More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_2664 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_2664  MATE efflux family protein  100 
 
 		 460 aa  904    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2418  MATE efflux family protein  45.53 
 
 		 471 aa  349  7e-95  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1841  MATE efflux family protein  44.17 
 
 		 469 aa  344  1e-93  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3111  MATE efflux family protein  43.17 
 
 		 489 aa  311  2e-83  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00116438 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0494  MATE efflux family protein  32.74 
 
 		 455 aa  243  6e-63  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0475117  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1967  MATE efflux family protein  35.24 
 
 		 488 aa  241  2.9999999999999997e-62  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0778152  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2355  MATE efflux family protein  30.86 
 
 		 449 aa  194  2e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0530772  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1862  MATE efflux family protein  32.16 
 
 		 449 aa  192  9e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0053  MATE efflux family protein  30.43 
 
 		 451 aa  175  9.999999999999999e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.39001  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0413  MATE efflux family protein  30.47 
 
 		 449 aa  173  5.999999999999999e-42  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0252  MATE efflux family protein  33.92 
 
 		 460 aa  159  1e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2492  MATE efflux family protein  31.4 
 
 		 485 aa  149  9e-35  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.544481  normal  0.228664 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1579  MATE efflux family protein  27.23 
 
 		 445 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1936  MATE efflux family protein  29.27 
 
 		 486 aa  129  1.0000000000000001e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1023  multi anti extrusion protein MatE  26.71 
 
 		 464 aa  123  7e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3692  MATE efflux family protein  28.32 
 
 		 461 aa  121  1.9999999999999998e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000025823  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3337  MATE efflux family protein  30 
 
 		 470 aa  118  1.9999999999999998e-25  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1277  MATE efflux family protein  24.5 
 
 		 480 aa  115  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6519  MATE efflux family protein  28.8 
 
 		 466 aa  114  3e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.510371  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1338  MATE efflux family protein  28.85 
 
 		 481 aa  113  6e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0113  MATE efflux family protein  23.77 
 
 		 464 aa  113  8.000000000000001e-24  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0591  MATE efflux family protein  24.34 
 
 		 438 aa  113  9e-24  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0111  MATE efflux family protein  23.77 
 
 		 464 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1808  MATE efflux family protein  26.48 
 
 		 499 aa  111  2.0000000000000002e-23  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.848054  normal  0.460632 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3565  MATE efflux family protein  30.22 
 
 		 452 aa  111  2.0000000000000002e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0707  MATE efflux family protein  25.46 
 
 		 518 aa  112  2.0000000000000002e-23  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.376903  normal  0.476505 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2369  MATE family protein  26.44 
 
 		 459 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.151607  normal  0.213094 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0755  MATE efflux family protein  29.61 
 
 		 456 aa  111  2.0000000000000002e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0124459  normal  0.621342 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09173  MATE efflux family protein  24.87 
 
 		 457 aa  110  5e-23  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4023  putative transporter  25.56 
 
 		 477 aa  110  6e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.343891  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0991  MATE efflux family protein  24.84 
 
 		 475 aa  110  7.000000000000001e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000156724  normal  0.091152 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46680  putative transporter  25.56 
 
 		 477 aa  109  8.000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.013844  hitchhiker  0.0000129498 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0811  multidrug efflux protein  25.78 
 
 		 425 aa  109  9.000000000000001e-23  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0545  MATE efflux family protein  28.17 
 
 		 470 aa  109  1e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5517  multidrug efflux protein NorA  27.94 
 
 		 464 aa  108  2e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1736  MATE efflux family protein  26.25 
 
 		 472 aa  108  2e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.282832  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0208  multidrug efflux protein NorA  28.83 
 
 		 462 aa  107  4e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0521775 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5314  multidrug efflux protein NorA  29.29 
 
 		 462 aa  106  7e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.133881 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5262  multidrug efflux protein NorA  29.29 
 
 		 462 aa  106  9e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00407645  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29880  Multidrug efflux protein  28.46 
 
 		 459 aa  106  9e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.613777  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2423  MATE efflux family protein  27.68 
 
 		 451 aa  106  9e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0441886  normal  0.25868 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1418  MATE efflux family protein  30.91 
 
 		 462 aa  105  1e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2226  MATE efflux family protein  25.32 
 
 		 459 aa  105  1e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00326481  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3887  multi anti extrusion protein MatE  26.79 
 
 		 466 aa  105  1e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0845713 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1680  multidrug efflux protein  25.52 
 
 		 457 aa  105  1e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2144  MATE efflux family protein  25.32 
 
 		 459 aa  106  1e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00844779  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2334  MATE efflux family protein  25.06 
 
 		 459 aa  105  2e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0215455  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1711  MATE efflux family protein  24.58 
 
 		 463 aa  105  2e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0339316  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0411  MATE efflux family protein  28.12 
 
 		 453 aa  105  2e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2180  MATE efflux family protein  25.32 
 
 		 459 aa  104  4e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0347307  hitchhiker  0.00809884 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0575  MATE efflux family protein  27.88 
 
