More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_1371 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_1371  MATE efflux family protein  100 
 
 		 463 aa  941    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2291  MATE efflux family protein  32.38 
 
 		 460 aa  209  7e-53  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04830  MATE efflux family protein  28.28 
 
 		 468 aa  162  1e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000202645  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2964  MATE efflux family protein  26.49 
 
 		 453 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000632854  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1353  MATE efflux family protein  27.96 
 
 		 453 aa  151  2e-35  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2358  MATE efflux family protein  24.37 
 
 		 467 aa  150  5e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2492  MATE efflux family protein  25.67 
 
 		 485 aa  148  2.0000000000000003e-34  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.544481  normal  0.228664 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0707  MATE efflux family protein  26.71 
 
 		 518 aa  145  1e-33  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.376903  normal  0.476505 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2458  MATE efflux family protein  28.34 
 
 		 500 aa  145  2e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.672094  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1936  MATE efflux family protein  25.4 
 
 		 486 aa  144  3e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1461  MATE efflux family protein  28.53 
 
 		 500 aa  143  8e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0014  MATE efflux family protein  28.25 
 
 		 453 aa  142  9.999999999999999e-33  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.0029857  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1808  MATE efflux family protein  24.71 
 
 		 499 aa  142  9.999999999999999e-33  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.848054  normal  0.460632 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1662  MATE efflux family protein  26.29 
 
 		 453 aa  140  4.999999999999999e-32  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.226136  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3337  MATE efflux family protein  26.87 
 
 		 470 aa  139  1e-31  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3963  MATE efflux family protein  28.49 
 
 		 457 aa  139  1e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0920263  normal  0.56178 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4033  MATE efflux family protein  26.41 
 
 		 458 aa  139  1e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000078929 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0091  MATE efflux family protein  26.53 
 
 		 454 aa  139  2e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0645  MATE efflux family protein  26.81 
 
 		 462 aa  138  2e-31  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000346552  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0575  MATE efflux family protein  27.19 
 
 		 459 aa  137  4e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000335028  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2888  MATE efflux family protein  27.31 
 
 		 462 aa  137  6.0000000000000005e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0238453  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3948  MATE efflux family protein  26.65 
 
 		 458 aa  136  9.999999999999999e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02728  MATE efflux family protein  25.16 
 
 		 460 aa  135  1.9999999999999998e-30  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0324679  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1166  ABC transporter releated protein  26.96 
 
 		 463 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.403976 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3677  MATE efflux family protein  24.48 
 
 		 500 aa  134  3.9999999999999996e-30  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.380257  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1071  MATE efflux family protein  26.97 
 
 		 475 aa  133  6e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0762  MATE efflux family protein  28.38 
 
 		 458 aa  133  7.999999999999999e-30  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1579  MATE efflux family protein  26.17 
 
 		 445 aa  132  9e-30  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1895  MATE efflux family protein  26.45 
 
 		 498 aa  131  3e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0743  MATE efflux family protein  26.68 
 
 		 454 aa  130  5.0000000000000004e-29  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000193663  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0485  hypothetical protein  28.37 
 
 		 454 aa  130  6e-29  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0273971  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0147  MATE efflux family protein  25.68 
 
 		 462 aa  129  9.000000000000001e-29  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000317216  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1851  MATE efflux family protein  25.19 
 
 		 475 aa  129  9.000000000000001e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00783953  normal  0.201536 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1597  MATE efflux family protein  25 
 
 		 460 aa  128  3e-28  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  3.36267e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2653  MATE efflux family protein  24.38 
 
 		 484 aa  127  5e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1925  MATE efflux family protein  27.16 
 
 		 455 aa  127  6e-28  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.16171  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3395  MATE efflux family protein  24.69 
 
 		 461 aa  126  6e-28  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0545  MATE efflux family protein  25.33 
 
 		 470 aa  126  7e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1529  MATE efflux family protein  24.77 
 
 		 554 aa  126  8.000000000000001e-28  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.130898  normal  0.344827 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1654  MATE efflux family protein  27.64 
 
 		 473 aa  126  1e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0381  MATE efflux family protein  26.92 
 
 		 451 aa  125  2e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00954667  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2306  MATE efflux family protein  25.32 
 
 		 469 aa  124  5e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.30452  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1711  MATE efflux family protein  25.49 
 
 		 463 aa  123  6e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0339316  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3175  MATE efflux family protein  25.51 
 
 		 468 aa  122  9.999999999999999e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.386097  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1160  MATE efflux family protein  27.23 
 
 		 486 aa  122  9.999999999999999e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6251  MATE efflux family protein  23.51 
 
 		 461 aa  122  9.999999999999999e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05190  MATE efflux family protein  26.39 
 
 		 454 aa  122  9.999999999999999e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.969197  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0747  MATE efflux family protein  23.99 
 
 		 490 aa  121  1.9999999999999998e-26  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2060  MATE efflux family protein  25.62 
 
 		 456 aa  122  1.9999999999999998e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000022927  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1338  MATE efflux family protein  24.22 
 
