More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_3461 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013743  Htur_3461  MATE efflux family protein  100 
 
 		 475 aa  910    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1498  MATE efflux family protein  76.57 
 
 		 478 aa  633  1e-180  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.518187  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3886  MATE efflux family protein  43.59 
 
 		 481 aa  339  7e-92  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3419  MATE efflux family protein  41.18 
 
 		 504 aa  315  1.9999999999999998e-84  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0998  MATE efflux family protein  40.78 
 
 		 500 aa  311  2e-83  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.280475  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4468  MATE efflux family protein  43.4 
 
 		 481 aa  310  2.9999999999999997e-83  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0713709  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1672  MATE efflux family protein  41.68 
 
 		 498 aa  309  5.9999999999999995e-83  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3236  MATE efflux family protein  43.16 
 
 		 502 aa  308  1.0000000000000001e-82  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0686  MATE efflux family protein  35.7 
 
 		 498 aa  235  2.0000000000000002e-60  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.221481  normal  0.278001 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1541  MATE efflux family protein  36.02 
 
 		 486 aa  229  9e-59  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.127259  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0991  MATE efflux family protein  28.13 
 
 		 475 aa  140  3.9999999999999997e-32  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000156724  normal  0.091152 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2306  MATE efflux family protein  27.2 
 
 		 469 aa  125  2e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.30452  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3674  MATE efflux family protein  28.75 
 
 		 473 aa  104  3e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.140006  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1579  MATE efflux family protein  26.72 
 
 		 445 aa  103  8e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1362  MATE efflux family protein  29.7 
 
 		 437 aa  103  8e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2295  MATE efflux family protein  25.82 
 
 		 475 aa  101  3e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00026572  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1166  ABC transporter releated protein  25.39 
 
 		 463 aa  99.4  1e-19  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.403976 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2358  MATE efflux family protein  25.56 
 
 		 467 aa  99  2e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0591  MATE efflux family protein  22.25 
 
 		 438 aa  93.6  7e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3692  MATE efflux family protein  26.8 
 
 		 461 aa  92.4  1e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000025823  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1180  MATE efflux family protein  23.62 
 
 		 455 aa  92.8  1e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1895  MATE efflux family protein  26.83 
 
 		 498 aa  93.2  1e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0762  MATE efflux family protein  24.28 
 
 		 458 aa  91.7  3e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1529  MATE efflux family protein  24.4 
 
 		 554 aa  90.9  5e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.130898  normal  0.344827 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3887  multi anti extrusion protein MatE  28.04 
 
 		 466 aa  90.5  6e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0845713 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1309  MATE efflux family protein  27.29 
 
 		 538 aa  90.1  9e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1338  MATE efflux family protein  28.07 
 
 		 481 aa  89.4  1e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1711  MATE efflux family protein  26.88 
 
 		 463 aa  89.4  1e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0339316  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1461  MATE efflux family protein  26.95 
 
 		 500 aa  89  2e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2492  MATE efflux family protein  26.33 
 
 		 485 aa  87.8  4e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.544481  normal  0.228664 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1936  MATE efflux family protein  26.41 
 
 		 486 aa  87  7e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2243  MATE efflux family protein  30.8 
 
 		 468 aa  87  7e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2458  MATE efflux family protein  28.71 
 
 		 500 aa  85.9  0.000000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.672094  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0707  MATE efflux family protein  28.73 
 
 		 518 aa  86.3  0.000000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.376903  normal  0.476505 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2439  MATE efflux family protein  25.65 
 
 		 485 aa  85.9  0.000000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.739641  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2343  MATE efflux family protein  28.36 
 
 		 483 aa  84.3  0.000000000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0308  MATE efflux family protein  24.77 
 
 		 441 aa  84.3  0.000000000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.426716  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0575  MATE efflux family protein  25.85 
 
 		 459 aa  83.6  0.000000000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000335028  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0747  MATE efflux family protein  26.17 
 
 		 490 aa  83.6  0.000000000000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2542  MATE efflux family protein  28.31 
 
 		 459 aa  83.2  0.000000000000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0100  MATE efflux family protein  23.49 
 
 		 454 aa  82.8  0.00000000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0456451  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3815  MATE efflux family protein  24.94 
 
 		 467 aa  81.6  0.00000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.142559  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0147  MATE efflux family protein  22.41 
 
 		 462 aa  81.3  0.00000000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000317216  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0427  MATE efflux family protein  23.21 
 
 		 446 aa  81.3  0.00000000000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.744275  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2237  MATE efflux family protein  24.43 
 
 		 469 aa  80.5  0.00000000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000615121  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1139  hypothetical protein  25.4 
 
 		 484 aa  80.1  0.00000000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.0000000023845  hitchhiker  0.0000334983 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04830  MATE efflux family protein  28 
 
 		 468 aa  80.1  0.00000000000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000202645  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05190  MATE efflux family protein  23.96 
 
 		 454 aa  80.1  0.00000000000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.969197  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6251  MATE efflux family protein  25.18 
 
 		 461 aa  79.7  0.0000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1659  hypothetical protein  25.17 
 
 		 495 aa  79.3  0.0000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.000000439345  normal  0.0451104 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0897  MATE efflux family protein  24.18 
 
