More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_0413 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_0413  MATE efflux family protein  100 
 
 		 449 aa  872    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2355  MATE efflux family protein  64.49 
 
 		 449 aa  563  1.0000000000000001e-159  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0530772  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1862  MATE efflux family protein  65.62 
 
 		 449 aa  553  1e-156  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0053  MATE efflux family protein  65.38 
 
 		 451 aa  539  9.999999999999999e-153  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.39001  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2418  MATE efflux family protein  32.46 
 
 		 471 aa  197  3e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1841  MATE efflux family protein  34.23 
 
 		 469 aa  194  3e-48  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3111  MATE efflux family protein  34.07 
 
 		 489 aa  192  1e-47  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00116438 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2664  MATE efflux family protein  30.11 
 
 		 460 aa  177  4e-43  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1967  MATE efflux family protein  29.31 
 
 		 488 aa  167  2.9999999999999998e-40  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0778152  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0494  MATE efflux family protein  28.67 
 
 		 455 aa  162  1e-38  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0475117  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2423  MATE efflux family protein  30.98 
 
 		 451 aa  140  3e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0441886  normal  0.25868 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0764  MATE family efflux pump NorM  30.98 
 
 		 451 aa  139  7.999999999999999e-32  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0411  MATE efflux family protein  30.73 
 
 		 453 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0755  MATE efflux family protein  29.7 
 
 		 456 aa  125  1e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0124459  normal  0.621342 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0650  MATE efflux family protein  27.06 
 
 		 458 aa  120  3.9999999999999996e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0252  MATE efflux family protein  29.69 
 
 		 460 aa  120  3.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1736  MATE efflux family protein  28.5 
 
 		 472 aa  114  4.0000000000000004e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.282832  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1930  MATE efflux family protein  27.76 
 
 		 460 aa  110  5e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.135248  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1263  MATE efflux family protein  26.41 
 
 		 467 aa  105  2e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0813234  normal  0.914064 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0591  MATE efflux family protein  26.62 
 
 		 438 aa  104  3e-21  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2708  MATE efflux family protein  27.32 
 
 		 467 aa  104  3e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2967  MATE efflux family protein  27.09 
 
 		 467 aa  103  9e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0284207 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1709  MATE efflux family protein  31.14 
 
 		 470 aa  99.4  1e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.578822 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1935  MATE efflux family protein  27.23 
 
 		 460 aa  98.6  2e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.18016  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4204  multi anti extrusion protein MatE  28.14 
 
 		 462 aa  97.8  3e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0638116  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3112  multidrug efflux protein  29.56 
 
 		 465 aa  98.2  3e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0279  MATE efflux family protein  23.61 
 
 		 445 aa  96.7  7e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0967  MATE efflux family protein  27.89 
 
 		 462 aa  96.7  7e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.932307  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0440  MATE efflux family protein  24.54 
 
 		 470 aa  96.7  8e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.589921  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2243  MATE efflux family protein  28.76 
 
 		 468 aa  96.3  9e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0971  MATE efflux family protein  27.89 
 
 		 462 aa  95.9  1e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.500099  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1050  MATE efflux family protein  27.64 
 
 		 462 aa  95.5  2e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.456746 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0612  MATE efflux family protein  27.64 
 
 		 462 aa  95.5  2e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1091  MATE efflux family protein  27.64 
 
 		 462 aa  95.5  2e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.427191  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5517  multidrug efflux protein NorA  29.47 
 
 		 464 aa  94.4  3e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3141  MATE efflux family protein  26.1 
 
 		 472 aa  93.6  6e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.565795  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2212  MATE efflux family protein  27.64 
 
 		 462 aa  92.4  1e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.520618  normal  0.988059 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3692  MATE efflux family protein  27.69 
 
 		 461 aa  92.8  1e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000025823  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2939  multidrug resistance protein  27.32 
 
 		 468 aa  92.8  1e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000000251457  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1686  multidrug resistance protein NorM, putative  27.82 
 
 		 464 aa  92.4  1e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.712622  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1298  MATE efflux family protein  27.27 
 
 		 467 aa  92.8  1e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0723  multidrug resistance protein  25.27 
 
 		 454 aa  93.2  1e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4462  MATE efflux family protein  27.83 
 
 		 470 aa  92.4  2e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0111  MATE efflux family protein  23.49 
 
 		 464 aa  90.9  5e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3565  MATE efflux family protein  25.63 
 
 		 452 aa  90.5  6e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0355  putative multidrug resistance protein NorM  23.83 
 
 		 471 aa  90.5  6e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.277827  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0113  MATE efflux family protein  23.73 
 
 		 464 aa  90.5  6e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1041  multi anti extrusion protein MatE  26.95 
 
 		 470 aa  90.1  7e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2943  MATE efflux family protein  26.95 
 
 		 470 aa  90.1  7e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.223425  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1279  putative inner membrane transmembrane protein  28.21 
 
 		 459 aa  89.7  8e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0284384  normal  0.285043 
 
 
-
 
NC_004310  BR0339  multidrug resistance protein NorM, putative  23.83 
 
 		 471 aa  89.4  1e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2885  multidrug efflux pump NorM  27.07 
 
