More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_5998 on replicon NC_010510
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010510  Mrad2831_5998  MATE efflux family protein  100 
 
 		 486 aa  894    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.926416 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4118  MATE efflux family protein  80.86 
 
 		 468 aa  610  1e-173  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3795  MATE efflux family protein  79.74 
 
 		 468 aa  602  1.0000000000000001e-171  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.195288  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0048  MATE efflux family protein  65.13 
 
 		 460 aa  508  9.999999999999999e-143  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.782578  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0048  MATE efflux family protein  66.29 
 
 		 460 aa  495  1e-139  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0386984 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3542  MATE efflux family protein  59.07 
 
 		 467 aa  462  1e-129  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.179333 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3694  MATE efflux family protein  57.05 
 
 		 472 aa  424  1e-117  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3317  MATE efflux family protein  45.86 
 
 		 469 aa  324  2e-87  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2205  hypothetical protein  44.5 
 
 		 480 aa  314  1.9999999999999998e-84  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.891807 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1345  multi anti extrusion protein MatE  45.66 
 
 		 459 aa  296  6e-79  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3623  MATE efflux family protein  42.12 
 
 		 457 aa  269  7e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.25462  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1675  MATE efflux family protein  42.21 
 
 		 457 aa  261  1e-68  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1888  MATE efflux family protein  41.04 
 
 		 457 aa  259  8e-68  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0796  multi anti extrusion protein MatE  38.22 
 
 		 484 aa  251  2e-65  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.505075 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5248  multi antimicrobial extrusion protein MatE  38.22 
 
 		 478 aa  244  1.9999999999999999e-63  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0908  multi anti extrusion protein MatE  37.21 
 
 		 483 aa  239  5.999999999999999e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0522974  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0771  putative cation-driven multidrug efflux pump  39.51 
 
 		 485 aa  224  4e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00132131 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3218  multi anti extrusion protein MatE  39.95 
 
 		 455 aa  202  8e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3060  multi anti extrusion protein MatE  39.29 
 
 		 456 aa  183  7e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.147245  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2291  MATE efflux family protein  28.25 
 
 		 460 aa  163  7e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0404  MATE efflux family protein  29.36 
 
 		 457 aa  120  7.999999999999999e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.294226 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3337  MATE efflux family protein  28.82 
 
 		 470 aa  119  1.9999999999999998e-25  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2964  MATE efflux family protein  30.6 
 
 		 453 aa  116  1.0000000000000001e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000632854  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1579  MATE efflux family protein  26.92 
 
 		 445 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04830  MATE efflux family protein  25.75 
 
 		 468 aa  115  2.0000000000000002e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000202645  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0470  MATE efflux family protein  27.55 
 
 		 455 aa  114  3e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.11231  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3126  MATE efflux family protein  29.19 
 
 		 455 aa  114  3e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.113083  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0702  MATE efflux family protein  26.82 
 
 		 452 aa  113  6e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4310  MATE efflux family protein  26.6 
 
 		 451 aa  113  8.000000000000001e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2508  multi anti extrusion protein MatE  28.04 
 
 		 463 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0640  MATE efflux family protein  26.36 
 
 		 454 aa  111  4.0000000000000004e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.690668  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0111  MATE efflux family protein  25.96 
 
 		 464 aa  110  4.0000000000000004e-23  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0113  MATE efflux family protein  25.96 
 
 		 464 aa  110  5e-23  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3710  MATE efflux family protein  27.48 
 
 		 455 aa  110  5e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.232724  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0666  MATE efflux family protein  27.48 
 
 		 455 aa  110  7.000000000000001e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1461  MATE efflux family protein  29.89 
 
 		 500 aa  110  7.000000000000001e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0643  MATE efflux family protein  27.48 
 
 		 455 aa  109  9.000000000000001e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2653  MATE efflux family protein  29.62 
 
 		 484 aa  109  1e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1338  MATE efflux family protein  30.68 
 
 		 481 aa  108  1e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0670  MATE efflux family protein  27.25 
 
 		 455 aa  109  1e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.358402  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3662  MATE efflux family protein  27.13 
 
 		 476 aa  109  1e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.000000389251  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05190  MATE efflux family protein  25.87 
 
 		 454 aa  108  2e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.969197  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0147  MATE efflux family protein  23.68 
 
 		 462 aa  108  2e-22  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000317216  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4033  MATE efflux family protein  28.43 
 
 		 458 aa  108  2e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000078929 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2492  MATE efflux family protein  29.6 
 
 		 485 aa  108  3e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.544481  normal  0.228664 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3948  MATE efflux family protein  28 
 
 		 458 aa  106  1e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2612  MATE efflux family protein  28.98 
 
 		 459 aa  104  3e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1936  MATE efflux family protein  27.63 
 
 		 486 aa  104  3e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1529  MATE efflux family protein  27.05 
 
 		 554 aa  103  8e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.130898  normal  0.344827 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2888  MATE efflux family protein  26.26 
 
 		 462 aa  103  9e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0238453  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0091  MATE efflux family protein  27.22 
 
