More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_0316 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_0316  putative multi anti extrusion protein (MatE)  100 
 
 		 436 aa  849    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.915712 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0162  multi anti extrusion protein MatE  65.22 
 
 		 449 aa  519  1e-146  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0187  MATE efflux family protein  65.6 
 
 		 449 aa  511  1e-144  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2889  MATE efflux family protein  61.24 
 
 		 471 aa  485  1e-136  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.78127  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4281  MATE efflux family protein  56.36 
 
 		 455 aa  443  1e-123  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.711709 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4169  MATE efflux family protein  56.36 
 
 		 455 aa  443  1e-123  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3541  multi anti extrusion protein MatE  51.49 
 
 		 491 aa  441  1e-123  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.325016 
 
 
-
 
NC_003296  RS03157  hypothetical protein  55.68 
 
 		 455 aa  441  9.999999999999999e-123  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.367645 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2869  MATE efflux family protein  51.03 
 
 		 472 aa  413  1e-114  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0768419  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3557  putative MATE efflux protein  47.15 
 
 		 469 aa  395  1e-109  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.43043  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1846  integral membrane protein, putative  47.15 
 
 		 469 aa  392  1e-108  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.563684  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1621  Na+ driven multidrug efflux pump  47.15 
 
 		 469 aa  393  1e-108  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1823  putative MATE efflux protein  47.15 
 
 		 469 aa  393  1e-108  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1591  Na+ driven multidrug efflux pump  47.15 
 
 		 469 aa  393  1e-108  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.742873  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1787  putative MATE efflux protein  46.92 
 
 		 469 aa  392  1e-108  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1899  putative MATE efflux protein  47.15 
 
 		 469 aa  392  1e-108  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00227155  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1641  MATE efflux family protein  46.7 
 
 		 469 aa  394  1e-108  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.725642  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1419  MATE efflux family protein  46.47 
 
 		 469 aa  385  1e-106  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.703884  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3059  MATE efflux family protein  46.01 
 
 		 469 aa  381  1e-104  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.231532  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3296  MATE efflux family protein  46.01 
 
 		 469 aa  381  1e-104  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.660304  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1159  MATE efflux family protein  46.7 
 
 		 478 aa  376  1e-103  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.666411  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3177  MATE efflux family protein  46.47 
 
 		 469 aa  373  1e-102  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.186099  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2862  MATE efflux family protein  46.24 
 
 		 469 aa  371  1e-101  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.83664  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1839  MATE efflux family protein  45.1 
 
 		 480 aa  355  8.999999999999999e-97  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2347  MATE efflux family protein  44.98 
 
 		 476 aa  342  8e-93  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1972  putative multi anti extrusion protein (MatE)  42.2 
 
 		 458 aa  302  6.000000000000001e-81  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.84525  normal  0.887527 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3642  multi anti extrusion protein MatE  37.24 
 
 		 496 aa  256  7e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.104533  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05514  hypothetical protein  36.1 
 
 		 482 aa  244  1.9999999999999999e-63  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.957983  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3962  multi antimicrobial extrusion protein  36.78 
 
 		 492 aa  241  2.9999999999999997e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.789789  normal  0.0338284 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1160  MATE efflux family protein  35.17 
 
 		 486 aa  240  4e-62  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02151  multi antimicrobial extrusion family protein  36.34 
 
 		 503 aa  231  2e-59  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3884  MATE efflux family protein  34.26 
 
 		 521 aa  226  8e-58  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0031  MATE efflux family protein  34.71 
 
 		 503 aa  224  2e-57  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0022  MATE efflux family protein  34.03 
 
 		 524 aa  218  2e-55  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00967763  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1044  MATE efflux family protein  34.1 
 
 		 494 aa  213  5.999999999999999e-54  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1642  Na+ driven multidrug antiporter, C-terminus  45.9 
 
 		 270 aa  212  9e-54  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2639  MATE efflux family protein  36.32 
 
 		 481 aa  191  2.9999999999999997e-47  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1641  Na+ driven multidrug antiporter, N-terminus  47.55 
 
 		 238 aa  189  1e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.908649  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0931  MATE efflux family protein  30 
 
 		 448 aa  186  6e-46  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.102954  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1597  MATE efflux family protein  27.87 
 
 		 460 aa  182  7e-45  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  3.36267e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1936  MATE efflux family protein  31.44 
 
 		 486 aa  182  1e-44  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0147  MATE efflux family protein  28.21 
 
 		 462 aa  171  2e-41  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000317216  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1091  MATE efflux family protein  30.57 
 
 		 465 aa  169  7e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.719825  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1058  MATE efflux family protein  27.17 
 
 		 453 aa  154  2.9999999999999998e-36  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0707  MATE efflux family protein  27.27 
 
 		 518 aa  150  3e-35  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.376903  normal  0.476505 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0906  MATE efflux family protein  25 
 
 		 448 aa  149  8e-35  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000766798  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1895  MATE efflux family protein  26.74 
 
 		 498 aa  146  9e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1180  MATE efflux family protein  25.87 
 
 		 455 aa  145  2e-33  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05190  MATE efflux family protein  29.06 
 
