More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcer98_2297 on replicon NC_009674
Organism: Bacillus cytotoxicus NVH 391-98



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009674  Bcer98_2297  MATE efflux family protein  100 
 
 
450 aa  872    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1352  Na+-driven multidrug efflux pump  33 
 
 
303 aa  142  1.9999999999999998e-32  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1199  MATE efflux family protein  24.04 
 
 
450 aa  98.2  3e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0538393  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2306  MATE efflux family protein  21.96 
 
 
469 aa  93.6  6e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.30452  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0111  MATE efflux family protein  23.25 
 
 
464 aa  91.7  2e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2766  MATE efflux family protein  25.98 
 
 
453 aa  89.7  1e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0984562  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0113  MATE efflux family protein  23.35 
 
 
464 aa  89  2e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0591  MATE efflux family protein  22.99 
 
 
438 aa  87.4  5e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1359  multi anti extrusion protein MatE  25.61 
 
 
408 aa  85.9  0.000000000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0427  MATE efflux family protein  21.48 
 
 
446 aa  82.8  0.00000000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.744275  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2243  MATE efflux family protein  19.57 
 
 
468 aa  81.6  0.00000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2237  MATE efflux family protein  20.78 
 
 
469 aa  80.9  0.00000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000615121  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0723  multidrug resistance protein  20.96 
 
 
454 aa  80.5  0.00000000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4055  MATE efflux family protein  18.63 
 
 
483 aa  80.5  0.00000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0254154 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1711  MATE efflux family protein  24.17 
 
 
463 aa  80.5  0.00000000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0339316  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2515  MATE efflux family protein  25.85 
 
 
442 aa  78.2  0.0000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1267  multidrug efflux protein  23.47 
 
 
453 aa  77  0.0000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1472  multidrug efflux protein  23.47 
 
 
453 aa  76.3  0.000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1295  multidrug efflux protein  23.47 
 
 
453 aa  76.3  0.000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0578421  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1402  multidrug efflux protein  23.47 
 
 
453 aa  76.3  0.000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1461  MATE efflux family protein  24.53 
 
 
500 aa  76.3  0.000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02855  hypothetical protein  29.65 
 
 
445 aa  75.5  0.000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0850  MATE efflux family protein  22.62 
 
 
439 aa  75.1  0.000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.313022  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0621  MATE efflux family protein  21.67 
 
 
460 aa  74.7  0.000000000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.27098  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1269  multidrug efflux protein  22.57 
 
 
453 aa  73.9  0.000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.801506  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1109  multidrug efflux protein  22.36 
 
 
452 aa  73.6  0.000000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.654532  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0755  MATE efflux family protein  24.03 
 
 
456 aa  72  0.00000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0124459  normal  0.621342 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2295  MATE efflux family protein  22.94 
 
 
475 aa  72  0.00000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00026572  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1736  MATE efflux family protein  26.67 
 
 
472 aa  70.9  0.00000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.282832  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1501  multidrug efflux protein  23.86 
 
 
454 aa  70.5  0.00000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0945  MATE efflux family protein  21.39 
 
 
453 aa  70.1  0.00000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.228244  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09280  MATE efflux family protein  22.73 
 
 
453 aa  70.1  0.00000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000476954  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0991  MATE efflux family protein  22.3 
 
 
475 aa  69.3  0.0000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000156724  normal  0.091152 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0762  MATE efflux family protein  21.8 
 
 
458 aa  68.6  0.0000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1930  MATE efflux family protein  23.05 
 
 
460 aa  68.6  0.0000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.135248  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1767  MATE efflux family protein  21.9 
 
 
462 aa  68.6  0.0000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0545  MATE efflux family protein  21.81 
 
 
470 aa  68.6  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3091  multi anti extrusion protein MatE  22.97 
 
 
451 aa  68.2  0.0000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.170605  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2369  MATE family protein  22.08 
 
 
459 aa  68.2  0.0000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.151607  normal  0.213094 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0548  MATE efflux family protein  23.61 
 
 
459 aa  68.2  0.0000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.0000824418  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1818  MATE efflux family protein  22.28 
 
 
459 aa  68.2  0.0000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.138431 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2828  MATE efflux family protein  21.77 
 
 
463 aa  67.8  0.0000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2514  MATE efflux family protein  22.08 
 
 
463 aa  68.6  0.0000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2626  MATE efflux family protein  20.35 
 
 
467 aa  68.2  0.0000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.287795  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1353  MATE efflux family protein  23.97 
 
 
453 aa  67.4  0.0000000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1856  multidrug efflux protein  20.78 
 
 
455 aa  67.4  0.0000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.30191  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0645  MATE efflux family protein  24.08 
 
 
462 aa  67.4  0.0000000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000346552  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0162  MATE efflux family protein  22.06 
 
 
486 aa  67  0.0000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0316  MATE efflux family protein  24.72 
 
 
444 aa  67.4  0.0000000006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000262265  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0764  MATE family efflux pump NorM  22.87 
 
