More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_3111 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_3111  MATE efflux family protein  100 
 
 		 489 aa  967    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00116438 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1841  MATE efflux family protein  60.35 
 
 		 469 aa  512  1e-144  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2418  MATE efflux family protein  56.03 
 
 		 471 aa  471  1.0000000000000001e-131  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2664  MATE efflux family protein  43.17 
 
 		 460 aa  323  3e-87  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1967  MATE efflux family protein  34.48 
 
 		 488 aa  246  6e-64  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0778152  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0494  MATE efflux family protein  33.11 
 
 		 455 aa  234  3e-60  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0475117  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0053  MATE efflux family protein  32.97 
 
 		 451 aa  198  2.0000000000000003e-49  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.39001  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2355  MATE efflux family protein  32.83 
 
 		 449 aa  191  2e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0530772  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0413  MATE efflux family protein  35.01 
 
 		 449 aa  186  9e-46  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1862  MATE efflux family protein  31.53 
 
 		 449 aa  181  2.9999999999999997e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0252  MATE efflux family protein  32.07 
 
 		 460 aa  137  5e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2492  MATE efflux family protein  28.26 
 
 		 485 aa  125  2e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.544481  normal  0.228664 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0411  MATE efflux family protein  29.5 
 
 		 453 aa  119  7.999999999999999e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1736  MATE efflux family protein  28.01 
 
 		 472 aa  119  1.9999999999999998e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.282832  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1808  MATE efflux family protein  25.83 
 
 		 499 aa  119  1.9999999999999998e-25  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.848054  normal  0.460632 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2423  MATE efflux family protein  29.65 
 
 		 451 aa  116  7.999999999999999e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0441886  normal  0.25868 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0764  MATE family efflux pump NorM  29.65 
 
 		 451 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0707  MATE efflux family protein  25.54 
 
 		 518 aa  114  5e-24  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.376903  normal  0.476505 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0113  MATE efflux family protein  25.05 
 
 		 464 aa  114  6e-24  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0358  multi anti extrusion protein MatE  30.77 
 
 		 452 aa  113  8.000000000000001e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000377442  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0111  MATE efflux family protein  24.84 
 
 		 464 aa  111  4.0000000000000004e-23  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3129  MATE efflux family protein  31.12 
 
 		 452 aa  110  6e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0991  MATE efflux family protein  24.68 
 
 		 475 aa  109  1e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000156724  normal  0.091152 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3887  multi anti extrusion protein MatE  26.23 
 
 		 466 aa  108  2e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0845713 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3565  MATE efflux family protein  31.1 
 
 		 452 aa  108  2e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4023  putative transporter  26.82 
 
 		 477 aa  108  2e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.343891  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46680  putative transporter  26.82 
 
 		 477 aa  108  2e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.013844  hitchhiker  0.0000129498 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3692  MATE efflux family protein  24.9 
 
 		 461 aa  108  2e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000025823  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1907  MATE efflux family protein  27.33 
 
 		 457 aa  105  1e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0742597  normal  0.100602 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0747  MATE efflux family protein  25.97 
 
 		 490 aa  104  4e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1783  multidrug efflux protein  26.41 
 
 		 457 aa  103  5e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00383484 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2542  MATE efflux family protein  27.56 
 
 		 459 aa  103  7e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4400  MATE efflux family protein  30.85 
 
 		 453 aa  103  7e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0121801  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0255  multidrug efflux protein NorA  29.44 
 
 		 461 aa  102  1e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5035  MATE efflux family protein  30.06 
 
 		 469 aa  102  1e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.88746  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0811  multidrug efflux protein  26.63 
 
 		 425 aa  102  2e-20  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0502  multidrug resistance protein NorM, putative  27.76 
 
 		 468 aa  101  3e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00841305  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2403  MATE efflux family protein  25.37 
 
 		 475 aa  101  3e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2343  MATE efflux family protein  24.16 
 
 		 464 aa  101  3e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000000238189  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2885  multidrug efflux pump NorM  27.76 
 
 		 468 aa  101  3e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.132426  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1835  multidrug efflux pump NorM  27.76 
 
 		 468 aa  101  3e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.143849  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2511  multidrug efflux pump NorM  27.76 
 
 		 468 aa  101  3e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0112614  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2770  multidrug efflux pump NorM  27.76 
 
 		 468 aa  101  3e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00327808  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01634  multidrug efflux protein NorM  26.02 
 
 		 457 aa  99.8  1e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.900215  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1977  MATE efflux family protein  26.02 
 
 		 457 aa  99.8  1e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000001739  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2376  multidrug efflux protein  26.02 
 
 		 457 aa  99.8  1e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000568736  normal  0.0171948 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2939  multidrug resistance protein  27.52 
 
 		 468 aa  99.8  1e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000000251457  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1877  multidrug efflux protein  26.02 
 
 		 457 aa  99.4  1e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000154294  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1743  multidrug efflux protein  26.02 
 
 		 457 aa  99.4  1e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000609014  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1579  MATE efflux family protein  25.39 
 
