More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_0187 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007406  Nwi_0162  multi anti extrusion protein MatE  85.97 
 
 		 449 aa  697    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0187  MATE efflux family protein  100 
 
 		 449 aa  872    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2889  MATE efflux family protein  62.92 
 
 		 471 aa  525  1e-148  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.78127  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0316  putative multi anti extrusion protein (MatE)  65.6 
 
 		 436 aa  519  1e-146  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.915712 
 
 
-
 
NC_003296  RS03157  hypothetical protein  60 
 
 		 455 aa  499  1e-140  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.367645 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4281  MATE efflux family protein  59.78 
 
 		 455 aa  491  1e-137  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.711709 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4169  MATE efflux family protein  59.78 
 
 		 455 aa  491  1e-137  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3541  multi anti extrusion protein MatE  54.05 
 
 		 491 aa  473  1e-132  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.325016 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2869  MATE efflux family protein  53.36 
 
 		 472 aa  460  9.999999999999999e-129  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0768419  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1641  MATE efflux family protein  48.22 
 
 		 469 aa  435  1e-121  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.725642  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1419  MATE efflux family protein  47.99 
 
 		 469 aa  432  1e-120  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.703884  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1621  Na+ driven multidrug efflux pump  47.33 
 
 		 469 aa  429  1e-119  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1591  Na+ driven multidrug efflux pump  47.33 
 
 		 469 aa  429  1e-119  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.742873  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1823  putative MATE efflux protein  47.33 
 
 		 469 aa  429  1e-119  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3557  putative MATE efflux protein  47.56 
 
 		 469 aa  431  1e-119  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.43043  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1787  putative MATE efflux protein  47.56 
 
 		 469 aa  428  1e-119  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1846  integral membrane protein, putative  47.33 
 
 		 469 aa  427  1e-118  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.563684  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1899  putative MATE efflux protein  47.33 
 
 		 469 aa  427  1e-118  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00227155  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3177  MATE efflux family protein  46.88 
 
 		 469 aa  413  1e-114  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.186099  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3059  MATE efflux family protein  46 
 
 		 469 aa  414  1e-114  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.231532  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3296  MATE efflux family protein  46 
 
 		 469 aa  414  1e-114  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.660304  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2862  MATE efflux family protein  46.88 
 
 		 469 aa  411  1e-113  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.83664  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1159  MATE efflux family protein  47.65 
 
 		 478 aa  411  1e-113  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.666411  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1839  MATE efflux family protein  47.77 
 
 		 480 aa  399  9.999999999999999e-111  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2347  MATE efflux family protein  45.45 
 
 		 476 aa  360  3e-98  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1972  putative multi anti extrusion protein (MatE)  41.65 
 
 		 458 aa  312  9e-84  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.84525  normal  0.887527 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0022  MATE efflux family protein  35.32 
 
 		 524 aa  244  1.9999999999999999e-63  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00967763  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0031  MATE efflux family protein  35.54 
 
 		 503 aa  244  1.9999999999999999e-63  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3642  multi anti extrusion protein MatE  33.26 
 
 		 496 aa  243  7e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.104533  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1642  Na+ driven multidrug antiporter, C-terminus  50 
 
 		 270 aa  242  1e-62  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1160  MATE efflux family protein  34.84 
 
 		 486 aa  239  8e-62  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05514  hypothetical protein  32.43 
 
 		 482 aa  234  2.0000000000000002e-60  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.957983  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02151  multi antimicrobial extrusion family protein  37 
 
 		 503 aa  227  3e-58  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3962  multi antimicrobial extrusion protein  31.91 
 
 		 492 aa  226  5.0000000000000005e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.789789  normal  0.0338284 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1044  MATE efflux family protein  34 
 
 		 494 aa  218  1e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3884  MATE efflux family protein  32.43 
 
 		 521 aa  211  1e-53  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1936  MATE efflux family protein  34.47 
 
 		 486 aa  198  2.0000000000000003e-49  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1641  Na+ driven multidrug antiporter, N-terminus  43.93 
 
 		 238 aa  195  1e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.908649  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0931  MATE efflux family protein  30.44 
 
 		 448 aa  194  3e-48  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.102954  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2639  MATE efflux family protein  36.02 
 
 		 481 aa  188  2e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1597  MATE efflux family protein  26.16 
 
 		 460 aa  172  1e-41  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  3.36267e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0147  MATE efflux family protein  27.48 
 
 		 462 aa  167  5e-40  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000317216  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1091  MATE efflux family protein  30.24 
 
 		 465 aa  166  5.9999999999999996e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.719825  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1454  MATE efflux family protein  30.34 
 
 		 477 aa  154  5e-36  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1895  MATE efflux family protein  29.46 
 
 		 498 aa  152  1e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2492  MATE efflux family protein  28.26 
 
 		 485 aa  150  4e-35  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.544481  normal  0.228664 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3677  MATE efflux family protein  28.76 
 
 		 500 aa  149  7e-35  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.380257  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3276  MATE efflux family protein  26.67 
 
 		 457 aa  149  1.0000000000000001e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000381455  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0707  MATE efflux family protein  28.04 
 
 		 518 aa  148  2.0000000000000003e-34  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.376903  normal  0.476505 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1058  MATE efflux family protein  24.44 
 
