More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_3884 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008752  Aave_3884  MATE efflux family protein  100 
 
 
521 aa  1009    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1160  MATE efflux family protein  65.9 
 
 
486 aa  576  1.0000000000000001e-163  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02151  multi antimicrobial extrusion family protein  62.02 
 
 
503 aa  534  1e-150  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3962  multi antimicrobial extrusion protein  53.85 
 
 
492 aa  486  1e-136  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.789789  normal  0.0338284 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3642  multi anti extrusion protein MatE  53.01 
 
 
496 aa  475  1e-133  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.104533  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0022  MATE efflux family protein  46.64 
 
 
524 aa  386  1e-106  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00967763  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1044  MATE efflux family protein  47.75 
 
 
494 aa  386  1e-106  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0031  MATE efflux family protein  46.54 
 
 
503 aa  388  1e-106  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05514  hypothetical protein  49.46 
 
 
482 aa  384  1e-105  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.957983  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1091  MATE efflux family protein  46.74 
 
 
465 aa  381  1e-104  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.719825  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2639  MATE efflux family protein  45.25 
 
 
481 aa  302  1e-80  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1419  MATE efflux family protein  33.98 
 
 
469 aa  293  5e-78  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.703884  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3557  putative MATE efflux protein  32.98 
 
 
469 aa  286  5e-76  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.43043  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1787  putative MATE efflux protein  32.98 
 
 
469 aa  286  7e-76  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1899  putative MATE efflux protein  32.76 
 
 
469 aa  284  3.0000000000000004e-75  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00227155  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1621  Na+ driven multidrug efflux pump  32.55 
 
 
469 aa  283  5.000000000000001e-75  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1591  Na+ driven multidrug efflux pump  32.55 
 
 
469 aa  283  5.000000000000001e-75  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.742873  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1823  putative MATE efflux protein  32.55 
 
 
469 aa  283  5.000000000000001e-75  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1641  MATE efflux family protein  31.91 
 
 
469 aa  282  1e-74  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.725642  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1846  integral membrane protein, putative  32.33 
 
 
469 aa  281  2e-74  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.563684  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1839  MATE efflux family protein  34.26 
 
 
480 aa  274  3e-72  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3059  MATE efflux family protein  31.77 
 
 
469 aa  270  4e-71  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.231532  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3296  MATE efflux family protein  31.77 
 
 
469 aa  270  4e-71  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.660304  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03157  hypothetical protein  38.66 
 
 
455 aa  266  5e-70  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.367645 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2862  MATE efflux family protein  32.62 
 
 
469 aa  263  4.999999999999999e-69  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.83664  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3177  MATE efflux family protein  32.2 
 
 
469 aa  261  2e-68  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.186099  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3541  multi anti extrusion protein MatE  34.44 
 
 
491 aa  258  1e-67  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.325016 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4281  MATE efflux family protein  38.15 
 
 
455 aa  257  4e-67  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.711709 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4169  MATE efflux family protein  38.15 
 
 
455 aa  257  4e-67  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1159  MATE efflux family protein  32.83 
 
 
478 aa  256  6e-67  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.666411  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2347  MATE efflux family protein  35.65 
 
 
476 aa  252  9.000000000000001e-66  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2889  MATE efflux family protein  34.77 
 
 
471 aa  240  5.999999999999999e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.78127  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0316  putative multi anti extrusion protein (MatE)  34.26 
 
 
436 aa  209  1e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.915712 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0931  MATE efflux family protein  31.54 
 
 
448 aa  207  5e-52  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.102954  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2869  MATE efflux family protein  32.96 
 
 
472 aa  205  2e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0768419  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0162  multi anti extrusion protein MatE  32.44 
 
 
449 aa  203  5e-51  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0187  MATE efflux family protein  32.21 
 
 
449 aa  200  6e-50  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1972  putative multi anti extrusion protein (MatE)  33.79 
 
 
458 aa  197  3e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.84525  normal  0.887527 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2492  MATE efflux family protein  30.06 
 
 
485 aa  186  1.0000000000000001e-45  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.544481  normal  0.228664 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1936  MATE efflux family protein  31.76 
 
 
486 aa  185  2.0000000000000003e-45  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05190  MATE efflux family protein  29.41 
 
 
454 aa  185  2.0000000000000003e-45  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.969197  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1597  MATE efflux family protein  26.29 
 
 
460 aa  182  2e-44  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  3.36267e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0747  MATE efflux family protein  30.61 
 
 
490 aa  173  6.999999999999999e-42  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0707  MATE efflux family protein  27.25 
 
 
518 aa  165  2.0000000000000002e-39  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.376903  normal  0.476505 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1058  MATE efflux family protein  27.05 
 
 
453 aa  163  8.000000000000001e-39  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3337  MATE efflux family protein  30.95 
 
 
470 aa  162  1e-38  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1808  MATE efflux family protein  29.09 
 
 
499 aa  161  3e-38  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.848054  normal  0.460632 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1810  MATE efflux family protein  26.59 
 
 
446 aa  161  3e-38  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.108169  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3173  MATE efflux family protein  25.65 
 
 
448 aa  158  2e-37  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000170892  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1461  MATE efflux family protein  30.54 
 
