More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_2100 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012029  Hlac_2100  MATE efflux family protein  100 
 
 		 491 aa  926    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.114433 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1670  MATE efflux family protein  46.38 
 
 		 466 aa  377  1e-103  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2343  MATE efflux family protein  44.76 
 
 		 483 aa  308  1.0000000000000001e-82  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1338  MATE efflux family protein  31.73 
 
 		 481 aa  176  9.999999999999999e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1461  MATE efflux family protein  32.28 
 
 		 500 aa  165  2.0000000000000002e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2591  MATE efflux family protein  31.96 
 
 		 525 aa  159  1e-37  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.677976  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1936  MATE efflux family protein  32.76 
 
 		 486 aa  159  1e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2458  MATE efflux family protein  29.94 
 
 		 500 aa  154  5e-36  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.672094  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2492  MATE efflux family protein  31.44 
 
 		 485 aa  153  5.9999999999999996e-36  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.544481  normal  0.228664 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2291  MATE efflux family protein  27.88 
 
 		 460 aa  150  5e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05190  MATE efflux family protein  29.45 
 
 		 454 aa  150  6e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.969197  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1895  MATE efflux family protein  29.89 
 
 		 498 aa  147  5e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6251  MATE efflux family protein  26.02 
 
 		 461 aa  146  7.0000000000000006e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2439  MATE efflux family protein  28.68 
 
 		 485 aa  144  3e-33  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.739641  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1309  MATE efflux family protein  31.39 
 
 		 538 aa  144  4e-33  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0591  MATE efflux family protein  26.47 
 
 		 438 aa  141  1.9999999999999998e-32  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04830  MATE efflux family protein  26.35 
 
 		 468 aa  141  3e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000202645  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3337  MATE efflux family protein  32.47 
 
 		 470 aa  139  1e-31  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3120  MATE efflux family protein  27 
 
 		 461 aa  137  3.0000000000000003e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.369114  normal  0.932515 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0545  MATE efflux family protein  27.94 
 
 		 470 aa  137  4e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1579  MATE efflux family protein  29.2 
 
 		 445 aa  135  9.999999999999999e-31  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0707  MATE efflux family protein  29 
 
 		 518 aa  135  1.9999999999999998e-30  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.376903  normal  0.476505 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3642  multi anti extrusion protein MatE  28.76 
 
 		 496 aa  134  3e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.104533  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0100  MATE efflux family protein  26.74 
 
 		 454 aa  134  3e-30  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0456451  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1808  MATE efflux family protein  30.06 
 
 		 499 aa  134  3.9999999999999996e-30  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.848054  normal  0.460632 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1529  MATE efflux family protein  29.46 
 
 		 554 aa  134  3.9999999999999996e-30  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.130898  normal  0.344827 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1166  ABC transporter releated protein  24.02 
 
 		 463 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.403976 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1851  MATE efflux family protein  24.44 
 
 		 475 aa  131  3e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00783953  normal  0.201536 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1071  MATE efflux family protein  23.21 
 
 		 475 aa  131  3e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3677  MATE efflux family protein  27.01 
 
 		 500 aa  130  4.0000000000000003e-29  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.380257  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0686  MATE efflux family protein  30.28 
 
 		 498 aa  128  3e-28  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.221481  normal  0.278001 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0147  MATE efflux family protein  24.08 
 
 		 462 aa  127  4.0000000000000003e-28  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000317216  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2295  MATE efflux family protein  28.61 
 
 		 475 aa  125  1e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00026572  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3962  multi antimicrobial extrusion protein  28.06 
 
 		 492 aa  124  5e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.789789  normal  0.0338284 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2358  MATE efflux family protein  26.44 
 
 		 467 aa  123  6e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0747  MATE efflux family protein  29.17 
 
 		 490 aa  123  7e-27  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0485  hypothetical protein  24.33 
 
 		 454 aa  120  3.9999999999999996e-26  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0273971  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1654  MATE efflux family protein  28.82 
 
 		 473 aa  119  7.999999999999999e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1597  MATE efflux family protein  24.42 
 
 		 460 aa  119  9.999999999999999e-26  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  3.36267e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1160  MATE efflux family protein  27.15 
 
 		 486 aa  119  1.9999999999999998e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4310  MATE efflux family protein  25.54 
 
 		 451 aa  118  1.9999999999999998e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1541  MATE efflux family protein  28.76 
 
 		 486 aa  117  3.9999999999999997e-25  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.127259  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1454  MATE efflux family protein  26.9 
 
 		 477 aa  117  5e-25  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2343  MATE efflux family protein  26.7 
 
 		 464 aa  117  6e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000000238189  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0055  MATE efflux family protein  27.3 
 
 		 446 aa  117  6.9999999999999995e-25  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1711  MATE efflux family protein  24.07 
 
 		 463 aa  117  6.9999999999999995e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0339316  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3492  integral membrane protein  26.84 
 
 		 485 aa  116  1.0000000000000001e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0396785  normal  0.244149 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0762  MATE efflux family protein  25.85 
 
