More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_0998 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013745  Htur_4468  MATE efflux family protein  71.6 
 
 		 481 aa  682    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0713709  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3886  MATE efflux family protein  69.6 
 
 		 481 aa  688    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0998  MATE efflux family protein  100 
 
 		 500 aa  969    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.280475  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3419  MATE efflux family protein  62.65 
 
 		 504 aa  589  1e-167  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1672  MATE efflux family protein  54.42 
 
 		 498 aa  507  9.999999999999999e-143  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3236  MATE efflux family protein  50.4 
 
 		 502 aa  466  9.999999999999999e-131  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3461  MATE efflux family protein  40.78 
 
 		 475 aa  300  5e-80  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1498  MATE efflux family protein  40.94 
 
 		 478 aa  278  1e-73  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.518187  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1541  MATE efflux family protein  34.66 
 
 		 486 aa  233  4.0000000000000004e-60  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.127259  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0686  MATE efflux family protein  35.83 
 
 		 498 aa  233  5e-60  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.221481  normal  0.278001 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0991  MATE efflux family protein  26.47 
 
 		 475 aa  143  7e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000156724  normal  0.091152 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0591  MATE efflux family protein  25.75 
 
 		 438 aa  126  1e-27  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3815  MATE efflux family protein  27.6 
 
 		 467 aa  122  9.999999999999999e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.142559  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3674  MATE efflux family protein  29.48 
 
 		 473 aa  116  7.999999999999999e-25  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.140006  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1579  MATE efflux family protein  27.45 
 
 		 445 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6251  MATE efflux family protein  27.47 
 
 		 461 aa  115  2.0000000000000002e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2306  MATE efflux family protein  26.48 
 
 		 469 aa  113  7.000000000000001e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.30452  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1936  MATE efflux family protein  26.84 
 
 		 486 aa  110  4.0000000000000004e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2439  MATE efflux family protein  24.95 
 
 		 485 aa  110  7.000000000000001e-23  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.739641  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1138  MATE efflux family protein  23.85 
 
 		 450 aa  110  7.000000000000001e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000318212  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2295  MATE efflux family protein  24.78 
 
 		 475 aa  108  2e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00026572  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2458  MATE efflux family protein  26.63 
 
 		 500 aa  108  3e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.672094  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2358  MATE efflux family protein  25.32 
 
 		 467 aa  107  5e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0830  MATE efflux family protein  26.4 
 
 		 445 aa  107  6e-22  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.000000918772  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3692  MATE efflux family protein  25.18 
 
 		 461 aa  106  8e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000025823  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0279  MATE efflux family protein  25.16 
 
 		 445 aa  105  2e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1461  MATE efflux family protein  27.59 
 
 		 500 aa  103  5e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0621  MATE efflux family protein  24.27 
 
 		 460 aa  103  6e-21  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.27098  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0707  MATE efflux family protein  25.7 
 
 		 518 aa  103  1e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.376903  normal  0.476505 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2766  MATE efflux family protein  23.44 
 
 		 453 aa  102  1e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0984562  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1353  MATE efflux family protein  24.28 
 
 		 453 aa  101  3e-20  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1139  hypothetical protein  23.72 
 
 		 484 aa  100  4e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.0000000023845  hitchhiker  0.0000334983 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1338  MATE efflux family protein  27 
 
 		 481 aa  101  4e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1669  MATE efflux family protein  23.72 
 
 		 495 aa  100  7e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000135228  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01896  predicted multidrug efflux system  23.72 
 
 		 547 aa  99.8  1e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0202846  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01885  hypothetical protein  23.72 
 
 		 547 aa  99.8  1e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0187925  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1659  hypothetical protein  23.72 
 
 		 495 aa  99.8  1e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.000000439345  normal  0.0451104 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2829  hypothetical protein  23.49 
 
 		 484 aa  99.4  1e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.0000000399298  normal  0.437543 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2267  hypothetical protein  23.72 
 
 		 546 aa  99.8  1e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000010697  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2108  hypothetical protein  23.49 
 
 		 546 aa  98.6  2e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  6.24671e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2492  MATE efflux family protein  25.81 
 
 		 485 aa  97.4  5e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.544481  normal  0.228664 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0147  MATE efflux family protein  24.02 
 
 		 462 aa  97.4  5e-19  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000317216  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1362  MATE efflux family protein  30.08 
 
 		 437 aa  97.1  7e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0747  MATE efflux family protein  25.05 
 
 		 490 aa  97.1  7e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3120  MATE efflux family protein  25.87 
 
 		 461 aa  97.1  7e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.369114  normal  0.932515 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1597  MATE efflux family protein  19.08 
 
 		 460 aa  97.1  7e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  3.36267e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0014  MATE efflux family protein  25.87 
 
 		 453 aa  95.1  2e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.0029857  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2591  MATE efflux family protein  28.12 
 
 		 525 aa  95.5  2e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.677976  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1895  MATE efflux family protein  26.1 
 
 		 498 aa  95.1  3e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0897  MATE efflux family protein  22.03 
 
 		 453 aa  92.8  1e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000262958  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0762  MATE efflux family protein  24.48 
 
