More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HY04AAS1_0316 on replicon NC_011126
Organism: Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011126  HY04AAS1_0316  MATE efflux family protein  100 
 
 		 444 aa  870    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000262265  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0591  MATE efflux family protein  34.5 
 
 		 438 aa  239  9e-62  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1359  multi anti extrusion protein MatE  32.1 
 
 		 408 aa  199  1.0000000000000001e-49  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0762  MATE efflux family protein  30.44 
 
 		 458 aa  180  4e-44  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2237  MATE efflux family protein  30.94 
 
 		 469 aa  168  2e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000615121  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3565  MATE efflux family protein  28.02 
 
 		 452 aa  163  6e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2243  MATE efflux family protein  29.28 
 
 		 468 aa  160  5e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0055  MATE efflux family protein  33.41 
 
 		 446 aa  160  5e-38  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4055  MATE efflux family protein  28.81 
 
 		 483 aa  157  3e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0254154 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3993  MATE efflux family protein  28.77 
 
 		 447 aa  155  1e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4087  MATE efflux family protein  28.54 
 
 		 447 aa  155  1e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0991  MATE efflux family protein  28.45 
 
 		 475 aa  154  4e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000156724  normal  0.091152 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0111  MATE efflux family protein  28.41 
 
 		 464 aa  150  4e-35  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0113  MATE efflux family protein  28.47 
 
 		 464 aa  149  1.0000000000000001e-34  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4400  MATE efflux family protein  29.23 
 
 		 453 aa  144  4e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0121801  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3692  MATE efflux family protein  26.86 
 
 		 461 aa  143  5e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000025823  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0575  MATE efflux family protein  24.49 
 
 		 459 aa  142  9e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000335028  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2306  MATE efflux family protein  24.77 
 
 		 469 aa  142  9.999999999999999e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.30452  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0545  MATE efflux family protein  27.06 
 
 		 470 aa  139  8.999999999999999e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1199  MATE efflux family protein  26.97 
 
 		 450 aa  138  2e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0538393  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1579  MATE efflux family protein  26.68 
 
 		 445 aa  136  6.0000000000000005e-31  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0358  multi anti extrusion protein MatE  27.63 
 
 		 452 aa  136  7.000000000000001e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000377442  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1418  MATE efflux family protein  27.11 
 
 		 462 aa  133  7.999999999999999e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3129  MATE efflux family protein  27.03 
 
 		 452 aa  130  7.000000000000001e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1461  MATE efflux family protein  29.56 
 
 		 500 aa  128  2.0000000000000002e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04830  MATE efflux family protein  27.55 
 
 		 468 aa  125  2e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000202645  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09280  MATE efflux family protein  25.94 
 
 		 453 aa  122  9.999999999999999e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000476954  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1711  MATE efflux family protein  24.39 
 
 		 463 aa  122  9.999999999999999e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0339316  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1166  ABC transporter releated protein  27.41 
 
 		 463 aa  122  1.9999999999999998e-26  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.403976 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0828  MATE efflux family protein  28.78 
 
 		 438 aa  121  3e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.478729  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1895  MATE efflux family protein  25.49 
 
 		 498 aa  120  3.9999999999999996e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0835  MATE efflux family protein  28.78 
 
 		 438 aa  120  3.9999999999999996e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2458  MATE efflux family protein  27.88 
 
 		 500 aa  119  7e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.672094  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2295  MATE efflux family protein  26.29 
 
 		 475 aa  119  9.999999999999999e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00026572  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1936  MATE efflux family protein  27.06 
 
 		 486 aa  116  7.999999999999999e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1071  MATE efflux family protein  25.06 
 
 		 475 aa  115  1.0000000000000001e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05190  MATE efflux family protein  27.38 
 
 		 454 aa  113  6e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.969197  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2291  MATE efflux family protein  23.93 
 
 		 460 aa  110  4.0000000000000004e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2492  MATE efflux family protein  25.37 
 
 		 485 aa  110  5e-23  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.544481  normal  0.228664 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1808  MATE efflux family protein  24.46 
 
 		 499 aa  110  6e-23  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.848054  normal  0.460632 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3677  MATE efflux family protein  23.7 
 
 		 500 aa  110  6e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.380257  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2343  MATE efflux family protein  22.1 
 
 		 464 aa  107  3e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000000238189  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01896  predicted multidrug efflux system  26.29 
 
 		 547 aa  106  7e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0202846  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0931  MATE efflux family protein  25.77 
 
 		 448 aa  106  7e-22  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.102954  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01885  hypothetical protein  26.29 
 
 		 547 aa  106  7e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0187925  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2267  hypothetical protein  26.29 
 
 		 546 aa  106  9e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000010697  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0707  MATE efflux family protein  25.53 
 
 		 518 aa  105  1e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.376903  normal  0.476505 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1851  MATE efflux family protein  27.19 
 
 		 475 aa  105  1e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00783953  normal  0.201536 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1669  MATE efflux family protein  26.1 
 
 		 495 aa  105  2e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000135228  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05890  putative efflux protein, MATE family  22.2 
 
