More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_1890 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007963  Csal_1890  MATE efflux family protein  100 
 
 		 442 aa  853    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6399  MATE efflux family protein  41.84 
 
 		 425 aa  275  8e-73  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.444399  normal  1 
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_28350  MOP(MATE) family transporter: multidrug efflux  36.53 
 
 		 428 aa  263  4e-69  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00440405  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0575  MATE efflux family protein  30.29 
 
 		 459 aa  151  2e-35  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000335028  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0545  MATE efflux family protein  27.94 
 
 		 470 aa  142  8e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1418  MATE efflux family protein  30.58 
 
 		 462 aa  137  5e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3565  MATE efflux family protein  30 
 
 		 452 aa  133  5e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3692  MATE efflux family protein  26.37 
 
 		 461 aa  131  3e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000025823  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6251  MATE efflux family protein  27.16 
 
 		 461 aa  129  7.000000000000001e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0762  MATE efflux family protein  27.68 
 
 		 458 aa  127  5e-28  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3120  MATE efflux family protein  26.24 
 
 		 461 aa  125  1e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.369114  normal  0.932515 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0991  MATE efflux family protein  26.39 
 
 		 475 aa  122  9e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000156724  normal  0.091152 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0591  MATE efflux family protein  23.85 
 
 		 438 aa  122  9.999999999999999e-27  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09280  MATE efflux family protein  22.76 
 
 		 453 aa  120  3e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000476954  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2243  MATE efflux family protein  30.5 
 
 		 468 aa  117  5e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0113  MATE efflux family protein  25.11 
 
 		 464 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0111  MATE efflux family protein  25.11 
 
 		 464 aa  114  3e-24  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4055  MATE efflux family protein  30.13 
 
 		 483 aa  114  4.0000000000000004e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0254154 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2237  MATE efflux family protein  28.21 
 
 		 469 aa  114  4.0000000000000004e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000615121  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2343  MATE efflux family protein  23.85 
 
 		 464 aa  113  8.000000000000001e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000000238189  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2291  MATE efflux family protein  24.26 
 
 		 460 aa  112  1.0000000000000001e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3815  MATE efflux family protein  28.85 
 
 		 467 aa  111  2.0000000000000002e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.142559  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09173  MATE efflux family protein  24.21 
 
 		 457 aa  110  4.0000000000000004e-23  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1767  MATE efflux family protein  24.88 
 
 		 462 aa  110  4.0000000000000004e-23  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1579  MATE efflux family protein  25.89 
 
 		 445 aa  108  2e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1131  MATE efflux family protein  26.15 
 
 		 445 aa  106  7e-22  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.899702  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4400  MATE efflux family protein  31.48 
 
 		 453 aa  103  9e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0121801  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3993  MATE efflux family protein  28.95 
 
 		 447 aa  102  1e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2333  MATE efflux family protein  25.92 
 
 		 456 aa  102  2e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2841  MATE efflux family protein  26.15 
 
 		 468 aa  101  3e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000678206  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5025  MATE efflux family protein  22.51 
 
 		 461 aa  101  3e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.274377  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4087  MATE efflux family protein  29.13 
 
 		 447 aa  100  5e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2295  MATE efflux family protein  24.45 
 
 		 475 aa  100  6e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00026572  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0427  MATE efflux family protein  25.35 
 
 		 446 aa  99.8  1e-19  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.744275  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1607  MATE efflux family protein  22.81 
 
 		 463 aa  99  2e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000142965  unclonable  4.95515e-23 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14620  putative efflux protein, MATE family  28.82 
 
 		 438 aa  97.8  3e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.220591  normal  0.503837 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3948  MATE efflux family protein  23.65 
 
 		 458 aa  97.4  4e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0055  MATE efflux family protein  25.27 
 
 		 446 aa  96.7  7e-19  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0755  MATE efflux family protein  27.46 
 
 		 456 aa  96.7  8e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0124459  normal  0.621342 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3887  multi anti extrusion protein MatE  27.4 
 
 		 466 aa  95.1  2e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0845713 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7238  MATE efflux family protein  23.17 
 
 		 450 aa  94.4  4e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.866766  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1359  multi anti extrusion protein MatE  22.03 
 
 		 408 aa  92.8  1e-17  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1267  multidrug efflux protein  22.1 
 
 		 453 aa  92  2e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4033  MATE efflux family protein  22.55 
 
 		 458 aa  91.7  2e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000078929 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1295  multidrug efflux protein  21.88 
 
 		 453 aa  91.3  3e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0578421  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003524  multidrug efflux protein NorM  23.06 
 
 		 456 aa  91.3  3e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2872  hypothetical protein  25.67 
 
 		 474 aa  91.3  3e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0273189  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1402  multidrug efflux protein  21.88 
 
 		 453 aa  91.3  3e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1071  MATE efflux family protein  22.99 
 
 		 475 aa  91.3  3e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1472  multidrug efflux protein  21.88 
 
 		 453 aa  90.9  4e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3111  MATE efflux family protein  27.89 
 