 		 481 aa  121  1.9999999999999998e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0991  MATE efflux family protein  25.4 
 
 		 475 aa  121  3e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000156724  normal  0.091152 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1858  MATE efflux family protein  27.39 
 
 		 467 aa  120  3.9999999999999996e-26  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0434953  normal  0.402686 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2612  MATE efflux family protein  26.07 
 
 		 459 aa  120  3.9999999999999996e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2544  MATE efflux family protein  23.97 
 
 		 455 aa  120  4.9999999999999996e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0012  MATE efflux family protein  26.97 
 
 		 477 aa  120  4.9999999999999996e-26  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00000348389  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2591  MATE efflux family protein  26.92 
 
 		 525 aa  119  7.999999999999999e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.677976  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1309  MATE efflux family protein  25.24 
 
 		 538 aa  119  9e-26  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2508  multi anti extrusion protein MatE  25.41 
 
 		 463 aa  119  9.999999999999999e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2859  MATE efflux family protein  23.75 
 
 		 455 aa  119  9.999999999999999e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3385  MATE efflux family protein  25.26 
 
 		 453 aa  119  9.999999999999999e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1058  MATE efflux family protein  23.95 
 
 		 453 aa  118  1.9999999999999998e-25  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0784  MATE efflux family protein  25.61 
 
 		 460 aa  116  6.9999999999999995e-25  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0997  MATE efflux family protein  26.85 
 
 		 437 aa  116  6.9999999999999995e-25  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.207525  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0877  MATE efflux family protein  26.46 
 
 		 447 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.371074  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1953  MATE efflux family protein  26.73 
 
 		 454 aa  116  1.0000000000000001e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0404  MATE efflux family protein  27.66 
 
 		 457 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.294226 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1509  MATE efflux family protein  25.98 
 
 		 460 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.712333  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0591  MATE efflux family protein  21.94 
 
 		 438 aa  114  3e-24  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03665  C-5 cytosine-specific DNA methylase:Multi antimicrobial extrusion (MatE) protein  25.5 
 
 		 455 aa  114  3e-24  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3884  MATE efflux family protein  25.84 
 
 		 521 aa  114  3e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0293  MATE efflux family protein  25.5 
 
 		 467 aa  114  4.0000000000000004e-24  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09280  MATE efflux family protein  23.93 
 
 		 453 aa  114  4.0000000000000004e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000476954  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02151  multi antimicrobial extrusion family protein  29.87 
 
 		 503 aa  114  4.0000000000000004e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2827  MATE efflux family protein  25.12 
 
 		 451 aa  113  8.000000000000001e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.658448  normal  0.32606 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1133  MATE efflux family protein  26.6 
 
 		 437 aa  113  8.000000000000001e-24  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1641  MATE efflux family protein  22.63 
 
 		 469 aa  112  2.0000000000000002e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.725642  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2636  integral membrane protein  26.46 
 
 		 478 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.117345 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1067  MATE efflux family protein  24.04 
 
 		 453 aa  111  2.0000000000000002e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000154468  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0022  MATE efflux family protein  27.58 
 
 		 524 aa  111  3e-23  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00967763  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0255  MATE efflux family protein  25.67 
 
 		 448 aa  110  4.0000000000000004e-23  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.392054  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3207  putative transmembrane efflux protein  24.48 
 
 		 467 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00227095 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1419  MATE efflux family protein  22.33 
 
 		 469 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.703884  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3557  putative MATE efflux protein  22.4 
 
 		 469 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.43043  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2841  MATE efflux family protein  24.65 
 
 		 468 aa  110  5e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000678206  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1621  Na+ driven multidrug efflux pump  22.17 
 
 		 469 aa  109  1e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1591  Na+ driven multidrug efflux pump  22.17 
 
 		 469 aa  109  1e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.742873  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3642  multi anti extrusion protein MatE  23.27 
 
 		 496 aa  109  1e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.104533  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0308  MATE efflux family protein  24.22 
 
 		 441 aa  109  1e-22  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.426716  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1823  putative MATE efflux protein  22.17 
 
 		 469 aa  109  1e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1899  putative MATE efflux protein  22.73 
 
 		 469 aa  109  1e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00227155  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1787  putative MATE efflux protein  22.17 
 
 		 469 aa  109  1e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1180  MATE efflux family protein  26.15 
 
 		 455 aa  109  1e-22  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05514  hypothetical protein  27.54 
 
 		 482 aa  108  2e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.957983  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1846  integral membrane protein, putative  22.73 
 
 		 469 aa  108  2e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.563684  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3059  MATE efflux family protein  22.43 
 
 		 469 aa  108  2e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.231532  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3492  integral membrane protein  24.5 
 
 		 485 aa  108  2e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0396785  normal  0.244149 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3296  MATE efflux family protein  22.43 
 
 		 469 aa  108  2e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.660304  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1166  MATE efflux family protein  25.25 
 
 		 460 aa  108  2e-22  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0006  MATE efflux family protein  23.95 
 
 		 442 aa  108  3e-22  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0243937 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0835  MATE efflux family protein  23.81 
 
 		 438 aa  108  3e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>