176 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_1023 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_1023  multi anti extrusion protein MatE  100 
 
 		 464 aa  926    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0494  MATE efflux family protein  26.15 
 
 		 455 aa  150  3e-35  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0475117  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2664  MATE efflux family protein  25.84 
 
 		 460 aa  135  1.9999999999999998e-30  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1967  MATE efflux family protein  29.22 
 
 		 488 aa  110  6e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0778152  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2418  MATE efflux family protein  27.04 
 
 		 471 aa  108  2e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1841  MATE efflux family protein  27.58 
 
 		 469 aa  106  8e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3111  MATE efflux family protein  26.34 
 
 		 489 aa  96.7  8e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00116438 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0252  MATE efflux family protein  26.95 
 
 		 460 aa  95.9  1e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2355  MATE efflux family protein  25.29 
 
 		 449 aa  89  1e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0530772  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0113  MATE efflux family protein  21.72 
 
 		 464 aa  83.6  0.000000000000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1862  MATE efflux family protein  26.33 
 
 		 449 aa  83.2  0.000000000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0111  MATE efflux family protein  21.63 
 
 		 464 aa  81.3  0.00000000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0413  MATE efflux family protein  24.15 
 
 		 449 aa  77.4  0.0000000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3692  MATE efflux family protein  25.55 
 
 		 461 aa  76.3  0.000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000025823  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09173  MATE efflux family protein  24.56 
 
 		 457 aa  75.1  0.000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2423  MATE efflux family protein  25.22 
 
 		 451 aa  74.7  0.000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0441886  normal  0.25868 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5025  MATE efflux family protein  22.94 
 
 		 461 aa  75.1  0.000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.274377  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0053  MATE efflux family protein  23.51 
 
 		 451 aa  73.9  0.000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.39001  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1199  MATE efflux family protein  20.39 
 
 		 450 aa  72.8  0.00000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0538393  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0764  MATE family efflux pump NorM  24.93 
 
 		 451 aa  72  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3565  MATE efflux family protein  23.8 
 
 		 452 aa  71.2  0.00000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0411  MATE efflux family protein  24.05 
 
 		 453 aa  71.6  0.00000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2306  MATE efflux family protein  21.46 
 
 		 469 aa  68.9  0.0000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.30452  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0591  MATE efflux family protein  21.94 
 
 		 438 aa  68.9  0.0000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1139  MATE efflux family protein  23.72 
 
 		 452 aa  68.6  0.0000000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.813977  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0755  MATE efflux family protein  23.39 
 
 		 456 aa  66.6  0.0000000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0124459  normal  0.621342 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2243  MATE efflux family protein  27.07 
 
 		 468 aa  65.9  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0575  MATE efflux family protein  26.36 
 
 		 459 aa  65.5  0.000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000335028  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4055  MATE efflux family protein  25.89 
 
 		 483 aa  65.1  0.000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0254154 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0621  MATE efflux family protein  26.26 
 
 		 460 aa  64.3  0.000000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.27098  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2237  MATE efflux family protein  23.08 
 
 		 469 aa  63.9  0.000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000615121  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1767  MATE efflux family protein  23.03 
 
 		 462 aa  63.2  0.000000009  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1736  MATE efflux family protein  25.42 
 
 		 472 aa  61.6  0.00000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.282832  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0299  MATE efflux family protein  22.25 
 
 		 456 aa  61.2  0.00000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000180901  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4400  MATE efflux family protein  24.28 
 
 		 453 aa  60.5  0.00000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0121801  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0967  MATE efflux family protein  27.04 
 
 		 462 aa  60.1  0.00000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.932307  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1094  MATE efflux family protein  23.65 
 
 		 464 aa  59.3  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000923462  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0971  MATE efflux family protein  26.71 
 
 		 462 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.500099  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0427  MATE efflux family protein  25.9 
 
 		 446 aa  58.2  0.0000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.744275  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46680  putative transporter  25.35 
 
 		 477 aa  58.2  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.013844  hitchhiker  0.0000129498 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3129  MATE efflux family protein  22.93 
 
 		 452 aa  57.8  0.0000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1263  MATE efflux family protein  27.05 
 
 		 467 aa  57.8  0.0000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0813234  normal  0.914064 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4023  putative transporter  25.35 
 
 		 477 aa  58.2  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.343891  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1117  MATE efflux family protein  25.41 
 
 		 483 aa  57.8  0.0000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.860788 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0850  MATE efflux family protein  23.84 
 
 		 439 aa  57.4  0.0000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.313022  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3887  multi anti extrusion protein MatE  23.46 
 
 		 466 aa  57.4  0.0000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0845713 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0279  MATE efflux family protein  23.13 
 
 		 445 aa  56.6  0.0000008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1359  multi anti extrusion protein MatE  24.92 
 
 		 408 aa  56.2  0.000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0897  MATE efflux family protein  25.14 
 
 		 453 aa  56.6  0.000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000262958  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2297  MATE efflux family protein  25.36 
 
