More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcolC_1659 on replicon NC_010468
Organism: Escherichia coli ATCC 8739



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_01896  predicted multidrug efflux system  99.39 
 
 		 547 aa  976    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0202846  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1669  MATE efflux family protein  99.39 
 
 		 495 aa  976    Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000135228  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2574  hypothetical protein  81.55 
 
 		 480 aa  745    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0900334 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2829  hypothetical protein  98.55 
 
 		 484 aa  947    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.0000000399298  normal  0.437543 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2108  hypothetical protein  98.79 
 
 		 546 aa  971    Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  6.24671e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2267  hypothetical protein  99.39 
 
 		 546 aa  976    Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000010697  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01885  hypothetical protein  99.39 
 
 		 547 aa  976    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0187925  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1659  hypothetical protein  100 
 
 		 495 aa  983    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.000000439345  normal  0.0451104 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1139  hypothetical protein  98.97 
 
 		 484 aa  951    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.0000000023845  hitchhiker  0.0000334983 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3106  hypothetical protein  78.41 
 
 		 484 aa  728    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.20256 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1531  hypothetical protein  62.74 
 
 		 478 aa  595  1e-169  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1590  hypothetical protein  62.53 
 
 		 476 aa  593  1e-168  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00267858  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2872  hypothetical protein  63.48 
 
 		 474 aa  590  1e-167  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0273189  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2504  hypothetical protein  62.98 
 
 		 474 aa  586  1e-166  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0192343  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2407  hypothetical protein  62.77 
 
 		 476 aa  583  1.0000000000000001e-165  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.149109  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1694  hypothetical protein  62.63 
 
 		 474 aa  583  1.0000000000000001e-165  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.832751  normal  0.156755 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1504  hypothetical protein  61.46 
 
 		 502 aa  581  1e-164  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.969676  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0441  MATE efflux family protein  30.22 
 
 		 446 aa  219  1e-55  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000223642  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2306  MATE efflux family protein  28.84 
 
 		 469 aa  202  9e-51  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.30452  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1252  MATE efflux family protein  29.8 
 
 		 445 aa  188  2e-46  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000131388  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0991  MATE efflux family protein  27.9 
 
 		 475 aa  188  2e-46  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000156724  normal  0.091152 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0347  MATE efflux family protein  29.68 
 
 		 454 aa  187  3e-46  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000816576  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0875  mate efflux family protein  27.66 
 
 		 446 aa  183  5.0000000000000004e-45  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3692  MATE efflux family protein  27.35 
 
 		 461 aa  172  9e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000025823  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0762  MATE efflux family protein  28.3 
 
 		 458 aa  171  3e-41  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1132  mate efflux family protein  26.51 
 
 		 446 aa  166  5.9999999999999996e-40  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0193769  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4055  MATE efflux family protein  30.1 
 
 		 483 aa  153  7e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0254154 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3565  MATE efflux family protein  30.84 
 
 		 452 aa  153  8e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0078  mate efflux family protein  25.74 
 
 		 439 aa  152  8.999999999999999e-36  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.129262  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0111  MATE efflux family protein  25.69 
 
 		 464 aa  152  1e-35  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0113  MATE efflux family protein  25.69 
 
 		 464 aa  152  2e-35  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2243  MATE efflux family protein  30.75 
 
 		 468 aa  150  7e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0691  MATE efflux family protein  26.62 
 
 		 450 aa  145  1e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0299  MATE efflux family protein  25.23 
 
 		 456 aa  145  2e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000180901  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1506  MATE efflux family protein  27.31 
 
 		 450 aa  144  3e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3993  MATE efflux family protein  29.15 
 
 		 447 aa  144  4e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4087  MATE efflux family protein  29.15 
 
 		 447 aa  142  9.999999999999999e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09280  MATE efflux family protein  25.78 
 
 		 453 aa  142  1.9999999999999998e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000476954  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1724  multi anti extrusion protein MatE  26.89 
 
 		 471 aa  141  1.9999999999999998e-32  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0645  DcuC protein  24.56 
 
 		 439 aa  140  3.9999999999999997e-32  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3815  MATE efflux family protein  26.24 
 
 		 467 aa  140  7e-32  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.142559  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0575  MATE efflux family protein  26.64 
 
 		 459 aa  139  2e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000335028  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2542  MATE efflux family protein  26.61 
 
 		 459 aa  135  1.9999999999999998e-30  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2237  MATE efflux family protein  29.52 
 
 		 469 aa  134  3e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000615121  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1856  Na+-driven multidrug efflux pump  26.81 
 
 		 429 aa  134  3e-30  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0920105  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2343  MATE efflux family protein  28.38 
 
 		 464 aa  134  3.9999999999999996e-30  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000000238189  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4103  Na+ driven multidrug efflux pump  26.13 
 
 		 463 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0660054  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18490  MATE efflux family protein  25.34 
 
 		 442 aa  132  2.0000000000000002e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000174233  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2295  MATE efflux family protein  25.98 
 
