More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_1711 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_1711  MATE efflux family protein  100 
 
 		 463 aa  917    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0339316  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0100  MATE efflux family protein  39.87 
 
 		 454 aa  333  4e-90  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0456451  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0828  MATE efflux family protein  36.94 
 
 		 438 aa  298  2e-79  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.478729  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0636  MATE efflux family protein  38.11 
 
 		 454 aa  296  4e-79  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.237827 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0835  MATE efflux family protein  36.94 
 
 		 438 aa  296  4e-79  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1922  MATE efflux family protein  34.75 
 
 		 456 aa  286  4e-76  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0534  MATE efflux family protein  35.1 
 
 		 451 aa  250  4e-65  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0111  MATE efflux family protein  29.88 
 
 		 464 aa  181  2.9999999999999997e-44  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0113  MATE efflux family protein  29.95 
 
 		 464 aa  180  4e-44  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05190  MATE efflux family protein  31.63 
 
 		 454 aa  176  9.999999999999999e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.969197  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1936  MATE efflux family protein  30.13 
 
 		 486 aa  174  1.9999999999999998e-42  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1597  MATE efflux family protein  28.87 
 
 		 460 aa  174  1.9999999999999998e-42  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  3.36267e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2492  MATE efflux family protein  29.91 
 
 		 485 aa  175  1.9999999999999998e-42  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.544481  normal  0.228664 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2291  MATE efflux family protein  30.11 
 
 		 460 aa  171  2e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1461  MATE efflux family protein  27.64 
 
 		 500 aa  164  4.0000000000000004e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04830  MATE efflux family protein  28.7 
 
 		 468 aa  161  2e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000202645  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1810  MATE efflux family protein  28.82 
 
 		 446 aa  158  2e-37  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.108169  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1808  MATE efflux family protein  27.77 
 
 		 499 aa  158  2e-37  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.848054  normal  0.460632 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2458  MATE efflux family protein  26.27 
 
 		 500 aa  157  5.0000000000000005e-37  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.672094  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2358  MATE efflux family protein  28.35 
 
 		 467 aa  155  1e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0762  MATE efflux family protein  28.08 
 
 		 458 aa  154  2.9999999999999998e-36  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0747  MATE efflux family protein  28.05 
 
 		 490 aa  154  2.9999999999999998e-36  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3276  MATE efflux family protein  28.21 
 
 		 457 aa  151  2e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000381455  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0381  MATE efflux family protein  28.15 
 
 		 451 aa  148  2.0000000000000003e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00954667  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0147  MATE efflux family protein  27.19 
 
 		 462 aa  147  3e-34  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000317216  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2306  MATE efflux family protein  27.35 
 
 		 469 aa  146  8.000000000000001e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.30452  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1895  MATE efflux family protein  26.78 
 
 		 498 aa  145  2e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1579  MATE efflux family protein  25.62 
 
 		 445 aa  144  2e-33  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0707  MATE efflux family protein  27.1 
 
 		 518 aa  143  5e-33  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.376903  normal  0.476505 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3677  MATE efflux family protein  27.62 
 
 		 500 aa  143  8e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.380257  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2343  MATE efflux family protein  27.37 
 
 		 464 aa  142  9.999999999999999e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000000238189  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2295  MATE efflux family protein  26.65 
 
 		 475 aa  141  3e-32  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00026572  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1067  MATE efflux family protein  25.34 
 
 		 453 aa  140  3e-32  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000154468  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1053  MATE efflux family protein  26.67 
 
 		 462 aa  140  3.9999999999999997e-32  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  1.2115099999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0293  MATE efflux family protein  28.82 
 
 		 467 aa  140  7e-32  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1199  MATE efflux family protein  26.06 
 
 		 450 aa  138  2e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0538393  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3385  MATE efflux family protein  29.2 
 
 		 453 aa  138  2e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0591  MATE efflux family protein  27.52 
 
 		 438 aa  137  5e-31  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2888  MATE efflux family protein  28.35 
 
 		 462 aa  136  9e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0238453  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0645  MATE efflux family protein  26.35 
 
 		 462 aa  135  9.999999999999999e-31  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000346552  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0906  MATE efflux family protein  28.7 
 
 		 448 aa  136  9.999999999999999e-31  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000766798  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0931  MATE efflux family protein  28.47 
 
 		 448 aa  133  5e-30  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.102954  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1338  MATE efflux family protein  27.39 
 
 		 481 aa  132  9e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1670  MATE efflux family protein  26.73 
 
 		 466 aa  132  1.0000000000000001e-29  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1055  MATE efflux family protein  29.91 
 
 		 449 aa  131  3e-29  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000467502  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2591  MATE efflux family protein  27.43 
 
 		 525 aa  131  3e-29  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.677976  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1180  MATE efflux family protein  25.73 
 
 		 455 aa  130  6e-29  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3337  MATE efflux family protein  26.2 
 
 		 470 aa  129  1.0000000000000001e-28  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0055  MATE efflux family protein  26 
 
 		 446 aa  128  2.0000000000000002e-28  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1925  MATE efflux family protein  27.06 
 
 		 455 aa  126  6e-28  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.16171  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2343  MATE efflux family protein  26.18 
 
