More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_0691 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012793  GWCH70_0691  MATE efflux family protein  100 
 
 		 450 aa  899    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1506  MATE efflux family protein  70.44 
 
 		 450 aa  651    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0299  MATE efflux family protein  54.42 
 
 		 456 aa  484  1e-135  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000180901  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1106  MATE efflux family protein  45.19 
 
 		 464 aa  395  1e-109  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000560081  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1088  efflux protein  45.19 
 
 		 464 aa  395  1e-109  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000024435  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1082  efflux protein  45.19 
 
 		 464 aa  396  1e-109  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000125629  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1343  MATE efflux family protein  45.19 
 
 		 464 aa  396  1e-109  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00000317655  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1196  MATE efflux family protein  45.19 
 
 		 464 aa  395  1e-109  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000655029  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18490  MATE efflux family protein  46.38 
 
 		 442 aa  395  1e-109  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000174233  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4103  Na+ driven multidrug efflux pump  45.19 
 
 		 463 aa  397  1e-109  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0660054  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1305  MATE efflux family protein  44.97 
 
 		 464 aa  394  1e-108  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.40401  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1266  MATE efflux family protein  45.19 
 
 		 464 aa  394  1e-108  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1239  MATE efflux family protein  44.97 
 
 		 464 aa  394  1e-108  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.238085  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1094  MATE efflux family protein  45.41 
 
 		 464 aa  393  1e-108  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000923462  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0901  MATE efflux family protein  43.75 
 
 		 463 aa  389  1e-107  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000627796  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3589  MATE efflux family protein  39.78 
 
 		 476 aa  329  6e-89  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3656  MATE efflux family protein  39.46 
 
 		 453 aa  329  7e-89  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3760  MATE efflux family protein  40.69 
 
 		 464 aa  328  9e-89  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0649  MATE efflux family protein  40 
 
 		 453 aa  328  9e-89  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000940  Na+ driven multidrug efflux pump  39.18 
 
 		 446 aa  327  3e-88  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000926882  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3779  MATE efflux family protein  40.13 
 
 		 453 aa  326  5e-88  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0651  MATE efflux family protein  39 
 
 		 446 aa  324  2e-87  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.000388571  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3187  MATE efflux family protein  39.42 
 
 		 486 aa  322  7e-87  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0645  DcuC protein  38.74 
 
 		 439 aa  321  1.9999999999999998e-86  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06935  Na+-driven multidrug efflux pump  39.41 
 
 		 446 aa  319  7.999999999999999e-86  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0802  MATE efflux family protein  38.98 
 
 		 453 aa  318  1e-85  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3485  MATE efflux family protein  38.74 
 
 		 453 aa  314  1.9999999999999998e-84  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3315  MATE efflux family protein  38.88 
 
 		 456 aa  313  3.9999999999999997e-84  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0638  MATE efflux family protein  38.88 
 
 		 456 aa  313  3.9999999999999997e-84  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0078  mate efflux family protein  36.53 
 
 		 439 aa  303  4.0000000000000003e-81  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.129262  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0648  mate efflux family protein  37.81 
 
 		 440 aa  302  8.000000000000001e-81  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.849411  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0536  mate efflux family protein  34.85 
 
 		 440 aa  270  5e-71  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0009  multi antimicrobial extrusion protein MatE  32.29 
 
 		 555 aa  236  8e-61  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.64807  hitchhiker  0.000313529 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0795  conserved hypothetical integral membrane protein, MATE family efflux protein  33.64 
 
 		 438 aa  234  2.0000000000000002e-60  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.472325  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0648  MATE efflux family protein  32.51 
 
 		 438 aa  228  2e-58  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0722  MATE efflux family protein  32.05 
 
 		 438 aa  226  5.0000000000000005e-58  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0500546  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1050  MATE efflux family protein  32.51 
 
 		 438 aa  220  3e-56  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0807602  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2306  MATE efflux family protein  29.77 
 
 		 469 aa  199  1.0000000000000001e-49  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.30452  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0446  multi anti extrusion protein MatE  30.42 
 
 		 455 aa  185  2.0000000000000003e-45  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2343  MATE efflux family protein  28.7 
 
 		 464 aa  180  4.999999999999999e-44  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000000238189  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7312  hypothetical protein  28.86 
 
 		 458 aa  176  5e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0762  MATE efflux family protein  28.08 
 
 		 458 aa  171  2e-41  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0991  MATE efflux family protein  27.72 
 
 		 475 aa  167  4e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000156724  normal  0.091152 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2295  MATE efflux family protein  26.8 
 
 		 475 aa  166  5.9999999999999996e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00026572  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2542  MATE efflux family protein  27.78 
 
 		 459 aa  162  1e-38  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2872  hypothetical protein  29.75 
 
 		 474 aa  155  1e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0273189  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1252  MATE efflux family protein  29.64 
 
 		 445 aa  155  1e-36  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000131388  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1669  MATE efflux family protein  26.53 
 
 		 495 aa  154  2e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000135228  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2829  hypothetical protein  26.77 
 
 		 484 aa  155  2e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.0000000399298  normal  0.437543 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1139  hypothetical protein  26.85 
 
