More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_0981 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014212  Mesil_0981  MATE efflux family protein  100 
 
 		 456 aa  883    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.730082  normal  0.0880752 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2630  MATE efflux family protein  69.57 
 
 		 472 aa  576  1.0000000000000001e-163  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.850794  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1415  MATE efflux family protein  42.86 
 
 		 466 aa  231  3e-59  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.167041 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0279  MATE efflux family protein  26.58 
 
 		 445 aa  159  1e-37  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2514  MATE efflux family protein  26.77 
 
 		 463 aa  153  5e-36  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2828  MATE efflux family protein  26.77 
 
 		 463 aa  153  7e-36  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0522  MATE efflux family protein  26.93 
 
 		 461 aa  139  1e-31  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1138  MATE efflux family protein  24.77 
 
 		 450 aa  138  2e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000318212  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0621  MATE efflux family protein  23.98 
 
 		 460 aa  129  1.0000000000000001e-28  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.27098  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3692  MATE efflux family protein  27.39 
 
 		 461 aa  128  2.0000000000000002e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000025823  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2766  MATE efflux family protein  23.76 
 
 		 453 aa  128  2.0000000000000002e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0984562  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0830  MATE efflux family protein  25.17 
 
 		 445 aa  127  3e-28  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.000000918772  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000109  adhesin  25.4 
 
 		 461 aa  127  6e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.466925  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0897  MATE efflux family protein  25.9 
 
 		 453 aa  126  7e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000262958  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003772  Na+ driven multidrug efflux pump  26.03 
 
 		 458 aa  121  1.9999999999999998e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02650  hypothetical protein  26.8 
 
 		 458 aa  120  7e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05715  Na+-driven multidrug efflux pump  25.56 
 
 		 461 aa  118  1.9999999999999998e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09280  MATE efflux family protein  23.89 
 
 		 453 aa  115  1.0000000000000001e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000476954  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0991  MATE efflux family protein  26.19 
 
 		 475 aa  116  1.0000000000000001e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000156724  normal  0.091152 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2022  multidrug efflux pump  23.08 
 
 		 459 aa  109  8.000000000000001e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.54695  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2243  MATE efflux family protein  28.02 
 
 		 468 aa  107  3e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0330  MATE efflux family protein  22.37 
 
 		 479 aa  108  3e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4055  MATE efflux family protein  27.11 
 
 		 483 aa  107  5e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0254154 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2306  MATE efflux family protein  23.29 
 
 		 469 aa  103  5e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.30452  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0537  hypothetical protein  26.03 
 
 		 460 aa  103  6e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1237  hypothetical protein  24.78 
 
 		 458 aa  103  6e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0290804  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0848  MATE efflux family protein  22.76 
 
 		 458 aa  103  7e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.720761  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3712  MATE efflux family protein  26.05 
 
 		 454 aa  103  9e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.139203  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0857  MATE efflux family protein  22.76 
 
 		 458 aa  103  9e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0575  MATE efflux family protein  25.23 
 
 		 459 aa  102  2e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000335028  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1659  hypothetical protein  24.12 
 
 		 495 aa  101  3e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.000000439345  normal  0.0451104 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2108  hypothetical protein  24.94 
 
 		 546 aa  100  4e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  6.24671e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3815  MATE efflux family protein  26.4 
 
 		 467 aa  100  4e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.142559  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6519  MATE efflux family protein  26.07 
 
 		 466 aa  100  6e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.510371  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1139  hypothetical protein  25.17 
 
 		 484 aa  100  7e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.0000000023845  hitchhiker  0.0000334983 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0762  MATE efflux family protein  25.06 
 
 		 458 aa  100  8e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2829  hypothetical protein  24.89 
 
 		 484 aa  99.4  1e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.0000000399298  normal  0.437543 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1669  MATE efflux family protein  24.94 
 
 		 495 aa  99  2e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000135228  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2267  hypothetical protein  24.49 
 
 		 546 aa  98.6  2e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000010697  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0113  MATE efflux family protein  25.83 
 
 		 464 aa  98.6  2e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0111  MATE efflux family protein  25.71 
 
 		 464 aa  99  2e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01896  predicted multidrug efflux system  24.49 
 
 		 547 aa  98.2  3e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0202846  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01885  hypothetical protein  24.49 
 
 		 547 aa  98.2  3e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0187925  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2542  MATE efflux family protein  26.8 
 
 		 459 aa  97.1  5e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0743  MATE efflux family protein  23.5 
 
 		 484 aa  95.5  2e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000192336  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3112  multidrug efflux protein  26.26 
 
 		 465 aa  91.7  2e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2237  MATE efflux family protein  26.65 
 
 		 469 aa  92  2e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000615121  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0994  MATE efflux family protein  22.86 
 
 		 449 aa  90.9  5e-17  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0875  mate efflux family protein  20.45 
 
 		 446 aa  89.7  9e-17  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3091  multi anti extrusion protein MatE  28.01 
 
 		 451 aa  88.2  3e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.170605  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0645  MATE efflux family protein  22.29 
 