 		 454 aa  101  2e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00144  multidrug efflux pump  26.97 
 
 		 456 aa  102  2e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2591  MATE efflux family protein  28.39 
 
 		 525 aa  102  2e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.677976  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0553  MATE efflux family protein  27.45 
 
 		 452 aa  101  2e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.136219 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2315  MATE efflux family protein  28.25 
 
 		 470 aa  101  2e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.1458  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2458  MATE efflux family protein  28.12 
 
 		 500 aa  101  3e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.672094  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3399  MATE efflux family protein  27.21 
 
 		 452 aa  100  4e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00107141 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02728  MATE efflux family protein  27.15 
 
 		 460 aa  100  5e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0324679  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3691  MATE efflux family protein  25.67 
 
 		 453 aa  100  5e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.830643  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3569  MATE efflux family protein  26.74 
 
 		 452 aa  100  6e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0796958  normal  0.0492062 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1171  MATE efflux family protein  25.23 
 
 		 457 aa  98.2  3e-19  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1670  MATE efflux family protein  29.98 
 
 		 466 aa  98.2  3e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2626  MATE efflux family protein  27.2 
 
 		 467 aa  97.8  4e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.287795  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0699  MATE efflux family protein  27.1 
 
 		 456 aa  97.1  6e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0250563  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0784  MATE efflux family protein  26.77 
 
 		 460 aa  96.7  7e-19  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0747  MATE efflux family protein  27.13 
 
 		 490 aa  96.3  1e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0420  MATE efflux family protein  26.51 
 
 		 459 aa  95.5  2e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000768677  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1166  ABC transporter releated protein  26.7 
 
 		 463 aa  94  6e-18  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.403976 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2827  MATE efflux family protein  26.71 
 
 		 451 aa  93.2  9e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.658448  normal  0.32606 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0707  MATE efflux family protein  25.67 
 
 		 518 aa  93.2  1e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.376903  normal  0.476505 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2244  hypothetical protein  28.28 
 
 		 460 aa  92.4  2e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2636  integral membrane protein  28.03 
 
 		 478 aa  92.4  2e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.117345 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3492  integral membrane protein  27.57 
 
 		 485 aa  92  2e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0396785  normal  0.244149 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1509  MATE efflux family protein  25.16 
 
 		 460 aa  91.7  3e-17  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.712333  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0293  MATE efflux family protein  24.52 
 
 		 467 aa  91.3  4e-17  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1808  MATE efflux family protein  26.13 
 
 		 499 aa  90.1  8e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.848054  normal  0.460632 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3120  MATE efflux family protein  27.1 
 
 		 461 aa  90.1  8e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.369114  normal  0.932515 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0743  MATE efflux family protein  24.46 
 
 		 454 aa  88.6  2e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000193663  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0906  MATE efflux family protein  22.66 
 
 		 448 aa  89  2e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000766798  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2841  MATE efflux family protein  23.53 
 
 		 468 aa  88.2  3e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000678206  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0545  MATE efflux family protein  25.78 
 
 		 470 aa  87.4  5e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0381  MATE efflux family protein  24.41 
 
 		 451 aa  87  7e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00954667  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6251  MATE efflux family protein  27.75 
 
 		 461 aa  86.7  8e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2295  MATE efflux family protein  26.09 
 
 		 475 aa  85.1  0.000000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00026572  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1166  MATE efflux family protein  24.53 
 
 		 460 aa  84.3  0.000000000000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1309  MATE efflux family protein  26.76 
 
 		 538 aa  83.6  0.000000000000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1071  MATE efflux family protein  23.84 
 
 		 475 aa  83.2  0.000000000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3395  MATE efflux family protein  23.75 
 
 		 461 aa  83.2  0.000000000000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3815  MATE efflux family protein  29.22 
 
 		 467 aa  82  0.00000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.142559  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0100  MATE efflux family protein  24.53 
 
 		 454 aa  81.6  0.00000000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0456451  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0012  MATE efflux family protein  28.06 
 
 		 477 aa  81.6  0.00000000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00000348389  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3175  MATE efflux family protein  22.79 
 
 		 468 aa  81.6  0.00000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.386097  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0591  MATE efflux family protein  24.12 
 
 		 438 aa  81.3  0.00000000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2343  MATE efflux family protein  22.47 
 
 		 464 aa  80.9  0.00000000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000000238189  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0575  MATE efflux family protein  26.37 
 
 		 459 aa  80.9  0.00000000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000335028  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3692  MATE efflux family protein  25.45 
 
 		 461 aa  79.7  0.0000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000025823  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1654  MATE efflux family protein  25.43 
 
 		 473 aa  78.6  0.0000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1334  MATE efflux family protein  29.25 
 
 		 478 aa  78.6  0.0000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.402123  normal  0.231405 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0991  MATE efflux family protein  23.45 
 
 		 475 aa  77.8  0.0000000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000156724  normal  0.091152 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1851  MATE efflux family protein  23.34 
 
 		 475 aa  77.4  0.0000000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00783953  normal  0.201536 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>