More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_2343 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013158  Huta_2343  MATE efflux family protein  100 
 
 		 483 aa  926    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1670  MATE efflux family protein  48.16 
 
 		 466 aa  390  1e-107  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2100  MATE efflux family protein  44.56 
 
 		 491 aa  269  8e-71  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.114433 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1461  MATE efflux family protein  31.84 
 
 		 500 aa  176  6e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2458  MATE efflux family protein  30.51 
 
 		 500 aa  175  9.999999999999999e-43  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.672094  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2591  MATE efflux family protein  34.75 
 
 		 525 aa  170  5e-41  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.677976  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1936  MATE efflux family protein  31.55 
 
 		 486 aa  164  3e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1338  MATE efflux family protein  32.51 
 
 		 481 aa  163  8.000000000000001e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04830  MATE efflux family protein  28.25 
 
 		 468 aa  160  4e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000202645  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1579  MATE efflux family protein  30.96 
 
 		 445 aa  155  2e-36  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3677  MATE efflux family protein  27.46 
 
 		 500 aa  154  5e-36  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.380257  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1309  MATE efflux family protein  29.19 
 
 		 538 aa  153  5.9999999999999996e-36  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2492  MATE efflux family protein  29.16 
 
 		 485 aa  150  6e-35  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.544481  normal  0.228664 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2439  MATE efflux family protein  29.23 
 
 		 485 aa  149  1.0000000000000001e-34  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.739641  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2358  MATE efflux family protein  27.88 
 
 		 467 aa  144  5e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1808  MATE efflux family protein  28.43 
 
 		 499 aa  142  9.999999999999999e-33  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.848054  normal  0.460632 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0147  MATE efflux family protein  24.44 
 
 		 462 aa  142  1.9999999999999998e-32  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000317216  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0545  MATE efflux family protein  26.75 
 
 		 470 aa  137  4e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2291  MATE efflux family protein  26.33 
 
 		 460 aa  135  9.999999999999999e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0747  MATE efflux family protein  28.28 
 
 		 490 aa  135  1.9999999999999998e-30  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1711  MATE efflux family protein  26.39 
 
 		 463 aa  134  3.9999999999999996e-30  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0339316  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0591  MATE efflux family protein  26.35 
 
 		 438 aa  134  5e-30  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05190  MATE efflux family protein  28.26 
 
 		 454 aa  131  2.0000000000000002e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.969197  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1851  MATE efflux family protein  26.61 
 
 		 475 aa  132  2.0000000000000002e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00783953  normal  0.201536 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1895  MATE efflux family protein  26.62 
 
 		 498 aa  131  3e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6251  MATE efflux family protein  25.62 
 
 		 461 aa  131  3e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2343  MATE efflux family protein  26.37 
 
 		 464 aa  130  4.0000000000000003e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000000238189  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0762  MATE efflux family protein  26.38 
 
 		 458 aa  130  5.0000000000000004e-29  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1071  MATE efflux family protein  25 
 
 		 475 aa  130  7.000000000000001e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3120  MATE efflux family protein  28.67 
 
 		 461 aa  129  1.0000000000000001e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.369114  normal  0.932515 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0100  MATE efflux family protein  26.24 
 
 		 454 aa  127  4.0000000000000003e-28  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0456451  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1529  MATE efflux family protein  27.71 
 
 		 554 aa  127  6e-28  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.130898  normal  0.344827 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0991  MATE efflux family protein  26.54 
 
 		 475 aa  127  6e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000156724  normal  0.091152 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3337  MATE efflux family protein  31.17 
 
 		 470 aa  126  1e-27  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1454  MATE efflux family protein  24.39 
 
 		 477 aa  125  2e-27  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0618  MATE efflux family protein  26.67 
 
 		 505 aa  125  2e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.316241  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0293  MATE efflux family protein  24.15 
 
 		 467 aa  124  5e-27  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0485  hypothetical protein  23.61 
 
 		 454 aa  124  5e-27  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0273971  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1180  MATE efflux family protein  24.52 
 
 		 455 aa  122  9.999999999999999e-27  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0707  MATE efflux family protein  26.59 
 
 		 518 aa  122  9.999999999999999e-27  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.376903  normal  0.476505 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0014  MATE efflux family protein  26.07 
 
 		 453 aa  122  9.999999999999999e-27  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.0029857  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0111  MATE efflux family protein  25.77 
 
 		 464 aa  120  4.9999999999999996e-26  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0113  MATE efflux family protein  26.17 
 
 		 464 aa  119  9e-26  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1541  MATE efflux family protein  31.7 
 
 		 486 aa  119  9.999999999999999e-26  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.127259  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1166  ABC transporter releated protein  24.38 
 
 		 463 aa  119  9.999999999999999e-26  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.403976 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0828  MATE efflux family protein  23.84 
 
 		 438 aa  118  1.9999999999999998e-25  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.478729  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0835  MATE efflux family protein  23.61 
 
 		 438 aa  117  3.9999999999999997e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3692  MATE efflux family protein  27.47 
 
 		 461 aa  115  1.0000000000000001e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000025823  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0055  MATE efflux family protein  26.26 
 
