More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_3542 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_3542  MATE efflux family protein  100 
 
 		 467 aa  881    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.179333 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3694  MATE efflux family protein  79.39 
 
 		 472 aa  649    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0048  MATE efflux family protein  59.78 
 
 		 460 aa  459  9.999999999999999e-129  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.782578  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5998  MATE efflux family protein  58.02 
 
 		 486 aa  455  1e-127  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.926416 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0048  MATE efflux family protein  61.35 
 
 		 460 aa  446  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0386984 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4118  MATE efflux family protein  60.45 
 
 		 468 aa  415  9.999999999999999e-116  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3795  MATE efflux family protein  60 
 
 		 468 aa  412  1e-114  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.195288  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3317  MATE efflux family protein  52.44 
 
 		 469 aa  381  1e-104  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2205  hypothetical protein  49.14 
 
 		 480 aa  343  2.9999999999999997e-93  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.891807 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1675  MATE efflux family protein  45.89 
 
 		 457 aa  309  6.999999999999999e-83  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3623  MATE efflux family protein  43.41 
 
 		 457 aa  306  5.0000000000000004e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.25462  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1345  multi anti extrusion protein MatE  46.65 
 
 		 459 aa  304  2.0000000000000002e-81  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0796  multi anti extrusion protein MatE  41.63 
 
 		 484 aa  298  1e-79  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.505075 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0908  multi anti extrusion protein MatE  39.46 
 
 		 483 aa  295  1e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0522974  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1888  MATE efflux family protein  45.21 
 
 		 457 aa  293  5e-78  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5248  multi antimicrobial extrusion protein MatE  40.27 
 
 		 478 aa  286  7e-76  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0771  putative cation-driven multidrug efflux pump  42.01 
 
 		 485 aa  256  6e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00132131 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3218  multi anti extrusion protein MatE  38.48 
 
 		 455 aa  217  5e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3060  multi anti extrusion protein MatE  38.98 
 
 		 456 aa  204  2e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.147245  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2291  MATE efflux family protein  30.08 
 
 		 460 aa  182  9.000000000000001e-45  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0404  MATE efflux family protein  29.03 
 
 		 457 aa  132  2.0000000000000002e-29  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.294226 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04830  MATE efflux family protein  26.23 
 
 		 468 aa  130  4.0000000000000003e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000202645  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2626  MATE efflux family protein  31.77 
 
 		 467 aa  130  6e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.287795  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2827  MATE efflux family protein  29.04 
 
 		 451 aa  129  9.000000000000001e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.658448  normal  0.32606 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0702  MATE efflux family protein  29.06 
 
 		 452 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0147  MATE efflux family protein  24.56 
 
 		 462 aa  128  2.0000000000000002e-28  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000317216  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3337  MATE efflux family protein  30.55 
 
 		 470 aa  127  4.0000000000000003e-28  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3691  MATE efflux family protein  28.1 
 
 		 453 aa  125  1e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.830643  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2964  MATE efflux family protein  29.21 
 
 		 453 aa  125  1e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000632854  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4310  MATE efflux family protein  27.62 
 
 		 451 aa  125  2e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05190  MATE efflux family protein  28.75 
 
 		 454 aa  124  4e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.969197  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1166  ABC transporter releated protein  27.79 
 
 		 463 aa  124  4e-27  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.403976 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0643  MATE efflux family protein  29.06 
 
 		 455 aa  124  4e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0666  MATE efflux family protein  30.09 
 
 		 455 aa  124  5e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0670  MATE efflux family protein  28.81 
 
 		 455 aa  123  7e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.358402  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3710  MATE efflux family protein  29.86 
 
 		 455 aa  123  7e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.232724  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0470  MATE efflux family protein  28.29 
 
 		 455 aa  123  7e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.11231  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1936  MATE efflux family protein  30 
 
 		 486 aa  120  3.9999999999999996e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3399  MATE efflux family protein  29.59 
 
 		 452 aa  120  3.9999999999999996e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00107141 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0553  MATE efflux family protein  29.59 
 
 		 452 aa  120  4.9999999999999996e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.136219 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3569  MATE efflux family protein  30 
 
 		 452 aa  119  7.999999999999999e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0796958  normal  0.0492062 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2888  MATE efflux family protein  30.33 
 
 		 462 aa  119  1.9999999999999998e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0238453  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0640  MATE efflux family protein  26.39 
 
 		 454 aa  118  1.9999999999999998e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.690668  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3126  MATE efflux family protein  28.67 
 
 		 455 aa  119  1.9999999999999998e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.113083  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0091  MATE efflux family protein  29.34 
 
 		 454 aa  117  5e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2508  multi anti extrusion protein MatE  30.41 
 
 		 463 aa  116  1.0000000000000001e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2653  MATE efflux family protein  30.28 
 
 		 484 aa  115  2.0000000000000002e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0699  MATE efflux family protein  31.22 
 
 		 456 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0250563  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4033  MATE efflux family protein  27.62 
 
