.7 
 
 		 441 aa  94.7  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4430  DNA-damage-inducible SOS response protein  29.7 
 
 		 441 aa  94.7  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000533043 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4580  DNA-damage-inducible SOS response protein  29.7 
 
 		 441 aa  94.7  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2204  multidrug efflux pump, MATE family  28.5 
 
 		 444 aa  94.4  4e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.023203  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0868  MATE efflux family protein  27.04 
 
 		 440 aa  93.2  8e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0983692  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0608  MATE efflux family protein  28.9 
 
 		 445 aa  93.2  8e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3527  MATE efflux family protein  27.27 
 
 		 436 aa  92.8  9e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00266  multidrug efflux pump  28.02 
 
 		 423 aa  93.2  9e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0247  MATE efflux family protein  24.43 
 
 		 447 aa  91.3  3e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04000  Na(+) driven multidrug efflux pump  26.51 
 
 		 424 aa  90.9  4e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1106  MATE efflux family protein  26.87 
 
 		 472 aa  90.5  6e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.373516  normal  0.414294 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1507  DNA-damage-inducible protein F  32.21 
 
 		 463 aa  89.4  1e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.208132  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1536  DNA-damage-inducible protein  32.21 
 
 		 463 aa  89  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.65109  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0845  MATE efflux family protein  27.98 
 
 		 439 aa  88.6  2e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.457545  normal  0.657757 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4284  DNA-damage-inducible SOS response protein  29.88 
 
 		 459 aa  87.8  3e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1890  MATE efflux family protein  28.31 
 
 		 442 aa  88.2  3e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63730  putative transporter  30.68 
 
 		 453 aa  87.8  3e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0352676  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03916  DNA-damage-inducible SOS response protein  29.65 
 
 		 459 aa  87.4  4e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4506  DNA-damage-inducible SOS response protein  29.65 
 
 		 441 aa  87.8  4e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0160  MATE efflux family protein  28.83 
 
 		 444 aa  87.4  4e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3984  DNA-damage-inducible SOS response protein  29.65 
 
 		 459 aa  87.4  4e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.270802 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03876  hypothetical protein  29.65 
 
 		 459 aa  87.4  4e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4597  DNA-damage-inducible SOS response protein  29.65 
 
 		 459 aa  87.8  4e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0596  DNA-damage-inducible protein  32.21 
 
 		 463 aa  87.4  5e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0179694  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4844  DNA-damage-inducible protein F  28.64 
 
 		 446 aa  87.4  5e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.8205  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2122  multi anti extrusion protein MatE  28.25 
 
 		 450 aa  87  6e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00000217461  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0283  DNA-damage-inducible F transmembrane protein  31.51 
 
 		 457 aa  86.3  9e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00354836  normal  0.290631 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1279  DNA-damage-inducible protein F  26.32 
 
 		 472 aa  85.9  0.000000000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.244391  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5525  DNA-damage-inducible SOS response protein  29.51 
 
 		 441 aa  85.9  0.000000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.580203  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3949  MATE efflux family protein  29.41 
 
 		 441 aa  85.1  0.000000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4553  DNA-damage-inducible SOS response protein  29.41 
 
 		 459 aa  85.5  0.000000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1069  MATE efflux family protein  29.17 
 
 		 461 aa  85.1  0.000000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.279345 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0180  MATE efflux family protein  27.88 
 
 		 445 aa  85.1  0.000000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>