 
500 aa  157  6e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1895  MATE efflux family protein  27.56 
 
 
498 aa  156  7e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1309  MATE efflux family protein  27.59 
 
 
538 aa  156  9e-37  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30280  putative efflux protein, MATE family  31.06 
 
 
477 aa  155  1e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.155954 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1641  Na+ driven multidrug antiporter, N-terminus  33.04 
 
 
238 aa  152  1e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.908649  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3762  MATE efflux family protein  30.25 
 
 
442 aa  152  1e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000783437  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0451  MATE efflux family protein  27.44 
 
 
446 aa  152  1e-35  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000226029  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3276  MATE efflux family protein  27.29 
 
 
457 aa  149  8e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000381455  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2458  MATE efflux family protein  26.83 
 
 
500 aa  147  4.0000000000000006e-34  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.672094  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2358  MATE efflux family protein  27.04 
 
 
467 aa  147  4.0000000000000006e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1579  MATE efflux family protein  28.76 
 
 
445 aa  144  4e-33  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3385  MATE efflux family protein  25.59 
 
 
453 aa  144  5e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2439  MATE efflux family protein  28.1 
 
 
485 aa  141  3e-32  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.739641  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04830  MATE efflux family protein  25.61 
 
 
468 aa  140  4.999999999999999e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000202645  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3677  MATE efflux family protein  27.22 
 
 
500 aa  140  7.999999999999999e-32  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.380257  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0113  MATE efflux family protein  26.11 
 
 
464 aa  138  3.0000000000000003e-31  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1529  MATE efflux family protein  28.66 
 
 
554 aa  138  3.0000000000000003e-31  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.130898  normal  0.344827 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0111  MATE efflux family protein  26.05 
 
 
464 aa  138  3.0000000000000003e-31  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5035  MATE efflux family protein  28.69 
 
 
469 aa  137  4e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.88746  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2591  MATE efflux family protein  28.36 
 
 
525 aa  135  1.9999999999999998e-30  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.677976  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1318  MATE efflux family protein  23.16 
 
 
443 aa  135  1.9999999999999998e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000101978  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6251  MATE efflux family protein  25.16 
 
 
461 aa  135  1.9999999999999998e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0465  MATE efflux family protein  30.34 
 
 
500 aa  134  3e-30  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2291  MATE efflux family protein  31.08 
 
 
460 aa  135  3e-30  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1338  MATE efflux family protein  29.71 
 
 
481 aa  134  3e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0545  MATE efflux family protein  25.33 
 
 
470 aa  133  6e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1642  Na+ driven multidrug antiporter, C-terminus  31.54 
 
 
270 aa  134  6e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0147  MATE efflux family protein  22.81 
 
 
462 aa  133  6.999999999999999e-30  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000317216  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2841  MATE efflux family protein  24.83 
 
 
468 aa  132  2.0000000000000002e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000678206  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1055  MATE efflux family protein  28.14 
 
 
449 aa  131  3e-29  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000467502  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0762  MATE efflux family protein  25.22 
 
 
458 aa  129  1.0000000000000001e-28  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3019  MATE efflux family protein  29.15 
 
 
453 aa  129  1.0000000000000001e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000108454  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1166  ABC transporter releated protein  24.42 
 
 
463 aa  129  2.0000000000000002e-28  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.403976 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3371  MATE efflux family protein  30.66 
 
 
494 aa  127  4.0000000000000003e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000918656 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0086  MATE efflux family protein  27.08 
 
 
522 aa  127  5e-28  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1353  MATE efflux family protein  24.09 
 
 
453 aa  126  8.000000000000001e-28  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1180  MATE efflux family protein  23.65 
 
 
455 aa  125  2e-27  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1071  MATE efflux family protein  24.25 
 
 
475 aa  121  3e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3692  MATE efflux family protein  25.82 
 
 
461 aa  121  3.9999999999999996e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000025823  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1454  MATE efflux family protein  23.55 
 
 
477 aa  120  4.9999999999999996e-26  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0173  Na+-driven multidrug efflux pump  26.67 
 
 
446 aa  120  7e-26  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000291986  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0645  MATE efflux family protein  22.46 
 
 
462 aa  118  1.9999999999999998e-25  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000346552  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4055  MATE efflux family protein  28.44 
 
 
483 aa  117  5e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0254154 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0906  MATE efflux family protein  22.22 
 
 
448 aa  115  2.0000000000000002e-24  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000766798  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1711  MATE efflux family protein  24.51 
 
 
463 aa  114  3e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0339316  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0512  Na+-driven multidrug efflux pump  27.41 
 
 
458 aa  114  3e-24  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.08405  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0883  MATE efflux family protein  24.07 
 
 
451 aa  114  3e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000000230192  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0485  hypothetical protein  23.28 
 
 
454 aa  114  5e-24  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0273971  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1371  MATE efflux family protein  25.84 
 
 
463 aa  113  8.000000000000001e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1842  MATE efflux family protein  27.8 
 
 
442 aa  113  9e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000407528  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2653  MATE efflux family protein  29 
 
 
484 aa  113  1.0000000000000001e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>