More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmur_2425 on replicon NC_014150
Organism: Brachyspira murdochii DSM 12563



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014150  Bmur_2425  MATE efflux family protein  100 
 
 		 461 aa  927    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.264518  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2475  MATE efflux family protein  49.67 
 
 		 463 aa  473  1e-132  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.211957  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0743  MATE efflux family protein  27.23 
 
 		 484 aa  199  1.0000000000000001e-49  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000192336  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0279  MATE efflux family protein  28.01 
 
 		 445 aa  171  3e-41  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0897  MATE efflux family protein  27.65 
 
 		 453 aa  168  2e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000262958  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1138  MATE efflux family protein  27.97 
 
 		 450 aa  161  3e-38  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000318212  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2828  MATE efflux family protein  26.21 
 
 		 463 aa  154  4e-36  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0848  MATE efflux family protein  28.07 
 
 		 458 aa  153  5e-36  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.720761  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2514  MATE efflux family protein  25.99 
 
 		 463 aa  153  5e-36  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0857  MATE efflux family protein  28.07 
 
 		 458 aa  153  7e-36  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2766  MATE efflux family protein  25.38 
 
 		 453 aa  152  1e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0984562  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0621  MATE efflux family protein  25.71 
 
 		 460 aa  152  2e-35  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.27098  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0994  MATE efflux family protein  27.06 
 
 		 449 aa  149  1.0000000000000001e-34  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0830  MATE efflux family protein  27.69 
 
 		 445 aa  148  2.0000000000000003e-34  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.000000918772  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0537  hypothetical protein  27.37 
 
 		 460 aa  134  3e-30  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2022  multidrug efflux pump  24.62 
 
 		 459 aa  133  6.999999999999999e-30  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.54695  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0330  MATE efflux family protein  24.3 
 
 		 479 aa  131  3e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1116  MATE efflux family protein  25 
 
 		 456 aa  126  8.000000000000001e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1237  hypothetical protein  23.58 
 
 		 458 aa  118  3e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0290804  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003772  Na+ driven multidrug efflux pump  25.16 
 
 		 458 aa  110  4.0000000000000004e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0522  MATE efflux family protein  22.84 
 
 		 461 aa  107  5e-22  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0597  hypothetical protein  22.22 
 
 		 444 aa  104  3e-21  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000109  adhesin  22.93 
 
 		 461 aa  104  4e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.466925  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02650  hypothetical protein  23.25 
 
 		 458 aa  102  1e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0596  hypothetical protein  24.08 
 
 		 449 aa  100  6e-20  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.207285  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0427  MATE efflux family protein  25.94 
 
 		 446 aa  99.8  1e-19  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.744275  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05715  Na+-driven multidrug efflux pump  23 
 
 		 461 aa  99.4  1e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1981  MATE efflux family protein  22.72 
 
 		 455 aa  96.7  9e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000219259  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09173  MATE efflux family protein  28.12 
 
 		 457 aa  89  2e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2306  MATE efflux family protein  24.36 
 
 		 469 aa  86.3  0.000000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.30452  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09280  MATE efflux family protein  25.05 
 
 		 453 aa  83.2  0.00000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000476954  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3712  MATE efflux family protein  24.78 
 
 		 454 aa  82.8  0.00000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.139203  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0591  MATE efflux family protein  26.55 
 
 		 438 aa  82  0.00000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0723  multidrug resistance protein  26.3 
 
 		 454 aa  80.5  0.00000000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4055  MATE efflux family protein  24.55 
 
 		 483 aa  80.5  0.00000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0254154 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2630  MATE efflux family protein  22.34 
 
 		 472 aa  79.7  0.00000000000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.850794  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1252  MATE efflux family protein  25.2 
 
 		 445 aa  79.3  0.0000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000131388  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1343  MATE efflux family protein  22.61 
 
 		 464 aa  77.4  0.0000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00000317655  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18490  MATE efflux family protein  24.46 
 
 		 442 aa  77.4  0.0000000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000174233  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1106  MATE efflux family protein  22.54 
 
 		 464 aa  76.6  0.0000000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000560081  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1088  efflux protein  22.54 
 
 		 464 aa  76.6  0.0000000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000024435  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1082  efflux protein  22.54 
 
 		 464 aa  76.6  0.0000000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000125629  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1196  MATE efflux family protein  22.54 
 
 		 464 aa  76.6  0.0000000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000655029  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2243  MATE efflux family protein  24.07 
 
 		 468 aa  76.3  0.000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1266  MATE efflux family protein  22.54 
 
 		 464 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1239  MATE efflux family protein  22.61 
 
 		 464 aa  75.5  0.000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.238085  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4103  Na+ driven multidrug efflux pump  22.93 
 
 		 463 aa  75.5  0.000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0660054  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7238  MATE efflux family protein  24.43 
 
 		 450 aa  75.5  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.866766  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1305  MATE efflux family protein  22.54 
 
 		 464 aa  75.1  0.000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.40401  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1094  MATE efflux family protein  22.93 
 
 		 464 aa  74.7  0.000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000923462  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0762  MATE efflux family protein  25.23 
 
 		 458 aa  73.6  0.000000000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2369  MATE family protein  23.99 
 