 		 462 aa  87.4  5e-16  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000346552  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1981  MATE efflux family protein  20.67 
 
 		 455 aa  87  7e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000219259  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2574  hypothetical protein  22.25 
 
 		 480 aa  87  7e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0900334 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1418  MATE efflux family protein  28.12 
 
 		 462 aa  85.5  0.000000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0901  MATE efflux family protein  22.84 
 
 		 463 aa  84.7  0.000000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000627796  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4839  MATE efflux family protein  26.21 
 
 		 449 aa  84.3  0.000000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2939  multidrug resistance protein  26.93 
 
 		 468 aa  84  0.000000000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000000251457  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3106  hypothetical protein  22.46 
 
 		 484 aa  83.6  0.000000000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.20256 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3565  MATE efflux family protein  24.77 
 
 		 452 aa  82.4  0.00000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1343  MATE efflux family protein  22.3 
 
 		 464 aa  82.8  0.00000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00000317655  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1106  MATE efflux family protein  22.76 
 
 		 464 aa  82.8  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000560081  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1088  efflux protein  22.76 
 
 		 464 aa  82.8  0.00000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000024435  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1082  efflux protein  22.76 
 
 		 464 aa  82.8  0.00000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000125629  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18490  MATE efflux family protein  20.77 
 
 		 442 aa  82.8  0.00000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000174233  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1196  MATE efflux family protein  22.76 
 
 		 464 aa  82.8  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000655029  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4103  Na+ driven multidrug efflux pump  22.99 
 
 		 463 aa  82.4  0.00000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0660054  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1199  MATE efflux family protein  24.47 
 
 		 450 aa  82.4  0.00000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0538393  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1305  MATE efflux family protein  22.76 
 
 		 464 aa  82  0.00000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.40401  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4087  MATE efflux family protein  27.06 
 
 		 447 aa  82  0.00000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1686  multidrug resistance protein NorM, putative  26.48 
 
 		 464 aa  81.6  0.00000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.712622  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3993  MATE efflux family protein  27.06 
 
 		 447 aa  81.3  0.00000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2333  MATE efflux family protein  25.53 
 
 		 456 aa  81.3  0.00000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0650  MATE efflux family protein  23.36 
 
 		 458 aa  81.6  0.00000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1266  MATE efflux family protein  23.11 
 
 		 464 aa  80.9  0.00000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1239  MATE efflux family protein  22.76 
 
 		 464 aa  80.5  0.00000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.238085  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0502  multidrug resistance protein NorM, putative  26.71 
 
 		 468 aa  80.5  0.00000000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00841305  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2885  multidrug efflux pump NorM  26.71 
 
 		 468 aa  80.5  0.00000000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.132426  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1835  multidrug efflux pump NorM  26.71 
 
 		 468 aa  80.5  0.00000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.143849  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2511  multidrug efflux pump NorM  26.71 
 
 		 468 aa  80.5  0.00000000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0112614  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2770  multidrug efflux pump NorM  26.71 
 
 		 468 aa  80.5  0.00000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00327808  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1094  MATE efflux family protein  22.63 
 
 		 464 aa  80.1  0.00000000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000923462  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2824  Na+-driven multidrug efflux pump  26.71 
 
 		 468 aa  80.1  0.00000000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.338684  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3887  multi anti extrusion protein MatE  24.88 
 
 		 466 aa  79.7  0.00000000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0845713 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0056  MATE efflux family protein  23.02 
 
 		 412 aa  79  0.0000000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00168356  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1504  hypothetical protein  22.32 
 
 		 502 aa  79  0.0000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.969676  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1531  hypothetical protein  22.78 
 
 		 478 aa  77.8  0.0000000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0177  MATE efflux family protein  27.29 
 
 		 442 aa  77.4  0.0000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0755  MATE efflux family protein  24.15 
 
 		 456 aa  77.4  0.0000000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0124459  normal  0.621342 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2404  hypothetical protein  24.37 
 
 		 429 aa  77  0.0000000000006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.146193  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3426  MATE efflux family protein  25.6 
 
 		 434 aa  76.6  0.0000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0784  MATE efflux family protein  21.88 
 
 		 460 aa  76.6  0.0000000000008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1579  MATE efflux family protein  24.55 
 
 		 445 aa  76.6  0.0000000000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0648  mate efflux family protein  21.1 
 
 		 440 aa  75.9  0.000000000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.849411  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2515  MATE efflux family protein  23.67 
 
 		 442 aa  75.5  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4400  MATE efflux family protein  25.68 
 
 		 453 aa  74.3  0.000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0121801  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2173  MATE efflux family protein  26.67 
 
 		 481 aa  74.3  0.000000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.843006 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1736  MATE efflux family protein  24.88 
 
 		 472 aa  73.9  0.000000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.282832  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09173  MATE efflux family protein  25.83 
 
 		 457 aa  73.9  0.000000000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2407  hypothetical protein  22.84 
 
 		 476 aa  73.9  0.000000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.149109  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7238  MATE efflux family protein  22.15 
 
 		 450 aa  73.6  0.000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.866766  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>