 
451 aa  67  0.0000000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0411  MATE efflux family protein  22.65 
 
 
453 aa  66.2  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1494  MATE efflux family protein  23.72 
 
 
451 aa  65.5  0.000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02790  putative efflux protein, MATE family  24.36 
 
 
434 aa  65.5  0.000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2418  MATE efflux family protein  19.22 
 
 
471 aa  65.1  0.000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1773  MATE efflux family protein  24.46 
 
 
451 aa  65.9  0.000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2404  hypothetical protein  22.15 
 
 
429 aa  65.9  0.000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.146193  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4310  MATE efflux family protein  25.6 
 
 
451 aa  65.5  0.000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3909  multidrug efflux protein  22.74 
 
 
452 aa  64.7  0.000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0537  hypothetical protein  20.95 
 
 
460 aa  64.7  0.000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2423  MATE efflux family protein  22.87 
 
 
451 aa  65.1  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0441886  normal  0.25868 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1438  MATE efflux family protein  23.22 
 
 
453 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.805906  hitchhiker  0.00501053 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1746  MATE efflux family protein  24.15 
 
 
451 aa  64.7  0.000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.325105  normal  0.141964 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1841  MATE efflux family protein  21.46 
 
 
469 aa  64.3  0.000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09173  MATE efflux family protein  27.35 
 
 
457 aa  64.3  0.000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0650  MATE efflux family protein  23.77 
 
 
458 aa  63.9  0.000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1304  multidrug efflux protein  21.97 
 
 
452 aa  63.5  0.000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5517  multidrug efflux protein NorA  22.25 
 
 
464 aa  63.5  0.000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3395  MATE efflux family protein  22.34 
 
 
461 aa  63.5  0.000000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6244  MATE efflux family protein  23.22 
 
 
450 aa  63.5  0.000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.813306  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1835  MATE efflux family protein  23.22 
 
 
450 aa  63.5  0.000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.967793  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0702  MATE efflux family protein  24.7 
 
 
452 aa  62.8  0.00000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3059  MATE efflux family protein  24.47 
 
 
469 aa  62.4  0.00000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.231532  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1435  multidrug efflux protein  22.74 
 
 
452 aa  62.8  0.00000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.602082  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3296  MATE efflux family protein  24.47 
 
 
469 aa  62.4  0.00000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.660304  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0025  MATE efflux family protein  25.1 
 
 
433 aa  62.8  0.00000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00700816  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3554  MATE efflux family protein  24.56 
 
 
466 aa  62.8  0.00000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0640  MATE efflux family protein  26.7 
 
 
454 aa  62.8  0.00000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.690668  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3112  multidrug efflux protein  21.23 
 
 
465 aa  61.6  0.00000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1899  putative MATE efflux protein  26.3 
 
 
469 aa  61.6  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00227155  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3583  MATE efflux family protein  21.64 
 
 
438 aa  62.4  0.00000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.662735  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1218  Na+ driven multidrug efflux pump  23.21 
 
 
464 aa  62.4  0.00000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.530621  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1823  putative MATE efflux protein  25.93 
 
 
469 aa  61.6  0.00000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0485  hypothetical protein  22.56 
 
 
454 aa  61.2  0.00000003  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0273971  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0055  MATE efflux family protein  22.83 
 
 
446 aa  61.2  0.00000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1621  Na+ driven multidrug efflux pump  25.93 
 
 
469 aa  61.6  0.00000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1591  Na+ driven multidrug efflux pump  25.93 
 
 
469 aa  61.6  0.00000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.742873  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0897  MATE efflux family protein  24.15 
 
 
453 aa  61.6  0.00000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000262958  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1409  MATE efflux family protein  21.78 
 
 
460 aa  61.6  0.00000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.851568  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3691  MATE efflux family protein  27.14 
 
 
453 aa  60.8  0.00000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.830643  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000109  adhesin  23.63 
 
 
461 aa  60.8  0.00000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.466925  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05715  Na+-driven multidrug efflux pump  23.66 
 
 
461 aa  60.8  0.00000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1541  multidrug efflux protein  22.81 
 
 
453 aa  61.2  0.00000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.1514  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0091  MATE efflux family protein  21.76 
 
 
454 aa  61.2  0.00000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1846  integral membrane protein, putative  25.93 
 
 
469 aa  60.8  0.00000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.563684  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5136  multi anti extrusion protein MatE  23.22 
 
 
453 aa  60.8  0.00000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.114978  normal  0.944792 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0330  MATE efflux family protein  27.51 
 
 
479 aa  60.8  0.00000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1641  MATE efflux family protein  25.18 
 
 
469 aa  60.5  0.00000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.725642  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1851  MATE efflux family protein  22.03 
 
 
475 aa  60.5  0.00000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00783953  normal  0.201536 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3319  MATE efflux family protein  20.3 
 
 
460 aa  60.5  0.00000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00330578  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1662  MATE efflux family protein  24.46 
 
 
453 aa  60.5  0.00000006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.226136  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>