More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_6233 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_6233  MATE efflux family protein  100 
 
 		 443 aa  886    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0410154  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1131  MATE efflux family protein  32.81 
 
 		 445 aa  216  5e-55  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.899702  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0113  MATE efflux family protein  28.04 
 
 		 464 aa  136  6.0000000000000005e-31  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0111  MATE efflux family protein  27.88 
 
 		 464 aa  136  6.0000000000000005e-31  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1199  MATE efflux family protein  25.89 
 
 		 450 aa  102  1e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0538393  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0575  MATE efflux family protein  27.51 
 
 		 459 aa  99.4  1e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000335028  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0762  MATE efflux family protein  26.08 
 
 		 458 aa  98.2  3e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0279  MATE efflux family protein  22.32 
 
 		 445 aa  97.1  6e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6399  MATE efflux family protein  25 
 
 		 425 aa  95.5  2e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.444399  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2022  multidrug efflux pump  23.34 
 
 		 459 aa  93.2  8e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.54695  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0830  MATE efflux family protein  24.4 
 
 		 445 aa  92.8  1e-17  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.000000918772  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2060  MATE efflux family protein  25 
 
 		 456 aa  88.6  2e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000022927  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3692  MATE efflux family protein  24.76 
 
 		 461 aa  85.9  0.000000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000025823  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6251  MATE efflux family protein  23.24 
 
 		 461 aa  85.1  0.000000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2418  MATE efflux family protein  23.5 
 
 		 471 aa  85.5  0.000000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1851  MATE efflux family protein  22.05 
 
 		 475 aa  85.5  0.000000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00783953  normal  0.201536 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1746  MATE efflux family protein  22.91 
 
 		 451 aa  84.7  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.325105  normal  0.141964 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5136  multi anti extrusion protein MatE  23.31 
 
 		 453 aa  85.1  0.000000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.114978  normal  0.944792 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1736  MATE efflux family protein  26.99 
 
 		 472 aa  84.7  0.000000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.282832  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0857  MATE efflux family protein  26.28 
 
 		 458 aa  84.7  0.000000000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0848  MATE efflux family protein  25.96 
 
 		 458 aa  84.3  0.000000000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.720761  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1773  MATE efflux family protein  22.63 
 
 		 451 aa  84.3  0.000000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1279  putative inner membrane transmembrane protein  22.71 
 
 		 459 aa  83.6  0.000000000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0284384  normal  0.285043 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1071  MATE efflux family protein  21.48 
 
 		 475 aa  82.4  0.00000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0545  MATE efflux family protein  20.9 
 
 		 470 aa  81.3  0.00000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1418  MATE efflux family protein  25.07 
 
 		 462 aa  81.6  0.00000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2211  multidrug resistance protein NorM, putative  23.25 
 
 		 451 aa  80.9  0.00000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0676191  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6244  MATE efflux family protein  22.91 
 
 		 450 aa  80.9  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.813306  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0723  multidrug resistance protein  23.35 
 
 		 454 aa  80.9  0.00000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1835  MATE efflux family protein  22.91 
 
 		 450 aa  80.9  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.967793  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1138  MATE efflux family protein  23.79 
 
 		 450 aa  79.7  0.00000000000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000318212  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1890  MATE efflux family protein  24.93 
 
 		 442 aa  79.7  0.00000000000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1438  MATE efflux family protein  21.64 
 
 		 453 aa  79.7  0.0000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.805906  hitchhiker  0.00501053 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0945  MATE efflux family protein  23.06 
 
 		 453 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.228244  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2217  MATE efflux family protein  22.53 
 
 		 451 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2255  MATE efflux family protein  22.53 
 
 		 451 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.643752  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3120  MATE efflux family protein  22.25 
 
 		 461 aa  78.6  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.369114  normal  0.932515 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2383  multidrug resistance protein  22.53 
 
 		 451 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2664  MATE efflux family protein  22.92 
 
 		 460 aa  79  0.0000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0427  MATE efflux family protein  22.31 
 
 		 446 aa  78.2  0.0000000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.744275  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2306  MATE efflux family protein  21.25 
 
 		 469 aa  78.6  0.0000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.30452  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2243  MATE efflux family protein  24.58 
 
 		 468 aa  78.6  0.0000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1859  MATE efflux family protein  23.06 
 
 		 450 aa  77.8  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0763838  normal  0.0423968 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1371  multidrug resistance protein NorM, putative  22.87 
 
 		 451 aa  78.2  0.0000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.31883  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2369  MATE family protein  22.58 
 
 		 459 aa  78.2  0.0000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.151607  normal  0.213094 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1133  putative multidrug resistance protein NorM  22.87 
 
 		 451 aa  78.2  0.0000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1862  putative multidrug resistance protein NorM  22.87 
 
 		 451 aa  78.2  0.0000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0035  putative multidrug resistance protein NorM  22.87 
 
 		 451 aa  78.2  0.0000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0708926  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09280  MATE efflux family protein  22.77 
 
 		 453 aa  77.4  0.0000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000476954  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1951  MATE efflux family protein  23.43 
 
 		 459 aa  77.4  0.0000000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000663691  normal  0.290024 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1115  MATE efflux family protein  22.41 
 
