More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_1091 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_1091  MATE efflux family protein  100 
 
 		 465 aa  909    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.719825  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3642  multi anti extrusion protein MatE  49.12 
 
 		 496 aa  427  1e-118  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.104533  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0022  MATE efflux family protein  48.6 
 
 		 524 aa  420  1e-116  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00967763  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3962  multi antimicrobial extrusion protein  47.58 
 
 		 492 aa  416  9.999999999999999e-116  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.789789  normal  0.0338284 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1044  MATE efflux family protein  50.9 
 
 		 494 aa  412  1e-114  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0031  MATE efflux family protein  47.69 
 
 		 503 aa  407  1.0000000000000001e-112  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3884  MATE efflux family protein  46.74 
 
 		 521 aa  387  1e-106  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1160  MATE efflux family protein  44.59 
 
 		 486 aa  361  2e-98  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02151  multi antimicrobial extrusion family protein  44.3 
 
 		 503 aa  346  5e-94  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2639  MATE efflux family protein  49.57 
 
 		 481 aa  343  5e-93  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05514  hypothetical protein  40.05 
 
 		 482 aa  304  2.0000000000000002e-81  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.957983  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3541  multi anti extrusion protein MatE  35.48 
 
 		 491 aa  216  9e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.325016 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1419  MATE efflux family protein  30.46 
 
 		 469 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.703884  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1641  MATE efflux family protein  29.8 
 
 		 469 aa  214  2.9999999999999995e-54  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.725642  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3557  putative MATE efflux protein  30.24 
 
 		 469 aa  213  3.9999999999999995e-54  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.43043  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1787  putative MATE efflux protein  30.24 
 
 		 469 aa  211  2e-53  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1846  integral membrane protein, putative  29.58 
 
 		 469 aa  210  5e-53  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.563684  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1899  putative MATE efflux protein  29.58 
 
 		 469 aa  210  5e-53  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00227155  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1621  Na+ driven multidrug efflux pump  29.58 
 
 		 469 aa  209  7e-53  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1591  Na+ driven multidrug efflux pump  29.58 
 
 		 469 aa  209  7e-53  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.742873  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1823  putative MATE efflux protein  29.58 
 
 		 469 aa  209  7e-53  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1839  MATE efflux family protein  29.52 
 
 		 480 aa  207  4e-52  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2889  MATE efflux family protein  31.84 
 
 		 471 aa  204  2e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.78127  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1159  MATE efflux family protein  30.91 
 
 		 478 aa  201  3e-50  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.666411  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3059  MATE efflux family protein  29.52 
 
 		 469 aa  198  2.0000000000000003e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.231532  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3296  MATE efflux family protein  29.52 
 
 		 469 aa  198  2.0000000000000003e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.660304  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2862  MATE efflux family protein  29.71 
 
 		 469 aa  196  9e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.83664  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3177  MATE efflux family protein  29.75 
 
 		 469 aa  193  5e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.186099  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03157  hypothetical protein  31.07 
 
 		 455 aa  182  8.000000000000001e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.367645 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4169  MATE efflux family protein  29.63 
 
 		 455 aa  177  4e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4281  MATE efflux family protein  29.63 
 
 		 455 aa  177  4e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.711709 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2347  MATE efflux family protein  29.71 
 
 		 476 aa  169  8e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2492  MATE efflux family protein  27.91 
 
 		 485 aa  169  1e-40  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.544481  normal  0.228664 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1936  MATE efflux family protein  31.59 
 
 		 486 aa  169  1e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1972  putative multi anti extrusion protein (MatE)  31.62 
 
 		 458 aa  169  1e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.84525  normal  0.887527 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0316  putative multi anti extrusion protein (MatE)  30.11 
 
 		 436 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.915712 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0187  MATE efflux family protein  30.24 
 
 		 449 aa  165  1.0000000000000001e-39  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2869  MATE efflux family protein  31.33 
 
 		 472 aa  166  1.0000000000000001e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0768419  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0931  MATE efflux family protein  27.41 
 
 		 448 aa  157  4e-37  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.102954  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0162  multi anti extrusion protein MatE  29.82 
 
 		 449 aa  157  5.0000000000000005e-37  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0747  MATE efflux family protein  29.56 
 
 		 490 aa  156  1e-36  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2458  MATE efflux family protein  28.63 
 
 		 500 aa  153  5.9999999999999996e-36  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.672094  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1597  MATE efflux family protein  24.74 
 
 		 460 aa  148  2.0000000000000003e-34  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  3.36267e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3173  MATE efflux family protein  25.49 
 
 		 448 aa  145  1e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000170892  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3677  MATE efflux family protein  27.78 
 
 		 500 aa  145  1e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.380257  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1461  MATE efflux family protein  26.16 
 
 		 500 aa  143  8e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1808  MATE efflux family protein  27.87 
 
 		 499 aa  142  9.999999999999999e-33  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.848054  normal  0.460632 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05190  MATE efflux family protein  26.13 
 
 		 454 aa  141  3e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.969197  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0707  MATE efflux family protein  28.03 
 
 		 518 aa  139  1e-31  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.376903  normal  0.476505 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3762  MATE efflux family protein  27.51 
 
