More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_3674 on replicon NC_013923
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013923  Nmag_3674  MATE efflux family protein  100 
 
 		 473 aa  933    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.140006  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1362  MATE efflux family protein  52.47 
 
 		 437 aa  434  1e-120  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0762  MATE efflux family protein  27.65 
 
 		 458 aa  154  2.9999999999999998e-36  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1541  MATE efflux family protein  30.36 
 
 		 486 aa  146  8.000000000000001e-34  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.127259  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0686  MATE efflux family protein  29.2 
 
 		 498 aa  141  3e-32  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.221481  normal  0.278001 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2295  MATE efflux family protein  26.71 
 
 		 475 aa  134  3.9999999999999996e-30  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00026572  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3419  MATE efflux family protein  28.95 
 
 		 504 aa  126  8.000000000000001e-28  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1672  MATE efflux family protein  29.44 
 
 		 498 aa  124  3e-27  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2306  MATE efflux family protein  25.84 
 
 		 469 aa  123  9e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.30452  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3815  MATE efflux family protein  29.02 
 
 		 467 aa  121  1.9999999999999998e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.142559  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0998  MATE efflux family protein  29.51 
 
 		 500 aa  122  1.9999999999999998e-26  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.280475  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0991  MATE efflux family protein  26.68 
 
 		 475 aa  121  3e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000156724  normal  0.091152 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3886  MATE efflux family protein  26.84 
 
 		 481 aa  120  6e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1461  MATE efflux family protein  29.82 
 
 		 500 aa  119  1.9999999999999998e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3692  MATE efflux family protein  27.73 
 
 		 461 aa  116  8.999999999999998e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000025823  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2343  MATE efflux family protein  25.06 
 
 		 464 aa  115  1.0000000000000001e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000000238189  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0591  MATE efflux family protein  24.37 
 
 		 438 aa  115  2.0000000000000002e-24  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6251  MATE efflux family protein  26.88 
 
 		 461 aa  114  5e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3236  MATE efflux family protein  25.99 
 
 		 502 aa  112  1.0000000000000001e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2243  MATE efflux family protein  29.55 
 
 		 468 aa  112  1.0000000000000001e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1936  MATE efflux family protein  28.97 
 
 		 486 aa  112  1.0000000000000001e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2237  MATE efflux family protein  26.9 
 
 		 469 aa  112  2.0000000000000002e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000615121  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2591  MATE efflux family protein  29.42 
 
 		 525 aa  111  3e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.677976  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09280  MATE efflux family protein  26.3 
 
 		 453 aa  110  5e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000476954  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3993  MATE efflux family protein  27.86 
 
 		 447 aa  109  9.000000000000001e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1338  MATE efflux family protein  28.99 
 
 		 481 aa  107  4e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0575  MATE efflux family protein  25.38 
 
 		 459 aa  107  4e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000335028  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4468  MATE efflux family protein  27.47 
 
 		 481 aa  106  7e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0713709  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4087  MATE efflux family protein  27.24 
 
 		 447 aa  106  1e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3461  MATE efflux family protein  28.1 
 
 		 475 aa  103  5e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1498  MATE efflux family protein  29.72 
 
 		 478 aa  103  9e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.518187  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4055  MATE efflux family protein  27.18 
 
 		 483 aa  102  1e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0254154 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1418  MATE efflux family protein  26.75 
 
 		 462 aa  102  1e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2458  MATE efflux family protein  27.32 
 
 		 500 aa  101  2e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.672094  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04830  MATE efflux family protein  28.94 
 
 		 468 aa  101  2e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000202645  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3565  MATE efflux family protein  25.65 
 
 		 452 aa  101  2e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0111  MATE efflux family protein  25.66 
 
 		 464 aa  101  3e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0113  MATE efflux family protein  25.66 
 
 		 464 aa  100  5e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3120  MATE efflux family protein  27.44 
 
 		 461 aa  99  2e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.369114  normal  0.932515 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0055  MATE efflux family protein  25.56 
 
 		 446 aa  98.2  2e-19  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0299  MATE efflux family protein  24.62 
 
 		 456 aa  99  2e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000180901  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2108  hypothetical protein  24.14 
 
 		 546 aa  97.1  6e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  6.24671e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2358  MATE efflux family protein  23.96 
 
 		 467 aa  97.1  7e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1607  MATE efflux family protein  25.4 
 
 		 463 aa  96.7  7e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000142965  unclonable  4.95515e-23 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1579  MATE efflux family protein  25.17 
 
 		 445 aa  96.7  7e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1669  MATE efflux family protein  24.14 
 
 		 495 aa  95.1  2e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000135228  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2267  hypothetical protein  23.96 
 
 		 546 aa  95.1  2e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000010697  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1359  multi anti extrusion protein MatE  23.81 
 
 		 408 aa  95.5  2e-18  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01896  predicted multidrug efflux system  24.14 
 
 		 547 aa  94.7  3e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0202846  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1139  hypothetical protein  23.96 
 
 		 484 aa  94.7  3e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.0000000023845  hitchhiker  0.0000334983 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01885  hypothetical protein  24.14 
 