 		 483 aa  127  6e-28  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1371  MATE efflux family protein  25.92 
 
 		 463 aa  126  9e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3962  multi antimicrobial extrusion protein  23.43 
 
 		 492 aa  126  1e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.789789  normal  0.0338284 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3173  MATE efflux family protein  25.86 
 
 		 448 aa  125  1e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000170892  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1662  MATE efflux family protein  27.9 
 
 		 453 aa  125  2e-27  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.226136  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3762  MATE efflux family protein  26.77 
 
 		 442 aa  125  2e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000783437  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2964  MATE efflux family protein  26.06 
 
 		 453 aa  124  4e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000632854  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1166  ABC transporter releated protein  23.97 
 
 		 463 aa  122  9.999999999999999e-27  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.403976 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0991  MATE efflux family protein  25 
 
 		 475 aa  121  1.9999999999999998e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000156724  normal  0.091152 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3019  MATE efflux family protein  27.17 
 
 		 453 aa  121  1.9999999999999998e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000108454  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09280  MATE efflux family protein  26.32 
 
 		 453 aa  121  3e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000476954  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0883  MATE efflux family protein  27.07 
 
 		 451 aa  121  3e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000000230192  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0316  MATE efflux family protein  24.67 
 
 		 444 aa  121  3e-26  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000262265  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30280  putative efflux protein, MATE family  25.59 
 
 		 477 aa  120  3.9999999999999996e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.155954 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0014  MATE efflux family protein  27.63 
 
 		 453 aa  120  4.9999999999999996e-26  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.0029857  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0743  MATE efflux family protein  27.12 
 
 		 454 aa  120  6e-26  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000193663  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1454  MATE efflux family protein  27.68 
 
 		 477 aa  119  9e-26  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1058  MATE efflux family protein  28.46 
 
 		 453 aa  119  9.999999999999999e-26  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1541  MATE efflux family protein  27.64 
 
 		 486 aa  119  9.999999999999999e-26  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.127259  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1160  MATE efflux family protein  26.58 
 
 		 486 aa  118  1.9999999999999998e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3642  multi anti extrusion protein MatE  23.77 
 
 		 496 aa  118  1.9999999999999998e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.104533  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02151  multi antimicrobial extrusion family protein  26.03 
 
 		 503 aa  118  1.9999999999999998e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05890  putative efflux protein, MATE family  26.28 
 
 		 472 aa  118  1.9999999999999998e-25  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2060  MATE efflux family protein  25.06 
 
 		 456 aa  118  1.9999999999999998e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000022927  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3993  MATE efflux family protein  26.77 
 
 		 447 aa  117  3e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3419  MATE efflux family protein  28.61 
 
 		 504 aa  117  3.9999999999999997e-25  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1309  MATE efflux family protein  25 
 
 		 538 aa  117  3.9999999999999997e-25  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3395  MATE efflux family protein  24.56 
 
 		 461 aa  117  5e-25  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0784  MATE efflux family protein  26.62 
 
 		 460 aa  117  5e-25  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1353  MATE efflux family protein  27.91 
 
 		 453 aa  116  6.9999999999999995e-25  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0173  Na+-driven multidrug efflux pump  28.46 
 
 		 446 aa  116  6.9999999999999995e-25  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000291986  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0451  MATE efflux family protein  24.45 
 
 		 446 aa  115  1.0000000000000001e-24  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000226029  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0997  MATE efflux family protein  26.47 
 
 		 437 aa  115  2.0000000000000002e-24  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.207525  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4087  MATE efflux family protein  26.85 
 
 		 447 aa  115  2.0000000000000002e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1419  MATE efflux family protein  23.4 
 
 		 469 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.703884  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0877  MATE efflux family protein  25.96 
 
 		 447 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.371074  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4055  MATE efflux family protein  25.49 
 
 		 483 aa  114  3e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0254154 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4033  MATE efflux family protein  24.55 
 
 		 458 aa  114  3e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000078929 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02728  MATE efflux family protein  28.28 
 
 		 460 aa  114  5e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0324679  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1133  MATE efflux family protein  26.47 
 
 		 437 aa  113  7.000000000000001e-24  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0091  MATE efflux family protein  25.13 
 
 		 454 aa  113  9e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_16054  MOP(MATE) family transporter: multidrug efflux  24.34 
 
 		 443 aa  112  1.0000000000000001e-23  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0679405  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1387  MATE efflux family protein  25.19 
 
 		 454 aa  112  2.0000000000000002e-23  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00032817  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1171  MATE efflux family protein  27.8 
 
 		 457 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1359  multi anti extrusion protein MatE  27.25 
 
 		 408 aa  112  2.0000000000000002e-23  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0545  MATE efflux family protein  24.38 
 
 		 470 aa  112  2.0000000000000002e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0575  MATE efflux family protein  25.22 
 
 		 459 aa  112  2.0000000000000002e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000335028  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0512  Na+-driven multidrug efflux pump  27.43 
 
 		 458 aa  112  2.0000000000000002e-23  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.08405  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3692  MATE efflux family protein  23.45 
 
 		 461 aa  112  2.0000000000000002e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000025823  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2889  MATE efflux family protein  26.08 
 
 		 471 aa  111  3e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.78127  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>