 		 454 aa  144  3e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.969197  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1808  MATE efflux family protein  26.42 
 
 		 499 aa  143  8e-33  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.848054  normal  0.460632 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2492  MATE efflux family protein  27.13 
 
 		 485 aa  142  9.999999999999999e-33  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.544481  normal  0.228664 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1454  MATE efflux family protein  27.68 
 
 		 477 aa  139  7e-32  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0747  MATE efflux family protein  26.48 
 
 		 490 aa  139  1e-31  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3276  MATE efflux family protein  25.68 
 
 		 457 aa  138  2e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000381455  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04830  MATE efflux family protein  26.78 
 
 		 468 aa  137  5e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000202645  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3762  MATE efflux family protein  30.52 
 
 		 442 aa  134  1.9999999999999998e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000783437  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1055  MATE efflux family protein  27.33 
 
 		 449 aa  131  3e-29  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000467502  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0883  MATE efflux family protein  28.36 
 
 		 451 aa  130  4.0000000000000003e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000000230192  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30280  putative efflux protein, MATE family  31.49 
 
 		 477 aa  130  4.0000000000000003e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.155954 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2458  MATE efflux family protein  25.73 
 
 		 500 aa  129  1.0000000000000001e-28  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.672094  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3677  MATE efflux family protein  26.61 
 
 		 500 aa  127  3e-28  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.380257  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1318  MATE efflux family protein  26.04 
 
 		 443 aa  127  4.0000000000000003e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000101978  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0217  MATE efflux family protein  26.54 
 
 		 445 aa  127  5e-28  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000958822  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3337  MATE efflux family protein  28.21 
 
 		 470 aa  126  6e-28  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2237  MATE efflux family protein  25.62 
 
 		 469 aa  125  1e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000615121  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3019  MATE efflux family protein  27.73 
 
 		 453 aa  125  2e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000108454  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1461  MATE efflux family protein  27.03 
 
 		 500 aa  124  2e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3173  MATE efflux family protein  25.47 
 
 		 448 aa  125  2e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000170892  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1810  MATE efflux family protein  25.71 
 
 		 446 aa  122  9.999999999999999e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.108169  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4033  MATE efflux family protein  27.17 
 
 		 458 aa  122  1.9999999999999998e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000078929 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2060  MATE efflux family protein  23.84 
 
 		 456 aa  120  4.9999999999999996e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000022927  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3692  MATE efflux family protein  25.77 
 
 		 461 aa  119  7e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000025823  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1529  MATE efflux family protein  25.42 
 
 		 554 aa  119  9.999999999999999e-26  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.130898  normal  0.344827 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1309  MATE efflux family protein  25.37 
 
 		 538 aa  119  9.999999999999999e-26  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0762  MATE efflux family protein  25.23 
 
 		 458 aa  119  1.9999999999999998e-25  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3948  MATE efflux family protein  26.3 
 
 		 458 aa  117  3e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0173  Na+-driven multidrug efflux pump  29.14 
 
 		 446 aa  117  6e-25  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000291986  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2358  MATE efflux family protein  25.75 
 
 		 467 aa  115  1.0000000000000001e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0645  MATE efflux family protein  21.43 
 
 		 462 aa  115  1.0000000000000001e-24  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000346552  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0381  MATE efflux family protein  24.2 
 
 		 451 aa  115  2.0000000000000002e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00954667  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0451  MATE efflux family protein  24.71 
 
 		 446 aa  115  2.0000000000000002e-24  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000226029  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0086  MATE efflux family protein  32.28 
 
 		 522 aa  114  4.0000000000000004e-24  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3385  MATE efflux family protein  29.3 
 
 		 453 aa  112  1.0000000000000001e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2591  MATE efflux family protein  28.37 
 
 		 525 aa  110  5e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.677976  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2243  MATE efflux family protein  27.85 
 
 		 468 aa  110  6e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2439  MATE efflux family protein  24.72 
 
 		 485 aa  108  1e-22  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.739641  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0485  hypothetical protein  21.66 
 
 		 454 aa  107  3e-22  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0273971  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2291  MATE efflux family protein  24.42 
 
 		 460 aa  108  3e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2964  MATE efflux family protein  27.53 
 
 		 453 aa  106  7e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000632854  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0702  MATE efflux family protein  26.92 
 
 		 452 aa  105  1e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4055  MATE efflux family protein  28.31 
 
 		 483 aa  104  3e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0254154 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0111  MATE efflux family protein  22.81 
 
 		 464 aa  104  3e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0113  MATE efflux family protein  22.81 
 
 		 464 aa  104  3e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6251  MATE efflux family protein  23.24 
 
 		 461 aa  103  4e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0465  MATE efflux family protein  30.37 
 
 		 500 aa  103  5e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1166  ABC transporter releated protein  24.06 
 
 		 463 aa  103  6e-21  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.403976 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1579  MATE efflux family protein  24.04 
 
 		 445 aa  102  1e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1071  MATE efflux family protein  21.13 
 
 		 475 aa  101  3e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0575  MATE efflux family protein  23.42 
 
 		 459 aa  101  3e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000335028  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2295  MATE efflux family protein  25.3 
 
 		 475 aa  100  5e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00026572  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>