 		 547 aa  94.7  3e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0187925  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4400  MATE efflux family protein  25.39 
 
 		 453 aa  94.4  4e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0121801  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1166  ABC transporter releated protein  26.15 
 
 		 463 aa  94.4  4e-18  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.403976 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18490  MATE efflux family protein  24.36 
 
 		 442 aa  94  5e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000174233  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2829  hypothetical protein  23.71 
 
 		 484 aa  92.4  1e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.0000000399298  normal  0.437543 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1504  hypothetical protein  24.73 
 
 		 502 aa  92.8  1e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.969676  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2872  hypothetical protein  24.73 
 
 		 474 aa  91.7  3e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0273189  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0545  MATE efflux family protein  25.05 
 
 		 470 aa  90.9  4e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1309  MATE efflux family protein  25.37 
 
 		 538 aa  90.5  6e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1659  hypothetical protein  23.28 
 
 		 495 aa  89.7  1e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.000000439345  normal  0.0451104 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000940  Na+ driven multidrug efflux pump  25.38 
 
 		 446 aa  88.2  3e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000926882  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1670  MATE efflux family protein  26.28 
 
 		 466 aa  88.2  3e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2439  MATE efflux family protein  25.49 
 
 		 485 aa  87.4  5e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.739641  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1531  hypothetical protein  24.13 
 
 		 478 aa  87.4  5e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1590  hypothetical protein  24.51 
 
 		 476 aa  87.4  5e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00267858  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0906  MATE efflux family protein  23.12 
 
 		 448 aa  87.4  5e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000766798  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0707  MATE efflux family protein  26.46 
 
 		 518 aa  86.3  0.000000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.376903  normal  0.476505 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1529  MATE efflux family protein  24.95 
 
 		 554 aa  84.7  0.000000000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.130898  normal  0.344827 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2333  MATE efflux family protein  25.06 
 
 		 456 aa  84.7  0.000000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2492  MATE efflux family protein  26.13 
 
 		 485 aa  84.3  0.000000000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.544481  normal  0.228664 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05190  MATE efflux family protein  25.38 
 
 		 454 aa  84  0.000000000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.969197  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0358  multi anti extrusion protein MatE  27.66 
 
 		 452 aa  83.6  0.000000000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000377442  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2291  MATE efflux family protein  24.6 
 
 		 460 aa  83.6  0.000000000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0147  MATE efflux family protein  24.59 
 
 		 462 aa  82.8  0.00000000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000317216  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3175  MATE efflux family protein  23.86 
 
 		 468 aa  82.8  0.00000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.386097  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1199  MATE efflux family protein  24.44 
 
 		 450 aa  82.8  0.00000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0538393  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3337  MATE efflux family protein  27.43 
 
 		 470 aa  82  0.00000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3129  MATE efflux family protein  27.23 
 
 		 452 aa  81.6  0.00000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2407  hypothetical protein  24.73 
 
 		 476 aa  81.6  0.00000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.149109  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2504  hypothetical protein  24.73 
 
 		 474 aa  81.3  0.00000000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0192343  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1808  MATE efflux family protein  26.44 
 
 		 499 aa  80.9  0.00000000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.848054  normal  0.460632 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1694  hypothetical protein  24.73 
 
 		 474 aa  80.5  0.00000000000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.832751  normal  0.156755 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1711  MATE efflux family protein  25.19 
 
 		 463 aa  80.5  0.00000000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0339316  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2542  MATE efflux family protein  27.21 
 
 		 459 aa  80.1  0.00000000000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2841  MATE efflux family protein  21.49 
 
 		 468 aa  79.3  0.0000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000678206  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3173  MATE efflux family protein  23.48 
 
 		 448 aa  79  0.0000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000170892  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3642  multi anti extrusion protein MatE  24.46 
 
 		 496 aa  78.2  0.0000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.104533  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1094  MATE efflux family protein  24.94 
 
 		 464 aa  78.2  0.0000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000923462  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3106  hypothetical protein  23.87 
 
 		 484 aa  77.8  0.0000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.20256 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1641  MATE efflux family protein  21.98 
 
 		 469 aa  77.4  0.0000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.725642  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1419  MATE efflux family protein  21.71 
 
 		 469 aa  76.3  0.000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.703884  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7238  MATE efflux family protein  24.64 
 
 		 450 aa  76.6  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.866766  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1846  integral membrane protein, putative  22.1 
 
 		 469 aa  75.9  0.000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.563684  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1899  putative MATE efflux protein  22.1 
 
 		 469 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00227155  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1621  Na+ driven multidrug efflux pump  22.1 
 
 		 469 aa  75.9  0.000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1591  Na+ driven multidrug efflux pump  22.1 
 
 		 469 aa  75.9  0.000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.742873  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1823  putative MATE efflux protein  22.1 
 
 		 469 aa  75.9  0.000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2574  hypothetical protein  23.39 
 
 		 480 aa  75.5  0.000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0900334 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1506  MATE efflux family protein  25.38 
 
 		 450 aa  75.1  0.000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1266  MATE efflux family protein  24.04 
 
 		 464 aa  75.1  0.000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>