More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_0591 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_0591  MATE efflux family protein  100 
 
 
438 aa  865    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1359  multi anti extrusion protein MatE  44.15 
 
 
408 aa  324  2e-87  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0055  MATE efflux family protein  37.19 
 
 
446 aa  244  1.9999999999999999e-63  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0762  MATE efflux family protein  34.58 
 
 
458 aa  240  4e-62  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0991  MATE efflux family protein  32.67 
 
 
475 aa  238  2e-61  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000156724  normal  0.091152 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2306  MATE efflux family protein  30.96 
 
 
469 aa  236  7e-61  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.30452  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3692  MATE efflux family protein  30.97 
 
 
461 aa  233  4.0000000000000004e-60  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000025823  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0316  MATE efflux family protein  34.5 
 
 
444 aa  230  3e-59  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000262265  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3565  MATE efflux family protein  31.94 
 
 
452 aa  222  9.999999999999999e-57  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0113  MATE efflux family protein  30.21 
 
 
464 aa  197  3e-49  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0111  MATE efflux family protein  30.21 
 
 
464 aa  197  3e-49  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4055  MATE efflux family protein  27.51 
 
 
483 aa  193  6e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0254154 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2243  MATE efflux family protein  27.04 
 
 
468 aa  193  6e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2237  MATE efflux family protein  30.14 
 
 
469 aa  192  8e-48  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000615121  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4087  MATE efflux family protein  30.95 
 
 
447 aa  191  2e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3993  MATE efflux family protein  30.73 
 
 
447 aa  190  2.9999999999999997e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0575  MATE efflux family protein  28.05 
 
 
459 aa  189  7e-47  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000335028  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1579  MATE efflux family protein  30.02 
 
 
445 aa  189  1e-46  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2343  MATE efflux family protein  30 
 
 
464 aa  186  8e-46  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000000238189  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3129  MATE efflux family protein  33.25 
 
 
452 aa  184  3e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1418  MATE efflux family protein  28.01 
 
 
462 aa  183  7e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0358  multi anti extrusion protein MatE  31.69 
 
 
452 aa  182  1e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000377442  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09280  MATE efflux family protein  28.86 
 
 
453 aa  177  4e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000476954  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4400  MATE efflux family protein  30.15 
 
 
453 aa  173  5.999999999999999e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0121801  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6251  MATE efflux family protein  26.48 
 
 
461 aa  164  3e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1670  MATE efflux family protein  30.9 
 
 
466 aa  164  4.0000000000000004e-39  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3120  MATE efflux family protein  27.85 
 
 
461 aa  162  8.000000000000001e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.369114  normal  0.932515 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1353  MATE efflux family protein  27.77 
 
 
453 aa  161  2e-38  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1597  MATE efflux family protein  27.21 
 
 
460 aa  159  8e-38  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  3.36267e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0545  MATE efflux family protein  27.92 
 
 
470 aa  159  1e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2291  MATE efflux family protein  28.07 
 
 
460 aa  157  3e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1199  MATE efflux family protein  27 
 
 
450 aa  157  3e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0538393  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0293  MATE efflux family protein  30 
 
 
467 aa  157  4e-37  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1252  MATE efflux family protein  27.11 
 
 
445 aa  156  5.0000000000000005e-37  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000131388  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1851  MATE efflux family protein  27.33 
 
 
475 aa  154  2e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00783953  normal  0.201536 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1071  MATE efflux family protein  28.96 
 
 
475 aa  155  2e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04830  MATE efflux family protein  29 
 
 
468 aa  154  2.9999999999999998e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000202645  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3173  MATE efflux family protein  29.75 
 
 
448 aa  151  2e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000170892  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2591  MATE efflux family protein  27.31 
 
 
525 aa  148  2.0000000000000003e-34  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.677976  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0906  MATE efflux family protein  26.08 
 
 
448 aa  147  3e-34  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000766798  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2492  MATE efflux family protein  25.63 
 
 
485 aa  147  4.0000000000000006e-34  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.544481  normal  0.228664 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1541  MATE efflux family protein  25.39 
 
 
486 aa  147  5e-34  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.127259  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2458  MATE efflux family protein  26.32 
 
 
500 aa  145  1e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.672094  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0686  MATE efflux family protein  25.87 
 
 
498 aa  145  1e-33  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.221481  normal  0.278001 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0707  MATE efflux family protein  24.89 
 
 
518 aa  144  3e-33  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.376903  normal  0.476505 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2295  MATE efflux family protein  24.32 
 
 
475 aa  143  6e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00026572  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1318  MATE efflux family protein  27.98 
 
 
443 aa  143  6e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000101978  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2358  MATE efflux family protein  26.53 
 
 
467 aa  143  7e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1461  MATE efflux family protein  26.45 
 
 
500 aa  143  7e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0494  MATE efflux family protein  26.79 
 
 
455 aa  142  1.9999999999999998e-32  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0475117  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05190  MATE efflux family protein  29.46 
 
