More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_3175 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_3175  MATE efflux family protein  100 
 
 		 468 aa  929    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.386097  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2841  MATE efflux family protein  49.15 
 
 		 468 aa  462  1e-129  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000678206  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6251  MATE efflux family protein  42.73 
 
 		 461 aa  399  9.999999999999999e-111  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0545  MATE efflux family protein  43.72 
 
 		 470 aa  391  1e-107  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3120  MATE efflux family protein  44.9 
 
 		 461 aa  372  1e-102  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.369114  normal  0.932515 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1851  MATE efflux family protein  40.75 
 
 		 475 aa  340  2.9999999999999998e-92  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00783953  normal  0.201536 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1071  MATE efflux family protein  38.9 
 
 		 475 aa  317  3e-85  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1579  MATE efflux family protein  28.41 
 
 		 445 aa  179  9e-44  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2295  MATE efflux family protein  26.27 
 
 		 475 aa  177  5e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00026572  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2291  MATE efflux family protein  26.23 
 
 		 460 aa  176  6e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04830  MATE efflux family protein  25.79 
 
 		 468 aa  169  1e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000202645  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0147  MATE efflux family protein  27.79 
 
 		 462 aa  166  6.9999999999999995e-40  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000317216  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1936  MATE efflux family protein  25.76 
 
 		 486 aa  166  6.9999999999999995e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2492  MATE efflux family protein  25.28 
 
 		 485 aa  162  2e-38  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.544481  normal  0.228664 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1338  MATE efflux family protein  26.22 
 
 		 481 aa  159  7e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05190  MATE efflux family protein  27.17 
 
 		 454 aa  157  5.0000000000000005e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.969197  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3337  MATE efflux family protein  25.39 
 
 		 470 aa  153  7e-36  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0991  MATE efflux family protein  25.59 
 
 		 475 aa  152  1e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000156724  normal  0.091152 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1461  MATE efflux family protein  26.04 
 
 		 500 aa  152  2e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2343  MATE efflux family protein  24.23 
 
 		 464 aa  150  4e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000000238189  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2458  MATE efflux family protein  26.46 
 
 		 500 aa  149  8e-35  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.672094  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2591  MATE efflux family protein  25.99 
 
 		 525 aa  149  8e-35  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.677976  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1808  MATE efflux family protein  24.2 
 
 		 499 aa  148  2.0000000000000003e-34  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.848054  normal  0.460632 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09280  MATE efflux family protein  25.4 
 
 		 453 aa  147  6e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000476954  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0707  MATE efflux family protein  24.58 
 
 		 518 aa  146  9e-34  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.376903  normal  0.476505 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0906  MATE efflux family protein  25 
 
 		 448 aa  144  2e-33  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000766798  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1597  MATE efflux family protein  23.84 
 
 		 460 aa  143  7e-33  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  3.36267e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0645  MATE efflux family protein  23.46 
 
 		 462 aa  141  3e-32  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000346552  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3059  MATE efflux family protein  24.19 
 
 		 469 aa  140  3.9999999999999997e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.231532  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3296  MATE efflux family protein  24.19 
 
 		 469 aa  140  3.9999999999999997e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.660304  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1895  MATE efflux family protein  24.25 
 
 		 498 aa  139  1e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1166  ABC transporter releated protein  25.67 
 
 		 463 aa  139  1e-31  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.403976 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1670  MATE efflux family protein  24.83 
 
 		 466 aa  138  2e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4033  MATE efflux family protein  26.24 
 
 		 458 aa  137  5e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000078929 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3642  multi anti extrusion protein MatE  24.34 
 
 		 496 aa  137  5e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.104533  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1419  MATE efflux family protein  25 
 
 		 469 aa  136  7.000000000000001e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.703884  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1180  MATE efflux family protein  26.21 
 
 		 455 aa  135  1.9999999999999998e-30  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3948  MATE efflux family protein  25.77 
 
 		 458 aa  135  1.9999999999999998e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0485  hypothetical protein  23.95 
 
 		 454 aa  134  3e-30  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0273971  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1641  MATE efflux family protein  24.78 
 
 		 469 aa  134  3.9999999999999996e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.725642  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1309  MATE efflux family protein  24.79 
 
 		 538 aa  134  3.9999999999999996e-30  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3677  MATE efflux family protein  24.04 
 
 		 500 aa  132  2.0000000000000002e-29  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.380257  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1846  integral membrane protein, putative  25.23 
 
 		 469 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.563684  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1899  putative MATE efflux protein  25.23 
 
 		 469 aa  132  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00227155  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1621  Na+ driven multidrug efflux pump  25 
 
 		 469 aa  130  7.000000000000001e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1591  Na+ driven multidrug efflux pump  25 
 
 		 469 aa  130  7.000000000000001e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.742873  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1823  putative MATE efflux protein  25 
 
 		 469 aa  130  7.000000000000001e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3557  putative MATE efflux protein  25 
 
 		 469 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.43043  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1607  MATE efflux family protein  24.61 
 