 		 472 aa  105  2e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2108  hypothetical protein  26.29 
 
 		 546 aa  105  2e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  6.24671e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1139  hypothetical protein  25.71 
 
 		 484 aa  105  2e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.0000000023845  hitchhiker  0.0000334983 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1659  hypothetical protein  25.49 
 
 		 495 aa  105  2e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.000000439345  normal  0.0451104 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0279  MATE efflux family protein  25 
 
 		 445 aa  104  3e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2829  hypothetical protein  26.04 
 
 		 484 aa  103  6e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.0000000399298  normal  0.437543 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6251  MATE efflux family protein  25.96 
 
 		 461 aa  103  6e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5035  MATE efflux family protein  24.1 
 
 		 469 aa  103  6e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.88746  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0014  MATE efflux family protein  27.21 
 
 		 453 aa  102  1e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.0029857  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3887  multi anti extrusion protein MatE  25.06 
 
 		 466 aa  102  2e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0845713 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0534  MATE efflux family protein  26.5 
 
 		 451 aa  102  2e-20  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0100  MATE efflux family protein  24.3 
 
 		 454 aa  102  2e-20  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0456451  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1907  MATE efflux family protein  25.62 
 
 		 457 aa  101  3e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0742597  normal  0.100602 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3059  MATE efflux family protein  22.84 
 
 		 469 aa  100  4e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.231532  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1529  MATE efflux family protein  23.08 
 
 		 554 aa  100  4e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.130898  normal  0.344827 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3296  MATE efflux family protein  22.84 
 
 		 469 aa  100  4e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.660304  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1353  MATE efflux family protein  26.65 
 
 		 453 aa  98.6  2e-19  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0427  MATE efflux family protein  23.13 
 
 		 446 aa  97.8  3e-19  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.744275  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0485  hypothetical protein  26.29 
 
 		 454 aa  97.4  4e-19  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0273971  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0147  MATE efflux family protein  24.94 
 
 		 462 aa  97.1  5e-19  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000317216  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3557  putative MATE efflux protein  22.89 
 
 		 469 aa  96.3  9e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.43043  normal  1 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3337  MATE efflux family protein  25.33 
 
 		 470 aa  95.9  1e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1641  MATE efflux family protein  24.82 
 
 		 469 aa  96.3  1e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.725642  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3120  MATE efflux family protein  23.53 
 
 		 461 aa  95.1  2e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.369114  normal  0.932515 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0906  MATE efflux family protein  24.64 
 
 		 448 aa  95.1  2e-18  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000766798  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2766  MATE efflux family protein  27.86 
 
 		 453 aa  95.1  2e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0984562  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4023  putative transporter  23.76 
 
 		 477 aa  94.7  3e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.343891  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0454  MATE efflux family protein  23.5 
 
 		 477 aa  94.7  3e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1419  MATE efflux family protein  22.38 
 
 		 469 aa  94.4  3e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.703884  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3585  MATE efflux family protein  25.38 
 
 		 472 aa  94.7  3e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2841  MATE efflux family protein  22.95 
 
 		 468 aa  94.4  4e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000678206  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1846  integral membrane protein, putative  23.02 
 
 		 469 aa  94.4  4e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.563684  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1504  hypothetical protein  24.21 
 
 		 502 aa  94.4  4e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.969676  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1309  MATE efflux family protein  24.3 
 
 		 538 aa  94.4  4e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2156  MATE efflux family protein  22.98 
 
 		 451 aa  94.4  4e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.540946 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46680  putative transporter  23.76 
 
 		 477 aa  94.4  4e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.013844  hitchhiker  0.0000129498 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2343  MATE efflux family protein  24.19 
 
 		 483 aa  94  5e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1899  putative MATE efflux protein  23.02 
 
 		 469 aa  93.6  6e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00227155  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1621  Na+ driven multidrug efflux pump  22.78 
 
 		 469 aa  93.6  7e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1591  Na+ driven multidrug efflux pump  22.78 
 
 		 469 aa  93.6  7e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.742873  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1823  putative MATE efflux protein  22.78 
 
 		 469 aa  93.6  7e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1694  hypothetical protein  26.89 
 
 		 474 aa  93.2  8e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.832751  normal  0.156755 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2504  hypothetical protein  26.89 
 
 		 474 aa  93.2  9e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0192343  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3419  MATE efflux family protein  26.65 
 
 		 504 aa  92.8  1e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2407  hypothetical protein  26.89 
 
 		 476 aa  92.4  1e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.149109  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0618  MATE efflux family protein  25 
 
 		 505 aa  92.8  1e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.316241  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2574  hypothetical protein  25.61 
 
 		 480 aa  92.4  2e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0900334 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3112  multidrug efflux protein  26.09 
 
 		 465 aa  92.4  2e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1670  MATE efflux family protein  23.67 
 
 		 466 aa  92  2e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1787  putative MATE efflux protein  23.37 
 
 		 469 aa  91.7  3e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0177  MATE efflux family protein  25.45 
 
 		 442 aa  91.3  3e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>