 		 459 aa  103  4e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000335028  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1746  MATE efflux family protein  26.2 
 
 		 451 aa  103  5e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.325105  normal  0.141964 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0073  multidrug efflux protein NorA  28.46 
 
 		 460 aa  103  5e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0764  MATE family efflux pump NorM  27.42 
 
 		 451 aa  103  5e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3120  MATE efflux family protein  25.5 
 
 		 461 aa  103  5e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.369114  normal  0.932515 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1773  MATE efflux family protein  26.2 
 
 		 451 aa  103  6e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1225  multidrug efflux pump, NorM, MATE family  25.12 
 
 		 455 aa  103  9e-21  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000329619  normal  0.0233556 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5025  MATE efflux family protein  23.5 
 
 		 461 aa  102  1e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.274377  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0115  multidrug resistance protein NorM, putative  27.7 
 
 		 460 aa  102  1e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1712  multidrug efflux protein  26.03 
 
 		 457 aa  102  1e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2766  MATE efflux family protein  22.41 
 
 		 453 aa  102  2e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0984562  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2021  MATE efflux family protein  25.32 
 
 		 459 aa  101  2e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.068877  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5172  multidrug efflux protein NorA  29.08 
 
 		 462 aa  101  3e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.204458 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1131  MATE efflux family protein  26.12 
 
 		 445 aa  101  3e-20  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.899702  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09280  MATE efflux family protein  24.34 
 
 		 453 aa  101  3e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000476954  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1907  MATE efflux family protein  28.57 
 
 		 457 aa  100  4e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0742597  normal  0.100602 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2939  multidrug resistance protein  28.57 
 
 		 468 aa  100  4e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000000251457  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1166  MATE efflux family protein  25.12 
 
 		 455 aa  100  4e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0236579  normal  0.0144354 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2189  multidrug efflux protein  26.46 
 
 		 458 aa  100  4e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00321419  hitchhiker  0.00000631963 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2039  MATE efflux family protein  24.81 
 
 		 459 aa  101  4e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.017072  normal  0.0193468 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1139  MATE efflux family protein  25.89 
 
 		 452 aa  100  5e-20  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.813977  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0502  multidrug resistance protein NorM, putative  28.57 
 
 		 468 aa  100  5e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00841305  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1438  MATE efflux family protein  25.67 
 
 		 453 aa  100  5e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.805906  hitchhiker  0.00501053 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1382  multidrug efflux protein  26.37 
 
 		 460 aa  100  5e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.13512  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2511  multidrug efflux pump NorM  28.57 
 
 		 468 aa  100  5e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0112614  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2770  multidrug efflux pump NorM  28.57 
 
 		 468 aa  100  5e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00327808  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2885  multidrug efflux pump NorM  28.57 
 
 		 468 aa  100  5e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.132426  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1835  multidrug efflux pump NorM  28.57 
 
 		 468 aa  100  5e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.143849  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1783  multidrug efflux protein  26.41 
 
 		 457 aa  100  6e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00383484 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2025  MATE efflux family protein  25.06 
 
 		 459 aa  100  6e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0331062  normal  0.321717 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2306  MATE efflux family protein  24.61 
 
 		 469 aa  100  6e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.30452  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2268  MATE efflux family protein  21.99 
 
 		 452 aa  100  7e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.012169  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1686  multidrug resistance protein NorM, putative  28.57 
 
 		 464 aa  100  7e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.712622  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2295  MATE efflux family protein  25.06 
 
 		 459 aa  99.8  8e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2237  MATE efflux family protein  28.57 
 
 		 469 aa  100  8e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000615121  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1818  MATE efflux family protein  25.13 
 
 		 459 aa  100  8e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.138431 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1951  MATE efflux family protein  25.32 
 
 		 459 aa  99.8  9e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000663691  normal  0.290024 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2458  MATE efflux family protein  26.25 
 
 		 500 aa  99.4  1e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.672094  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2403  MATE efflux family protein  25.7 
 
 		 475 aa  99.4  1e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3141  MATE efflux family protein  28.76 
 
 		 472 aa  99.4  1e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.565795  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1263  MATE efflux family protein  29.59 
 
 		 467 aa  99  2e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0813234  normal  0.914064 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6251  MATE efflux family protein  25.88 
 
 		 461 aa  99  2e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0255  multidrug efflux protein NorA  29.2 
 
 		 461 aa  98.2  2e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0967  MATE efflux family protein  28.98 
 
 		 462 aa  98.6  2e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.932307  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1709  MATE efflux family protein  32.26 
 
 		 470 aa  97.8  3e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.578822 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0100  MATE efflux family protein  23.91 
 
 		 454 aa  97.8  3e-19  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0456451  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003524  multidrug efflux protein NorM  26.34 
 
 		 456 aa  98.2  3e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0260  MATE efflux family protein  27.08 
 
 		 478 aa  98.2  3e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2824  Na+-driven multidrug efflux pump  28.31 
 
 		 468 aa  98.2  3e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.338684  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1895  MATE efflux family protein  25.8 
 
 		 498 aa  97.4  4e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>