More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_2869 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_2869  MATE efflux family protein  100 
 
 		 472 aa  907    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0768419  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2889  MATE efflux family protein  61.67 
 
 		 471 aa  543  1e-153  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.78127  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0162  multi anti extrusion protein MatE  53.81 
 
 		 449 aa  446  1.0000000000000001e-124  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3541  multi anti extrusion protein MatE  52.24 
 
 		 491 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.325016 
 
 
-
 
NC_003296  RS03157  hypothetical protein  53.85 
 
 		 455 aa  443  1e-123  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.367645 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4281  MATE efflux family protein  53.33 
 
 		 455 aa  444  1e-123  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.711709 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4169  MATE efflux family protein  53.33 
 
 		 455 aa  444  1e-123  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0187  MATE efflux family protein  53.36 
 
 		 449 aa  429  1e-119  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0316  putative multi anti extrusion protein (MatE)  51.03 
 
 		 436 aa  389  1e-107  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.915712 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1787  putative MATE efflux protein  40 
 
 		 469 aa  355  6.999999999999999e-97  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1621  Na+ driven multidrug efflux pump  39.54 
 
 		 469 aa  354  2e-96  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1591  Na+ driven multidrug efflux pump  39.54 
 
 		 469 aa  354  2e-96  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.742873  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3557  putative MATE efflux protein  39.48 
 
 		 469 aa  354  2e-96  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.43043  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1823  putative MATE efflux protein  39.54 
 
 		 469 aa  354  2e-96  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1641  MATE efflux family protein  39.12 
 
 		 469 aa  353  5e-96  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.725642  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1846  integral membrane protein, putative  39.54 
 
 		 469 aa  352  5.9999999999999994e-96  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.563684  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1899  putative MATE efflux protein  40.75 
 
 		 469 aa  352  8e-96  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00227155  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1419  MATE efflux family protein  40.49 
 
 		 469 aa  342  7e-93  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.703884  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1159  MATE efflux family protein  38.91 
 
 		 478 aa  339  5.9999999999999996e-92  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.666411  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3177  MATE efflux family protein  40.75 
 
 		 469 aa  337  2.9999999999999997e-91  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.186099  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3059  MATE efflux family protein  39.96 
 
 		 469 aa  336  5.999999999999999e-91  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.231532  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3296  MATE efflux family protein  39.96 
 
 		 469 aa  336  5.999999999999999e-91  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.660304  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2862  MATE efflux family protein  40.22 
 
 		 469 aa  334  2e-90  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.83664  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1839  MATE efflux family protein  40.31 
 
 		 480 aa  330  2e-89  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2347  MATE efflux family protein  43.62 
 
 		 476 aa  326  5e-88  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1972  putative multi anti extrusion protein (MatE)  39.96 
 
 		 458 aa  286  7e-76  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.84525  normal  0.887527 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3642  multi anti extrusion protein MatE  34.31 
 
 		 496 aa  230  4e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.104533  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05514  hypothetical protein  32.97 
 
 		 482 aa  216  9e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.957983  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3962  multi antimicrobial extrusion protein  32.28 
 
 		 492 aa  215  9.999999999999999e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.789789  normal  0.0338284 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1160  MATE efflux family protein  33.11 
 
 		 486 aa  210  4e-53  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3884  MATE efflux family protein  32.3 
 
 		 521 aa  202  9e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0022  MATE efflux family protein  33.73 
 
 		 524 aa  200  5e-50  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00967763  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0031  MATE efflux family protein  33.94 
 
 		 503 aa  199  1.0000000000000001e-49  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0931  MATE efflux family protein  29.49 
 
 		 448 aa  192  1e-47  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.102954  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1044  MATE efflux family protein  32.27 
 
 		 494 aa  191  2e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1597  MATE efflux family protein  27.87 
 
 		 460 aa  190  4e-47  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  3.36267e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02151  multi antimicrobial extrusion family protein  32.8 
 
 		 503 aa  187  3e-46  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1641  Na+ driven multidrug antiporter, N-terminus  38.02 
 
 		 238 aa  186  8e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.908649  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1642  Na+ driven multidrug antiporter, C-terminus  40.59 
 
 		 270 aa  176  9e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1058  MATE efflux family protein  26.35 
 
 		 453 aa  169  1e-40  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1936  MATE efflux family protein  30 
 
 		 486 aa  162  8.000000000000001e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2639  MATE efflux family protein  34.19 
 
 		 481 aa  154  4e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1091  MATE efflux family protein  31.15 
 
 		 465 aa  154  5e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.719825  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3173  MATE efflux family protein  24.83 
 
 		 448 aa  152  1e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000170892  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0747  MATE efflux family protein  28.63 
 
 		 490 aa  149  1.0000000000000001e-34  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3762  MATE efflux family protein  27.83 
 
 		 442 aa  147  5e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000783437  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3276  MATE efflux family protein  24.5 
 
 		 457 aa  143  9e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000381455  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0707  MATE efflux family protein  27.06 
 
 		 518 aa  142  9.999999999999999e-33  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.376903  normal  0.476505 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1454  MATE efflux family protein  28.5 
 
 		 477 aa  142  9.999999999999999e-33  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2492  MATE efflux family protein  25.51 
 