 		 442 aa  139  2e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000783437  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3337  MATE efflux family protein  30.54 
 
 		 470 aa  136  8e-31  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0451  MATE efflux family protein  24.72 
 
 		 446 aa  133  6.999999999999999e-30  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000226029  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1338  MATE efflux family protein  27.64 
 
 		 481 aa  132  1.0000000000000001e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1058  MATE efflux family protein  25.28 
 
 		 453 aa  132  1.0000000000000001e-29  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1810  MATE efflux family protein  26.11 
 
 		 446 aa  131  2.0000000000000002e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.108169  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30280  putative efflux protein, MATE family  28.17 
 
 		 477 aa  131  2.0000000000000002e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.155954 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0147  MATE efflux family protein  25.27 
 
 		 462 aa  130  5.0000000000000004e-29  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000317216  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1180  MATE efflux family protein  26.52 
 
 		 455 aa  128  2.0000000000000002e-28  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2591  MATE efflux family protein  26.79 
 
 		 525 aa  127  3e-28  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.677976  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3276  MATE efflux family protein  23.9 
 
 		 457 aa  127  4.0000000000000003e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000381455  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1895  MATE efflux family protein  26.05 
 
 		 498 aa  127  5e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1166  ABC transporter releated protein  25.43 
 
 		 463 aa  127  5e-28  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.403976 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1318  MATE efflux family protein  24.34 
 
 		 443 aa  125  1e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000101978  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3385  MATE efflux family protein  25.53 
 
 		 453 aa  124  3e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0883  MATE efflux family protein  27.17 
 
 		 451 aa  124  5e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000000230192  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0545  MATE efflux family protein  24.13 
 
 		 470 aa  122  9.999999999999999e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0217  MATE efflux family protein  24.89 
 
 		 445 aa  122  1.9999999999999998e-26  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000958822  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1309  MATE efflux family protein  26.79 
 
 		 538 aa  122  1.9999999999999998e-26  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2439  MATE efflux family protein  24.95 
 
 		 485 aa  122  1.9999999999999998e-26  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.739641  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04830  MATE efflux family protein  25.87 
 
 		 468 aa  122  1.9999999999999998e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000202645  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1579  MATE efflux family protein  25.93 
 
 		 445 aa  121  3e-26  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6251  MATE efflux family protein  25.71 
 
 		 461 aa  120  4.9999999999999996e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1529  MATE efflux family protein  25.39 
 
 		 554 aa  118  1.9999999999999998e-25  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.130898  normal  0.344827 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18080  putative efflux protein, MATE family  28.85 
 
 		 468 aa  117  3.9999999999999997e-25  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.98273 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2841  MATE efflux family protein  24.67 
 
 		 468 aa  117  5e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000678206  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0465  MATE efflux family protein  27.82 
 
 		 500 aa  116  1.0000000000000001e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1055  MATE efflux family protein  27.23 
 
 		 449 aa  115  1.0000000000000001e-24  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000467502  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1642  Na+ driven multidrug antiporter, C-terminus  30.08 
 
 		 270 aa  114  3e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0762  MATE efflux family protein  25.76 
 
 		 458 aa  113  7.000000000000001e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0906  MATE efflux family protein  22.96 
 
 		 448 aa  112  1.0000000000000001e-23  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000766798  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1711  MATE efflux family protein  24.57 
 
 		 463 aa  110  5e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0339316  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3692  MATE efflux family protein  23.91 
 
 		 461 aa  106  7e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000025823  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1071  MATE efflux family protein  22.49 
 
 		 475 aa  105  1e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0645  MATE efflux family protein  22.01 
 
 		 462 aa  106  1e-21  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000346552  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2653  MATE efflux family protein  25 
 
 		 484 aa  105  2e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1454  MATE efflux family protein  22.27 
 
 		 477 aa  103  7e-21  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3019  MATE efflux family protein  28.04 
 
 		 453 aa  102  1e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000108454  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2291  MATE efflux family protein  26.13 
 
 		 460 aa  102  2e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4055  MATE efflux family protein  27.58 
 
 		 483 aa  102  2e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0254154 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3120  MATE efflux family protein  22.27 
 
 		 461 aa  102  2e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.369114  normal  0.932515 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2295  MATE efflux family protein  23.03 
 
 		 475 aa  100  4e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00026572  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0381  MATE efflux family protein  24.08 
 
 		 451 aa  100  4e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00954667  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2508  multi anti extrusion protein MatE  26.84 
 
 		 463 aa  100  5e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0014  MATE efflux family protein  24.42 
 
 		 453 aa  100  7e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.0029857  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1641  Na+ driven multidrug antiporter, N-terminus  29.68 
 
 		 238 aa  99.8  9e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.908649  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2736  MATE efflux family protein  29.53 
 
 		 452 aa  97.4  5e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2766  MATE efflux family protein  23.3 
 
 		 453 aa  97.4  5e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0984562  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2358  MATE efflux family protein  21.51 
 
 		 467 aa  96.7  7e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2888  MATE efflux family protein  26.73 
 
 		 462 aa  95.9  1e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0238453  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1851  MATE efflux family protein  23.5 
 
 		 475 aa  95.9  1e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00783953  normal  0.201536 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>