 		 448 aa  77  0.0000000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.000487521  normal  0.525314 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2025  MATE efflux family protein  23.16 
 
 		 459 aa  76.3  0.0000000000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0331062  normal  0.321717 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0055  MATE efflux family protein  22.93 
 
 		 446 aa  76.3  0.000000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1023  MATE efflux family protein  22.41 
 
 		 448 aa  75.5  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00302987  normal  0.449754 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2355  MATE efflux family protein  23.12 
 
 		 449 aa  75.1  0.000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0530772  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0850  MATE efflux family protein  24.52 
 
 		 439 aa  74.3  0.000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.313022  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2039  MATE efflux family protein  22.89 
 
 		 459 aa  74.7  0.000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.017072  normal  0.0193468 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0260  MATE efflux family protein  21.73 
 
 		 478 aa  74.7  0.000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0991  MATE efflux family protein  21.37 
 
 		 475 aa  74.3  0.000000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000156724  normal  0.091152 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2515  MATE efflux family protein  24.5 
 
 		 442 aa  74.3  0.000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1166  ABC transporter releated protein  21.37 
 
 		 463 aa  74.3  0.000000000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.403976 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3642  multi anti extrusion protein MatE  22.76 
 
 		 496 aa  73.9  0.000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.104533  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0591  MATE efflux family protein  22.12 
 
 		 438 aa  73.6  0.000000000007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2295  MATE efflux family protein  22.62 
 
 		 459 aa  73.2  0.000000000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4055  MATE efflux family protein  23.87 
 
 		 483 aa  72.4  0.00000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0254154 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2458  MATE efflux family protein  22.52 
 
 		 500 aa  72.8  0.00000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.672094  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3886  MATE efflux family protein  22.67 
 
 		 481 aa  72.8  0.00000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0537  hypothetical protein  24.48 
 
 		 460 aa  72.4  0.00000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0753  MATE efflux family protein  25.07 
 
 		 441 aa  72.4  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.10371 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3962  multi antimicrobial extrusion protein  21.71 
 
 		 492 aa  72.8  0.00000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.789789  normal  0.0338284 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2626  MATE efflux family protein  26.7 
 
 		 467 aa  72.8  0.00000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.287795  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0764  MATE family efflux pump NorM  27.31 
 
 		 451 aa  71.6  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0743  MATE efflux family protein  23.79 
 
 		 484 aa  72.4  0.00000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000192336  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2423  MATE efflux family protein  27.31 
 
 		 451 aa  72  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0441886  normal  0.25868 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0411  MATE efflux family protein  25.43 
 
 		 453 aa  71.6  0.00000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1841  MATE efflux family protein  24.05 
 
 		 469 aa  71.2  0.00000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2162  MATE efflux family protein  27.76 
 
 		 453 aa  70.9  0.00000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0404  MATE efflux family protein  23.91 
 
 		 457 aa  70.5  0.00000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.294226 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0358  multi anti extrusion protein MatE  22.51 
 
 		 452 aa  70.5  0.00000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000377442  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2037  MATE efflux family protein  22.55 
 
 		 461 aa  70.5  0.00000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.01185  hitchhiker  0.00138183 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1818  MATE efflux family protein  22.1 
 
 		 459 aa  70.5  0.00000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.138431 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0100  MATE efflux family protein  23.39 
 
 		 454 aa  70.5  0.00000000006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0456451  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0997  MATE efflux family protein  21.79 
 
 		 437 aa  70.5  0.00000000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.207525  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1967  MATE efflux family protein  20.84 
 
 		 488 aa  70.1  0.00000000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0778152  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2021  MATE efflux family protein  22.07 
 
 		 459 aa  70.1  0.00000000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.068877  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2122  multi anti extrusion protein MatE  25 
 
 		 450 aa  70.1  0.00000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00000217461  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0162  MATE efflux family protein  22.7 
 
 		 486 aa  69.7  0.00000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2237  MATE efflux family protein  21.25 
 
 		 469 aa  69.7  0.00000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000615121  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1180  inner membrane transmembrane protein  24.11 
 
 		 448 aa  69.7  0.0000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00000781542  normal  0.19952 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1597  MATE efflux family protein  21.96 
 
 		 460 aa  69.7  0.0000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  3.36267e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_28350  MOP(MATE) family transporter: multidrug efflux  21.8 
 
 		 428 aa  69.3  0.0000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00440405  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2766  MATE efflux family protein  27.13 
 
 		 453 aa  69.3  0.0000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0984562  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1711  MATE efflux family protein  25 
 
 		 463 aa  69.3  0.0000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0339316  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3112  multidrug efflux protein  24.22 
 
 		 465 aa  68.9  0.0000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0454  MATE efflux family protein  26.36 
 
 		 477 aa  68.6  0.0000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0299  MATE efflux family protein  26.4 
 
 		 456 aa  68.9  0.0000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000180901  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1918  multidrug efflux protein  21.73 
 
 		 457 aa  67.8  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.00462926  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05190  MATE efflux family protein  25.57 
 
 		 454 aa  67.8  0.0000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.969197  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1521  multidrug efflux protein  21.73 
 
 		 457 aa  67.8  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0251273  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1749  multidrug efflux protein  21.73 
 
 		 457 aa  67.8  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.000000000456858  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>