 		 458 aa  114  3e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000078929 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3662  MATE efflux family protein  26.38 
 
 		 476 aa  114  4.0000000000000004e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.000000389251  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3948  MATE efflux family protein  26.89 
 
 		 458 aa  113  8.000000000000001e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02728  MATE efflux family protein  27.67 
 
 		 460 aa  112  2.0000000000000002e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0324679  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1579  MATE efflux family protein  28.14 
 
 		 445 aa  111  3e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2315  MATE efflux family protein  26.33 
 
 		 470 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.1458  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0420  MATE efflux family protein  27.74 
 
 		 459 aa  110  7.000000000000001e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000768677  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2492  MATE efflux family protein  28.75 
 
 		 485 aa  107  3e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.544481  normal  0.228664 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0906  MATE efflux family protein  24.24 
 
 		 448 aa  107  5e-22  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000766798  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0545  MATE efflux family protein  26.99 
 
 		 470 aa  106  1e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2612  MATE efflux family protein  26.4 
 
 		 459 aa  105  1e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6251  MATE efflux family protein  26.28 
 
 		 461 aa  105  1e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2295  MATE efflux family protein  27 
 
 		 475 aa  104  4e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00026572  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1338  MATE efflux family protein  29.82 
 
 		 481 aa  103  5e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00144  multidrug efflux pump  28.61 
 
 		 456 aa  103  6e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1461  MATE efflux family protein  27.01 
 
 		 500 aa  103  7e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1925  MATE efflux family protein  25.45 
 
 		 455 aa  101  4e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.16171  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2591  MATE efflux family protein  28.38 
 
 		 525 aa  100  6e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.677976  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0100  MATE efflux family protein  26.57 
 
 		 454 aa  100  6e-20  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0456451  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0707  MATE efflux family protein  26.18 
 
 		 518 aa  99.4  1e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.376903  normal  0.476505 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1180  MATE efflux family protein  24.17 
 
 		 455 aa  98.2  3e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0747  MATE efflux family protein  27.65 
 
 		 490 aa  96.3  1e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1529  MATE efflux family protein  26.71 
 
 		 554 aa  96.3  1e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.130898  normal  0.344827 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0784  MATE efflux family protein  28.2 
 
 		 460 aa  95.9  1e-18  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1851  MATE efflux family protein  26.42 
 
 		 475 aa  95.1  2e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00783953  normal  0.201536 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2244  hypothetical protein  29.69 
 
 		 460 aa  95.5  2e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2343  MATE efflux family protein  25.94 
 
 		 464 aa  94.7  3e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000000238189  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1808  MATE efflux family protein  24.39 
 
 		 499 aa  95.1  3e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.848054  normal  0.460632 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2458  MATE efflux family protein  25.45 
 
 		 500 aa  94.4  4e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.672094  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0012  MATE efflux family protein  28.76 
 
 		 477 aa  94.4  4e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00000348389  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1454  MATE efflux family protein  25.2 
 
 		 477 aa  94.4  4e-18  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2841  MATE efflux family protein  24.25 
 
 		 468 aa  94.4  4e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000678206  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2544  MATE efflux family protein  24.18 
 
 		 455 aa  93.6  7e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0743  MATE efflux family protein  26.78 
 
 		 454 aa  92.8  1e-17  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000193663  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3175  MATE efflux family protein  23.99 
 
 		 468 aa  92.8  1e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.386097  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2859  MATE efflux family protein  24.18 
 
 		 455 aa  93.2  1e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1071  MATE efflux family protein  25.53 
 
 		 475 aa  92.8  1e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1597  MATE efflux family protein  23.16 
 
 		 460 aa  92.8  1e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  3.36267e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3120  MATE efflux family protein  27.11 
 
 		 461 aa  90.9  4e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.369114  normal  0.932515 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0113  MATE efflux family protein  24.32 
 
 		 464 aa  90.5  5e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1334  MATE efflux family protein  29.81 
 
 		 478 aa  90.9  5e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.402123  normal  0.231405 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1166  MATE efflux family protein  28.29 
 
 		 460 aa  90.5  6e-17  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0111  MATE efflux family protein  24.32 
 
 		 464 aa  90.5  6e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0313  hypothetical protein  26.95 
 
 		 455 aa  89.7  9e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00088835  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02151  multi antimicrobial extrusion family protein  30.51 
 
 		 503 aa  89.4  1e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1509  MATE efflux family protein  26.97 
 
 		 460 aa  88.6  2e-16  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.712333  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1171  MATE efflux family protein  28.38 
 
 		 457 aa  89  2e-16  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1160  MATE efflux family protein  27.46 
 
 		 486 aa  89  2e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1309  MATE efflux family protein  27 
 
 		 538 aa  88.6  2e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2636  integral membrane protein  25.41 
 
 		 478 aa  88.2  3e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.117345 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3799  Fis family transcriptional regulator  29.43 
 
 		 440 aa  87.8  4e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.732609  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3395  MATE efflux family protein  23.67 
 
 		 461 aa  87  6e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>