 		 475 aa  130  6e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00026572  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4400  MATE efflux family protein  29.61 
 
 		 453 aa  130  7.000000000000001e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0121801  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1266  MATE efflux family protein  25.51 
 
 		 464 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1199  MATE efflux family protein  25.76 
 
 		 450 aa  129  1.0000000000000001e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0538393  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1305  MATE efflux family protein  25.73 
 
 		 464 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.40401  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1106  MATE efflux family protein  25.51 
 
 		 464 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000560081  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1088  efflux protein  25.51 
 
 		 464 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000024435  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1082  efflux protein  25.51 
 
 		 464 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000125629  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1196  MATE efflux family protein  25.51 
 
 		 464 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000655029  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1239  MATE efflux family protein  25.22 
 
 		 464 aa  125  1e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.238085  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0427  MATE efflux family protein  23.9 
 
 		 446 aa  125  1e-27  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.744275  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1343  MATE efflux family protein  25.51 
 
 		 464 aa  124  5e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00000317655  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7238  MATE efflux family protein  26.22 
 
 		 450 aa  123  8e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.866766  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1094  MATE efflux family protein  24.49 
 
 		 464 aa  123  8e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000923462  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0648  mate efflux family protein  23.46 
 
 		 440 aa  120  4.9999999999999996e-26  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.849411  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0279  MATE efflux family protein  24.28 
 
 		 445 aa  119  9e-26  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0901  MATE efflux family protein  24.83 
 
 		 463 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000627796  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0591  MATE efflux family protein  22.71 
 
 		 438 aa  118  1.9999999999999998e-25  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0536  mate efflux family protein  24.61 
 
 		 440 aa  119  1.9999999999999998e-25  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3426  MATE efflux family protein  27.38 
 
 		 434 aa  117  3.9999999999999997e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6251  MATE efflux family protein  25.34 
 
 		 461 aa  116  1.0000000000000001e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0147  MATE efflux family protein  24.48 
 
 		 462 aa  114  4.0000000000000004e-24  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000317216  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3129  MATE efflux family protein  28.25 
 
 		 452 aa  113  6e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0358  multi anti extrusion protein MatE  28.26 
 
 		 452 aa  113  6e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000377442  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0545  MATE efflux family protein  27.23 
 
 		 470 aa  112  2.0000000000000002e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0651  MATE efflux family protein  24.26 
 
 		 446 aa  112  2.0000000000000002e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.000388571  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3760  MATE efflux family protein  24.01 
 
 		 464 aa  110  4.0000000000000004e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2291  MATE efflux family protein  22.22 
 
 		 460 aa  110  8.000000000000001e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05890  putative efflux protein, MATE family  23.4 
 
 		 472 aa  109  1e-22  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0056  MATE efflux family protein  24.94 
 
 		 412 aa  109  1e-22  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00168356  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2404  hypothetical protein  26.22 
 
 		 429 aa  107  4e-22  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.146193  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3887  multi anti extrusion protein MatE  27.11 
 
 		 466 aa  107  5e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0845713 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1418  MATE efflux family protein  28.25 
 
 		 462 aa  106  1e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0906  MATE efflux family protein  23.22 
 
 		 448 aa  105  1e-21  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000766798  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1579  MATE efflux family protein  24.94 
 
 		 445 aa  104  4e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2494  MATE efflux family protein  24.89 
 
 		 458 aa  103  6e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.121522  hitchhiker  0.0012501 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1071  MATE efflux family protein  24.89 
 
 		 475 aa  102  1e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2766  MATE efflux family protein  20.95 
 
 		 453 aa  101  3e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0984562  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1981  MATE efflux family protein  21.11 
 
 		 455 aa  101  4e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000219259  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0981  MATE efflux family protein  24.12 
 
 		 456 aa  101  4e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.730082  normal  0.0880752 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1509  MATE efflux family protein  25.88 
 
 		 460 aa  100  4e-20  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.712333  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3419  MATE efflux family protein  24.31 
 
 		 504 aa  100  5e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000940  Na+ driven multidrug efflux pump  25.78 
 
 		 446 aa  100  5e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000926882  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1607  MATE efflux family protein  25.57 
 
 		 463 aa  100  7e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000142965  unclonable  4.95515e-23 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2117  MATE efflux family protein  23.29 
 
 		 458 aa  99.4  1e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0110658  normal  0.0465778 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0998  MATE efflux family protein  23.72 
 
 		 500 aa  99.8  1e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.280475  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0621  MATE efflux family protein  21.59 
 
 		 460 aa  99.4  2e-19  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.27098  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000109  adhesin  23.77 
 
 		 461 aa  99  2e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.466925  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0784  MATE efflux family protein  25.18 
 
 		 460 aa  99  2e-19  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1541  MATE efflux family protein  24.95 
 
 		 486 aa  98.6  2e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.127259  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0260  MATE efflux family protein  22.53 
 
 		 478 aa  98.6  2e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1672  MATE efflux family protein  25.91 
 
 		 498 aa  97.8  4e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>