More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_16054 on replicon NC_009361
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009361  OSTLU_16054  MOP(MATE) family transporter: multidrug efflux  100 
 
 
443 aa  889    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0679405  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0100  MATE efflux family protein  26.33 
 
 
454 aa  133  6e-30  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0456451  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0835  MATE efflux family protein  26.02 
 
 
438 aa  123  6e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0828  MATE efflux family protein  26.02 
 
 
438 aa  122  9.999999999999999e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.478729  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0147  MATE efflux family protein  26.46 
 
 
462 aa  121  1.9999999999999998e-26  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000317216  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2291  MATE efflux family protein  23.86 
 
 
460 aa  122  1.9999999999999998e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1936  MATE efflux family protein  27.4 
 
 
486 aa  115  1.0000000000000001e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2492  MATE efflux family protein  27.66 
 
 
485 aa  115  1.0000000000000001e-24  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.544481  normal  0.228664 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1338  MATE efflux family protein  27.13 
 
 
481 aa  114  3e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0906  MATE efflux family protein  25 
 
 
448 aa  113  8.000000000000001e-24  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000766798  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2458  MATE efflux family protein  25.21 
 
 
500 aa  112  1.0000000000000001e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.672094  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2591  MATE efflux family protein  26.92 
 
 
525 aa  110  4.0000000000000004e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.677976  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2358  MATE efflux family protein  25.75 
 
 
467 aa  110  5e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1922  MATE efflux family protein  24.66 
 
 
456 aa  108  2e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2533  multi anti extrusion protein MatE  25.36 
 
 
447 aa  107  6e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000103349  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1711  MATE efflux family protein  24.34 
 
 
463 aa  107  6e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0339316  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0113  MATE efflux family protein  21.98 
 
 
464 aa  105  1e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0111  MATE efflux family protein  21.88 
 
 
464 aa  106  1e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0991  MATE efflux family protein  24.43 
 
 
475 aa  103  7e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000156724  normal  0.091152 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1461  MATE efflux family protein  25.28 
 
 
500 aa  102  1e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0762  MATE efflux family protein  26.85 
 
 
458 aa  102  2e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3815  MATE efflux family protein  25.44 
 
 
467 aa  100  5e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.142559  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3337  MATE efflux family protein  27.67 
 
 
470 aa  99.8  8e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3677  MATE efflux family protein  24.45 
 
 
500 aa  99.8  9e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.380257  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1808  MATE efflux family protein  26.34 
 
 
499 aa  99.4  1e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.848054  normal  0.460632 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2243  MATE efflux family protein  26.68 
 
 
468 aa  99.8  1e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04830  MATE efflux family protein  24.08 
 
 
468 aa  98.2  2e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000202645  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2343  MATE efflux family protein  27.16 
 
 
483 aa  98.2  2e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1597  MATE efflux family protein  22.82 
 
 
460 aa  97.4  4e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  3.36267e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1895  MATE efflux family protein  25.05 
 
 
498 aa  97.1  6e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2439  MATE efflux family protein  24.64 
 
 
485 aa  96.7  8e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.739641  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2295  MATE efflux family protein  26.53 
 
 
475 aa  96.3  9e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00026572  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0534  MATE efflux family protein  23.72 
 
 
451 aa  95.5  2e-18  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0707  MATE efflux family protein  27.23 
 
 
518 aa  93.2  7e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.376903  normal  0.476505 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1180  MATE efflux family protein  24.13 
 
 
455 aa  93.6  7e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09280  MATE efflux family protein  23.6 
 
 
453 aa  92.8  1e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000476954  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1371  MATE efflux family protein  24.78 
 
 
463 aa  91.7  2e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4055  MATE efflux family protein  25.47 
 
 
483 aa  90.1  6e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0254154 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1199  MATE efflux family protein  22.17 
 
 
450 aa  89  1e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0538393  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05190  MATE efflux family protein  23.52 
 
 
454 aa  89  2e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.969197  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1166  ABC transporter releated protein  23.41 
 
 
463 aa  89  2e-16  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.403976 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2612  MATE efflux family protein  29.72 
 
 
459 aa  87.8  3e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1309  MATE efflux family protein  24.04 
 
 
538 aa  87.8  3e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5035  MATE efflux family protein  25 
 
 
469 aa  87.4  4e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.88746  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0358  multi anti extrusion protein MatE  25.81 
 
 
452 aa  86.7  7e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000377442  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4400  MATE efflux family protein  25.81 
 
 
453 aa  86.3  0.000000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0121801  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0299  MATE efflux family protein  23.85 
 
 
456 aa  85.1  0.000000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000180901  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1454  MATE efflux family protein  23.15 
 
 
477 aa  84.7  0.000000000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2343  MATE efflux family protein  23.36 
 
 
464 aa  84.7  0.000000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000000238189  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3129  MATE efflux family protein  25.81 
 
