More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_0009 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013204  Elen_0009  multi antimicrobial extrusion protein MatE  100 
 
 
555 aa  1100    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.64807  hitchhiker  0.000313529 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0691  MATE efflux family protein  32.29 
 
 
450 aa  248  2e-64  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1266  MATE efflux family protein  33.12 
 
 
464 aa  241  2e-62  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1082  efflux protein  33.12 
 
 
464 aa  240  5.999999999999999e-62  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000125629  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1343  MATE efflux family protein  32.62 
 
 
464 aa  239  1e-61  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00000317655  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1106  MATE efflux family protein  32.9 
 
 
464 aa  239  1e-61  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000560081  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1088  efflux protein  32.9 
 
 
464 aa  239  1e-61  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000024435  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1196  MATE efflux family protein  32.9 
 
 
464 aa  239  1e-61  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000655029  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1239  MATE efflux family protein  32.2 
 
 
464 aa  236  6e-61  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.238085  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4103  Na+ driven multidrug efflux pump  32.18 
 
 
463 aa  236  7e-61  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0660054  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1305  MATE efflux family protein  32.47 
 
 
464 aa  236  8e-61  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.40401  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1506  MATE efflux family protein  31.65 
 
 
450 aa  233  6e-60  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0299  MATE efflux family protein  30.2 
 
 
456 aa  230  6e-59  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000180901  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0901  MATE efflux family protein  31.68 
 
 
463 aa  228  2e-58  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000627796  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1094  MATE efflux family protein  31.41 
 
 
464 aa  226  1e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000923462  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18490  MATE efflux family protein  28.67 
 
 
442 aa  188  3e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000174233  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0645  DcuC protein  27.17 
 
 
439 aa  181  4e-44  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06935  Na+-driven multidrug efflux pump  28.4 
 
 
446 aa  177  5e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000940  Na+ driven multidrug efflux pump  27.75 
 
 
446 aa  176  9.999999999999999e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000926882  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3187  MATE efflux family protein  27.09 
 
 
486 aa  172  1e-41  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3485  MATE efflux family protein  27.74 
 
 
453 aa  171  2e-41  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3760  MATE efflux family protein  26.86 
 
 
464 aa  169  1e-40  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0078  mate efflux family protein  27.46 
 
 
439 aa  169  2e-40  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.129262  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0802  MATE efflux family protein  27.31 
 
 
453 aa  166  8e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3779  MATE efflux family protein  26.86 
 
 
453 aa  165  2.0000000000000002e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3589  MATE efflux family protein  26.64 
 
 
476 aa  164  5.0000000000000005e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3315  MATE efflux family protein  27.91 
 
 
456 aa  164  6e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3656  MATE efflux family protein  26.64 
 
 
453 aa  162  1e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0638  MATE efflux family protein  27.04 
 
 
456 aa  162  1e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0649  MATE efflux family protein  26.64 
 
 
453 aa  161  2e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7312  hypothetical protein  29.46 
 
 
458 aa  159  1e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0651  MATE efflux family protein  25.94 
 
 
446 aa  155  1e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.000388571  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0648  mate efflux family protein  24.64 
 
 
440 aa  153  7e-36  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.849411  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0536  mate efflux family protein  25.54 
 
 
440 aa  151  3e-35  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2295  MATE efflux family protein  24.08 
 
 
475 aa  119  9.999999999999999e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00026572  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1252  MATE efflux family protein  25.78 
 
 
445 aa  118  1.9999999999999998e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000131388  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0575  MATE efflux family protein  23.97 
 
 
459 aa  117  5e-25  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000335028  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6251  MATE efflux family protein  24.61 
 
 
461 aa  115  2.0000000000000002e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2306  MATE efflux family protein  23.38 
 
 
469 aa  113  8.000000000000001e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.30452  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0795  conserved hypothetical integral membrane protein, MATE family efflux protein  23.74 
 
 
438 aa  113  9e-24  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.472325  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1669  MATE efflux family protein  26.76 
 
 
495 aa  110  1e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000135228  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3120  MATE efflux family protein  25.54 
 
 
461 aa  109  1e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.369114  normal  0.932515 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01896  predicted multidrug efflux system  26.76 
 
 
547 aa  109  2e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0202846  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01885  hypothetical protein  26.76 
 
 
547 aa  109  2e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0187925  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2829  hypothetical protein  26.56 
 
 
484 aa  108  3e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.0000000399298  normal  0.437543 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2267  hypothetical protein  26.2 
 
 
546 aa  108  3e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000010697  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2108  hypothetical protein  26.56 
 
 
546 aa  108  4e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  6.24671e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1139  hypothetical protein  25.99 
 
 
484 aa  106  8e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.0000000023845  hitchhiker  0.0000334983 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0113  MATE efflux family protein  23.21 
 
 
464 aa  106  1e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0111  MATE efflux family protein  23.21 
 
