More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smon_0994 on replicon NC_013515
Organism: Streptobacillus moniliformis DSM 12112



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013515  Smon_0994  MATE efflux family protein  100 
 
 		 449 aa  871    Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0279  MATE efflux family protein  32.08 
 
 		 445 aa  249  9e-65  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0830  MATE efflux family protein  31.86 
 
 		 445 aa  236  6e-61  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.000000918772  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2766  MATE efflux family protein  31.58 
 
 		 453 aa  229  1e-58  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0984562  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0621  MATE efflux family protein  31.03 
 
 		 460 aa  225  2e-57  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.27098  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2828  MATE efflux family protein  30.28 
 
 		 463 aa  211  2e-53  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2514  MATE efflux family protein  30.07 
 
 		 463 aa  211  3e-53  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0330  MATE efflux family protein  29.13 
 
 		 479 aa  199  1.0000000000000001e-49  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1138  MATE efflux family protein  27.68 
 
 		 450 aa  198  2.0000000000000003e-49  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000318212  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05715  Na+-driven multidrug efflux pump  28.32 
 
 		 461 aa  181  2.9999999999999997e-44  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0857  MATE efflux family protein  27.45 
 
 		 458 aa  173  5e-42  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0848  MATE efflux family protein  27.23 
 
 		 458 aa  172  7.999999999999999e-42  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.720761  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0897  MATE efflux family protein  25.66 
 
 		 453 aa  172  9e-42  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000262958  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000109  adhesin  27.56 
 
 		 461 aa  170  4e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.466925  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1116  MATE efflux family protein  26.43 
 
 		 456 aa  166  6.9999999999999995e-40  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0522  MATE efflux family protein  26.97 
 
 		 461 aa  166  1.0000000000000001e-39  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2022  multidrug efflux pump  24.5 
 
 		 459 aa  149  8e-35  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.54695  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2425  MATE efflux family protein  27.06 
 
 		 461 aa  149  1.0000000000000001e-34  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.264518  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2475  MATE efflux family protein  27.79 
 
 		 463 aa  148  2.0000000000000003e-34  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.211957  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0537  hypothetical protein  26.84 
 
 		 460 aa  140  3.9999999999999997e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1981  MATE efflux family protein  26.83 
 
 		 455 aa  140  3.9999999999999997e-32  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000219259  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0743  MATE efflux family protein  24.14 
 
 		 484 aa  134  3e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000192336  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02650  hypothetical protein  24.73 
 
 		 458 aa  134  3.9999999999999996e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1237  hypothetical protein  24.18 
 
 		 458 aa  133  6.999999999999999e-30  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0290804  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0597  hypothetical protein  24.94 
 
 		 444 aa  127  5e-28  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003772  Na+ driven multidrug efflux pump  23.92 
 
 		 458 aa  125  1e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1252  MATE efflux family protein  28.54 
 
 		 445 aa  118  1.9999999999999998e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000131388  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04830  MATE efflux family protein  27.67 
 
 		 468 aa  117  3e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000202645  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3712  MATE efflux family protein  25.66 
 
 		 454 aa  112  1.0000000000000001e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.139203  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09280  MATE efflux family protein  25.43 
 
 		 453 aa  110  5e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000476954  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0596  hypothetical protein  25.12 
 
 		 449 aa  109  1e-22  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.207285  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0591  MATE efflux family protein  27.27 
 
 		 438 aa  107  4e-22  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2306  MATE efflux family protein  24.75 
 
 		 469 aa  107  6e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.30452  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2630  MATE efflux family protein  23.82 
 
 		 472 aa  102  9e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.850794  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3886  MATE efflux family protein  25.71 
 
 		 481 aa  102  2e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1461  MATE efflux family protein  23.28 
 
 		 500 aa  99.8  8e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0575  MATE efflux family protein  23.68 
 
 		 459 aa  99.4  1e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000335028  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0147  MATE efflux family protein  27.67 
 
 		 462 aa  98.2  3e-19  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000317216  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0299  MATE efflux family protein  24.38 
 
 		 456 aa  94.4  4e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000180901  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0427  MATE efflux family protein  23.28 
 
 		 446 aa  93.2  7e-18  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.744275  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1579  MATE efflux family protein  23.93 
 
 		 445 aa  93.2  8e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0645  MATE efflux family protein  24.56 
 
 		 462 aa  92.8  1e-17  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000346552  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2458  MATE efflux family protein  24.17 
 
 		 500 aa  92.8  1e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.672094  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4055  MATE efflux family protein  21.57 
 
 		 483 aa  92.8  1e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0254154 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2243  MATE efflux family protein  21.55 
 
 		 468 aa  92.4  1e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4468  MATE efflux family protein  24.65 
 
 		 481 aa  92.4  1e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0713709  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0981  MATE efflux family protein  22.86 
 
 		 456 aa  90.9  5e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.730082  normal  0.0880752 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0441  MATE efflux family protein  26.62 
 
 		 446 aa  88.6  2e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000223642  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0055  MATE efflux family protein  23.28 
 
 		 446 aa  89  2e-16  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0762  MATE efflux family protein  24.51 
 