 		 453 aa  78.6  0.0000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000262958  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0906  MATE efflux family protein  21.77 
 
 		 448 aa  78.6  0.0000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000766798  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2829  hypothetical protein  24.24 
 
 		 484 aa  79  0.0000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.0000000399298  normal  0.437543 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4055  MATE efflux family protein  29.78 
 
 		 483 aa  79  0.0000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0254154 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1669  MATE efflux family protein  25.17 
 
 		 495 aa  78.2  0.0000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000135228  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1199  MATE efflux family protein  21.88 
 
 		 450 aa  78.2  0.0000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0538393  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1808  MATE efflux family protein  24.95 
 
 		 499 aa  78.6  0.0000000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.848054  normal  0.460632 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2267  hypothetical protein  25.17 
 
 		 546 aa  78.2  0.0000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000010697  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01896  predicted multidrug efflux system  25.17 
 
 		 547 aa  77.8  0.0000000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0202846  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01885  hypothetical protein  25.17 
 
 		 547 aa  77.8  0.0000000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0187925  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0743  MATE efflux family protein  26.69 
 
 		 484 aa  77.4  0.0000000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000192336  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2108  hypothetical protein  25.69 
 
 		 546 aa  77  0.0000000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  6.24671e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3337  MATE efflux family protein  27.33 
 
 		 470 aa  77  0.0000000000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0545  MATE efflux family protein  25.57 
 
 		 470 aa  76.6  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0014  MATE efflux family protein  25 
 
 		 453 aa  75.9  0.000000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.0029857  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1359  multi anti extrusion protein MatE  22.04 
 
 		 408 aa  76.3  0.000000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4023  putative transporter  28.81 
 
 		 477 aa  75.9  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.343891  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2343  MATE efflux family protein  23.33 
 
 		 464 aa  75.9  0.000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000000238189  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46680  putative transporter  28.81 
 
 		 477 aa  75.9  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.013844  hitchhiker  0.0000129498 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0055  MATE efflux family protein  23.53 
 
 		 446 aa  74.7  0.000000000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2591  MATE efflux family protein  26.62 
 
 		 525 aa  74.7  0.000000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.677976  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05890  putative efflux protein, MATE family  25.16 
 
 		 472 aa  73.9  0.000000000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1071  MATE efflux family protein  25 
 
 		 475 aa  74.3  0.000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2766  MATE efflux family protein  25.06 
 
 		 453 aa  72.8  0.00000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0984562  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3120  MATE efflux family protein  25.87 
 
 		 461 aa  72.8  0.00000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.369114  normal  0.932515 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1981  MATE efflux family protein  26.07 
 
 		 455 aa  72.4  0.00000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000219259  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2630  MATE efflux family protein  26.68 
 
 		 472 aa  71.6  0.00000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.850794  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3141  MATE efflux family protein  26.37 
 
 		 472 aa  71.6  0.00000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.565795  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1841  MATE efflux family protein  24.37 
 
 		 469 aa  71.6  0.00000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1382  multidrug efflux protein  26.94 
 
 		 460 aa  71.6  0.00000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.13512  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1418  MATE efflux family protein  27.98 
 
 		 462 aa  71.2  0.00000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0645  MATE efflux family protein  21.3 
 
 		 462 aa  71.2  0.00000000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000346552  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05715  Na+-driven multidrug efflux pump  23.31 
 
 		 461 aa  70.5  0.00000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5035  MATE efflux family protein  28.61 
 
 		 469 aa  70.5  0.00000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.88746  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0901  MATE efflux family protein  22.62 
 
 		 463 aa  69.3  0.0000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000627796  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1506  MATE efflux family protein  25.16 
 
 		 450 aa  69.3  0.0000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09280  MATE efflux family protein  24.13 
 
 		 453 aa  69.3  0.0000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000476954  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3677  MATE efflux family protein  26.35 
 
 		 500 aa  68.9  0.0000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.380257  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0534  MATE efflux family protein  22.89 
 
 		 451 aa  67.8  0.0000000004  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3565  MATE efflux family protein  24.74 
 
 		 452 aa  67.8  0.0000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0279  MATE efflux family protein  22.2 
 
 		 445 aa  67  0.0000000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0618  MATE efflux family protein  24.7 
 
 		 505 aa  67  0.0000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.316241  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2100  MATE efflux family protein  28.24 
 
 		 491 aa  67.4  0.0000000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.114433 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1094  MATE efflux family protein  22.62 
 
 		 464 aa  67  0.0000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000923462  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0111  MATE efflux family protein  24.44 
 
 		 464 aa  67  0.0000000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1353  MATE efflux family protein  22.64 
 
 		 453 aa  66.6  0.0000000008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0316  MATE efflux family protein  23.46 
 
 		 444 aa  67  0.0000000008  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000262265  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0113  MATE efflux family protein  24.44 
 
 		 464 aa  66.6  0.0000000009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1019  MATE efflux family protein  26.28 
 
 		 474 aa  66.6  0.0000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1907  MATE efflux family protein  27.57 
 
 		 457 aa  66.6  0.0000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0742597  normal  0.100602 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>