More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_0850 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_0850  MATE efflux family protein  100 
 
 		 439 aa  870    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.313022  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2915  multidrug resistance protein NorM  29.84 
 
 		 472 aa  179  5.999999999999999e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.706169  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02236  multidrug efflux protein  30.36 
 
 		 456 aa  179  1e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1501  multidrug efflux protein  27.74 
 
 		 454 aa  177  3e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3909  multidrug efflux protein  27.63 
 
 		 452 aa  177  5e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1295  multidrug efflux protein  27.4 
 
 		 453 aa  176  6e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0578421  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1402  multidrug efflux protein  27.4 
 
 		 453 aa  176  6e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1472  multidrug efflux protein  27.4 
 
 		 453 aa  176  7e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1267  multidrug efflux protein  27.4 
 
 		 453 aa  176  7e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1304  multidrug efflux protein  28.17 
 
 		 452 aa  176  7e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1856  multidrug efflux protein  28.37 
 
 		 455 aa  175  1.9999999999999998e-42  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.30191  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2346  MATE efflux family protein  27.62 
 
 		 460 aa  174  1.9999999999999998e-42  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00458496 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2117  MATE efflux family protein  29.34 
 
 		 458 aa  174  2.9999999999999996e-42  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0110658  normal  0.0465778 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2268  MATE efflux family protein  28.47 
 
 		 452 aa  173  5e-42  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.012169  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2494  MATE efflux family protein  29.84 
 
 		 458 aa  173  5.999999999999999e-42  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.121522  hitchhiker  0.0012501 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003524  multidrug efflux protein NorM  29.33 
 
 		 456 aa  173  5.999999999999999e-42  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1269  multidrug efflux protein  26.7 
 
 		 453 aa  172  6.999999999999999e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.801506  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1435  multidrug efflux protein  27.17 
 
 		 452 aa  171  2e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.602082  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1109  multidrug efflux protein  28.47 
 
 		 452 aa  170  5e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.654532  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2037  MATE efflux family protein  30.5 
 
 		 461 aa  167  4e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.01185  hitchhiker  0.00138183 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1761  MATE efflux family protein  30.02 
 
 		 453 aa  167  4e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.129666  normal  0.0637882 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2675  multidrug efflux protein  28.97 
 
 		 457 aa  166  5.9999999999999996e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1166  MATE efflux family protein  27.69 
 
 		 455 aa  166  6.9999999999999995e-40  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0236579  normal  0.0144354 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1277  MATE efflux family protein  28.18 
 
 		 480 aa  164  2.0000000000000002e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1225  multidrug efflux pump, NorM, MATE family  27.46 
 
 		 455 aa  165  2.0000000000000002e-39  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000329619  normal  0.0233556 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3887  multi anti extrusion protein MatE  28.74 
 
 		 466 aa  164  3e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0845713 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1382  multidrug efflux protein  28.19 
 
 		 460 aa  163  6e-39  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.13512  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2226  MATE efflux family protein  29.22 
 
 		 459 aa  163  7e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00326481  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2180  MATE efflux family protein  29.22 
 
 		 459 aa  162  8.000000000000001e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0347307  hitchhiker  0.00809884 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2144  MATE efflux family protein  29.22 
 
 		 459 aa  162  9e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00844779  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1702  MATE efflux family protein  29.27 
 
 		 453 aa  162  9e-39  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.125502  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1712  multidrug efflux protein  27.66 
 
 		 457 aa  162  1e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2334  MATE efflux family protein  28.98 
 
 		 459 aa  161  2e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0215455  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1356  MATE efflux family protein  30.14 
 
 		 461 aa  161  2e-38  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2391  multidrug efflux protein  27.7 
 
 		 457 aa  161  2e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.346064  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1541  multidrug efflux protein  27.63 
 
 		 453 aa  160  3e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.1514  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1680  multidrug efflux protein  27.94 
 
 		 457 aa  160  4e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2021  MATE efflux family protein  28.23 
 
 		 459 aa  160  5e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.068877  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46680  putative transporter  30.12 
 
 		 477 aa  159  8e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.013844  hitchhiker  0.0000129498 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1146  multidrug efflux protein  28.05 
 
 		 461 aa  158  1e-37  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.292586  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4023  putative transporter  30.41 
 
 		 477 aa  159  1e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.343891  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2538  MATE efflux family protein  28.1 
 
 		 454 aa  159  1e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2579  multidrug efflux protein  27.73 
 
 		 457 aa  157  3e-37  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.966509  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1750  multidrug efflux protein  27.73 
 
 		 457 aa  157  3e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000919244  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2403  MATE efflux family protein  29.06 
 
 		 475 aa  157  3e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2031  MATE efflux family protein  27.78 
 
 		 453 aa  157  3e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1856  multidrug efflux protein  27.73 
 
 		 457 aa  157  3e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.372072  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2039  MATE efflux family protein  28.57 
 
 		 459 aa  157  3e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.017072  normal  0.0193468 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0811  multidrug efflux protein  28.22 
 
 		 425 aa  156  6e-37  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2025  MATE efflux family protein  28.57 
 
