More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_3371 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014151  Cfla_3371  MATE efflux family protein  100 
 
 		 494 aa  952    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000918656 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0086  MATE efflux family protein  58.4 
 
 		 522 aa  555  1e-157  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30280  putative efflux protein, MATE family  54.97 
 
 		 477 aa  468  9.999999999999999e-131  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.155954 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0465  MATE efflux family protein  51.27 
 
 		 500 aa  357  3.9999999999999996e-97  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0512  Na+-driven multidrug efflux pump  43.05 
 
 		 458 aa  334  2e-90  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.08405  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0173  Na+-driven multidrug efflux pump  38.81 
 
 		 446 aa  319  9e-86  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000291986  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1597  Na+-driven multidrug efflux pump  43.5 
 
 		 408 aa  301  2e-80  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0508805  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3019  MATE efflux family protein  40.28 
 
 		 453 aa  281  1e-74  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000108454  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3385  MATE efflux family protein  35.15 
 
 		 453 aa  253  8.000000000000001e-66  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0217  MATE efflux family protein  30.09 
 
 		 445 aa  247  3e-64  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000958822  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0883  MATE efflux family protein  35.24 
 
 		 451 aa  228  2e-58  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000000230192  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1810  MATE efflux family protein  30.88 
 
 		 446 aa  209  1e-52  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.108169  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3762  MATE efflux family protein  28.18 
 
 		 442 aa  208  2e-52  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000783437  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3173  MATE efflux family protein  30.21 
 
 		 448 aa  201  3e-50  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000170892  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3276  MATE efflux family protein  30.89 
 
 		 457 aa  197  5.000000000000001e-49  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000381455  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1318  MATE efflux family protein  28.8 
 
 		 443 aa  186  1.0000000000000001e-45  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000101978  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0451  MATE efflux family protein  28.57 
 
 		 446 aa  186  1.0000000000000001e-45  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000226029  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1842  MATE efflux family protein  30.61 
 
 		 442 aa  180  4e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000407528  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0931  MATE efflux family protein  30.46 
 
 		 448 aa  176  9.999999999999999e-43  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.102954  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1621  Na+ driven multidrug efflux pump  30.02 
 
 		 469 aa  166  9e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1591  Na+ driven multidrug efflux pump  30.02 
 
 		 469 aa  166  9e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.742873  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1823  putative MATE efflux protein  30.02 
 
 		 469 aa  166  9e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3557  putative MATE efflux protein  30.25 
 
 		 469 aa  165  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.43043  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1787  putative MATE efflux protein  30.02 
 
 		 469 aa  165  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1055  MATE efflux family protein  27.31 
 
 		 449 aa  164  5.0000000000000005e-39  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000467502  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1641  MATE efflux family protein  29.42 
 
 		 469 aa  163  7e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.725642  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1899  putative MATE efflux protein  29.8 
 
 		 469 aa  162  2e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00227155  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1846  integral membrane protein, putative  29.8 
 
 		 469 aa  161  2e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.563684  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3059  MATE efflux family protein  28.02 
 
 		 469 aa  156  7e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.231532  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3296  MATE efflux family protein  28.02 
 
 		 469 aa  156  7e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.660304  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1160  MATE efflux family protein  33.26 
 
 		 486 aa  156  1e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2862  MATE efflux family protein  29.8 
 
 		 469 aa  155  2e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.83664  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3177  MATE efflux family protein  29.44 
 
 		 469 aa  153  5.9999999999999996e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.186099  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3962  multi antimicrobial extrusion protein  29.57 
 
 		 492 aa  149  1.0000000000000001e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.789789  normal  0.0338284 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1419  MATE efflux family protein  29.04 
 
 		 469 aa  147  4.0000000000000006e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.703884  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3884  MATE efflux family protein  31.67 
 
 		 521 aa  146  7.0000000000000006e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3642  multi anti extrusion protein MatE  27.62 
 
 		 496 aa  145  2e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.104533  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1839  MATE efflux family protein  29.71 
 
 		 480 aa  142  9.999999999999999e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1597  MATE efflux family protein  25.52 
 
 		 460 aa  140  7e-32  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  3.36267e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1058  MATE efflux family protein  27.11 
 
 		 453 aa  137  4e-31  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03157  hypothetical protein  30.09 
 
 		 455 aa  134  5e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.367645 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2889  MATE efflux family protein  28.45 
 
 		 471 aa  134  6e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.78127  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2869  MATE efflux family protein  27.89 
 
 		 472 aa  133  6.999999999999999e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0768419  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05514  hypothetical protein  29.98 
 
 		 482 aa  130  7.000000000000001e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.957983  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0031  MATE efflux family protein  27 
 
 		 503 aa  130  7.000000000000001e-29  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2347  MATE efflux family protein  29.39 
 
 		 476 aa  129  2.0000000000000002e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4169  MATE efflux family protein  30.11 
 
 		 455 aa  127  6e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0022  MATE efflux family protein  28.42 
 
 		 524 aa  127  6e-28  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00967763  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4281  MATE efflux family protein  30.11 
 
 		 455 aa  127  6e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.711709 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1159  MATE efflux family protein  28.29 
 