 
464 aa  106  1e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1659  hypothetical protein  25.99 
 
 
495 aa  105  2e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.000000439345  normal  0.0451104 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2343  MATE efflux family protein  23.28 
 
 
464 aa  105  2e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000000238189  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1856  Na+-driven multidrug efflux pump  25.12 
 
 
429 aa  105  2e-21  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0920105  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2243  MATE efflux family protein  27.41 
 
 
468 aa  101  4e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0056  MATE efflux family protein  24.05 
 
 
412 aa  100  8e-20  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00168356  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4055  MATE efflux family protein  26.63 
 
 
483 aa  99.8  1e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0254154 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3815  MATE efflux family protein  24.03 
 
 
467 aa  98.6  2e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.142559  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0446  multi anti extrusion protein MatE  23.03 
 
 
455 aa  99.4  2e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1050  MATE efflux family protein  23.08 
 
 
438 aa  97.8  4e-19  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0807602  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1936  MATE efflux family protein  24.35 
 
 
486 aa  97.4  6e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1504  hypothetical protein  23.59 
 
 
502 aa  97.1  7e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.969676  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0722  MATE efflux family protein  23.08 
 
 
438 aa  97.1  9e-19  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0500546  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2542  MATE efflux family protein  26.57 
 
 
459 aa  96.3  1e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0648  MATE efflux family protein  23.32 
 
 
438 aa  96.7  1e-18  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0441  MATE efflux family protein  24.34 
 
 
446 aa  95.5  2e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000223642  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2439  MATE efflux family protein  26 
 
 
485 aa  95.1  3e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.739641  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2291  MATE efflux family protein  24.41 
 
 
460 aa  94.7  3e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2407  hypothetical protein  25.6 
 
 
476 aa  94.4  5e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.149109  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1590  hypothetical protein  27.1 
 
 
476 aa  94.4  5e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00267858  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2872  hypothetical protein  25.86 
 
 
474 aa  92.4  2e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0273189  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1579  MATE efflux family protein  22.75 
 
 
445 aa  92.8  2e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1694  hypothetical protein  25.83 
 
 
474 aa  91.7  3e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.832751  normal  0.156755 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2504  hypothetical protein  25.83 
 
 
474 aa  91.3  4e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0192343  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1531  hypothetical protein  26.44 
 
 
478 aa  90.5  7e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0991  MATE efflux family protein  21.13 
 
 
475 aa  90.5  7e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000156724  normal  0.091152 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3692  MATE efflux family protein  21.92 
 
 
461 aa  90.1  9e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000025823  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2591  MATE efflux family protein  25.32 
 
 
525 aa  88.2  3e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.677976  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0545  MATE efflux family protein  22.47 
 
 
470 aa  87  9e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0875  mate efflux family protein  21.71 
 
 
446 aa  86.3  0.000000000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2574  hypothetical protein  24.73 
 
 
480 aa  86.3  0.000000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0900334 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0762  MATE efflux family protein  22.43 
 
 
458 aa  84.3  0.000000000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0723  multidrug resistance protein  22.67 
 
 
454 aa  84.3  0.000000000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1529  MATE efflux family protein  21.73 
 
 
554 aa  82.4  0.00000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.130898  normal  0.344827 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1851  MATE efflux family protein  20.83 
 
 
475 aa  82.4  0.00000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00783953  normal  0.201536 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000109  adhesin  21.79 
 
 
461 aa  81.6  0.00000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.466925  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3106  hypothetical protein  24.9 
 
 
484 aa  82  0.00000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.20256 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2492  MATE efflux family protein  25.3 
 
 
485 aa  80.9  0.00000000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.544481  normal  0.228664 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1338  MATE efflux family protein  24.89 
 
 
481 aa  80.1  0.0000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1309  MATE efflux family protein  22.43 
 
 
538 aa  79.3  0.0000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05890  putative efflux protein, MATE family  23.03 
 
 
472 aa  77.4  0.0000000000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1494  MATE efflux family protein  26.11 
 
 
451 aa  77.4  0.0000000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0347  MATE efflux family protein  20.8 
 
 
454 aa  77.4  0.0000000000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000816576  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2841  MATE efflux family protein  22.6 
 
 
468 aa  76.6  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000678206  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7238  MATE efflux family protein  22.41 
 
 
450 aa  75.9  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.866766  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1895  MATE efflux family protein  24.42 
 
 
498 aa  75.5  0.000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2828  MATE efflux family protein  22.66 
 
 
463 aa  75.9  0.000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1071  MATE efflux family protein  22.08 
 
 
475 aa  75.9  0.000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2514  MATE efflux family protein  22.44 
 
 
463 aa  75.9  0.000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05715  Na+-driven multidrug efflux pump  21.41 
 
 
461 aa  75.5  0.000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3337  MATE efflux family protein  24.61 
 
 
470 aa  75.5  0.000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>