More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_3712 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_3712  MATE efflux family protein  100 
 
 		 454 aa  904    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.139203  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000109  adhesin  33.26 
 
 		 461 aa  264  3e-69  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.466925  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05715  Na+-driven multidrug efflux pump  32.81 
 
 		 461 aa  262  1e-68  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0537  hypothetical protein  32.96 
 
 		 460 aa  245  9.999999999999999e-64  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1237  hypothetical protein  32.59 
 
 		 458 aa  237  3e-61  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0290804  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2766  MATE efflux family protein  32.67 
 
 		 453 aa  236  9e-61  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0984562  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2828  MATE efflux family protein  31.7 
 
 		 463 aa  231  3e-59  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2514  MATE efflux family protein  31.47 
 
 		 463 aa  229  1e-58  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02650  hypothetical protein  33.26 
 
 		 458 aa  228  2e-58  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003772  Na+ driven multidrug efflux pump  33.19 
 
 		 458 aa  224  2e-57  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2022  multidrug efflux pump  33.04 
 
 		 459 aa  221  1.9999999999999999e-56  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.54695  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0279  MATE efflux family protein  30.97 
 
 		 445 aa  218  2e-55  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1138  MATE efflux family protein  30.04 
 
 		 450 aa  197  3e-49  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000318212  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0621  MATE efflux family protein  29.02 
 
 		 460 aa  197  4.0000000000000005e-49  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.27098  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0830  MATE efflux family protein  28.92 
 
 		 445 aa  194  3e-48  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.000000918772  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0897  MATE efflux family protein  30.54 
 
 		 453 aa  189  1e-46  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000262958  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0522  MATE efflux family protein  28.57 
 
 		 461 aa  188  2e-46  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0330  MATE efflux family protein  29.32 
 
 		 479 aa  177  5e-43  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1981  MATE efflux family protein  27.27 
 
 		 455 aa  176  8e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000219259  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0857  MATE efflux family protein  27.59 
 
 		 458 aa  174  2.9999999999999996e-42  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0848  MATE efflux family protein  27.59 
 
 		 458 aa  174  2.9999999999999996e-42  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.720761  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1116  MATE efflux family protein  28.41 
 
 		 456 aa  167  2.9999999999999998e-40  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0994  MATE efflux family protein  27.07 
 
 		 449 aa  142  9e-33  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2630  MATE efflux family protein  27.25 
 
 		 472 aa  136  6.0000000000000005e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.850794  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0743  MATE efflux family protein  24.62 
 
 		 484 aa  128  2.0000000000000002e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000192336  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1415  MATE efflux family protein  28.92 
 
 		 466 aa  126  7e-28  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.167041 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0762  MATE efflux family protein  28.41 
 
 		 458 aa  125  1e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0991  MATE efflux family protein  27.91 
 
 		 475 aa  124  3e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000156724  normal  0.091152 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0981  MATE efflux family protein  26.05 
 
 		 456 aa  124  4e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.730082  normal  0.0880752 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09280  MATE efflux family protein  27.95 
 
 		 453 aa  120  3.9999999999999996e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000476954  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2306  MATE efflux family protein  24.78 
 
 		 469 aa  120  4.9999999999999996e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.30452  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2425  MATE efflux family protein  24.78 
 
 		 461 aa  115  2.0000000000000002e-24  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.264518  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2237  MATE efflux family protein  27.05 
 
 		 469 aa  113  6e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000615121  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0575  MATE efflux family protein  24.28 
 
 		 459 aa  112  1.0000000000000001e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000335028  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2475  MATE efflux family protein  25.6 
 
 		 463 aa  112  2.0000000000000002e-23  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.211957  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0597  hypothetical protein  24.55 
 
 		 444 aa  110  7.000000000000001e-23  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0596  hypothetical protein  25.22 
 
 		 449 aa  107  3e-22  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.207285  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2156  MATE efflux family protein  27.85 
 
 		 451 aa  107  4e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.540946 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1541  MATE efflux family protein  27.23 
 
 		 486 aa  107  5e-22  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.127259  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1094  MATE efflux family protein  23.95 
 
 		 464 aa  105  2e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000923462  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0802  MATE efflux family protein  24.08 
 
 		 453 aa  103  5e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7238  MATE efflux family protein  26.15 
 
 		 450 aa  103  6e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.866766  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0427  MATE efflux family protein  24.27 
 
 		 446 aa  102  1e-20  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.744275  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3760  MATE efflux family protein  24.26 
 
 		 464 aa  101  2e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0901  MATE efflux family protein  24.32 
 
 		 463 aa  102  2e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000627796  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3565  MATE efflux family protein  26.13 
 
 		 452 aa  100  4e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3485  MATE efflux family protein  23.98 
 
 		 453 aa  100  5e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3419  MATE efflux family protein  24.47 
 
 		 504 aa  100  6e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1082  efflux protein  23.84 
 
 		 464 aa  100  7e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000125629  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1106  MATE efflux family protein  23.84 
 