 		 459 aa  156  6e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0331062  normal  0.321717 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1951  MATE efflux family protein  28.57 
 
 		 459 aa  156  7e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000663691  normal  0.290024 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0387  multidrug efflux protein  25.73 
 
 		 457 aa  155  1e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0273741  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2189  multidrug efflux protein  25.87 
 
 		 458 aa  155  1e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00321419  hitchhiker  0.00000631963 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2295  MATE efflux family protein  28.98 
 
 		 459 aa  155  2e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1783  multidrug efflux protein  26.77 
 
 		 457 aa  155  2e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00383484 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2909  multidrug efflux protein  27.23 
 
 		 449 aa  153  5e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000144905  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1907  MATE efflux family protein  28.05 
 
 		 457 aa  153  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0742597  normal  0.100602 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0260  MATE efflux family protein  26.87 
 
 		 478 aa  151  2e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1656  MATE efflux family protein  27.71 
 
 		 456 aa  150  4e-35  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.737178  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2247  Na+-driven multidrug efflux pump  28.51 
 
 		 464 aa  150  6e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1743  multidrug efflux protein  28.01 
 
 		 457 aa  150  6e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000609014  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1966  multidrug efflux protein  28.01 
 
 		 457 aa  150  6e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000267108 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01634  multidrug efflux protein NorM  28.01 
 
 		 457 aa  149  7e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.900215  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01624  hypothetical protein  28.01 
 
 		 457 aa  149  7e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1977  MATE efflux family protein  28.01 
 
 		 457 aa  149  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000001739  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2376  multidrug efflux protein  28.01 
 
 		 457 aa  149  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000568736  normal  0.0171948 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1534  multidrug efflux protein  28.01 
 
 		 457 aa  148  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00445038  hitchhiker  0.00117159 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1861  multidrug efflux protein  28.01 
 
 		 457 aa  148  2.0000000000000003e-34  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000216071  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1877  multidrug efflux protein  28.01 
 
 		 457 aa  148  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000154294  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1535  multidrug efflux protein  28.21 
 
 		 457 aa  146  8.000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.153308  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1521  multidrug efflux protein  28.01 
 
 		 457 aa  145  1e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0251273  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1749  multidrug efflux protein  28.01 
 
 		 457 aa  145  1e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.000000000456858  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02164  multidrug efflux protein NorA  26.43 
 
 		 457 aa  145  2e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.193678  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29880  Multidrug efflux protein  28.83 
 
 		 459 aa  144  3e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.613777  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1918  multidrug efflux protein  27.98 
 
 		 457 aa  144  4e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.00462926  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1558  multidrug efflux protein  27.78 
 
 		 457 aa  143  5e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.554893  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2429  multidrug efflux protein  25.69 
 
 		 455 aa  143  6e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2369  MATE family protein  27.67 
 
 		 459 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.151607  normal  0.213094 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5025  MATE efflux family protein  28.96 
 
 		 461 aa  139  8.999999999999999e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.274377  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2036  MATE efflux family protein  28.57 
 
 		 464 aa  138  2e-31  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.0000288761  decreased coverage  0.0000000485587 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0723  multidrug resistance protein  25.89 
 
 		 454 aa  136  6.0000000000000005e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0945  MATE efflux family protein  29.47 
 
 		 453 aa  134  3e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.228244  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09173  MATE efflux family protein  27.49 
 
 		 457 aa  134  3e-30  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3309  MATE efflux family protein  28.31 
 
 		 479 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1818  MATE efflux family protein  27.34 
 
 		 459 aa  132  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.138431 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1746  MATE efflux family protein  27.49 
 
 		 451 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.325105  normal  0.141964 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1313  Na+-driven multidrug efflux pump  24.88 
 
 		 449 aa  128  2.0000000000000002e-28  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0190769  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0755  MATE efflux family protein  29.67 
 
 		 456 aa  127  4.0000000000000003e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0124459  normal  0.621342 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1930  MATE efflux family protein  26.64 
 
 		 460 aa  127  5e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.135248  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5136  multi anti extrusion protein MatE  27.79 
 
 		 453 aa  126  7e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.114978  normal  0.944792 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1773  MATE efflux family protein  27.49 
 
 		 451 aa  126  8.000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0454  MATE efflux family protein  28.02 
 
 		 477 aa  125  2e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1438  MATE efflux family protein  29.13 
 
 		 453 aa  124  5e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.805906  hitchhiker  0.00501053 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04042  multidrug efflux protein  27.55 
 
 		 441 aa  123  6e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1224  MATE efflux family protein  26.53 
 
 		 446 aa  119  7.999999999999999e-26  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000144559  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2515  MATE efflux family protein  25.23 
 
 		 442 aa  119  9e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6244  MATE efflux family protein  26.11 
 
 		 450 aa  119  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.813306  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1835  MATE efflux family protein  26.11 
 
 		 450 aa  119  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.967793  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2122  multi anti extrusion protein MatE  27.14 
 
 		 450 aa  117  3.9999999999999997e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00000217461  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0664  MATE efflux family protein  28 
 
 		 472 aa  117  5e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.253686 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>