More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_3963 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007802  Jann_3963  MATE efflux family protein  100 
 
 		 457 aa  906    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0920263  normal  0.56178 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2653  MATE efflux family protein  36.63 
 
 		 484 aa  263  3e-69  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0404  MATE efflux family protein  36.75 
 
 		 457 aa  253  4.0000000000000004e-66  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.294226 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2315  MATE efflux family protein  34.36 
 
 		 470 aa  253  6e-66  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.1458  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2508  multi anti extrusion protein MatE  34.16 
 
 		 463 aa  251  2e-65  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1507  mate efflux family protein  36.34 
 
 		 446 aa  227  3e-58  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00640866  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4033  MATE efflux family protein  34.44 
 
 		 458 aa  226  7e-58  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000078929 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3948  MATE efflux family protein  33.97 
 
 		 458 aa  219  7.999999999999999e-56  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1790  hypothetical protein  33.5 
 
 		 443 aa  205  1e-51  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2291  MATE efflux family protein  28.07 
 
 		 460 aa  153  5e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6251  MATE efflux family protein  28.85 
 
 		 461 aa  135  1.9999999999999998e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04830  MATE efflux family protein  27.37 
 
 		 468 aa  132  9e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000202645  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0091  MATE efflux family protein  27.2 
 
 		 454 aa  131  3e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1371  MATE efflux family protein  28.49 
 
 		 463 aa  130  4.0000000000000003e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3120  MATE efflux family protein  27.82 
 
 		 461 aa  129  1.0000000000000001e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.369114  normal  0.932515 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3173  MATE efflux family protein  27.15 
 
 		 448 aa  129  1.0000000000000001e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000170892  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0707  MATE efflux family protein  26.01 
 
 		 518 aa  127  4.0000000000000003e-28  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.376903  normal  0.476505 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0420  MATE efflux family protein  28.89 
 
 		 459 aa  127  4.0000000000000003e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000768677  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0014  MATE efflux family protein  27.54 
 
 		 453 aa  126  8.000000000000001e-28  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.0029857  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2492  MATE efflux family protein  26.4 
 
 		 485 aa  125  2e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.544481  normal  0.228664 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00144  multidrug efflux pump  29.81 
 
 		 456 aa  124  5e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1461  MATE efflux family protein  32.52 
 
 		 500 aa  124  5e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4310  MATE efflux family protein  28.5 
 
 		 451 aa  123  6e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3337  MATE efflux family protein  28.18 
 
 		 470 aa  123  8e-27  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0670  MATE efflux family protein  27.18 
 
 		 455 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.358402  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1726  MATE efflux family protein  28.14 
 
 		 447 aa  122  9.999999999999999e-27  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0666  MATE efflux family protein  27.18 
 
 		 455 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0643  MATE efflux family protein  27.18 
 
 		 455 aa  122  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3710  MATE efflux family protein  27.18 
 
 		 455 aa  122  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.232724  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1820  Na+-driven multidrug efflux pump-like protein  27.27 
 
 		 461 aa  121  3e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1597  MATE efflux family protein  25.41 
 
 		 460 aa  121  3e-26  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  3.36267e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1851  MATE efflux family protein  23.68 
 
 		 475 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00783953  normal  0.201536 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3662  MATE efflux family protein  27.85 
 
 		 476 aa  120  6e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.000000389251  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1936  MATE efflux family protein  28.03 
 
 		 486 aa  119  7.999999999999999e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0877  MATE efflux family protein  27.21 
 
 		 447 aa  119  1.9999999999999998e-25  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.371074  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2244  hypothetical protein  29.3 
 
 		 460 aa  118  1.9999999999999998e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1808  MATE efflux family protein  24.94 
 
 		 499 aa  117  3e-25  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.848054  normal  0.460632 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002223  Na+-driven multidrug efflux pump  26.09 
 
 		 428 aa  116  8.999999999999998e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.851646  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0147  MATE efflux family protein  25.07 
 
 		 462 aa  116  8.999999999999998e-25  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000317216  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1353  MATE efflux family protein  26.32 
 
 		 453 aa  116  8.999999999999998e-25  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0545  MATE efflux family protein  27.27 
 
 		 470 aa  115  2.0000000000000002e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1133  MATE efflux family protein  26.2 
 
 		 437 aa  115  2.0000000000000002e-24  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1895  MATE efflux family protein  25.45 
 
 		 498 aa  115  2.0000000000000002e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0470  MATE efflux family protein  27.45 
 
 		 455 aa  114  3e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.11231  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0997  MATE efflux family protein  25.97 
 
 		 437 aa  114  3e-24  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.207525  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2639  MATE efflux family protein  27.31 
 
 		 515 aa  114  4.0000000000000004e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1825  MATE efflux family protein  27.31 
 
 		 515 aa  114  4.0000000000000004e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.559247  normal  0.52538 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2526  MATE efflux family protein  27.31 
 
 		 515 aa  114  4.0000000000000004e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0640  MATE efflux family protein  26.98 
 