 		 478 aa  126  1e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.666411  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02151  multi antimicrobial extrusion family protein  29.53 
 
 		 503 aa  122  1.9999999999999998e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1711  MATE efflux family protein  25.66 
 
 		 463 aa  119  9.999999999999999e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0339316  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18080  putative efflux protein, MATE family  25.59 
 
 		 468 aa  116  7.999999999999999e-25  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.98273 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1972  putative multi anti extrusion protein (MatE)  28.44 
 
 		 458 aa  116  1.0000000000000001e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.84525  normal  0.887527 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1641  Na+ driven multidrug antiporter, N-terminus  35.24 
 
 		 238 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.908649  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1044  MATE efflux family protein  28.25 
 
 		 494 aa  115  2.0000000000000002e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1309  MATE efflux family protein  28.94 
 
 		 538 aa  115  3e-24  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3541  multi anti extrusion protein MatE  24.66 
 
 		 491 aa  114  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.325016 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2439  MATE efflux family protein  28.74 
 
 		 485 aa  114  5e-24  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.739641  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04830  MATE efflux family protein  25.26 
 
 		 468 aa  112  1.0000000000000001e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000202645  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0162  multi anti extrusion protein MatE  26.01 
 
 		 449 aa  109  9.000000000000001e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0187  MATE efflux family protein  27.43 
 
 		 449 aa  108  2e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1579  MATE efflux family protein  26.63 
 
 		 445 aa  108  2e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0147  MATE efflux family protein  25.12 
 
 		 462 aa  108  3e-22  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000317216  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2291  MATE efflux family protein  27.11 
 
 		 460 aa  107  7e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1529  MATE efflux family protein  28.11 
 
 		 554 aa  106  1e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.130898  normal  0.344827 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0762  MATE efflux family protein  26.21 
 
 		 458 aa  106  1e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2591  MATE efflux family protein  30.51 
 
 		 525 aa  104  3e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.677976  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05890  putative efflux protein, MATE family  28.77 
 
 		 472 aa  105  3e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0485  hypothetical protein  24.24 
 
 		 454 aa  104  4e-21  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0273971  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6251  MATE efflux family protein  29.37 
 
 		 461 aa  103  6e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0906  MATE efflux family protein  24.57 
 
 		 448 aa  102  2e-20  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000766798  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3120  MATE efflux family protein  28.87 
 
 		 461 aa  100  7e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.369114  normal  0.932515 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2492  MATE efflux family protein  26.63 
 
 		 485 aa  97.1  7e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.544481  normal  0.228664 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0534  MATE efflux family protein  23.1 
 
 		 451 aa  96.7  8e-19  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1922  MATE efflux family protein  23.19 
 
 		 456 aa  95.1  2e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1180  MATE efflux family protein  25 
 
 		 455 aa  95.9  2e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1820  Na+-driven multidrug efflux pump-like protein  26.21 
 
 		 461 aa  95.5  2e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0702  MATE efflux family protein  24.28 
 
 		 452 aa  94.7  3e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1067  MATE efflux family protein  24.84 
 
 		 453 aa  94.7  3e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000154468  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3710  MATE efflux family protein  24.44 
 
 		 455 aa  95.1  3e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.232724  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0666  MATE efflux family protein  24.44 
 
 		 455 aa  94.7  4e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1461  MATE efflux family protein  27 
 
 		 500 aa  94  5e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0670  MATE efflux family protein  24.2 
 
 		 455 aa  94  6e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.358402  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0643  MATE efflux family protein  24.2 
 
 		 455 aa  93.6  7e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1925  MATE efflux family protein  32.43 
 
 		 455 aa  93.6  8e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.16171  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0645  MATE efflux family protein  21.64 
 
 		 462 aa  93.2  9e-18  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000346552  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05190  MATE efflux family protein  24.34 
 
 		 454 aa  92.8  1e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.969197  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0100  MATE efflux family protein  26.81 
 
 		 454 aa  93.2  1e-17  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0456451  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2888  MATE efflux family protein  22.17 
 
 		 462 aa  92  2e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0238453  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1808  MATE efflux family protein  25.36 
 
 		 499 aa  92.4  2e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.848054  normal  0.460632 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1338  MATE efflux family protein  28.36 
 
 		 481 aa  92  2e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4310  MATE efflux family protein  23.9 
 
 		 451 aa  91.3  3e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1813  MATE efflux family protein  27.27 
 
 		 461 aa  91.3  3e-17  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  unclonable  0.000000145997  normal  0.0820418 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1091  MATE efflux family protein  26.52 
 
 		 465 aa  91.3  3e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.719825  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0404  MATE efflux family protein  26.54 
 
 		 457 aa  90.9  4e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.294226 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0828  MATE efflux family protein  22.01 
 
 		 438 aa  90.1  8e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.478729  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0621  MATE efflux family protein  25.08 
 
 		 460 aa  89.7  9e-17  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.27098  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0835  MATE efflux family protein  22.01 
 
 		 438 aa  89.4  1e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0381  MATE efflux family protein  24.87 
 
 		 451 aa  89.4  1e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00954667  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>