 		 463 aa  129  1.0000000000000001e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000142965  unclonable  4.95515e-23 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0762  MATE efflux family protein  26.32 
 
 		 458 aa  128  2.0000000000000002e-28  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1787  putative MATE efflux protein  25 
 
 		 469 aa  127  6e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1529  MATE efflux family protein  24.53 
 
 		 554 aa  126  7e-28  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.130898  normal  0.344827 
 
 
-
 
NC_003296  RS03157  hypothetical protein  25.61 
 
 		 455 aa  126  9e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.367645 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2964  MATE efflux family protein  24.03 
 
 		 453 aa  125  1e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000632854  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2306  MATE efflux family protein  24.24 
 
 		 469 aa  125  1e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.30452  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0618  MATE efflux family protein  23.72 
 
 		 505 aa  124  3e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.316241  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0747  MATE efflux family protein  24.89 
 
 		 490 aa  124  4e-27  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1371  MATE efflux family protein  25.51 
 
 		 463 aa  124  5e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3815  MATE efflux family protein  25.65 
 
 		 467 aa  122  9.999999999999999e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.142559  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0591  MATE efflux family protein  23.46 
 
 		 438 aa  122  1.9999999999999998e-26  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1454  MATE efflux family protein  24.72 
 
 		 477 aa  121  3e-26  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0111  MATE efflux family protein  24.77 
 
 		 464 aa  120  6e-26  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3962  multi antimicrobial extrusion protein  23.09 
 
 		 492 aa  120  7e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.789789  normal  0.0338284 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0113  MATE efflux family protein  24.83 
 
 		 464 aa  119  9.999999999999999e-26  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3173  MATE efflux family protein  27.16 
 
 		 448 aa  119  1.9999999999999998e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000170892  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0091  MATE efflux family protein  23.49 
 
 		 454 aa  117  3e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1839  MATE efflux family protein  25.6 
 
 		 480 aa  117  5e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1353  MATE efflux family protein  23.24 
 
 		 453 aa  116  7.999999999999999e-25  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2888  MATE efflux family protein  25.6 
 
 		 462 aa  115  1.0000000000000001e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0238453  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4281  MATE efflux family protein  24.57 
 
 		 455 aa  115  2.0000000000000002e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.711709 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4169  MATE efflux family protein  24.57 
 
 		 455 aa  115  2.0000000000000002e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2889  MATE efflux family protein  23.08 
 
 		 471 aa  114  3e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.78127  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1790  hypothetical protein  26.02 
 
 		 443 aa  114  3e-24  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0381  MATE efflux family protein  23.41 
 
 		 451 aa  114  4.0000000000000004e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00954667  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0784  MATE efflux family protein  25.23 
 
 		 460 aa  114  5e-24  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1171  MATE efflux family protein  24.65 
 
 		 457 aa  113  7.000000000000001e-24  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1058  MATE efflux family protein  24.09 
 
 		 453 aa  113  7.000000000000001e-24  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0702  MATE efflux family protein  23.02 
 
 		 452 aa  113  8.000000000000001e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0931  MATE efflux family protein  25 
 
 		 448 aa  112  1.0000000000000001e-23  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.102954  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3565  MATE efflux family protein  26.4 
 
 		 452 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2862  MATE efflux family protein  23.23 
 
 		 469 aa  112  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.83664  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1199  MATE efflux family protein  26.78 
 
 		 450 aa  111  3e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0538393  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2439  MATE efflux family protein  22.88 
 
 		 485 aa  111  3e-23  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.739641  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3177  MATE efflux family protein  23.37 
 
 		 469 aa  111  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.186099  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2827  MATE efflux family protein  24.45 
 
 		 451 aa  110  4.0000000000000004e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.658448  normal  0.32606 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2358  MATE efflux family protein  21.29 
 
 		 467 aa  109  1e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0666  MATE efflux family protein  22.63 
 
 		 455 aa  108  2e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0643  MATE efflux family protein  22.63 
 
 		 455 aa  108  2e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3710  MATE efflux family protein  22.63 
 
 		 455 aa  107  3e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.232724  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0640  MATE efflux family protein  22.43 
 
 		 454 aa  107  4e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.690668  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1160  MATE efflux family protein  23.15 
 
 		 486 aa  107  5e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0670  MATE efflux family protein  22.63 
 
 		 455 aa  107  5e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.358402  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2653  MATE efflux family protein  24.52 
 
 		 484 aa  106  8e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0699  MATE efflux family protein  22.33 
 
 		 456 aa  106  9e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0250563  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1044  MATE efflux family protein  25.11 
 
 		 494 aa  105  1e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1418  MATE efflux family protein  25.7 
 
 		 462 aa  105  1e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1159  MATE efflux family protein  24.73 
 
 		 478 aa  105  1e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.666411  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0162  multi anti extrusion protein MatE  25.76 
 
 		 449 aa  105  2e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0420  MATE efflux family protein  22.33 
 
 		 459 aa  105  2e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000768677  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3993  MATE efflux family protein  25.12 
 
 		 447 aa  105  2e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>