More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_2243 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_2243  MATE efflux family protein  100 
 
 		 468 aa  877    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4055  MATE efflux family protein  90.09 
 
 		 483 aa  758    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0254154 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1418  MATE efflux family protein  54.79 
 
 		 462 aa  433  1e-120  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2237  MATE efflux family protein  48.53 
 
 		 469 aa  376  1e-103  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000615121  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0762  MATE efflux family protein  34.77 
 
 		 458 aa  239  5.999999999999999e-62  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0111  MATE efflux family protein  33.1 
 
 		 464 aa  226  8e-58  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0113  MATE efflux family protein  33.1 
 
 		 464 aa  226  9e-58  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0575  MATE efflux family protein  36.46 
 
 		 459 aa  217  2.9999999999999998e-55  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000335028  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0991  MATE efflux family protein  33.87 
 
 		 475 aa  215  1.9999999999999998e-54  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000156724  normal  0.091152 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09280  MATE efflux family protein  30.58 
 
 		 453 aa  205  1e-51  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000476954  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0591  MATE efflux family protein  27.51 
 
 		 438 aa  203  5e-51  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2306  MATE efflux family protein  31.28 
 
 		 469 aa  201  3e-50  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.30452  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1199  MATE efflux family protein  31.84 
 
 		 450 aa  192  1e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0538393  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3692  MATE efflux family protein  30.86 
 
 		 461 aa  192  2e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000025823  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3993  MATE efflux family protein  32.57 
 
 		 447 aa  183  6e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4087  MATE efflux family protein  32.57 
 
 		 447 aa  182  1e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3565  MATE efflux family protein  31.31 
 
 		 452 aa  178  2e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05890  putative efflux protein, MATE family  32.08 
 
 		 472 aa  177  4e-43  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1359  multi anti extrusion protein MatE  31.37 
 
 		 408 aa  163  6e-39  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4400  MATE efflux family protein  33.11 
 
 		 453 aa  162  9e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0121801  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0316  MATE efflux family protein  29.28 
 
 		 444 aa  160  3e-38  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000262265  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3129  MATE efflux family protein  32.89 
 
 		 452 aa  158  2e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5035  MATE efflux family protein  32.74 
 
 		 469 aa  157  4e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.88746  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2108  hypothetical protein  30.75 
 
 		 546 aa  156  6e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  6.24671e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2343  MATE efflux family protein  27.21 
 
 		 464 aa  156  7e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000000238189  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1579  MATE efflux family protein  27.75 
 
 		 445 aa  156  9e-37  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1139  hypothetical protein  31 
 
 		 484 aa  155  1e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.0000000023845  hitchhiker  0.0000334983 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0358  multi anti extrusion protein MatE  32.96 
 
 		 452 aa  155  1e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000377442  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3815  MATE efflux family protein  32.12 
 
 		 467 aa  156  1e-36  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.142559  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01896  predicted multidrug efflux system  30.75 
 
 		 547 aa  154  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0202846  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1669  MATE efflux family protein  30.75 
 
 		 495 aa  154  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000135228  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01885  hypothetical protein  30.75 
 
 		 547 aa  154  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0187925  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2267  hypothetical protein  30.75 
 
 		 546 aa  154  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000010697  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1659  hypothetical protein  30.75 
 
 		 495 aa  154  4e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.000000439345  normal  0.0451104 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2829  hypothetical protein  30.5 
 
 		 484 aa  152  8.999999999999999e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.0000000399298  normal  0.437543 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0055  MATE efflux family protein  29.51 
 
 		 446 aa  152  2e-35  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1166  ABC transporter releated protein  27.7 
 
 		 463 aa  151  3e-35  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.403976 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1082  efflux protein  27.06 
 
 		 464 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000125629  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0299  MATE efflux family protein  28.6 
 
 		 456 aa  147  4.0000000000000006e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000180901  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1895  MATE efflux family protein  28.28 
 
 		 498 aa  147  5e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0441  MATE efflux family protein  26.79 
 
 		 446 aa  147  5e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000223642  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0707  MATE efflux family protein  30.81 
 
 		 518 aa  146  8.000000000000001e-34  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.376903  normal  0.476505 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1343  MATE efflux family protein  26.68 
 
 		 464 aa  145  1e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00000317655  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0901  MATE efflux family protein  26.8 
 
 		 463 aa  145  2e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000627796  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0691  MATE efflux family protein  28.25 
 
 		 450 aa  145  2e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1094  MATE efflux family protein  26.68 
 
 		 464 aa  144  4e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000923462  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1106  MATE efflux family protein  26.68 
 
 		 464 aa  143  5e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000560081  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1088  efflux protein  26.68 
 
 		 464 aa  143  5e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000024435  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1196  MATE efflux family protein  26.68 
 
 		 464 aa  143  5e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000655029  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2291  MATE efflux family protein  26.54 
 
 		 460 aa  143  8e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1266  MATE efflux family protein  26.68 
 
 		 464 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1309  MATE efflux family protein  29.8 
 