 		 489 aa  90.9  4e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00116438 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1907  MATE efflux family protein  28.1 
 
 		 457 aa  90.9  4e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0742597  normal  0.100602 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2664  MATE efflux family protein  25.35 
 
 		 460 aa  90.5  5e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6233  MATE efflux family protein  24.8 
 
 		 443 aa  90.1  8e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0410154  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05190  MATE efflux family protein  23.54 
 
 		 454 aa  88.6  2e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.969197  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1856  multidrug efflux protein  23.3 
 
 		 455 aa  88.2  2e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.30191  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0147  MATE efflux family protein  23.79 
 
 		 462 aa  88.6  2e-16  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000317216  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6069  multidrug efflux protein NorA  26.64 
 
 		 462 aa  88.2  2e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5035  MATE efflux family protein  26.08 
 
 		 469 aa  89  2e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.88746  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1501  multidrug efflux protein  21.05 
 
 		 454 aa  87.8  3e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0177  MATE efflux family protein  30.02 
 
 		 442 aa  88.2  3e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1343  MATE efflux family protein  21.02 
 
 		 464 aa  88.2  3e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00000317655  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1019  MATE efflux family protein  26.39 
 
 		 474 aa  87.8  3e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0811  multidrug efflux protein  24.78 
 
 		 425 aa  87.8  3e-16  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1109  multidrug efflux protein  21.04 
 
 		 452 aa  87.8  4e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.654532  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2085  MATE efflux family protein  29.27 
 
 		 444 aa  87.4  4e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0451278  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2131  MATE efflux family protein  29.27 
 
 		 444 aa  87.4  4e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0258983 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2068  MATE efflux family protein  29.27 
 
 		 444 aa  87.4  4e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.163332  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4103  Na+ driven multidrug efflux pump  21.11 
 
 		 463 aa  87  5e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0660054  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1719  MATE efflux family protein  28.82 
 
 		 441 aa  87  6e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0706811  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1851  MATE efflux family protein  23.8 
 
 		 475 aa  86.7  7e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00783953  normal  0.201536 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2653  MATE efflux family protein  26.43 
 
 		 484 aa  86.7  8e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1541  MATE efflux family protein  28.41 
 
 		 486 aa  86.7  8e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.127259  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0440  MATE efflux family protein  26.6 
 
 		 470 aa  86.7  8e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.589921  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1305  MATE efflux family protein  21.11 
 
 		 464 aa  85.9  0.000000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.40401  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1106  MATE efflux family protein  21.11 
 
 		 464 aa  86.3  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000560081  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1088  efflux protein  21.11 
 
 		 464 aa  86.3  0.000000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000024435  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1435  multidrug efflux protein  21.21 
 
 		 452 aa  85.9  0.000000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.602082  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1196  MATE efflux family protein  21.11 
 
 		 464 aa  86.3  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000655029  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1686  multidrug resistance protein NorM, putative  26.88 
 
 		 464 aa  86.3  0.000000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.712622  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0967  MATE efflux family protein  25.85 
 
 		 462 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.932307  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1082  efflux protein  21.11 
 
 		 464 aa  85.1  0.000000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000125629  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29880  Multidrug efflux protein  29.59 
 
 		 459 aa  85.5  0.000000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.613777  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4106  MATE efflux family protein  32.46 
 
 		 458 aa  85.5  0.000000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0906  MATE efflux family protein  21.79 
 
 		 448 aa  85.1  0.000000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000766798  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02164  multidrug efflux protein NorA  22.77 
 
 		 457 aa  84.7  0.000000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.193678  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1590  hypothetical protein  25.45 
 
 		 476 aa  84.7  0.000000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00267858  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1239  MATE efflux family protein  20.89 
 
 		 464 aa  84.3  0.000000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.238085  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0454  MATE efflux family protein  28.9 
 
 		 477 aa  84.7  0.000000000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0971  MATE efflux family protein  25.61 
 
 		 462 aa  84.7  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.500099  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2346  MATE efflux family protein  24.53 
 
 		 460 aa  84.7  0.000000000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00458496 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0494  MATE efflux family protein  22.31 
 
 		 455 aa  84.3  0.000000000000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0475117  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0358  multi anti extrusion protein MatE  29.08 
 
 		 452 aa  84.3  0.000000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000377442  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2156  MATE efflux family protein  22.07 
 
 		 451 aa  84.3  0.000000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.540946 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1094  MATE efflux family protein  20.18 
 
 		 464 aa  84.3  0.000000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000923462  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3909  multidrug efflux protein  21.21 
 
 		 452 aa  84.3  0.000000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0255  multidrug efflux protein NorA  29.29 
 
 		 461 aa  84  0.000000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0612  MATE efflux family protein  26.1 
 
 		 462 aa  84  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1050  MATE efflux family protein  26.1 
 
 		 462 aa  84  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.456746 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2268  MATE efflux family protein  25.48 
 
 		 452 aa  84  0.000000000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.012169  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>