 		 453 aa  141  1.9999999999999998e-32  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3173  MATE efflux family protein  25.44 
 
 		 448 aa  141  3e-32  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000170892  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05190  MATE efflux family protein  27.63 
 
 		 454 aa  139  1e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.969197  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1180  MATE efflux family protein  26.52 
 
 		 455 aa  138  2e-31  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1808  MATE efflux family protein  27.83 
 
 		 499 aa  137  6.0000000000000005e-31  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.848054  normal  0.460632 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3762  MATE efflux family protein  26.86 
 
 		 442 aa  136  7.000000000000001e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000783437  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0747  MATE efflux family protein  26.17 
 
 		 490 aa  136  8e-31  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1055  MATE efflux family protein  23.88 
 
 		 449 aa  136  9e-31  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000467502  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04830  MATE efflux family protein  28.61 
 
 		 468 aa  136  9e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000202645  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30280  putative efflux protein, MATE family  31.59 
 
 		 477 aa  135  1.9999999999999998e-30  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.155954 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0451  MATE efflux family protein  27.47 
 
 		 446 aa  134  1.9999999999999998e-30  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000226029  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0086  MATE efflux family protein  29.53 
 
 		 522 aa  132  7.999999999999999e-30  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3019  MATE efflux family protein  27.21 
 
 		 453 aa  132  2.0000000000000002e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000108454  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2458  MATE efflux family protein  27.62 
 
 		 500 aa  130  5.0000000000000004e-29  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.672094  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0217  MATE efflux family protein  27.17 
 
 		 445 aa  130  5.0000000000000004e-29  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000958822  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2237  MATE efflux family protein  27.08 
 
 		 469 aa  129  1.0000000000000001e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000615121  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1318  MATE efflux family protein  24.7 
 
 		 443 aa  128  2.0000000000000002e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000101978  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1461  MATE efflux family protein  26.52 
 
 		 500 aa  125  2e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3337  MATE efflux family protein  28.29 
 
 		 470 aa  124  3e-27  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0906  MATE efflux family protein  23.08 
 
 		 448 aa  124  5e-27  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000766798  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0883  MATE efflux family protein  26.12 
 
 		 451 aa  123  7e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000000230192  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0173  Na+-driven multidrug efflux pump  28.1 
 
 		 446 aa  122  9.999999999999999e-27  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000291986  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2439  MATE efflux family protein  25.94 
 
 		 485 aa  119  9.999999999999999e-26  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.739641  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6251  MATE efflux family protein  24.94 
 
 		 461 aa  117  3e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2591  MATE efflux family protein  29.26 
 
 		 525 aa  117  5e-25  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.677976  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2964  MATE efflux family protein  26.65 
 
 		 453 aa  116  6.9999999999999995e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000632854  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2060  MATE efflux family protein  24.89 
 
 		 456 aa  116  8.999999999999998e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000022927  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2736  MATE efflux family protein  29.19 
 
 		 452 aa  115  2.0000000000000002e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1810  MATE efflux family protein  24.94 
 
 		 446 aa  115  2.0000000000000002e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.108169  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1529  MATE efflux family protein  26.48 
 
 		 554 aa  115  2.0000000000000002e-24  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.130898  normal  0.344827 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2291  MATE efflux family protein  25.91 
 
 		 460 aa  113  6e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3385  MATE efflux family protein  26.68 
 
 		 453 aa  113  8.000000000000001e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3565  MATE efflux family protein  26.82 
 
 		 452 aa  111  3e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0091  MATE efflux family protein  26.67 
 
 		 454 aa  111  3e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3692  MATE efflux family protein  25.68 
 
 		 461 aa  111  3e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000025823  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1309  MATE efflux family protein  24.79 
 
 		 538 aa  110  5e-23  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0381  MATE efflux family protein  22.97 
 
 		 451 aa  110  5e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00954667  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1338  MATE efflux family protein  27.69 
 
 		 481 aa  110  8.000000000000001e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3120  MATE efflux family protein  24.19 
 
 		 461 aa  109  1e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.369114  normal  0.932515 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0485  hypothetical protein  21.13 
 
 		 454 aa  108  2e-22  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0273971  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2295  MATE efflux family protein  25.71 
 
 		 475 aa  108  3e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00026572  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0762  MATE efflux family protein  22.9 
 
 		 458 aa  107  4e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4103  Na+ driven multidrug efflux pump  25.62 
 
 		 463 aa  107  4e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0660054  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0645  MATE efflux family protein  21.08 
 
 		 462 aa  107  5e-22  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000346552  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2358  MATE efflux family protein  24.38 
 
 		 467 aa  107  5e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2612  MATE efflux family protein  25.17 
 
 		 459 aa  107  6e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0545  MATE efflux family protein  23.02 
 
 		 470 aa  106  8e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2343  MATE efflux family protein  24.66 
 
 		 464 aa  106  9e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000000238189  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0113  MATE efflux family protein  23.08 
 
 		 464 aa  105  1e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1082  efflux protein  26.17 
 
 		 464 aa  105  1e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000125629  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0901  MATE efflux family protein  25.9 
 
 		 463 aa  105  1e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000627796  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>