72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene STER_1352 on replicon NC_008532
Organism: Streptococcus thermophilus LMD-9



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008532  STER_1352  Na+-driven multidrug efflux pump  100 
 
 		 303 aa  585  1e-166  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2297  MATE efflux family protein  33 
 
 		 450 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3059  MATE efflux family protein  26.9 
 
 		 469 aa  60.1  0.00000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.231532  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3296  MATE efflux family protein  26.9 
 
 		 469 aa  60.1  0.00000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.660304  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0485  hypothetical protein  24.84 
 
 		 454 aa  58.9  0.0000001  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0273971  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3557  putative MATE efflux protein  25.56 
 
 		 469 aa  57.8  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.43043  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1787  putative MATE efflux protein  27.16 
 
 		 469 aa  57.4  0.0000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1823  putative MATE efflux protein  25.56 
 
 		 469 aa  57  0.0000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1621  Na+ driven multidrug efflux pump  25.56 
 
 		 469 aa  57  0.0000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1591  Na+ driven multidrug efflux pump  25.56 
 
 		 469 aa  57  0.0000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.742873  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1899  putative MATE efflux protein  25.56 
 
 		 469 aa  56.6  0.0000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00227155  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1846  integral membrane protein, putative  25.56 
 
 		 469 aa  56.6  0.0000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.563684  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1641  MATE efflux family protein  26.84 
 
 		 469 aa  56.2  0.0000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.725642  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3760  MATE efflux family protein  19.64 
 
 		 464 aa  54.7  0.000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2862  MATE efflux family protein  25.95 
 
 		 469 aa  54.7  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.83664  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1419  MATE efflux family protein  27.04 
 
 		 469 aa  54.7  0.000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.703884  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3177  MATE efflux family protein  26.27 
 
 		 469 aa  53.9  0.000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.186099  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09280  MATE efflux family protein  26.24 
 
 		 453 aa  53.9  0.000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000476954  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1461  MATE efflux family protein  23.08 
 
 		 500 aa  52.8  0.000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2404  hypothetical protein  24.58 
 
 		 429 aa  52  0.00001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.146193  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1266  MATE efflux family protein  28.18 
 
 		 464 aa  51.6  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1239  MATE efflux family protein  28.18 
 
 		 464 aa  50.4  0.00003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.238085  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3704  hypothetical protein  26.62 
 
 		 496 aa  50.4  0.00004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.546893 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4103  Na+ driven multidrug efflux pump  27.62 
 
 		 463 aa  49.3  0.00007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0660054  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0762  MATE efflux family protein  22.56 
 
 		 458 aa  49.3  0.00008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1082  efflux protein  27.62 
 
 		 464 aa  48.9  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000125629  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1106  MATE efflux family protein  27.62 
 
 		 464 aa  48.9  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000560081  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1088  efflux protein  27.62 
 
 		 464 aa  48.9  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000024435  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0823  polysaccharide biosynthesis protein  24.59 
 
 		 465 aa  48.9  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.110638  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1196  MATE efflux family protein  27.62 
 
 		 464 aa  48.9  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000655029  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1094  MATE efflux family protein  27.62 
 
 		 464 aa  48.5  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000923462  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1343  MATE efflux family protein  27.62 
 
 		 464 aa  48.5  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00000317655  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1541  MATE efflux family protein  24.32 
 
 		 486 aa  47.8  0.0002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.127259  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1159  MATE efflux family protein  25.32 
 
 		 478 aa  47.8  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.666411  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03157  hypothetical protein  24.18 
 
 		 455 aa  48.5  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.367645 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02855  hypothetical protein  24.29 
 
 		 445 aa  47.4  0.0003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3541  multi anti extrusion protein MatE  23.93 
 
 		 491 aa  47.4  0.0003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.325016 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1305  MATE efflux family protein  27.07 
 
 		 464 aa  47.4  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.40401  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1058  MATE efflux family protein  24.79 
 
 		 453 aa  46.6  0.0005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3642  multi anti extrusion protein MatE  23.92 
 
 		 496 aa  46.6  0.0005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.104533  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0591  MATE efflux family protein  23.13 
 
 		 438 aa  46.6  0.0006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1069  polysaccharide biosynthesis protein  37.29 
 
 		 512 aa  46.2  0.0007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.544527 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0111  MATE efflux family protein  24.37 
 
 		 464 aa  46.2  0.0008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0113  MATE efflux family protein  24.37 
 
 		 464 aa  45.8  0.0009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0307  MATE efflux family protein  27.94 
 
 		 451 aa  45.4  0.001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3016  multi antimicrobial extrusion protein MatE  27.27 
 
 		 451 aa  45.1  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.160373  normal  0.416485 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03665  C-5 cytosine-specific DNA methylase:Multi antimicrobial extrusion (MatE) protein  22.66 
 
 		 455 aa  45.4  0.001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1992  multi antimicrobial extrusion protein MatE  32.98 
 
 		 483 aa  45.4  0.001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1368  multi anti extrusion protein MatE  26.75 
 
 		 451 aa  45.4  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1236  polysaccharide biosynthesis protein  28.23 
 
 		 482 aa  45.4  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.286439 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1332  multi anti extrusion protein MatE  26.75 
 
 		 451 aa  45.4  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.478618  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5025  MATE efflux family protein  25.25 
 
 		 461 aa  45.8  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.274377  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1342  multi anti extrusion protein MatE  27.27 
 
 		 451 aa  45.4  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.934996  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02164  multidrug efflux protein NorA  25 
 
 		 457 aa  44.7  0.002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.193678  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2295  MATE efflux family protein  27.34 
 
 		 475 aa  44.7  0.002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00026572  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0994  MATE efflux family protein  26.9 
 
 		 449 aa  44.7  0.002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1839  MATE efflux family protein  24.14 
 
 		 480 aa  44.7  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0006  MATE efflux family protein  28.16 
 
 		 442 aa  44.3  0.003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0243937 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3921  multidrug efflux protein NorA  24.89 
 
 		 444 aa  43.9  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0451131  decreased coverage  0.00764846 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1841  MATE efflux family protein  25 
 
 		 469 aa  43.9  0.003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1856  Na+-driven multidrug efflux pump  22.92 
 
 		 429 aa  43.9  0.004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0920105  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2176  exporter of O-antigen and teichoic acid  43.64 
 
 		 456 aa  43.5  0.004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.311164 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0621  polysaccharide biosynthesis protein  32.22 
 
 		 475 aa  43.9  0.004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.914686  normal  0.0318754 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0522  MATE efflux family protein  26.16 
 
 		 461 aa  43.9  0.004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0796  multi anti extrusion protein MatE  27.14 
 
 		 484 aa  43.1  0.006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.505075 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0187  MATE efflux family protein  22.92 
 
 		 449 aa  42.7  0.007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2544  MATE efflux family protein  30.12 
 
 		 455 aa  42.7  0.008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2859  MATE efflux family protein  30.12 
 
 		 455 aa  42.7  0.008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2306  MATE efflux family protein  22.79 
 
 		 469 aa  42.4  0.009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.30452  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0050  polysaccharide biosynthesis protein  51.16 
 
 		 529 aa  42.4  0.009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2869  MATE efflux family protein  24.36 
 
 		 472 aa  42.4  0.009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0768419  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1359  multi anti extrusion protein MatE  29.06 
 
 		 408 aa  42.4  0.01  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>