More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew185_3656 on replicon NC_009665
Organism: Shewanella baltica OS185



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009438  Sputcn32_3187  MATE efflux family protein  93.13 
 
 		 486 aa  801    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0802  MATE efflux family protein  88.94 
 
 		 453 aa  761    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3315  MATE efflux family protein  92.49 
 
 		 456 aa  791    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0638  MATE efflux family protein  92.49 
 
 		 456 aa  791    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3656  MATE efflux family protein  100 
 
 		 453 aa  905    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3589  MATE efflux family protein  98.68 
 
 		 476 aa  895    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3485  MATE efflux family protein  91.83 
 
 		 453 aa  786    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3779  MATE efflux family protein  98.9 
 
 		 453 aa  892    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0649  MATE efflux family protein  99.12 
 
 		 453 aa  900    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000940  Na+ driven multidrug efflux pump  52.04 
 
 		 446 aa  470  1.0000000000000001e-131  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000926882  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06935  Na+-driven multidrug efflux pump  51.13 
 
 		 446 aa  458  9.999999999999999e-129  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0691  MATE efflux family protein  39.46 
 
 		 450 aa  342  1e-92  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0299  MATE efflux family protein  40.18 
 
 		 456 aa  306  6e-82  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000180901  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1506  MATE efflux family protein  39 
 
 		 450 aa  304  2.0000000000000002e-81  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1094  MATE efflux family protein  35.24 
 
 		 464 aa  266  8e-70  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000923462  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1343  MATE efflux family protein  34.38 
 
 		 464 aa  263  4.999999999999999e-69  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00000317655  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1082  efflux protein  34.46 
 
 		 464 aa  262  8e-69  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000125629  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1305  MATE efflux family protein  34.46 
 
 		 464 aa  262  8.999999999999999e-69  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.40401  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1106  MATE efflux family protein  34.46 
 
 		 464 aa  262  8.999999999999999e-69  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000560081  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1088  efflux protein  34.46 
 
 		 464 aa  262  8.999999999999999e-69  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000024435  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1196  MATE efflux family protein  34.46 
 
 		 464 aa  262  8.999999999999999e-69  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000655029  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4103  Na+ driven multidrug efflux pump  34.23 
 
 		 463 aa  262  1e-68  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0660054  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0901  MATE efflux family protein  33.92 
 
 		 463 aa  261  2e-68  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000627796  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1266  MATE efflux family protein  33.71 
 
 		 464 aa  258  1e-67  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1239  MATE efflux family protein  34.01 
 
 		 464 aa  258  2e-67  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.238085  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18490  MATE efflux family protein  32.28 
 
 		 442 aa  249  6e-65  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000174233  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0651  MATE efflux family protein  35.36 
 
 		 446 aa  246  6e-64  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.000388571  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3760  MATE efflux family protein  33.18 
 
 		 464 aa  242  9e-63  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0645  DcuC protein  31.57 
 
 		 439 aa  230  5e-59  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0078  mate efflux family protein  32.27 
 
 		 439 aa  229  9e-59  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.129262  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0536  mate efflux family protein  28.34 
 
 		 440 aa  194  3e-48  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0648  mate efflux family protein  28.38 
 
 		 440 aa  182  1e-44  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.849411  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1050  MATE efflux family protein  29.32 
 
 		 438 aa  163  5.0000000000000005e-39  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0807602  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2306  MATE efflux family protein  27.27 
 
 		 469 aa  160  5e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.30452  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0722  MATE efflux family protein  28.77 
 
 		 438 aa  159  7e-38  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0500546  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0648  MATE efflux family protein  29.22 
 
 		 438 aa  159  7e-38  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0009  multi antimicrobial extrusion protein MatE  26.64 
 
 		 555 aa  159  8e-38  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.64807  hitchhiker  0.000313529 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0795  conserved hypothetical integral membrane protein, MATE family efflux protein  26.38 
 
 		 438 aa  145  2e-33  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.472325  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0991  MATE efflux family protein  24.05 
 
 		 475 aa  134  5e-30  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000156724  normal  0.091152 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0113  MATE efflux family protein  23.22 
 
 		 464 aa  131  2.0000000000000002e-29  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0111  MATE efflux family protein  23.22 
 
 		 464 aa  131  2.0000000000000002e-29  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0446  multi anti extrusion protein MatE  27 
 
 		 455 aa  129  7.000000000000001e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3815  MATE efflux family protein  25.86 
 
 		 467 aa  129  1.0000000000000001e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.142559  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2343  MATE efflux family protein  23.81 
 
 		 464 aa  124  5e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000000238189  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3692  MATE efflux family protein  24.55 
 
 		 461 aa  122  9.999999999999999e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000025823  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000109  adhesin  26.06 
 
 		 461 aa  119  9e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.466925  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7312  hypothetical protein  26.07 
 
 		 458 aa  119  9.999999999999999e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09280  MATE efflux family protein  23.74 
 
 		 453 aa  116  6.9999999999999995e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000476954  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2237  MATE efflux family protein  26.43 
 
 		 469 aa  115  2.0000000000000002e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000615121  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2295  MATE efflux family protein  22.58 
 
