More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_I2022 on replicon NC_011312
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009457  VC0395_A1237  hypothetical protein  69.87 
 
 		 458 aa  643    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0290804  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2022  multidrug efflux pump  100 
 
 		 459 aa  915    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.54695  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02650  hypothetical protein  63.38 
 
 		 458 aa  603  1.0000000000000001e-171  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003772  Na+ driven multidrug efflux pump  63.88 
 
 		 458 aa  591  1e-168  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0537  hypothetical protein  33.7 
 
 		 460 aa  268  2e-70  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05715  Na+-driven multidrug efflux pump  34.01 
 
 		 461 aa  257  3e-67  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2766  MATE efflux family protein  33.55 
 
 		 453 aa  249  1e-64  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0984562  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0830  MATE efflux family protein  34.92 
 
 		 445 aa  245  9.999999999999999e-64  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.000000918772  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0279  MATE efflux family protein  34.74 
 
 		 445 aa  242  1e-62  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000109  adhesin  31.99 
 
 		 461 aa  239  9e-62  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.466925  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2514  MATE efflux family protein  30.11 
 
 		 463 aa  232  1e-59  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2828  MATE efflux family protein  29.89 
 
 		 463 aa  231  2e-59  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0848  MATE efflux family protein  31.5 
 
 		 458 aa  228  1e-58  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.720761  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0857  MATE efflux family protein  31.5 
 
 		 458 aa  228  2e-58  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0522  MATE efflux family protein  30.32 
 
 		 461 aa  209  7e-53  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0621  MATE efflux family protein  31 
 
 		 460 aa  206  1e-51  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.27098  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0330  MATE efflux family protein  28.79 
 
 		 479 aa  203  5e-51  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0897  MATE efflux family protein  29.66 
 
 		 453 aa  201  1.9999999999999998e-50  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000262958  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3712  MATE efflux family protein  33.04 
 
 		 454 aa  196  6e-49  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.139203  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1116  MATE efflux family protein  28.86 
 
 		 456 aa  190  4e-47  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1981  MATE efflux family protein  29.2 
 
 		 455 aa  183  6e-45  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000219259  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1138  MATE efflux family protein  27.35 
 
 		 450 aa  182  1e-44  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000318212  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0994  MATE efflux family protein  24.5 
 
 		 449 aa  149  9e-35  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0743  MATE efflux family protein  26.19 
 
 		 484 aa  141  3e-32  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000192336  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2425  MATE efflux family protein  24.62 
 
 		 461 aa  133  6.999999999999999e-30  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.264518  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0691  MATE efflux family protein  24.6 
 
 		 450 aa  125  2e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0596  hypothetical protein  25.18 
 
 		 449 aa  123  7e-27  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.207285  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18490  MATE efflux family protein  22.92 
 
 		 442 aa  117  3e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000174233  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1506  MATE efflux family protein  24.6 
 
 		 450 aa  110  5e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0981  MATE efflux family protein  23.08 
 
 		 456 aa  109  8.000000000000001e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.730082  normal  0.0880752 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1094  MATE efflux family protein  22.95 
 
 		 464 aa  109  1e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000923462  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0575  MATE efflux family protein  25.84 
 
 		 459 aa  106  8e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000335028  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0901  MATE efflux family protein  22.05 
 
 		 463 aa  105  1e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000627796  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4103  Na+ driven multidrug efflux pump  23.42 
 
 		 463 aa  104  3e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0660054  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0427  MATE efflux family protein  25.5 
 
 		 446 aa  104  3e-21  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.744275  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0299  MATE efflux family protein  25.79 
 
 		 456 aa  104  3e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000180901  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1082  efflux protein  23.25 
 
 		 464 aa  104  4e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000125629  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2475  MATE efflux family protein  23.34 
 
 		 463 aa  103  5e-21  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.211957  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1106  MATE efflux family protein  23.08 
 
 		 464 aa  103  5e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000560081  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1088  efflux protein  23.08 
 
 		 464 aa  103  5e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000024435  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1343  MATE efflux family protein  23.02 
 
 		 464 aa  103  5e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00000317655  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1196  MATE efflux family protein  23.08 
 
 		 464 aa  103  5e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000655029  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1709  MATE efflux family protein  26.41 
 
 		 470 aa  102  1e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.578822 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1266  MATE efflux family protein  23.08 
 
 		 464 aa  102  1e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1579  MATE efflux family protein  25.75 
 
 		 445 aa  102  1e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0762  MATE efflux family protein  25.06 
 
 		 458 aa  102  2e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1305  MATE efflux family protein  22.85 
 
 		 464 aa  101  3e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.40401  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1239  MATE efflux family protein  22.85 
 
 		 464 aa  101  3e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.238085  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1767  MATE efflux family protein  25.5 
 
 		 462 aa  100  8e-20  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2630  MATE efflux family protein  24.72 
 
 		 472 aa  100  8e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.850794  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09280  MATE efflux family protein  23.79 
 