 		 468 aa  89  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.132426  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0502  multidrug resistance protein NorM, putative  27.07 
 
 		 468 aa  89  2e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00841305  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1835  multidrug efflux pump NorM  27.07 
 
 		 468 aa  89  2e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.143849  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1579  MATE efflux family protein  24.75 
 
 		 445 aa  88.2  2e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2511  multidrug efflux pump NorM  27.07 
 
 		 468 aa  89  2e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0112614  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2770  multidrug efflux pump NorM  27.07 
 
 		 468 aa  89  2e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00327808  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0208  multidrug efflux protein NorA  29.18 
 
 		 462 aa  88.2  3e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0521775 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0797  MATE efflux family protein  27.11 
 
 		 463 aa  87.8  4e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.158372 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2824  Na+-driven multidrug efflux pump  26.82 
 
 		 468 aa  87  6e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.338684  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0697  multi anti extrusion protein MatE  25.13 
 
 		 468 aa  87  6e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.596572  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1237  hypothetical protein  25.06 
 
 		 458 aa  87  6e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0290804  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0991  MATE efflux family protein  26.65 
 
 		 475 aa  86.3  0.000000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000156724  normal  0.091152 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0073  multidrug efflux protein NorA  28.46 
 
 		 460 aa  85.5  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2369  MATE family protein  28.28 
 
 		 459 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.151607  normal  0.213094 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0427  MATE efflux family protein  22.92 
 
 		 446 aa  84.7  0.000000000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.744275  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1166  ABC transporter releated protein  24.67 
 
 		 463 aa  85.1  0.000000000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.403976 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5035  MATE efflux family protein  27.89 
 
 		 469 aa  83.6  0.000000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.88746  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09280  MATE efflux family protein  25.84 
 
 		 453 aa  83.2  0.000000000000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000476954  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4055  MATE efflux family protein  29.31 
 
 		 483 aa  83.2  0.000000000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0254154 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5262  multidrug efflux protein NorA  28.27 
 
 		 462 aa  81.6  0.00000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00407645  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0033  MATE efflux family protein  26.67 
 
 		 463 aa  81.6  0.00000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0259659  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0454  MATE efflux family protein  24.94 
 
 		 477 aa  81.3  0.00000000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0255  multidrug efflux protein NorA  27.87 
 
 		 461 aa  81.3  0.00000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0686  MATE efflux family protein  30.11 
 
 		 498 aa  80.9  0.00000000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.221481  normal  0.278001 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1541  MATE efflux family protein  30.23 
 
 		 486 aa  80.5  0.00000000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.127259  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2514  MATE efflux family protein  23.63 
 
 		 463 aa  80.9  0.00000000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02650  hypothetical protein  26.19 
 
 		 458 aa  80.5  0.00000000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1199  MATE efflux family protein  25.58 
 
 		 450 aa  80.1  0.00000000000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0538393  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2828  MATE efflux family protein  22.74 
 
 		 463 aa  80.1  0.00000000000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1680  multidrug efflux protein  24.35 
 
 		 457 aa  80.1  0.00000000000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1418  MATE efflux family protein  26.25 
 
 		 462 aa  80.1  0.00000000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5314  multidrug efflux protein NorA  29.28 
 
 		 462 aa  79.3  0.0000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.133881 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2306  MATE efflux family protein  22.84 
 
 		 469 aa  79.3  0.0000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.30452  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1117  MATE efflux family protein  26.18 
 
 		 483 aa  78.6  0.0000000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.860788 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1019  MATE efflux family protein  25.44 
 
 		 474 aa  79  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2022  multidrug efflux pump  24.82 
 
 		 459 aa  78.2  0.0000000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.54695  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0115  multidrug resistance protein NorM, putative  27.65 
 
 		 460 aa  77.8  0.0000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1558  multidrug efflux protein  25.05 
 
 		 457 aa  77.8  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.554893  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0945  MATE efflux family protein  25.32 
 
 		 453 aa  77.8  0.0000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.228244  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0953  MATE efflux family protein  26.28 
 
 		 450 aa  78.2  0.0000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0857  MATE efflux family protein  22.28 
 
 		 458 aa  77.8  0.0000000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2515  MATE efflux family protein  28.29 
 
 		 442 aa  77.8  0.0000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003772  Na+ driven multidrug efflux pump  25.96 
 
 		 458 aa  76.6  0.0000000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1918  multidrug efflux protein  24.84 
 
 		 457 aa  76.6  0.0000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.00462926  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0848  MATE efflux family protein  22.03 
 
 		 458 aa  77  0.0000000000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.720761  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2346  MATE efflux family protein  21.28 
 
 		 460 aa  76.6  0.0000000000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00458496 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1749  multidrug efflux protein  24.84 
 
 		 457 aa  76.3  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.000000000456858  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1783  multidrug efflux protein  23.53 
 
 		 457 aa  75.9  0.000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00383484 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000109  adhesin  22.96 
 
 		 461 aa  75.9  0.000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.466925  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>