 		 458 aa  88.6  2e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3419  MATE efflux family protein  24.81 
 
 		 504 aa  87.8  3e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0536  mate efflux family protein  26.38 
 
 		 440 aa  87.8  4e-16  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0991  MATE efflux family protein  23.06 
 
 		 475 aa  87  5e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000156724  normal  0.091152 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0691  MATE efflux family protein  24.32 
 
 		 450 aa  87.4  5e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2237  MATE efflux family protein  22.06 
 
 		 469 aa  85.9  0.000000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000615121  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1318  MATE efflux family protein  24.07 
 
 		 443 aa  84.7  0.000000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000101978  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1353  MATE efflux family protein  25.87 
 
 		 453 aa  84  0.000000000000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0998  MATE efflux family protein  22.56 
 
 		 500 aa  83.2  0.000000000000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.280475  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18490  MATE efflux family protein  22 
 
 		 442 aa  83.2  0.00000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000174233  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0901  MATE efflux family protein  24.94 
 
 		 463 aa  82  0.00000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000627796  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1846  integral membrane protein, putative  22.56 
 
 		 469 aa  81.6  0.00000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.563684  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1899  putative MATE efflux protein  22.99 
 
 		 469 aa  81.6  0.00000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00227155  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0645  DcuC protein  24.83 
 
 		 439 aa  81.3  0.00000000000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2343  MATE efflux family protein  21.79 
 
 		 464 aa  81.3  0.00000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000000238189  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1672  MATE efflux family protein  24.31 
 
 		 498 aa  81.3  0.00000000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1823  putative MATE efflux protein  22.99 
 
 		 469 aa  80.9  0.00000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1621  Na+ driven multidrug efflux pump  22.99 
 
 		 469 aa  80.9  0.00000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1591  Na+ driven multidrug efflux pump  22.99 
 
 		 469 aa  80.9  0.00000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.742873  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0100  MATE efflux family protein  24.56 
 
 		 454 aa  80.9  0.00000000000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0456451  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0111  MATE efflux family protein  24.04 
 
 		 464 aa  79.7  0.00000000000009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3557  putative MATE efflux protein  23.21 
 
 		 469 aa  79.3  0.0000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.43043  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1641  MATE efflux family protein  22.69 
 
 		 469 aa  79.7  0.0000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.725642  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2156  MATE efflux family protein  22.58 
 
 		 451 aa  79.3  0.0000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.540946 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0113  MATE efflux family protein  24.04 
 
 		 464 aa  79.7  0.0000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3692  MATE efflux family protein  21.59 
 
 		 461 aa  79.3  0.0000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000025823  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1094  MATE efflux family protein  24.14 
 
 		 464 aa  79.7  0.0000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000923462  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1607  MATE efflux family protein  23.38 
 
 		 463 aa  79  0.0000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000142965  unclonable  4.95515e-23 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3760  MATE efflux family protein  22.63 
 
 		 464 aa  78.2  0.0000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0688  DNA damage inducible protein - mate transporter family  22.33 
 
 		 521 aa  78.2  0.0000000000003  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1266  MATE efflux family protein  24.63 
 
 		 464 aa  78.2  0.0000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1597  MATE efflux family protein  25.53 
 
 		 460 aa  77  0.0000000000007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  3.36267e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3120  MATE efflux family protein  22.87 
 
 		 461 aa  76.6  0.0000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.369114  normal  0.932515 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1787  putative MATE efflux protein  22.61 
 
 		 469 aa  76.6  0.0000000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4103  Na+ driven multidrug efflux pump  24.88 
 
 		 463 aa  76.6  0.0000000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0660054  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1106  MATE efflux family protein  24.38 
 
 		 464 aa  75.9  0.000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000560081  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1088  efflux protein  24.38 
 
 		 464 aa  75.9  0.000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000024435  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1082  efflux protein  24.38 
 
 		 464 aa  76.3  0.000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000125629  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1196  MATE efflux family protein  24.38 
 
 		 464 aa  75.9  0.000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000655029  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1159  MATE efflux family protein  22.88 
 
 		 478 aa  75.9  0.000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.666411  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1305  MATE efflux family protein  24.63 
 
 		 464 aa  75.5  0.000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.40401  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1239  MATE efflux family protein  24.88 
 
 		 464 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.238085  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1454  MATE efflux family protein  23.04 
 
 		 477 aa  75.9  0.000000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3236  MATE efflux family protein  23.19 
 
 		 502 aa  75.5  0.000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7238  MATE efflux family protein  22.15 
 
 		 450 aa  74.7  0.000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.866766  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6251  MATE efflux family protein  22 
 
 		 461 aa  74.3  0.000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1058  MATE efflux family protein  26.16 
 
 		 453 aa  74.7  0.000000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1343  MATE efflux family protein  24.38 
 
 		 464 aa  73.9  0.000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00000317655  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1419  MATE efflux family protein  21.21 
 
 		 469 aa  73.9  0.000000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.703884  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0651  MATE efflux family protein  23.38 
 
 		 446 aa  73.9  0.000000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.000388571  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3173  MATE efflux family protein  23.44 
 
 		 448 aa  73.6  0.000000000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000170892  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>