 
454 aa  142  1.9999999999999998e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.969197  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5035  MATE efflux family protein  26.23 
 
 
469 aa  139  7e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.88746  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1309  MATE efflux family protein  25.96 
 
 
538 aa  138  2e-31  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1529  MATE efflux family protein  24.43 
 
 
554 aa  137  3.0000000000000003e-31  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.130898  normal  0.344827 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0347  MATE efflux family protein  26.92 
 
 
454 aa  137  4e-31  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000816576  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1454  MATE efflux family protein  29.77 
 
 
477 aa  137  4e-31  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0875  mate efflux family protein  24.32 
 
 
446 aa  137  5e-31  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1138  MATE efflux family protein  28.02 
 
 
450 aa  136  8e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000318212  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1166  ABC transporter releated protein  23.93 
 
 
463 aa  136  8e-31  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.403976 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1936  MATE efflux family protein  25.99 
 
 
486 aa  135  9.999999999999999e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0830  MATE efflux family protein  27.46 
 
 
445 aa  135  9.999999999999999e-31  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.000000918772  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0014  MATE efflux family protein  26.47 
 
 
453 aa  135  9.999999999999999e-31  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.0029857  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1094  MATE efflux family protein  26.46 
 
 
464 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000923462  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05890  putative efflux protein, MATE family  26.33 
 
 
472 aa  135  1.9999999999999998e-30  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1338  MATE efflux family protein  24.89 
 
 
481 aa  134  3.9999999999999996e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1058  MATE efflux family protein  28.6 
 
 
453 aa  134  3.9999999999999996e-30  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1343  MATE efflux family protein  25.57 
 
 
464 aa  133  6e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00000317655  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0381  MATE efflux family protein  24.42 
 
 
451 aa  133  6e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00954667  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1180  MATE efflux family protein  24.71 
 
 
455 aa  133  6.999999999999999e-30  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2841  MATE efflux family protein  26.48 
 
 
468 aa  132  7.999999999999999e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000678206  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1106  MATE efflux family protein  25.57 
 
 
464 aa  132  9e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000560081  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1088  efflux protein  25.57 
 
 
464 aa  132  9e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000024435  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1196  MATE efflux family protein  25.57 
 
 
464 aa  132  9e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000655029  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1082  efflux protein  25.52 
 
 
464 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000125629  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0427  MATE efflux family protein  25.57 
 
 
446 aa  131  2.0000000000000002e-29  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.744275  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0835  MATE efflux family protein  29.56 
 
 
438 aa  131  2.0000000000000002e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4103  Na+ driven multidrug efflux pump  25.34 
 
 
463 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0660054  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0279  MATE efflux family protein  25.63 
 
 
445 aa  131  2.0000000000000002e-29  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1305  MATE efflux family protein  25.57 
 
 
464 aa  131  3e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.40401  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0828  MATE efflux family protein  29.56 
 
 
438 aa  131  3e-29  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.478729  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1266  MATE efflux family protein  25.57 
 
 
464 aa  131  3e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1711  MATE efflux family protein  27.13 
 
 
463 aa  130  4.0000000000000003e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0339316  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3419  MATE efflux family protein  26.92 
 
 
504 aa  129  9.000000000000001e-29  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1662  MATE efflux family protein  24.88 
 
 
453 aa  129  1.0000000000000001e-28  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.226136  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0485  hypothetical protein  27.12 
 
 
454 aa  128  2.0000000000000002e-28  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0273971  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0621  MATE efflux family protein  26.98 
 
 
460 aa  127  3e-28  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.27098  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6399  MATE efflux family protein  27.1 
 
 
425 aa  127  4.0000000000000003e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.444399  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1239  MATE efflux family protein  24.89 
 
 
464 aa  127  5e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.238085  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1895  MATE efflux family protein  24.61 
 
 
498 aa  126  6e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2418  MATE efflux family protein  26.7 
 
 
471 aa  126  8.000000000000001e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00144  multidrug efflux pump  30.92 
 
 
456 aa  126  8.000000000000001e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0998  MATE efflux family protein  25.75 
 
 
500 aa  126  9e-28  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.280475  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3815  MATE efflux family protein  24.32 
 
 
467 aa  126  9e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.142559  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0147  MATE efflux family protein  24.6 
 
 
462 aa  125  1e-27  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000317216  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0931  MATE efflux family protein  23.81 
 
 
448 aa  124  4e-27  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.102954  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0901  MATE efflux family protein  26.29 
 
 
463 aa  124  4e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000627796  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3886  MATE efflux family protein  25.34 
 
 
481 aa  123  7e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2439  MATE efflux family protein  24.52 
 
 
485 aa  123  7e-27  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.739641  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3236  MATE efflux family protein  23.3 
 
 
502 aa  123  7e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3557  putative MATE efflux protein  27.33 
 
 
469 aa  122  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.43043  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>