 		 464 aa  99.4  1e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000560081  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1088  efflux protein  23.84 
 
 		 464 aa  99.4  1e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000024435  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1196  MATE efflux family protein  23.84 
 
 		 464 aa  99.4  1e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000655029  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1343  MATE efflux family protein  23.84 
 
 		 464 aa  99.4  1e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00000317655  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1305  MATE efflux family protein  23.84 
 
 		 464 aa  98.6  2e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.40401  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0113  MATE efflux family protein  25.81 
 
 		 464 aa  98.6  2e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0111  MATE efflux family protein  25.81 
 
 		 464 aa  99  2e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4103  Na+ driven multidrug efflux pump  24.03 
 
 		 463 aa  97.8  4e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0660054  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1266  MATE efflux family protein  23.84 
 
 		 464 aa  97.8  4e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3187  MATE efflux family protein  23.79 
 
 		 486 aa  97.8  4e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3779  MATE efflux family protein  23.79 
 
 		 453 aa  95.9  1e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2542  MATE efflux family protein  24.46 
 
 		 459 aa  95.9  1e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3589  MATE efflux family protein  24.56 
 
 		 476 aa  95.1  2e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6399  MATE efflux family protein  24.05 
 
 		 425 aa  95.1  2e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.444399  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1199  MATE efflux family protein  23.88 
 
 		 450 aa  95.5  2e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0538393  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1506  MATE efflux family protein  25.06 
 
 		 450 aa  94.7  3e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1239  MATE efflux family protein  23.81 
 
 		 464 aa  94.4  4e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.238085  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3315  MATE efflux family protein  24.05 
 
 		 456 aa  94.4  4e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0638  MATE efflux family protein  24.05 
 
 		 456 aa  94.4  4e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0591  MATE efflux family protein  25.85 
 
 		 438 aa  94  6e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3692  MATE efflux family protein  22.08 
 
 		 461 aa  93.6  6e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000025823  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3656  MATE efflux family protein  23.96 
 
 		 453 aa  93.6  7e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1359  multi anti extrusion protein MatE  24.1 
 
 		 408 aa  93.2  9e-18  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0686  MATE efflux family protein  25.06 
 
 		 498 aa  92.4  1e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.221481  normal  0.278001 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5035  MATE efflux family protein  24.29 
 
 		 469 aa  92.8  1e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.88746  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0252  MATE efflux family protein  25.69 
 
 		 460 aa  92.8  1e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05190  MATE efflux family protein  27.8 
 
 		 454 aa  92.4  2e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.969197  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1252  MATE efflux family protein  26.08 
 
 		 445 aa  92.4  2e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000131388  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0649  MATE efflux family protein  23.96 
 
 		 453 aa  91.7  2e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1672  MATE efflux family protein  24.34 
 
 		 498 aa  91.3  4e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18490  MATE efflux family protein  24.45 
 
 		 442 aa  90.5  5e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000174233  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0299  MATE efflux family protein  23.8 
 
 		 456 aa  90.5  5e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000180901  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0691  MATE efflux family protein  23.16 
 
 		 450 aa  90.5  6e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0875  mate efflux family protein  23.49 
 
 		 446 aa  89.7  9e-17  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0147  MATE efflux family protein  27.07 
 
 		 462 aa  89.7  1e-16  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000317216  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1579  MATE efflux family protein  25.43 
 
 		 445 aa  89.4  1e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0293  MATE efflux family protein  28.22 
 
 		 467 aa  88.6  2e-16  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_28350  MOP(MATE) family transporter: multidrug efflux  24.37 
 
 		 428 aa  89  2e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00440405  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000940  Na+ driven multidrug efflux pump  24.32 
 
 		 446 aa  87.4  5e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000926882  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0055  MATE efflux family protein  24.77 
 
 		 446 aa  86.7  7e-16  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1166  ABC transporter releated protein  22.74 
 
 		 463 aa  86.7  7e-16  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.403976 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1767  MATE efflux family protein  24.33 
 
 		 462 aa  86.7  8e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4055  MATE efflux family protein  28.97 
 
 		 483 aa  86.3  0.000000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0254154 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2243  MATE efflux family protein  29.44 
 
 		 468 aa  86.3  0.000000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09173  MATE efflux family protein  24.94 
 
 		 457 aa  85.1  0.000000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1842  MATE efflux family protein  23.94 
 
 		 442 aa  85.1  0.000000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000407528  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0355  putative multidrug resistance protein NorM  22.9 
 
 		 471 aa  84.7  0.000000000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.277827  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5025  MATE efflux family protein  23.29 
 
 		 461 aa  84.3  0.000000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.274377  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3236  MATE efflux family protein  22.25 
 
 		 502 aa  84  0.000000000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0339  multidrug resistance protein NorM, putative  22.9 
 
 		 471 aa  84  0.000000000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1418  MATE efflux family protein  31.75 
 
 		 462 aa  84  0.000000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>