 		 484 aa  155  2e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.0000000023845  hitchhiker  0.0000334983 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2574  hypothetical protein  29.49 
 
 		 480 aa  154  2e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0900334 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01896  predicted multidrug efflux system  26.53 
 
 		 547 aa  154  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0202846  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01885  hypothetical protein  26.53 
 
 		 547 aa  154  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0187925  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2108  hypothetical protein  26.3 
 
 		 546 aa  154  4e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  6.24671e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2267  hypothetical protein  26.85 
 
 		 546 aa  153  5e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000010697  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1590  hypothetical protein  29.96 
 
 		 476 aa  153  5.9999999999999996e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00267858  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0111  MATE efflux family protein  25.68 
 
 		 464 aa  152  1e-35  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1659  hypothetical protein  26.62 
 
 		 495 aa  151  2e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.000000439345  normal  0.0451104 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0113  MATE efflux family protein  25.68 
 
 		 464 aa  152  2e-35  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0056  MATE efflux family protein  28.71 
 
 		 412 aa  148  2.0000000000000003e-34  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00168356  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1694  hypothetical protein  27.29 
 
 		 474 aa  148  2.0000000000000003e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.832751  normal  0.156755 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2504  hypothetical protein  27.68 
 
 		 474 aa  148  2.0000000000000003e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0192343  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1504  hypothetical protein  27.51 
 
 		 502 aa  147  3e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.969676  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2407  hypothetical protein  27.68 
 
 		 476 aa  146  8.000000000000001e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.149109  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1856  Na+-driven multidrug efflux pump  27.95 
 
 		 429 aa  145  2e-33  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0920105  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4055  MATE efflux family protein  26.7 
 
 		 483 aa  144  3e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0254154 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2243  MATE efflux family protein  28.48 
 
 		 468 aa  143  7e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1531  hypothetical protein  27.94 
 
 		 478 aa  141  1.9999999999999998e-32  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09280  MATE efflux family protein  28.57 
 
 		 453 aa  139  8.999999999999999e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000476954  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2237  MATE efflux family protein  26.73 
 
 		 469 aa  138  2e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000615121  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0875  mate efflux family protein  27.65 
 
 		 446 aa  137  6.0000000000000005e-31  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3106  hypothetical protein  28.31 
 
 		 484 aa  134  3.9999999999999996e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.20256 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3692  MATE efflux family protein  23.27 
 
 		 461 aa  134  5e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000025823  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1936  MATE efflux family protein  26.58 
 
 		 486 aa  133  7.999999999999999e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02650  hypothetical protein  26.14 
 
 		 458 aa  131  2.0000000000000002e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3993  MATE efflux family protein  26.17 
 
 		 447 aa  132  2.0000000000000002e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3565  MATE efflux family protein  25.98 
 
 		 452 aa  131  3e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4087  MATE efflux family protein  26.17 
 
 		 447 aa  131  3e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0897  MATE efflux family protein  25 
 
 		 453 aa  130  4.0000000000000003e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000262958  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0441  MATE efflux family protein  27.46 
 
 		 446 aa  130  5.0000000000000004e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000223642  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000109  adhesin  27.29 
 
 		 461 aa  130  5.0000000000000004e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.466925  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1199  MATE efflux family protein  25.62 
 
 		 450 aa  130  6e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0538393  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0427  MATE efflux family protein  26.39 
 
 		 446 aa  129  1.0000000000000001e-28  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.744275  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2766  MATE efflux family protein  26.59 
 
 		 453 aa  128  2.0000000000000002e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0984562  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2022  multidrug efflux pump  24.6 
 
 		 459 aa  127  3e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.54695  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0575  MATE efflux family protein  22.45 
 
 		 459 aa  127  3e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000335028  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3815  MATE efflux family protein  24.25 
 
 		 467 aa  127  4.0000000000000003e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.142559  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003772  Na+ driven multidrug efflux pump  26.14 
 
 		 458 aa  126  8.000000000000001e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0279  MATE efflux family protein  21.66 
 
 		 445 aa  126  8.000000000000001e-28  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7238  MATE efflux family protein  24.07 
 
 		 450 aa  125  2e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.866766  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0347  MATE efflux family protein  26.61 
 
 		 454 aa  125  2e-27  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000816576  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0621  MATE efflux family protein  25.63 
 
 		 460 aa  124  5e-27  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.27098  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2358  MATE efflux family protein  25.36 
 
 		 467 aa  124  5e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0830  MATE efflux family protein  26.35 
 
 		 445 aa  123  8e-27  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.000000918772  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2404  hypothetical protein  27.37 
 
 		 429 aa  123  8e-27  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.146193  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1237  hypothetical protein  26.4 
 
 		 458 aa  122  9e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0290804  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0591  MATE efflux family protein  24.72 
 
 		 438 aa  120  3.9999999999999996e-26  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2915  multidrug resistance protein NorM  25.74 
 
 		 472 aa  119  9.999999999999999e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.706169  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4400  MATE efflux family protein  26.44 
 
 		 453 aa  119  9.999999999999999e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0121801  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09173  MATE efflux family protein  24.77 
 
 		 457 aa  117  3e-25  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>