 
452 aa  83.6  0.000000000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2060  MATE efflux family protein  23.57 
 
 
456 aa  82.8  0.00000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000022927  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1541  MATE efflux family protein  25.43 
 
 
486 aa  82.4  0.00000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.127259  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2237  MATE efflux family protein  27.31 
 
 
469 aa  82.4  0.00000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000615121  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3126  MATE efflux family protein  27.05 
 
 
455 aa  82.4  0.00000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.113083  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3492  integral membrane protein  25.23 
 
 
485 aa  81.3  0.00000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0396785  normal  0.244149 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0618  MATE efflux family protein  23.4 
 
 
505 aa  81.6  0.00000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.316241  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0784  MATE efflux family protein  24.12 
 
 
460 aa  80.1  0.00000000000008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1071  MATE efflux family protein  24.53 
 
 
475 aa  79.7  0.0000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1106  MATE efflux family protein  23.53 
 
 
464 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000560081  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1088  efflux protein  23.53 
 
 
464 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000024435  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1196  MATE efflux family protein  23.53 
 
 
464 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000655029  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3691  MATE efflux family protein  26.03 
 
 
453 aa  78.6  0.0000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.830643  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0485  hypothetical protein  24.57 
 
 
454 aa  78.2  0.0000000000002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0273971  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1343  MATE efflux family protein  23.53 
 
 
464 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00000317655  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3886  MATE efflux family protein  28.09 
 
 
481 aa  78.2  0.0000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1082  efflux protein  23.53 
 
 
464 aa  78.2  0.0000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000125629  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0747  MATE efflux family protein  23.81 
 
 
490 aa  78.2  0.0000000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1529  MATE efflux family protein  22.2 
 
 
554 aa  78.2  0.0000000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.130898  normal  0.344827 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1579  MATE efflux family protein  23.52 
 
 
445 aa  77.8  0.0000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1058  MATE efflux family protein  22.77 
 
 
453 aa  77.8  0.0000000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1670  MATE efflux family protein  26.14 
 
 
466 aa  77.8  0.0000000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0998  MATE efflux family protein  26.25 
 
 
500 aa  77.4  0.0000000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.280475  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2333  MATE efflux family protein  27.38 
 
 
456 aa  77  0.0000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1239  MATE efflux family protein  23.29 
 
 
464 aa  77  0.0000000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.238085  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3962  multi antimicrobial extrusion protein  25.95 
 
 
492 aa  77  0.0000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.789789  normal  0.0338284 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1171  MATE efflux family protein  23.33 
 
 
457 aa  76.6  0.0000000000008  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1266  MATE efflux family protein  23.29 
 
 
464 aa  76.3  0.000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1305  MATE efflux family protein  23.29 
 
 
464 aa  76.3  0.000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.40401  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4103  Na+ driven multidrug efflux pump  24.29 
 
 
463 aa  75.9  0.000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0660054  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3542  MATE efflux family protein  26.77 
 
 
467 aa  75.9  0.000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.179333 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0908  multi anti extrusion protein MatE  26.16 
 
 
483 aa  75.9  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0522974  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1094  MATE efflux family protein  23.29 
 
 
464 aa  76.3  0.000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000923462  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1418  MATE efflux family protein  26.05 
 
 
462 aa  75.5  0.000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0014  MATE efflux family protein  20.57 
 
 
453 aa  75.1  0.000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.0029857  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3642  multi anti extrusion protein MatE  24.61 
 
 
496 aa  75.5  0.000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.104533  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4310  MATE efflux family protein  25.6 
 
 
451 aa  74.7  0.000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1053  MATE efflux family protein  21.9 
 
 
462 aa  74.7  0.000000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  1.2115099999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0901  MATE efflux family protein  22.2 
 
 
463 aa  74.3  0.000000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000627796  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0670  MATE efflux family protein  23.7 
 
 
455 aa  74.3  0.000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.358402  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3710  MATE efflux family protein  23.7 
 
 
455 aa  74.3  0.000000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.232724  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0055  MATE efflux family protein  25.91 
 
 
446 aa  73.9  0.000000000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1654  MATE efflux family protein  24.61 
 
 
473 aa  73.9  0.000000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0643  MATE efflux family protein  23.7 
 
 
455 aa  73.9  0.000000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1166  MATE efflux family protein  23.06 
 
 
460 aa  73.9  0.000000000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2306  MATE efflux family protein  24.86 
 
 
469 aa  73.9  0.000000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.30452  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1509  MATE efflux family protein  23.94 
 
 
460 aa  73.6  0.000000000007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.712333  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0470  MATE efflux family protein  25.93 
 
 
455 aa  73.2  0.000000000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.11231  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1067  MATE efflux family protein  23.81 
 
 
453 aa  73.2  0.000000000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000154468  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0666  MATE efflux family protein  23.38 
 
 
455 aa  72.8  0.00000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6251  MATE efflux family protein  24.04 
 
 
461 aa  73.2  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>