 		 459 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.151607  normal  0.213094 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1767  MATE efflux family protein  23.93 
 
 		 462 aa  72.8  0.00000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0111  MATE efflux family protein  23.08 
 
 		 464 aa  70.9  0.00000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0575  MATE efflux family protein  27.23 
 
 		 459 aa  71.2  0.00000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000335028  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0901  MATE efflux family protein  22.83 
 
 		 463 aa  70.9  0.00000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000627796  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0113  MATE efflux family protein  23.42 
 
 		 464 aa  70.5  0.00000000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2358  MATE efflux family protein  23.81 
 
 		 467 aa  70.1  0.00000000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2268  MATE efflux family protein  24.19 
 
 		 452 aa  69.7  0.0000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.012169  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0688  DNA damage inducible protein - mate transporter family  20.79 
 
 		 521 aa  69.7  0.0000000001  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04830  MATE efflux family protein  24.85 
 
 		 468 aa  69.3  0.0000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000202645  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0945  MATE efflux family protein  24.6 
 
 		 453 aa  68.9  0.0000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.228244  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1579  MATE efflux family protein  25.15 
 
 		 445 aa  68.9  0.0000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0162  MATE efflux family protein  23.6 
 
 		 486 aa  67.8  0.0000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2037  MATE efflux family protein  25.71 
 
 		 461 aa  67.8  0.0000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.01185  hitchhiker  0.00138183 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2237  MATE efflux family protein  23.46 
 
 		 469 aa  67  0.0000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000615121  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1856  Na+-driven multidrug efflux pump  22.91 
 
 		 429 aa  67.4  0.0000000006  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0920105  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0347  MATE efflux family protein  25 
 
 		 454 aa  66.2  0.000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000816576  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1225  multidrug efflux pump, NorM, MATE family  24.79 
 
 		 455 aa  65.9  0.000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000329619  normal  0.0233556 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1166  MATE efflux family protein  22.81 
 
 		 455 aa  66.2  0.000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0236579  normal  0.0144354 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0691  MATE efflux family protein  22.66 
 
 		 450 aa  65.9  0.000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2291  MATE efflux family protein  23.29 
 
 		 460 aa  65.1  0.000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2117  MATE efflux family protein  23.47 
 
 		 458 aa  64.7  0.000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0110658  normal  0.0465778 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0687  DNA damage inducible protein - mate transporter family  22.71 
 
 		 540 aa  65.1  0.000000003  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2343  MATE efflux family protein  23.36 
 
 		 464 aa  64.7  0.000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000000238189  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1818  MATE efflux family protein  23.24 
 
 		 459 aa  64.3  0.000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.138431 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2494  MATE efflux family protein  24.6 
 
 		 458 aa  64.7  0.000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.121522  hitchhiker  0.0012501 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1736  MATE efflux family protein  22.71 
 
 		 472 aa  63.9  0.000000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.282832  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0299  MATE efflux family protein  24.11 
 
 		 456 aa  63.9  0.000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000180901  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1761  MATE efflux family protein  23.04 
 
 		 453 aa  63.5  0.000000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.129666  normal  0.0637882 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1712  multidrug efflux protein  21.58 
 
 		 457 aa  62.8  0.00000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0440  MATE efflux family protein  25.52 
 
 		 470 aa  62.4  0.00000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.589921  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1641  MATE efflux family protein  24.1 
 
 		 469 aa  62.4  0.00000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.725642  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06935  Na+-driven multidrug efflux pump  25.32 
 
 		 446 aa  62.8  0.00000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1199  MATE efflux family protein  23.31 
 
 		 450 aa  62  0.00000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0538393  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3106  hypothetical protein  22.43 
 
 		 484 aa  62  0.00000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.20256 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0850  MATE efflux family protein  21.05 
 
 		 439 aa  61.6  0.00000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.313022  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2675  multidrug efflux protein  22.54 
 
 		 457 aa  60.8  0.00000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0055  MATE efflux family protein  23.24 
 
 		 446 aa  61.2  0.00000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1621  Na+ driven multidrug efflux pump  23.19 
 
 		 469 aa  61.2  0.00000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1591  Na+ driven multidrug efflux pump  23.19 
 
 		 469 aa  61.2  0.00000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.742873  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0981  MATE efflux family protein  20.67 
 
 		 456 aa  60.8  0.00000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.730082  normal  0.0880752 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1823  putative MATE efflux protein  23.19 
 
 		 469 aa  61.2  0.00000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0387  multidrug efflux protein  23.36 
 
 		 457 aa  61.2  0.00000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0273741  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0651  MATE efflux family protein  21.97 
 
 		 446 aa  60.8  0.00000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.000388571  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2915  multidrug resistance protein NorM  24.19 
 
 		 472 aa  60.5  0.00000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.706169  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2295  MATE efflux family protein  22.99 
 
 		 475 aa  60.5  0.00000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00026572  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1146  multidrug efflux protein  25.21 
 
 		 461 aa  60.5  0.00000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.292586  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1494  MATE efflux family protein  22.95 
 
 		 451 aa  60.1  0.00000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2355  MATE efflux family protein  20.33 
 
 		 449 aa  60.1  0.00000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0530772  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>