 		 446 aa  116  1.0000000000000001e-24  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0645  MATE efflux family protein  22.15 
 
 		 462 aa  115  2.0000000000000002e-24  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000346552  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0575  MATE efflux family protein  30.1 
 
 		 459 aa  115  2.0000000000000002e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000335028  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2295  MATE efflux family protein  26.15 
 
 		 475 aa  114  3e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00026572  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1353  MATE efflux family protein  23.04 
 
 		 453 aa  114  4.0000000000000004e-24  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1597  MATE efflux family protein  23.82 
 
 		 460 aa  114  4.0000000000000004e-24  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  3.36267e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2964  MATE efflux family protein  24.66 
 
 		 453 aa  113  7.000000000000001e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000632854  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1371  MATE efflux family protein  23.57 
 
 		 463 aa  112  1.0000000000000001e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3565  MATE efflux family protein  27.77 
 
 		 452 aa  111  2.0000000000000002e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0686  MATE efflux family protein  29.4 
 
 		 498 aa  110  5e-23  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.221481  normal  0.278001 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0906  MATE efflux family protein  25.34 
 
 		 448 aa  109  9.000000000000001e-23  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000766798  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2243  MATE efflux family protein  29.65 
 
 		 468 aa  109  1e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4055  MATE efflux family protein  29.22 
 
 		 483 aa  108  3e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0254154 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2306  MATE efflux family protein  25.93 
 
 		 469 aa  108  3e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.30452  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0316  MATE efflux family protein  24.19 
 
 		 444 aa  105  2e-21  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000262265  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1067  MATE efflux family protein  24.45 
 
 		 453 aa  105  2e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000154468  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3642  multi anti extrusion protein MatE  25 
 
 		 496 aa  104  4e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.104533  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1160  MATE efflux family protein  25.66 
 
 		 486 aa  103  6e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1138  MATE efflux family protein  24.79 
 
 		 450 aa  103  6e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000318212  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0381  MATE efflux family protein  23.23 
 
 		 451 aa  102  1e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00954667  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_16054  MOP(MATE) family transporter: multidrug efflux  27.51 
 
 		 443 aa  103  1e-20  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0679405  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3173  MATE efflux family protein  23.19 
 
 		 448 aa  102  2e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000170892  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0640  MATE efflux family protein  24.4 
 
 		 454 aa  100  5e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.690668  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2888  MATE efflux family protein  24.03 
 
 		 462 aa  100  6e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0238453  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0427  MATE efflux family protein  24.93 
 
 		 446 aa  99  2e-19  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.744275  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1199  MATE efflux family protein  24.52 
 
 		 450 aa  99  2e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0538393  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2333  MATE efflux family protein  27.79 
 
 		 456 aa  99  2e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4310  MATE efflux family protein  22.08 
 
 		 451 aa  98.6  2e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2612  MATE efflux family protein  25.81 
 
 		 459 aa  98.2  3e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05514  hypothetical protein  25.84 
 
 		 482 aa  98.2  3e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.957983  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1318  MATE efflux family protein  23.38 
 
 		 443 aa  96.3  1e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000101978  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3962  multi antimicrobial extrusion protein  24.84 
 
 		 492 aa  95.5  2e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.789789  normal  0.0338284 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0670  MATE efflux family protein  23.61 
 
 		 455 aa  95.1  2e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.358402  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1662  MATE efflux family protein  26.01 
 
 		 453 aa  95.5  2e-18  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.226136  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3710  MATE efflux family protein  23.61 
 
 		 455 aa  94.7  3e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.232724  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1252  MATE efflux family protein  24.15 
 
 		 445 aa  94.7  3e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000131388  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3175  MATE efflux family protein  24.78 
 
 		 468 aa  94.4  4e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.386097  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000109  adhesin  25.94 
 
 		 461 aa  94.4  4e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.466925  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0643  MATE efflux family protein  23.61 
 
 		 455 aa  94.7  4e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0666  MATE efflux family protein  23.61 
 
 		 455 aa  94.4  4e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09280  MATE efflux family protein  21.33 
 
 		 453 aa  94.4  5e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000476954  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3762  MATE efflux family protein  22.5 
 
 		 442 aa  94  5e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000783437  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02728  MATE efflux family protein  22.76 
 
 		 460 aa  93.6  7e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0324679  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2205  hypothetical protein  27.82 
 
 		 480 aa  93.6  7e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.891807 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0308  MATE efflux family protein  24.46 
 
 		 441 aa  93.6  8e-18  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.426716  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1409  MATE efflux family protein  22.92 
 
 		 460 aa  93.6  8e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.851568  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3319  MATE efflux family protein  21.63 
 
 		 460 aa  92.8  1e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00330578  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3662  MATE efflux family protein  24.04 
 
 		 476 aa  92.8  1e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.000000389251  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0702  MATE efflux family protein  24.49 
 
 		 452 aa  92  2e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003772  Na+ driven multidrug efflux pump  23.7 
 
 		 458 aa  92  2e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3569  MATE efflux family protein  27.31 
 
 		 452 aa  92  2e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0796958  normal  0.0492062 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1218  Na+ driven multidrug efflux pump  23.11 
 
 		 464 aa  91.7  3e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.530621  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>