More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_2418 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007519  Dde_2418  MATE efflux family protein  100 
 
 		 471 aa  930    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1841  MATE efflux family protein  55.19 
 
 		 469 aa  483  1e-135  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3111  MATE efflux family protein  55.91 
 
 		 489 aa  457  1e-127  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00116438 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2664  MATE efflux family protein  45.53 
 
 		 460 aa  352  7e-96  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1967  MATE efflux family protein  36.78 
 
 		 488 aa  271  1e-71  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0778152  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0494  MATE efflux family protein  34.99 
 
 		 455 aa  263  4.999999999999999e-69  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0475117  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2355  MATE efflux family protein  34.87 
 
 		 449 aa  216  5e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0530772  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1862  MATE efflux family protein  34.21 
 
 		 449 aa  211  2e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0053  MATE efflux family protein  33.11 
 
 		 451 aa  199  7e-50  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.39001  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0413  MATE efflux family protein  32.46 
 
 		 449 aa  192  8e-48  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3692  MATE efflux family protein  28.48 
 
 		 461 aa  143  8e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000025823  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0252  MATE efflux family protein  32.07 
 
 		 460 aa  141  1.9999999999999998e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2306  MATE efflux family protein  26.22 
 
 		 469 aa  136  8e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.30452  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0591  MATE efflux family protein  26.48 
 
 		 438 aa  134  3e-30  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2423  MATE efflux family protein  29.7 
 
 		 451 aa  131  2.0000000000000002e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0441886  normal  0.25868 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0764  MATE family efflux pump NorM  29.7 
 
 		 451 aa  130  6e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0991  MATE efflux family protein  26.34 
 
 		 475 aa  129  9.000000000000001e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000156724  normal  0.091152 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0358  multi anti extrusion protein MatE  30.61 
 
 		 452 aa  128  2.0000000000000002e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000377442  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0411  MATE efflux family protein  29.19 
 
 		 453 aa  125  1e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3129  MATE efflux family protein  33.33 
 
 		 452 aa  118  1.9999999999999998e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0111  MATE efflux family protein  22.41 
 
 		 464 aa  117  3e-25  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1277  MATE efflux family protein  27.27 
 
 		 480 aa  117  3.9999999999999997e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0440  MATE efflux family protein  26.79 
 
 		 470 aa  117  5e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.589921  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46680  putative transporter  26.22 
 
 		 477 aa  117  5e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.013844  hitchhiker  0.0000129498 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4023  putative transporter  26.22 
 
 		 477 aa  117  6e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.343891  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1783  multidrug efflux protein  27.25 
 
 		 457 aa  117  6e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00383484 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0113  MATE efflux family protein  22.59 
 
 		 464 aa  116  8.999999999999998e-25  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2492  MATE efflux family protein  27.35 
 
 		 485 aa  115  2.0000000000000002e-24  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.544481  normal  0.228664 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0260  MATE efflux family protein  27.59 
 
 		 478 aa  114  4.0000000000000004e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0747  MATE efflux family protein  27.92 
 
 		 490 aa  114  5e-24  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3887  multi anti extrusion protein MatE  27.88 
 
 		 466 aa  113  6e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0845713 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09280  MATE efflux family protein  22.25 
 
 		 453 aa  113  6e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000476954  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1712  multidrug efflux protein  25.58 
 
 		 457 aa  112  1.0000000000000001e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1382  multidrug efflux protein  26.54 
 
 		 460 aa  112  2.0000000000000002e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.13512  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1907  MATE efflux family protein  29.93 
 
 		 457 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0742597  normal  0.100602 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3141  MATE efflux family protein  30.23 
 
 		 472 aa  111  3e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.565795  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4400  MATE efflux family protein  29.41 
 
 		 453 aa  111  3e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0121801  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2403  MATE efflux family protein  27.09 
 
 		 475 aa  110  4.0000000000000004e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0355  putative multidrug resistance protein NorM  26.88 
 
 		 471 aa  110  5e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.277827  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1680  multidrug efflux protein  26.1 
 
 		 457 aa  110  6e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2243  MATE efflux family protein  28.7 
 
 		 468 aa  110  7.000000000000001e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1736  MATE efflux family protein  27.76 
 
 		 472 aa  109  8.000000000000001e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.282832  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0339  multidrug resistance protein NorM, putative  26.88 
 
 		 471 aa  109  9.000000000000001e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1818  MATE efflux family protein  27.13 
 
 		 459 aa  109  1e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.138431 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2268  MATE efflux family protein  27.06 
 
 		 452 aa  108  1e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.012169  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1225  multidrug efflux pump, NorM, MATE family  26.05 
 
 		 455 aa  108  2e-22  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000329619  normal  0.0233556 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1743  multidrug efflux protein  27.95 
 
 		 457 aa  107  5e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000609014  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1966  multidrug efflux protein  27.95 
 
 		 457 aa  107  5e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000267108 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3565  MATE efflux family protein  29.26 
 
 		 452 aa  107  5e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01634  multidrug efflux protein NorM  27.95 
 