 		 458 aa  116  1.0000000000000001e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2888  MATE efflux family protein  24.46 
 
 		 462 aa  115  3e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0238453  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1180  MATE efflux family protein  25.85 
 
 		 455 aa  114  3e-24  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1662  MATE efflux family protein  28.69 
 
 		 453 aa  113  6e-24  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.226136  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0702  MATE efflux family protein  23.99 
 
 		 452 aa  113  7.000000000000001e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1607  MATE efflux family protein  28.93 
 
 		 463 aa  112  1.0000000000000001e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000142965  unclonable  4.95515e-23 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0670  MATE efflux family protein  23.81 
 
 		 455 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.358402  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0091  MATE efflux family protein  25.84 
 
 		 454 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0111  MATE efflux family protein  24.82 
 
 		 464 aa  111  3e-23  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3710  MATE efflux family protein  23.81 
 
 		 455 aa  111  3e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.232724  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0113  MATE efflux family protein  25.06 
 
 		 464 aa  111  4.0000000000000004e-23  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0643  MATE efflux family protein  23.81 
 
 		 455 aa  111  4.0000000000000004e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2964  MATE efflux family protein  24.51 
 
 		 453 aa  110  5e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000632854  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0991  MATE efflux family protein  26.46 
 
 		 475 aa  110  5e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000156724  normal  0.091152 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3395  MATE efflux family protein  22.93 
 
 		 461 aa  110  5e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0666  MATE efflux family protein  23.81 
 
 		 455 aa  110  6e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0645  MATE efflux family protein  23.08 
 
 		 462 aa  110  6e-23  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000346552  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0381  MATE efflux family protein  22.33 
 
 		 451 aa  109  1e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00954667  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0420  MATE efflux family protein  25.18 
 
 		 459 aa  109  1e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000768677  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1353  MATE efflux family protein  26.32 
 
 		 453 aa  108  2e-22  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3884  MATE efflux family protein  28.05 
 
 		 521 aa  108  2e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3691  MATE efflux family protein  23.98 
 
 		 453 aa  108  2e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.830643  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2060  MATE efflux family protein  24.82 
 
 		 456 aa  107  3e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000022927  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0575  MATE efflux family protein  28.93 
 
 		 459 aa  107  4e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000335028  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0835  MATE efflux family protein  26.17 
 
 		 438 aa  107  5e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0828  MATE efflux family protein  26.17 
 
 		 438 aa  107  5e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.478729  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0640  MATE efflux family protein  25.06 
 
 		 454 aa  106  9e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.690668  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0553  MATE efflux family protein  24.04 
 
 		 452 aa  105  1e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.136219 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0293  MATE efflux family protein  25.82 
 
 		 467 aa  104  3e-21  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3399  MATE efflux family protein  23.8 
 
 		 452 aa  104  3e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00107141 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0784  MATE efflux family protein  24.87 
 
 		 460 aa  104  3e-21  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0316  MATE efflux family protein  26.14 
 
 		 444 aa  104  4e-21  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000262265  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4033  MATE efflux family protein  26.85 
 
 		 458 aa  104  4e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000078929 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0014  MATE efflux family protein  25.12 
 
 		 453 aa  103  5e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.0029857  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3662  MATE efflux family protein  25.36 
 
 		 476 aa  103  6e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.000000389251  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4055  MATE efflux family protein  27.01 
 
 		 483 aa  103  6e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0254154 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0699  MATE efflux family protein  23.63 
 
 		 456 aa  103  7e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0250563  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3569  MATE efflux family protein  23.21 
 
 		 452 aa  102  1e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0796958  normal  0.0492062 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02728  MATE efflux family protein  24.69 
 
 		 460 aa  102  2e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0324679  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02151  multi antimicrobial extrusion family protein  28.3 
 
 		 503 aa  102  2e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1067  MATE efflux family protein  22.87 
 
 		 453 aa  101  3e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000154468  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0906  MATE efflux family protein  23.33 
 
 		 448 aa  101  3e-20  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000766798  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2612  MATE efflux family protein  26.65 
 
 		 459 aa  101  4e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1925  MATE efflux family protein  24.23 
 
 		 455 aa  101  4e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.16171  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05514  hypothetical protein  27.71 
 
 		 482 aa  100  6e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.957983  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2243  MATE efflux family protein  27.91 
 
 		 468 aa  100  6e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3126  MATE efflux family protein  23.3 
 
 		 455 aa  100  6e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.113083  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3948  MATE efflux family protein  26.54 
 
 		 458 aa  100  8e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1509  MATE efflux family protein  24.09 
 
 		 460 aa  100  8e-20  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.712333  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1138  MATE efflux family protein  25.95 
 
 		 450 aa  99.8  9e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000318212  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2080  MATE efflux family protein  26.39 
 
 		 454 aa  99.8  1e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.634791 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1274  Na+ driven multidrug efflux protein  21.6 
 
 		 456 aa  99.4  1e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.605029  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0330  MATE efflux family protein  24.07 
 
 		 479 aa  98.6  2e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>