More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_0048 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_0048  MATE efflux family protein  100 
 
 		 460 aa  834    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0386984 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0048  MATE efflux family protein  83.48 
 
 		 460 aa  669    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.782578  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5998  MATE efflux family protein  66.29 
 
 		 486 aa  506  9.999999999999999e-143  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.926416 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3542  MATE efflux family protein  61.35 
 
 		 467 aa  466  9.999999999999999e-131  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.179333 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3795  MATE efflux family protein  64.27 
 
 		 468 aa  440  9.999999999999999e-123  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.195288  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4118  MATE efflux family protein  63.58 
 
 		 468 aa  441  9.999999999999999e-123  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3694  MATE efflux family protein  60.58 
 
 		 472 aa  434  1e-120  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3317  MATE efflux family protein  46.54 
 
 		 469 aa  335  7.999999999999999e-91  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2205  hypothetical protein  47.15 
 
 		 480 aa  314  1.9999999999999998e-84  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.891807 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1345  multi anti extrusion protein MatE  45.66 
 
 		 459 aa  292  9e-78  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0796  multi anti extrusion protein MatE  40.78 
 
 		 484 aa  263  3e-69  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.505075 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3623  MATE efflux family protein  42.08 
 
 		 457 aa  263  4.999999999999999e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.25462  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1675  MATE efflux family protein  40.59 
 
 		 457 aa  259  6e-68  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5248  multi antimicrobial extrusion protein MatE  39.1 
 
 		 478 aa  259  7e-68  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0908  multi anti extrusion protein MatE  37.25 
 
 		 483 aa  252  8.000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0522974  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1888  MATE efflux family protein  42.18 
 
 		 457 aa  249  6e-65  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3218  multi anti extrusion protein MatE  41.4 
 
 		 455 aa  230  4e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0771  putative cation-driven multidrug efflux pump  39.33 
 
 		 485 aa  228  2e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00132131 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3060  multi anti extrusion protein MatE  41.76 
 
 		 456 aa  207  5e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.147245  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2291  MATE efflux family protein  32.01 
 
 		 460 aa  187  5e-46  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0666  MATE efflux family protein  29 
 
 		 455 aa  133  7.999999999999999e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0643  MATE efflux family protein  28.77 
 
 		 455 aa  132  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0670  MATE efflux family protein  28.54 
 
 		 455 aa  131  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.358402  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3710  MATE efflux family protein  28.54 
 
 		 455 aa  131  3e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.232724  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0470  MATE efflux family protein  30.54 
 
 		 455 aa  130  6e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.11231  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4033  MATE efflux family protein  28.89 
 
 		 458 aa  128  3e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000078929 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0147  MATE efflux family protein  27.12 
 
 		 462 aa  127  3e-28  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000317216  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0702  MATE efflux family protein  27.59 
 
 		 452 aa  127  5e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4310  MATE efflux family protein  27.97 
 
 		 451 aa  127  5e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3126  MATE efflux family protein  30.91 
 
 		 455 aa  126  6e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.113083  normal  1 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3337  MATE efflux family protein  31.03 
 
 		 470 aa  126  7e-28  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3948  MATE efflux family protein  27.9 
 
 		 458 aa  124  5e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1936  MATE efflux family protein  30.04 
 
 		 486 aa  121  3e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0404  MATE efflux family protein  29.88 
 
 		 457 aa  120  3.9999999999999996e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.294226 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0640  MATE efflux family protein  27.51 
 
 		 454 aa  120  3.9999999999999996e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.690668  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2508  multi anti extrusion protein MatE  30.58 
 
 		 463 aa  120  4.9999999999999996e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0113  MATE efflux family protein  26.8 
 
 		 464 aa  120  7e-26  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05190  MATE efflux family protein  26.53 
 
 		 454 aa  120  7e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.969197  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0111  MATE efflux family protein  26.74 
 
 		 464 aa  119  7.999999999999999e-26  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2653  MATE efflux family protein  32.39 
 
 		 484 aa  119  9e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0420  MATE efflux family protein  28.86 
 
 		 459 aa  119  9.999999999999999e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000768677  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2964  MATE efflux family protein  28.8 
 
 		 453 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000632854  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1579  MATE efflux family protein  28.54 
 
 		 445 aa  117  3.9999999999999997e-25  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0553  MATE efflux family protein  27.94 
 
 		 452 aa  117  6e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.136219 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3399  MATE efflux family protein  27.94 
 
 		 452 aa  116  8.999999999999998e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00107141 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3662  MATE efflux family protein  27.01 
 
 		 476 aa  114  5e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.000000389251  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3569  MATE efflux family protein  27.7 
 
 		 452 aa  113  6e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0796958  normal  0.0492062 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2315  MATE efflux family protein  30.92 
 
 		 470 aa  113  6e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.1458  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3691  MATE efflux family protein  27 
 
 		 453 aa  113  8.000000000000001e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.830643  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2295  MATE efflux family protein  28.54 
 
 		 475 aa  113  8.000000000000001e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00026572  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2492  MATE efflux family protein  28.6 
 