 		 445 aa  99.8  1e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1966  multidrug efflux protein  26.02 
 
 		 457 aa  99.4  1e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000267108 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2824  Na+-driven multidrug efflux pump  27.52 
 
 		 468 aa  99.8  1e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.338684  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2291  MATE efflux family protein  25.95 
 
 		 460 aa  99.8  1e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1534  multidrug efflux protein  26.02 
 
 		 457 aa  99.4  1e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00445038  hitchhiker  0.00117159 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01624  hypothetical protein  26.02 
 
 		 457 aa  99.8  1e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1861  multidrug efflux protein  26.02 
 
 		 457 aa  99.4  1e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000216071  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1535  multidrug efflux protein  25.58 
 
 		 457 aa  98.6  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.153308  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2237  MATE efflux family protein  27.18 
 
 		 469 aa  98.6  2e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000615121  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1686  multidrug resistance protein NorM, putative  27.76 
 
 		 464 aa  99  2e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.712622  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1749  multidrug efflux protein  25.58 
 
 		 457 aa  98.6  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.000000000456858  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0967  MATE efflux family protein  27.21 
 
 		 462 aa  99  2e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.932307  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1521  multidrug efflux protein  25.58 
 
 		 457 aa  98.6  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0251273  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2306  MATE efflux family protein  24.42 
 
 		 469 aa  98.6  2e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.30452  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2653  MATE efflux family protein  27.66 
 
 		 484 aa  98.2  3e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1382  multidrug efflux protein  26.1 
 
 		 460 aa  98.2  3e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.13512  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1918  multidrug efflux protein  25.58 
 
 		 457 aa  98.2  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.00462926  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0797  MATE efflux family protein  27.74 
 
 		 463 aa  98.2  3e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.158372 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0971  MATE efflux family protein  27.21 
 
 		 462 aa  97.8  4e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.500099  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2358  MATE efflux family protein  23.52 
 
 		 467 aa  97.8  4e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1558  multidrug efflux protein  25.58 
 
 		 457 aa  97.8  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.554893  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1895  MATE efflux family protein  24.45 
 
 		 498 aa  97.8  4e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0755  MATE efflux family protein  27.2 
 
 		 456 aa  97.1  7e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0124459  normal  0.621342 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0591  MATE efflux family protein  23.4 
 
 		 438 aa  95.9  1e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1680  multidrug efflux protein  25.44 
 
 		 457 aa  96.3  1e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29880  Multidrug efflux protein  29 
 
 		 459 aa  95.9  1e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.613777  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4033  MATE efflux family protein  27.32 
 
 		 458 aa  95.9  1e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000078929 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0260  MATE efflux family protein  25.45 
 
 		 478 aa  96.7  1e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3677  MATE efflux family protein  25.61 
 
 		 500 aa  95.1  2e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.380257  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1146  multidrug efflux protein  25.38 
 
 		 461 aa  95.9  2e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.292586  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2243  MATE efflux family protein  28.89 
 
 		 468 aa  95.5  2e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1023  multi anti extrusion protein MatE  26.34 
 
 		 464 aa  95.5  2e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1166  ABC transporter releated protein  24.01 
 
 		 463 aa  95.5  2e-18  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.403976 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2212  MATE efflux family protein  26.93 
 
 		 462 aa  94.7  3e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.520618  normal  0.988059 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1199  MATE efflux family protein  23.41 
 
 		 450 aa  94.7  3e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0538393  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4204  multi anti extrusion protein MatE  26.29 
 
 		 462 aa  94.4  4e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0638116  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0575  MATE efflux family protein  28.33 
 
 		 459 aa  94  5e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000335028  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3141  MATE efflux family protein  28.57 
 
 		 472 aa  93.2  9e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.565795  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1050  MATE efflux family protein  26.68 
 
 		 462 aa  93.2  1e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.456746 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3993  MATE efflux family protein  27.3 
 
 		 447 aa  92.8  1e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0612  MATE efflux family protein  26.68 
 
 		 462 aa  93.2  1e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1019  MATE efflux family protein  28.79 
 
 		 474 aa  92.8  1e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1091  MATE efflux family protein  26.68 
 
 		 462 aa  93.2  1e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.427191  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4087  MATE efflux family protein  27.3 
 
 		 447 aa  92  2e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4462  MATE efflux family protein  27.59 
 
 		 470 aa  92.4  2e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1890  MATE efflux family protein  27.81 
 
 		 442 aa  92.4  2e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2943  MATE efflux family protein  26.42 
 
 		 470 aa  91.7  2e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.223425  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69890  multidrug efflux protein NorA  27.27 
 
 		 488 aa  92.4  2e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1225  multidrug efflux pump, NorM, MATE family  26.38 
 
 		 455 aa  91.7  3e-17  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000329619  normal  0.0233556 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6069  multidrug efflux protein NorA  27.04 
 
 		 462 aa  91.3  3e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1712  multidrug efflux protein  24.49 
 
 		 457 aa  91.3  3e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>