 		 453 aa  99.4  1e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000476954  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0111  MATE efflux family protein  23.08 
 
 		 464 aa  98.2  3e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0764  MATE family efflux pump NorM  25.66 
 
 		 451 aa  97.8  4e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0113  MATE efflux family protein  23.49 
 
 		 464 aa  97.4  5e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2423  MATE efflux family protein  25.66 
 
 		 451 aa  96.7  9e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0441886  normal  0.25868 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3059  MATE efflux family protein  23.56 
 
 		 469 aa  95.9  1e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.231532  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1199  MATE efflux family protein  25.66 
 
 		 450 aa  96.3  1e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0538393  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3296  MATE efflux family protein  23.56 
 
 		 469 aa  95.9  1e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.660304  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0591  MATE efflux family protein  26.23 
 
 		 438 aa  95.5  2e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2295  MATE efflux family protein  24.62 
 
 		 475 aa  95.1  2e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00026572  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6233  MATE efflux family protein  23.34 
 
 		 443 aa  93.2  8e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0410154  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000940  Na+ driven multidrug efflux pump  27.13 
 
 		 446 aa  93.2  9e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000926882  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0650  MATE efflux family protein  26.07 
 
 		 458 aa  93.2  9e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3565  MATE efflux family protein  23.87 
 
 		 452 aa  92.8  1e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3692  MATE efflux family protein  25.11 
 
 		 461 aa  92  2e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000025823  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1415  MATE efflux family protein  26.52 
 
 		 466 aa  91.7  2e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.167041 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0906  MATE efflux family protein  22.94 
 
 		 448 aa  90.5  6e-17  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000766798  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1419  MATE efflux family protein  23.78 
 
 		 469 aa  90.1  7e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.703884  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5025  MATE efflux family protein  24.75 
 
 		 461 aa  90.1  7e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.274377  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3886  MATE efflux family protein  26.89 
 
 		 481 aa  90.1  8e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3760  MATE efflux family protein  24.63 
 
 		 464 aa  89.7  9e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1930  MATE efflux family protein  26.83 
 
 		 460 aa  89.4  1e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.135248  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0991  MATE efflux family protein  23.75 
 
 		 475 aa  88.6  2e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000156724  normal  0.091152 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1641  MATE efflux family protein  22.75 
 
 		 469 aa  88.6  2e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.725642  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4055  MATE efflux family protein  27.62 
 
 		 483 aa  89  2e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0254154 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0454  MATE efflux family protein  23.96 
 
 		 477 aa  87.8  4e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06935  Na+-driven multidrug efflux pump  25.6 
 
 		 446 aa  87.4  5e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0440  MATE efflux family protein  23.04 
 
 		 470 aa  87  6e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.589921  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0355  putative multidrug resistance protein NorM  23.26 
 
 		 471 aa  86.7  8e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.277827  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1621  Na+ driven multidrug efflux pump  22.75 
 
 		 469 aa  86.7  8e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1591  Na+ driven multidrug efflux pump  22.75 
 
 		 469 aa  86.7  8e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.742873  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6399  MATE efflux family protein  28.86 
 
 		 425 aa  86.7  8e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.444399  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1823  putative MATE efflux protein  22.75 
 
 		 469 aa  86.7  8e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3419  MATE efflux family protein  27.49 
 
 		 504 aa  86.7  9e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3019  MATE efflux family protein  23.04 
 
 		 453 aa  86.7  9e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000108454  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1263  MATE efflux family protein  27.06 
 
 		 467 aa  86.3  0.000000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0813234  normal  0.914064 
 
 
-
 
NC_004310  BR0339  multidrug resistance protein NorM, putative  23.26 
 
 		 471 aa  86.3  0.000000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0485  hypothetical protein  26.15 
 
 		 454 aa  86.3  0.000000000000001  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0273971  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0597  hypothetical protein  23.23 
 
 		 444 aa  86.3  0.000000000000001  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0651  MATE efflux family protein  24.41 
 
 		 446 aa  85.9  0.000000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.000388571  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0998  MATE efflux family protein  26.28 
 
 		 500 aa  85.9  0.000000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.280475  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1166  ABC transporter releated protein  23.98 
 
 		 463 aa  86.3  0.000000000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.403976 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2306  MATE efflux family protein  23.82 
 
 		 469 aa  85.9  0.000000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.30452  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1846  integral membrane protein, putative  22.5 
 
 		 469 aa  85.1  0.000000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.563684  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3177  MATE efflux family protein  22.81 
 
 		 469 aa  85.5  0.000000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.186099  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0147  MATE efflux family protein  24.19 
 
 		 462 aa  85.1  0.000000000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000317216  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0411  MATE efflux family protein  24.57 
 
 		 453 aa  85.1  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1899  putative MATE efflux protein  22.5 
 
 		 469 aa  85.5  0.000000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00227155  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2862  MATE efflux family protein  23.94 
 
 		 469 aa  85.1  0.000000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.83664  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0645  DcuC protein  22.87 
 
 		 439 aa  84.7  0.000000000000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>