 		 485 aa  112  1.0000000000000001e-23  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.544481  normal  0.228664 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1166  ABC transporter releated protein  27.53 
 
 		 463 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.403976 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02728  MATE efflux family protein  30.19 
 
 		 460 aa  112  2.0000000000000002e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0324679  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00144  multidrug efflux pump  27.36 
 
 		 456 aa  110  4.0000000000000004e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1461  MATE efflux family protein  28.69 
 
 		 500 aa  110  4.0000000000000004e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04830  MATE efflux family protein  25.38 
 
 		 468 aa  110  5e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000202645  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2888  MATE efflux family protein  28.08 
 
 		 462 aa  110  6e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0238453  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2343  MATE efflux family protein  26.15 
 
 		 464 aa  109  1e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000000238189  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6251  MATE efflux family protein  26.96 
 
 		 461 aa  108  2e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2626  MATE efflux family protein  30.08 
 
 		 467 aa  107  5e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.287795  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0699  MATE efflux family protein  27.15 
 
 		 456 aa  107  6e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0250563  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0707  MATE efflux family protein  26.82 
 
 		 518 aa  106  8e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.376903  normal  0.476505 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2458  MATE efflux family protein  27.66 
 
 		 500 aa  106  1e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.672094  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1808  MATE efflux family protein  26.35 
 
 		 499 aa  103  4e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.848054  normal  0.460632 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2591  MATE efflux family protein  30.44 
 
 		 525 aa  102  1e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.677976  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0100  MATE efflux family protein  26.01 
 
 		 454 aa  101  3e-20  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0456451  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1338  MATE efflux family protein  30.43 
 
 		 481 aa  101  3e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2612  MATE efflux family protein  24.92 
 
 		 459 aa  101  3e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0091  MATE efflux family protein  26.26 
 
 		 454 aa  100  5e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1529  MATE efflux family protein  27.68 
 
 		 554 aa  99.4  1e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.130898  normal  0.344827 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1597  MATE efflux family protein  22.03 
 
 		 460 aa  96.7  7e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  3.36267e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2827  MATE efflux family protein  26.23 
 
 		 451 aa  97.1  7e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.658448  normal  0.32606 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1925  MATE efflux family protein  26.47 
 
 		 455 aa  96.7  8e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.16171  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0743  MATE efflux family protein  26.21 
 
 		 454 aa  95.9  1e-18  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000193663  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0747  MATE efflux family protein  28.6 
 
 		 490 aa  95.1  2e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2244  hypothetical protein  27.29 
 
 		 460 aa  95.9  2e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2636  integral membrane protein  27.68 
 
 		 478 aa  95.1  2e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.117345 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0381  MATE efflux family protein  23.89 
 
 		 451 aa  95.1  2e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00954667  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1409  MATE efflux family protein  25.32 
 
 		 460 aa  94.4  4e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.851568  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0906  MATE efflux family protein  24.12 
 
 		 448 aa  93.6  7e-18  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000766798  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2358  MATE efflux family protein  26.63 
 
 		 467 aa  92.8  1e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1654  MATE efflux family protein  29.07 
 
 		 473 aa  91.7  2e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3395  MATE efflux family protein  24.22 
 
 		 461 aa  92.4  2e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1895  MATE efflux family protein  26.87 
 
 		 498 aa  91.7  3e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002223  Na+-driven multidrug efflux pump  27.79 
 
 		 428 aa  91.3  3e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.851646  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0545  MATE efflux family protein  25.17 
 
 		 470 aa  90.1  7e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1218  Na+ driven multidrug efflux pump  25.82 
 
 		 464 aa  90.1  7e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.530621  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1309  MATE efflux family protein  27.29 
 
 		 538 aa  90.1  8e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1180  MATE efflux family protein  23.56 
 
 		 455 aa  89.4  1e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1359  multi anti extrusion protein MatE  24.82 
 
 		 408 aa  89  2e-16  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0784  MATE efflux family protein  27.24 
 
 		 460 aa  88.2  3e-16  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3120  MATE efflux family protein  24.81 
 
 		 461 aa  88.2  3e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.369114  normal  0.932515 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3642  multi anti extrusion protein MatE  29.32 
 
 		 496 aa  87.4  4e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.104533  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1171  MATE efflux family protein  27.9 
 
 		 457 aa  87  7e-16  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3962  multi antimicrobial extrusion protein  26.46 
 
 		 492 aa  85.9  0.000000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.789789  normal  0.0338284 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2060  MATE efflux family protein  23.21 
 
 		 456 aa  86.3  0.000000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000022927  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1166  MATE efflux family protein  27.01 
 
 		 460 aa  85.9  0.000000000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0931  MATE efflux family protein  23.77 
 
 		 448 aa  85.1  0.000000000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.102954  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1454  MATE efflux family protein  26.63 
 
 		 477 aa  85.9  0.000000000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1509  MATE efflux family protein  26.37 
 
 		 460 aa  85.5  0.000000000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.712333  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>