 		 475 aa  114  4.0000000000000004e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00026572  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2156  MATE efflux family protein  25.84 
 
 		 451 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.540946 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7238  MATE efflux family protein  24.38 
 
 		 450 aa  111  2.0000000000000002e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.866766  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0830  MATE efflux family protein  25.23 
 
 		 445 aa  105  2e-21  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.000000918772  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05715  Na+-driven multidrug efflux pump  24.94 
 
 		 461 aa  103  4e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2243  MATE efflux family protein  26.47 
 
 		 468 aa  104  4e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0762  MATE efflux family protein  22.73 
 
 		 458 aa  100  7e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1139  hypothetical protein  24.17 
 
 		 484 aa  99.8  8e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.0000000023845  hitchhiker  0.0000334983 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2574  hypothetical protein  25.67 
 
 		 480 aa  99.8  1e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0900334 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3565  MATE efflux family protein  24.94 
 
 		 452 aa  99.8  1e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2872  hypothetical protein  23.71 
 
 		 474 aa  99.8  1e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0273189  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0897  MATE efflux family protein  25 
 
 		 453 aa  99  2e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000262958  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2267  hypothetical protein  24.17 
 
 		 546 aa  98.6  2e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000010697  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2492  MATE efflux family protein  25.57 
 
 		 485 aa  98.6  2e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.544481  normal  0.228664 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1659  hypothetical protein  23.96 
 
 		 495 aa  98.6  2e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.000000439345  normal  0.0451104 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1418  MATE efflux family protein  27.54 
 
 		 462 aa  98.2  3e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1590  hypothetical protein  23.61 
 
 		 476 aa  97.8  4e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00267858  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1669  MATE efflux family protein  23.96 
 
 		 495 aa  97.1  6e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000135228  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1694  hypothetical protein  24.06 
 
 		 474 aa  97.1  6e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.832751  normal  0.156755 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01896  predicted multidrug efflux system  23.96 
 
 		 547 aa  97.1  7e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0202846  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2108  hypothetical protein  23.96 
 
 		 546 aa  96.7  7e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  6.24671e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01885  hypothetical protein  23.96 
 
 		 547 aa  97.1  7e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0187925  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2829  hypothetical protein  23.76 
 
 		 484 aa  97.1  7e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.0000000399298  normal  0.437543 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2504  hypothetical protein  24.06 
 
 		 474 aa  96.7  8e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0192343  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1936  MATE efflux family protein  27.92 
 
 		 486 aa  96.3  1e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0707  MATE efflux family protein  25.89 
 
 		 518 aa  95.5  2e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.376903  normal  0.476505 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2407  hypothetical protein  24.06 
 
 		 476 aa  94.7  3e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.149109  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0056  MATE efflux family protein  23.54 
 
 		 412 aa  94.4  4e-18  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00168356  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2766  MATE efflux family protein  22.84 
 
 		 453 aa  94.4  4e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0984562  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1504  hypothetical protein  23.71 
 
 		 502 aa  94  5e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.969676  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0279  MATE efflux family protein  21.43 
 
 		 445 aa  94  5e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4055  MATE efflux family protein  24.04 
 
 		 483 aa  94  5e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0254154 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1808  MATE efflux family protein  22.66 
 
 		 499 aa  94  6e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.848054  normal  0.460632 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6251  MATE efflux family protein  22.7 
 
 		 461 aa  92  2e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2542  MATE efflux family protein  23.71 
 
 		 459 aa  92.4  2e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1313  Na+-driven multidrug efflux pump  22.7 
 
 		 449 aa  92.4  2e-17  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0190769  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4087  MATE efflux family protein  25.28 
 
 		 447 aa  90.5  6e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3993  MATE efflux family protein  25.06 
 
 		 447 aa  90.1  8e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1531  hypothetical protein  22.94 
 
 		 478 aa  89.4  1e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3120  MATE efflux family protein  23.65 
 
 		 461 aa  89  1e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.369114  normal  0.932515 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2333  MATE efflux family protein  23.67 
 
 		 456 aa  88.2  3e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0260  MATE efflux family protein  24.82 
 
 		 478 aa  86.7  8e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0621  MATE efflux family protein  22.32 
 
 		 460 aa  86.3  0.000000000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.27098  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1856  multidrug efflux protein  20.84 
 
 		 455 aa  85.1  0.000000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.30191  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0147  MATE efflux family protein  23.25 
 
 		 462 aa  85.5  0.000000000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000317216  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3106  hypothetical protein  23.28 
 
 		 484 aa  85.5  0.000000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.20256 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1252  MATE efflux family protein  21.95 
 
 		 445 aa  84.7  0.000000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000131388  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3948  MATE efflux family protein  21.45 
 
 		 458 aa  85.1  0.000000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0427  MATE efflux family protein  21.59 
 
 		 446 aa  84.7  0.000000000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.744275  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2358  MATE efflux family protein  21.83 
 
 		 467 aa  84.3  0.000000000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2404  hypothetical protein  22.81 
 
 		 429 aa  84  0.000000000000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.146193  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>