 		 457 aa  107  6e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.900215  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3993  MATE efflux family protein  29.28 
 
 		 447 aa  107  6e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01624  hypothetical protein  27.95 
 
 		 457 aa  107  6e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7238  MATE efflux family protein  24.87 
 
 		 450 aa  106  8e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.866766  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2376  multidrug efflux protein  27.95 
 
 		 457 aa  106  8e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000568736  normal  0.0171948 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1977  MATE efflux family protein  27.95 
 
 		 457 aa  106  9e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000001739  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1877  multidrug efflux protein  27.44 
 
 		 457 aa  106  9e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000154294  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1861  multidrug efflux protein  27.44 
 
 		 457 aa  106  9e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000216071  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0255  multidrug efflux protein NorA  30.08 
 
 		 461 aa  106  9e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2291  MATE efflux family protein  28.12 
 
 		 460 aa  106  9e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2189  multidrug efflux protein  25.26 
 
 		 458 aa  106  1e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00321419  hitchhiker  0.00000631963 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4087  MATE efflux family protein  29.28 
 
 		 447 aa  106  1e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1534  multidrug efflux protein  27.44 
 
 		 457 aa  106  1e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00445038  hitchhiker  0.00117159 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1166  MATE efflux family protein  25.32 
 
 		 455 aa  105  2e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0236579  normal  0.0144354 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2226  MATE efflux family protein  26.53 
 
 		 459 aa  105  2e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00326481  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1579  MATE efflux family protein  24.27 
 
 		 445 aa  104  3e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0073  multidrug efflux protein NorA  27.78 
 
 		 460 aa  104  3e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2369  MATE family protein  26.26 
 
 		 459 aa  104  3e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.151607  normal  0.213094 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1808  MATE efflux family protein  26 
 
 		 499 aa  104  3e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.848054  normal  0.460632 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0945  MATE efflux family protein  26.11 
 
 		 453 aa  104  4e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.228244  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2391  multidrug efflux protein  25.26 
 
 		 457 aa  104  4e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.346064  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0755  MATE efflux family protein  26.77 
 
 		 456 aa  104  4e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0124459  normal  0.621342 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2675  multidrug efflux protein  25.25 
 
 		 457 aa  103  5e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2885  multidrug efflux pump NorM  28.61 
 
 		 468 aa  103  6e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.132426  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1835  multidrug efflux pump NorM  28.61 
 
 		 468 aa  103  6e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.143849  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0502  multidrug resistance protein NorM, putative  28.61 
 
 		 468 aa  103  6e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00841305  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2511  multidrug efflux pump NorM  28.61 
 
 		 468 aa  103  6e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0112614  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2770  multidrug efflux pump NorM  28.61 
 
 		 468 aa  103  6e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00327808  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2144  MATE efflux family protein  26.28 
 
 		 459 aa  103  7e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00844779  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1773  MATE efflux family protein  25.2 
 
 		 451 aa  103  7e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0427  MATE efflux family protein  22.39 
 
 		 446 aa  103  9e-21  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.744275  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1746  MATE efflux family protein  24.67 
 
 		 451 aa  102  1e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.325105  normal  0.141964 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0115  multidrug resistance protein NorM, putative  27.07 
 
 		 460 aa  102  1e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1535  multidrug efflux protein  27.25 
 
 		 457 aa  102  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.153308  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003524  multidrug efflux protein NorM  24.27 
 
 		 456 aa  102  1e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2334  MATE efflux family protein  26.02 
 
 		 459 aa  102  1e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0215455  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1686  multidrug resistance protein NorM, putative  27.92 
 
 		 464 aa  102  1e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.712622  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1918  multidrug efflux protein  26.97 
 
 		 457 aa  102  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.00462926  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1558  multidrug efflux protein  27.25 
 
 		 457 aa  102  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.554893  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1749  multidrug efflux protein  26.97 
 
 		 457 aa  102  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.000000000456858  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02236  multidrug efflux protein  25 
 
 		 456 aa  101  2e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2824  Na+-driven multidrug efflux pump  28.35 
 
 		 468 aa  102  2e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.338684  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2939  multidrug resistance protein  28.35 
 
 		 468 aa  102  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000000251457  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1521  multidrug efflux protein  26.97 
 
 		 457 aa  102  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0251273  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0723  multidrug resistance protein  24.42 
 
 		 454 aa  102  2e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0575  MATE efflux family protein  31.86 
 
 		 459 aa  101  2e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000335028  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1023  multi anti extrusion protein MatE  27.04 
 
 		 464 aa  102  2e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2180  MATE efflux family protein  26.28 
 
 		 459 aa  101  3e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0347307  hitchhiker  0.00809884 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2021  MATE efflux family protein  26.11 
 
 		 459 aa  101  4e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.068877  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1146  multidrug efflux protein  24.74 
 
 		 461 aa  100  4e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.292586  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0707  MATE efflux family protein  25.9 
 
 		 518 aa  100  5e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.376903  normal  0.476505 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>