 		 450 aa  56.2  0.000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6399  MATE efflux family protein  27.72 
 
 		 425 aa  56.6  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.444399  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0293  MATE efflux family protein  22.14 
 
 		 467 aa  55.8  0.000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0358  multi anti extrusion protein MatE  24.05 
 
 		 452 aa  55.8  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000377442  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1506  MATE efflux family protein  26.42 
 
 		 450 aa  55.5  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0723  multidrug resistance protein  23.38 
 
 		 454 aa  55.8  0.000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2173  MATE efflux family protein  21.96 
 
 		 481 aa  55.8  0.000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.843006 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5035  MATE efflux family protein  28.36 
 
 		 469 aa  55.8  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.88746  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1719  MATE efflux family protein  29.29 
 
 		 441 aa  55.1  0.000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0706811  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2212  MATE efflux family protein  24.16 
 
 		 462 aa  53.9  0.000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.520618  normal  0.988059 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1106  MATE efflux family protein  22.64 
 
 		 464 aa  53.9  0.000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000560081  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1088  efflux protein  22.64 
 
 		 464 aa  53.9  0.000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000024435  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1196  MATE efflux family protein  22.64 
 
 		 464 aa  53.9  0.000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000655029  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1277  MATE efflux family protein  23.11 
 
 		 480 aa  53.9  0.000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1082  efflux protein  22.64 
 
 		 464 aa  53.5  0.000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000125629  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2514  MATE efflux family protein  23.11 
 
 		 463 aa  53.1  0.000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2828  MATE efflux family protein  23.11 
 
 		 463 aa  53.1  0.00001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3112  multidrug efflux protein  23.9 
 
 		 465 aa  52.8  0.00001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1139  hypothetical protein  26.91 
 
 		 484 aa  53.1  0.00001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.0000000023845  hitchhiker  0.0000334983 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4103  Na+ driven multidrug efflux pump  21.62 
 
 		 463 aa  53.1  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0660054  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0162  MATE efflux family protein  24.94 
 
 		 486 aa  53.1  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0875  mate efflux family protein  25.37 
 
 		 446 aa  53.1  0.00001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1659  hypothetical protein  26.46 
 
 		 495 aa  53.1  0.00001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.000000439345  normal  0.0451104 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1305  MATE efflux family protein  22.3 
 
 		 464 aa  52  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.40401  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1418  MATE efflux family protein  23.3 
 
 		 462 aa  52.4  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1266  MATE efflux family protein  22.64 
 
 		 464 aa  52.4  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2291  MATE efflux family protein  20.86 
 
 		 460 aa  52  0.00002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1239  MATE efflux family protein  23.95 
 
 		 464 aa  52  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.238085  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2108  hypothetical protein  26.46 
 
 		 546 aa  52  0.00002  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  6.24671e-19  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01896  predicted multidrug efflux system  23.66 
 
 		 547 aa  51.6  0.00003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0202846  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1669  MATE efflux family protein  26.46 
 
 		 495 aa  51.6  0.00003  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000135228  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1050  MATE efflux family protein  27.83 
 
 		 462 aa  51.6  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.456746 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0612  MATE efflux family protein  27.83 
 
 		 462 aa  51.6  0.00003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1091  MATE efflux family protein  27.83 
 
 		 462 aa  51.6  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.427191  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01885  hypothetical protein  23.66 
 
 		 547 aa  51.6  0.00003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0187925  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3760  MATE efflux family protein  22.34 
 
 		 464 aa  51.2  0.00003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2829  hypothetical protein  26.46 
 
 		 484 aa  51.2  0.00004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.0000000399298  normal  0.437543 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4204  multi anti extrusion protein MatE  27.83 
 
 		 462 aa  51.2  0.00004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0638116  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003772  Na+ driven multidrug efflux pump  23.82 
 
 		 458 aa  51.2  0.00004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0650  MATE efflux family protein  21.53 
 
 		 458 aa  51.2  0.00004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2267  hypothetical protein  26.46 
 
 		 546 aa  51.2  0.00004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000010697  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4087  MATE efflux family protein  22.37 
 
 		 447 aa  50.8  0.00005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2708  MATE efflux family protein  24.44 
 
 		 467 aa  50.4  0.00006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0014  MATE efflux family protein  22.8 
 
 		 453 aa  50.4  0.00006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.0029857  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1907  MATE efflux family protein  23.3 
 
 		 457 aa  50.4  0.00007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0742597  normal  0.100602 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09280  MATE efflux family protein  19.55 
 
 		 453 aa  50.1  0.00009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000476954  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1621  Na+ driven multidrug efflux pump  21.64 
 
 		 469 aa  49.7  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1591  Na+ driven multidrug efflux pump  21.64 
 
 		 469 aa  49.7  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.742873  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1670  MATE efflux family protein  21.88 
 
 		 466 aa  49.7  0.0001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1541  MATE efflux family protein  28.4 
 
 		 486 aa  49.7  0.0001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.127259  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1823  putative MATE efflux protein  21.64 
 
 		 469 aa  49.7  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>