 		 485 aa  142  1.9999999999999998e-32  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.544481  normal  0.228664 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1810  MATE efflux family protein  24.54 
 
 		 446 aa  138  2e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.108169  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0147  MATE efflux family protein  24.72 
 
 		 462 aa  138  2e-31  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000317216  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05190  MATE efflux family protein  29.26 
 
 		 454 aa  136  8e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.969197  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1318  MATE efflux family protein  27.27 
 
 		 443 aa  135  1.9999999999999998e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000101978  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2291  MATE efflux family protein  26.98 
 
 		 460 aa  135  1.9999999999999998e-30  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2358  MATE efflux family protein  25.96 
 
 		 467 aa  133  6e-30  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0217  MATE efflux family protein  27.19 
 
 		 445 aa  132  2.0000000000000002e-29  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000958822  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4033  MATE efflux family protein  27.91 
 
 		 458 aa  129  1.0000000000000001e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000078929 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0173  Na+-driven multidrug efflux pump  28.31 
 
 		 446 aa  129  1.0000000000000001e-28  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000291986  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1808  MATE efflux family protein  23.9 
 
 		 499 aa  127  3e-28  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.848054  normal  0.460632 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04830  MATE efflux family protein  25 
 
 		 468 aa  127  4.0000000000000003e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000202645  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1895  MATE efflux family protein  24.83 
 
 		 498 aa  127  5e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6251  MATE efflux family protein  24.94 
 
 		 461 aa  127  6e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0451  MATE efflux family protein  28.08 
 
 		 446 aa  126  1e-27  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000226029  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1529  MATE efflux family protein  24.17 
 
 		 554 aa  125  1e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.130898  normal  0.344827 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1309  MATE efflux family protein  24.63 
 
 		 538 aa  125  1e-27  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5035  MATE efflux family protein  26.82 
 
 		 469 aa  125  2e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.88746  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0086  MATE efflux family protein  27.4 
 
 		 522 aa  124  5e-27  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3948  MATE efflux family protein  26.86 
 
 		 458 aa  121  1.9999999999999998e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3692  MATE efflux family protein  27.27 
 
 		 461 aa  121  3e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000025823  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3385  MATE efflux family protein  28.15 
 
 		 453 aa  120  3.9999999999999996e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3677  MATE efflux family protein  25.59 
 
 		 500 aa  120  6e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.380257  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1579  MATE efflux family protein  25.28 
 
 		 445 aa  120  7.999999999999999e-26  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1842  MATE efflux family protein  27.82 
 
 		 442 aa  119  9e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000407528  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1055  MATE efflux family protein  24.89 
 
 		 449 aa  118  1.9999999999999998e-25  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000467502  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0762  MATE efflux family protein  24.54 
 
 		 458 aa  118  3e-25  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1461  MATE efflux family protein  27.19 
 
 		 500 aa  117  3.9999999999999997e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0906  MATE efflux family protein  23.54 
 
 		 448 aa  117  3.9999999999999997e-25  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000766798  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30280  putative efflux protein, MATE family  25.42 
 
 		 477 aa  117  3.9999999999999997e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.155954 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3565  MATE efflux family protein  28.2 
 
 		 452 aa  116  6.9999999999999995e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18080  putative efflux protein, MATE family  26.49 
 
 		 468 aa  116  7.999999999999999e-25  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.98273 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2458  MATE efflux family protein  25.05 
 
 		 500 aa  116  1.0000000000000001e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.672094  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0091  MATE efflux family protein  26.52 
 
 		 454 aa  116  1.0000000000000001e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0883  MATE efflux family protein  23.76 
 
 		 451 aa  115  1.0000000000000001e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000000230192  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2612  MATE efflux family protein  25.29 
 
 		 459 aa  115  2.0000000000000002e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2243  MATE efflux family protein  29.25 
 
 		 468 aa  115  2.0000000000000002e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2295  MATE efflux family protein  24.22 
 
 		 475 aa  114  3e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00026572  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1166  ABC transporter releated protein  22.97 
 
 		 463 aa  114  3e-24  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.403976 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4055  MATE efflux family protein  30.77 
 
 		 483 aa  114  4.0000000000000004e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0254154 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1925  MATE efflux family protein  24.38 
 
 		 455 aa  114  5e-24  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.16171  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0465  MATE efflux family protein  28.77 
 
 		 500 aa  114  5e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2591  MATE efflux family protein  27.33 
 
 		 525 aa  113  9e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.677976  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3337  MATE efflux family protein  28.24 
 
 		 470 aa  112  1.0000000000000001e-23  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1067  MATE efflux family protein  23.39 
 
 		 453 aa  112  1.0000000000000001e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000154468  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1506  MATE efflux family protein  27.19 
 
 		 450 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0381  MATE efflux family protein  24.11 
 
 		 451 aa  111  3e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00954667  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2888  MATE efflux family protein  25.3 
 
 		 462 aa  110  4.0000000000000004e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0238453  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0404  MATE efflux family protein  27.84 
 
 		 457 aa  110  5e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.294226 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3371  MATE efflux family protein  28.54 
 
 		 494 aa  110  5e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000918656 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0545  MATE efflux family protein  22.38 
 
 		 470 aa  110  5e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>