 		 454 aa  113  7.000000000000001e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.690668  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0702  MATE efflux family protein  26.26 
 
 		 452 aa  113  8.000000000000001e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0255  MATE efflux family protein  29.61 
 
 		 448 aa  113  9e-24  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.392054  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0185  MATE efflux family protein  26.5 
 
 		 449 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1925  MATE efflux family protein  25.06 
 
 		 455 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.16171  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0485  hypothetical protein  22.32 
 
 		 454 aa  112  1.0000000000000001e-23  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0273971  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2519  MATE efflux family protein  27.31 
 
 		 515 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0381  MATE efflux family protein  24.57 
 
 		 451 aa  112  2.0000000000000002e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00954667  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3395  MATE efflux family protein  23.68 
 
 		 461 aa  110  4.0000000000000004e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1180  MATE efflux family protein  25.2 
 
 		 455 aa  110  4.0000000000000004e-23  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1318  MATE efflux family protein  26.47 
 
 		 443 aa  110  4.0000000000000004e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000101978  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2888  MATE efflux family protein  25 
 
 		 462 aa  110  6e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0238453  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2374  MATE efflux family protein  29.01 
 
 		 509 aa  110  6e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2591  MATE efflux family protein  26.87 
 
 		 525 aa  110  7.000000000000001e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.677976  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1053  MATE efflux family protein  25.33 
 
 		 462 aa  109  9.000000000000001e-23  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  1.2115099999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0293  MATE efflux family protein  25.06 
 
 		 467 aa  109  1e-22  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1338  MATE efflux family protein  29.52 
 
 		 481 aa  108  2e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0111  MATE efflux family protein  26.27 
 
 		 464 aa  107  3e-22  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0113  MATE efflux family protein  25.74 
 
 		 464 aa  108  3e-22  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1071  MATE efflux family protein  25.61 
 
 		 475 aa  107  4e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0577  Na+-driven multidrug efflux pump  26.89 
 
 		 454 aa  107  4e-22  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.00131825  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3634  MATE efflux family protein  28.3 
 
 		 463 aa  107  4e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0948956 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0285  MATE efflux family protein  26.33 
 
 		 465 aa  107  4e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.47505 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1454  MATE efflux family protein  25.44 
 
 		 477 aa  107  4e-22  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3126  MATE efflux family protein  27.86 
 
 		 455 aa  107  4e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.113083  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0012  MATE efflux family protein  24.89 
 
 		 477 aa  107  6e-22  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00000348389  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0827  MATE efflux family protein  23.56 
 
 		 452 aa  106  1e-21  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0645  MATE efflux family protein  22.64 
 
 		 462 aa  106  1e-21  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000346552  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1067  MATE efflux family protein  22.65 
 
 		 453 aa  105  1e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000154468  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1497  MATE efflux family protein  22.86 
 
 		 460 aa  106  1e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00584213  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0699  MATE efflux family protein  26.63 
 
 		 456 aa  105  2e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0250563  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1822  MATE efflux family protein  25.93 
 
 		 505 aa  105  2e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0006  MATE efflux family protein  26.15 
 
 		 442 aa  104  3e-21  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0243937 
 
 
-
 
NC_003296  RS05514  hypothetical protein  30.91 
 
 		 482 aa  103  5e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.957983  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0883  MATE efflux family protein  26.2 
 
 		 451 aa  103  5e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000000230192  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3527  MATE efflux family protein  26.83 
 
 		 443 aa  103  6e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.755877  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2964  MATE efflux family protein  24.84 
 
 		 453 aa  103  6e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000632854  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3691  MATE efflux family protein  26.33 
 
 		 453 aa  103  6e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.830643  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05190  MATE efflux family protein  24.38 
 
 		 454 aa  103  7e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.969197  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1446  MATE efflux family protein  23.48 
 
 		 439 aa  103  8e-21  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.484247 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1058  MATE efflux family protein  25.94 
 
 		 453 aa  103  9e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1577  MATE efflux family protein  27.64 
 
 		 447 aa  102  1e-20  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.283423  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1652  MATE efflux family protein  24.08 
 
 		 454 aa  102  2e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000778713  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3487  MATE efflux family protein  26.9 
 
 		 459 aa  102  2e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3677  MATE efflux family protein  22.3 
 
 		 500 aa  101  2e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.380257  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1579  MATE efflux family protein  25.75 
 
 		 445 aa  101  2e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1623  MATE efflux family protein  27.12 
 
 		 520 aa  101  3e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1309  MATE efflux family protein  24.68 
 
 		 538 aa  100  4e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3492  integral membrane protein  24.65 
 
 		 485 aa  100  4e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0396785  normal  0.244149 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1698  MATE efflux family protein  27.12 
 
 		 517 aa  100  4e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1699  MATE efflux family protein  27.12 
 
 		 520 aa  100  4e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1171  MATE efflux family protein  24.57 
 
 		 457 aa  100  5e-20  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>