 		 458 aa  92.4  1e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0645  MATE efflux family protein  22.42 
 
 		 462 aa  93.2  1e-17  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000346552  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3106  hypothetical protein  25.12 
 
 		 484 aa  91.3  3e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.20256 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0691  MATE efflux family protein  22.34 
 
 		 450 aa  89.4  1e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1808  MATE efflux family protein  24.27 
 
 		 499 aa  89.4  1e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.848054  normal  0.460632 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0857  MATE efflux family protein  24.35 
 
 		 458 aa  89.7  1e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0848  MATE efflux family protein  24.14 
 
 		 458 aa  89.4  1e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.720761  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1094  MATE efflux family protein  22.54 
 
 		 464 aa  89.4  1e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000923462  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2343  MATE efflux family protein  21.95 
 
 		 464 aa  88.6  2e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000000238189  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5035  MATE efflux family protein  26.15 
 
 		 469 aa  89  2e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.88746  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04830  MATE efflux family protein  27.24 
 
 		 468 aa  88.6  2e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000202645  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0835  MATE efflux family protein  23.31 
 
 		 438 aa  88.2  3e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0828  MATE efflux family protein  23.31 
 
 		 438 aa  87.8  4e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.478729  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0330  MATE efflux family protein  23.99 
 
 		 479 aa  87.4  5e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2574  hypothetical protein  24.22 
 
 		 480 aa  87.4  5e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0900334 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1438  MATE efflux family protein  28.33 
 
 		 453 aa  87.4  6e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.805906  hitchhiker  0.00501053 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5136  multi anti extrusion protein MatE  27.68 
 
 		 453 aa  87  7e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.114978  normal  0.944792 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1851  MATE efflux family protein  24.89 
 
 		 475 aa  87  7e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00783953  normal  0.201536 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0177  MATE efflux family protein  29.91 
 
 		 442 aa  86.3  0.000000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3642  multi anti extrusion protein MatE  21.66 
 
 		 496 aa  85.9  0.000000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.104533  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1925  MATE efflux family protein  25.95 
 
 		 455 aa  86.7  0.000000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.16171  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3426  MATE efflux family protein  26.91 
 
 		 434 aa  86.3  0.000000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4055  MATE efflux family protein  27.19 
 
 		 483 aa  86.3  0.000000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0254154 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1071  MATE efflux family protein  26.08 
 
 		 475 aa  86.3  0.000000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1199  MATE efflux family protein  22.38 
 
 		 450 aa  85.5  0.000000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0538393  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1343  MATE efflux family protein  22.66 
 
 		 464 aa  85.9  0.000000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00000317655  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1529  MATE efflux family protein  23.92 
 
 		 554 aa  85.9  0.000000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.130898  normal  0.344827 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2022  multidrug efflux pump  26.28 
 
 		 459 aa  85.9  0.000000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.54695  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2243  MATE efflux family protein  28.25 
 
 		 468 aa  85.9  0.000000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1418  MATE efflux family protein  25.43 
 
 		 462 aa  85.1  0.000000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3175  MATE efflux family protein  23.56 
 
 		 468 aa  84.7  0.000000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.386097  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1082  efflux protein  22.66 
 
 		 464 aa  84.7  0.000000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000125629  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1711  MATE efflux family protein  26.71 
 
 		 463 aa  84.3  0.000000000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0339316  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4103  Na+ driven multidrug efflux pump  21.88 
 
 		 463 aa  84.3  0.000000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0660054  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1106  MATE efflux family protein  22.1 
 
 		 464 aa  84.3  0.000000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000560081  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1088  efflux protein  22.1 
 
 		 464 aa  84.3  0.000000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000024435  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1196  MATE efflux family protein  22.1 
 
 		 464 aa  84.3  0.000000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000655029  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1746  MATE efflux family protein  26.55 
 
 		 451 aa  84.3  0.000000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.325105  normal  0.141964 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3091  multi anti extrusion protein MatE  28.1 
 
 		 451 aa  83.6  0.000000000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.170605  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0091  MATE efflux family protein  28.48 
 
 		 454 aa  84  0.000000000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0931  MATE efflux family protein  21.55 
 
 		 448 aa  83.6  0.000000000000008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.102954  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0901  MATE efflux family protein  22.1 
 
 		 463 aa  83.6  0.000000000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000627796  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3385  MATE efflux family protein  24.03 
 
 		 453 aa  83.6  0.000000000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1773  MATE efflux family protein  25.5 
 
 		 451 aa  83.6  0.000000000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1053  MATE efflux family protein  23.19 
 
 		 462 aa  83.6  0.000000000000008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  1.2115099999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1305  MATE efflux family protein  22.1 
 
 		 464 aa  83.2  0.000000000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.40401  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0994  MATE efflux family protein  22.56 
 
 		 449 aa  83.2  0.000000000000009  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1266  MATE efflux family protein  22.1 
 
 		 464 aa  83.6  0.000000000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0022  MATE efflux family protein  24.41 
 
 		 524 aa  82.8  0.00000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00967763  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05190  MATE efflux family protein  26.18 
 
 		 454 aa  83.2  0.00000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.969197  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>