 		 538 aa  142  9.999999999999999e-33  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4103  Na+ driven multidrug efflux pump  26.42 
 
 		 463 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0660054  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1305  MATE efflux family protein  26.42 
 
 		 464 aa  140  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.40401  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1239  MATE efflux family protein  26.17 
 
 		 464 aa  140  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.238085  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2295  MATE efflux family protein  28.64 
 
 		 475 aa  139  7.999999999999999e-32  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00026572  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2504  hypothetical protein  28.88 
 
 		 474 aa  139  1e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0192343  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2407  hypothetical protein  28.88 
 
 		 476 aa  139  1e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.149109  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0427  MATE efflux family protein  25.83 
 
 		 446 aa  139  2e-31  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.744275  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0545  MATE efflux family protein  27.86 
 
 		 470 aa  137  3.0000000000000003e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1506  MATE efflux family protein  29.35 
 
 		 450 aa  137  5e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1936  MATE efflux family protein  30.97 
 
 		 486 aa  136  6.0000000000000005e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1694  hypothetical protein  28.64 
 
 		 474 aa  137  6.0000000000000005e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.832751  normal  0.156755 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1252  MATE efflux family protein  28.5 
 
 		 445 aa  136  7.000000000000001e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000131388  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6251  MATE efflux family protein  28.4 
 
 		 461 aa  135  9.999999999999999e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1138  MATE efflux family protein  26.07 
 
 		 450 aa  135  9.999999999999999e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000318212  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1504  hypothetical protein  28.89 
 
 		 502 aa  135  9.999999999999999e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.969676  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0906  MATE efflux family protein  26.3 
 
 		 448 aa  135  1.9999999999999998e-30  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000766798  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2458  MATE efflux family protein  29.21 
 
 		 500 aa  135  1.9999999999999998e-30  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.672094  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2315  MATE efflux family protein  30.65 
 
 		 470 aa  134  3e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.1458  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3760  MATE efflux family protein  26.61 
 
 		 464 aa  134  5e-30  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3948  MATE efflux family protein  29.01 
 
 		 458 aa  132  9e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1338  MATE efflux family protein  29.26 
 
 		 481 aa  132  1.0000000000000001e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05190  MATE efflux family protein  28.83 
 
 		 454 aa  132  2.0000000000000002e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.969197  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1529  MATE efflux family protein  26.94 
 
 		 554 aa  131  2.0000000000000002e-29  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.130898  normal  0.344827 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2591  MATE efflux family protein  28.47 
 
 		 525 aa  132  2.0000000000000002e-29  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.677976  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04830  MATE efflux family protein  25.06 
 
 		 468 aa  131  3e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000202645  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0048  MATE efflux family protein  27 
 
 		 501 aa  130  5.0000000000000004e-29  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.331446 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2542  MATE efflux family protein  31.74 
 
 		 459 aa  130  7.000000000000001e-29  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2492  MATE efflux family protein  27.73 
 
 		 485 aa  129  1.0000000000000001e-28  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.544481  normal  0.228664 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1597  MATE efflux family protein  25.06 
 
 		 460 aa  129  1.0000000000000001e-28  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  3.36267e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3887  multi anti extrusion protein MatE  28.89 
 
 		 466 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0845713 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1641  MATE efflux family protein  26.7 
 
 		 469 aa  129  2.0000000000000002e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.725642  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2889  MATE efflux family protein  30.86 
 
 		 471 aa  128  3e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.78127  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4033  MATE efflux family protein  28.69 
 
 		 458 aa  127  6e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000078929 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7238  MATE efflux family protein  28.9 
 
 		 450 aa  126  7e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.866766  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2574  hypothetical protein  30.05 
 
 		 480 aa  126  8.000000000000001e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0900334 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3106  hypothetical protein  30.96 
 
 		 484 aa  125  1e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.20256 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3120  MATE efflux family protein  27.36 
 
 		 461 aa  125  2e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.369114  normal  0.932515 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18490  MATE efflux family protein  25.83 
 
 		 442 aa  125  2e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000174233  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1856  Na+-driven multidrug efflux pump  27.04 
 
 		 429 aa  125  2e-27  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0920105  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3642  multi anti extrusion protein MatE  27.92 
 
 		 496 aa  124  3e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.104533  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0723  multidrug resistance protein  28.61 
 
 		 454 aa  124  3e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0404  MATE efflux family protein  27.58 
 
 		 457 aa  124  3e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.294226 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1180  MATE efflux family protein  24.03 
 
 		 455 aa  124  4e-27  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1531  hypothetical protein  27.49 
 
 		 478 aa  124  4e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1472  multidrug efflux protein  26.82 
 
 		 453 aa  124  5e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1295  multidrug efflux protein  26.82 
 
 		 453 aa  123  6e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0578421  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1402  multidrug efflux protein  26.82 
 
 		 453 aa  123  6e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3677  MATE efflux family protein  26.38 
 
 		 500 aa  123  7e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.380257  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>